Marker Genes
Dataset: Single-cell profiling of the developing mouse brain and spinal cord with split-pool barcoding
- tissue: Brain
- ontology: Brain
- genotype: C57BL/6 x DBA/2
- stage:
- treatment condition: WT
- cell/nucleus: Nuclei
- pmid: 29545511
- subset name: all
- total genes: Not reported
- clustering: Jaccard-Louvain
- pseudotime: t-SNE
- link: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE110823
Rows:50
dataset id | cluster id | cluster name | cell type name | sample id | gene symbol | entrez geneid | species specific geneid |
avg log fc (?)
|
pct 1 | pct 2 | p value | padj |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
69 | 13 | Cortex Layer 5 Pyramidal - Fezf2 | all | Tshz2 | 228911 | 2153084 | ||||||
69 | 13 | Cortex Layer 5 Pyramidal - Fezf2 | all | Gm26883 | NULL | |||||||
69 | 13 | Cortex Layer 5 Pyramidal - Fezf2 | all | Pcsk5 | 18552 | 97515 | ||||||
69 | 13 | Cortex Layer 5 Pyramidal - Fezf2 | all | Etv1 | 14009 | 99254 | ||||||
69 | 13 | Cortex Layer 5 Pyramidal - Fezf2 | all | Lypd1 | 72585 | 1919835 | ||||||
69 | 13 | Cortex Layer 5 Pyramidal - Fezf2 | all | Tshz3 | 243931 | 2442819 | ||||||
69 | 13 | Cortex Layer 5 Pyramidal - Fezf2 | all | Efr3a | 76740 | 1923990 | ||||||
69 | 13 | Cortex Layer 5 Pyramidal - Fezf2 | all | Mgat4c | 67569 | 1914819 | ||||||
69 | 13 | Cortex Layer 5 Pyramidal - Fezf2 | all | Tle4 | 21888 | 104633 | ||||||
69 | 13 | Cortex Layer 5 Pyramidal - Fezf2 | all | Mcc | 328949 | 96930 | ||||||
69 | 13 | Cortex Layer 5 Pyramidal - Fezf2 | all | Etl4 | 208618 | 95454 | ||||||
69 | 13 | Cortex Layer 5 Pyramidal - Fezf2 | all | P4ha1 | 18451 | 97463 | ||||||
69 | 13 | Cortex Layer 5 Pyramidal - Fezf2 | all | Grik3 | 14807 | 95816 | ||||||
69 | 13 | Cortex Layer 5 Pyramidal - Fezf2 | all | 2900026A02Rik | 243219 | 1920194 | ||||||
69 | 13 | Cortex Layer 5 Pyramidal - Fezf2 | all | Cntn3 | 18488 | 99534 | ||||||
69 | 13 | Cortex Layer 5 Pyramidal - Fezf2 | all | Rai14 | 75646 | 1922896 | ||||||
69 | 13 | Cortex Layer 5 Pyramidal - Fezf2 | all | Frmpd4 | 333605 | 3042378 | ||||||
69 | 13 | Cortex Layer 5 Pyramidal - Fezf2 | all | Kcnmb4 | 58802 | 1913272 | ||||||
69 | 13 | Cortex Layer 5 Pyramidal - Fezf2 | all | Chsy3 | 78923 | 1926173 | ||||||
69 | 13 | Cortex Layer 5 Pyramidal - Fezf2 | all | Vwc2l | 320460 | 2444069 | ||||||
69 | 13 | Cortex Layer 5 Pyramidal - Fezf2 | all | Neto2 | 74513 | 1921763 | ||||||
69 | 13 | Cortex Layer 5 Pyramidal - Fezf2 | all | Unc13b | 22249 | 1342278 | ||||||
69 | 13 | Cortex Layer 5 Pyramidal - Fezf2 | all | Ildr2 | 100039795 | 1196370 | ||||||
69 | 13 | Cortex Layer 5 Pyramidal - Fezf2 | all | Adcy2 | 210044 | 99676 | ||||||
69 | 13 | Cortex Layer 5 Pyramidal - Fezf2 | all | Bcl11b | 58208 | 1929913 | ||||||
69 | 13 | Cortex Layer 5 Pyramidal - Fezf2 | all | A830018L16Rik | 320492 | 2444149 | ||||||
69 | 13 | Cortex Layer 5 Pyramidal - Fezf2 | all | Thrb | 21834 | 98743 | ||||||
69 | 13 | Cortex Layer 5 Pyramidal - Fezf2 | all | Cdh11 | 12552 | 99217 | ||||||
69 | 13 | Cortex Layer 5 Pyramidal - Fezf2 | all | Tox | 252838 | 2181659 | ||||||
69 | 13 | Cortex Layer 5 Pyramidal - Fezf2 | all | Hs3st4 | 628779 | 1333792 | ||||||
69 | 13 | Cortex Layer 5 Pyramidal - Fezf2 | all | Cdh18 | 320865 | 1344366 | ||||||
69 | 13 | Cortex Layer 5 Pyramidal - Fezf2 | all | Cntn6 | 53870 | 1858223 | ||||||
69 | 13 | Cortex Layer 5 Pyramidal - Fezf2 | all | Smyd3 | 69726 | 1916976 | ||||||
69 | 13 | Cortex Layer 5 Pyramidal - Fezf2 | all | Satb1 | 20230 | 105084 | ||||||
69 | 13 | Cortex Layer 5 Pyramidal - Fezf2 | all | Sh3rf3 | 237353 | 2444637 | ||||||
69 | 13 | Cortex Layer 5 Pyramidal - Fezf2 | all | Fam189a1 | 70638 | 1917888 | ||||||
69 | 13 | Cortex Layer 5 Pyramidal - Fezf2 | all | Dync1i1 | 13426 | 107743 | ||||||
69 | 13 | Cortex Layer 5 Pyramidal - Fezf2 | all | Ptpru | 19273 | 1321151 | ||||||
69 | 13 | Cortex Layer 5 Pyramidal - Fezf2 | all | Cacnb4 | 12298 | 103301 | ||||||
69 | 13 | Cortex Layer 5 Pyramidal - Fezf2 | all | Zbtb16 | 235320 | 103222 | ||||||
69 | 13 | Cortex Layer 5 Pyramidal - Fezf2 | all | Adamts20 | 223838 | 2660628 | ||||||
69 | 13 | Cortex Layer 5 Pyramidal - Fezf2 | all | Zswim6 | 67263 | 1914513 | ||||||
69 | 13 | Cortex Layer 5 Pyramidal - Fezf2 | all | Cpne4 | 74020 | 1921270 | ||||||
69 | 13 | Cortex Layer 5 Pyramidal - Fezf2 | all | Slit1 | 20562 | 1315203 | ||||||
69 | 13 | Cortex Layer 5 Pyramidal - Fezf2 | all | Tmem108 | 81907 | 1932411 | ||||||
69 | 13 | Cortex Layer 5 Pyramidal - Fezf2 | all | Pdzd2 | 68070 | 1922394 | ||||||
69 | 13 | Cortex Layer 5 Pyramidal - Fezf2 | all | Dpy19l1 | 244745 | 1915685 | ||||||
69 | 13 | Cortex Layer 5 Pyramidal - Fezf2 | all | Tmem200a | 77220 | 1924470 | ||||||
69 | 13 | Cortex Layer 5 Pyramidal - Fezf2 | all | Kcnab1 | 16497 | 109155 | ||||||
69 | 13 | Cortex Layer 5 Pyramidal - Fezf2 | all | Cabp1 | 29867 | 1352750 |