Marker Genes

Dataset: Single-cell transcriptome analysis reveals differential nutrient absorption functions in human intestine

  • tissue: Intestine
  • ontology: Intestine
  • genotype:
  • stage:
  • treatment condition:
  • cell/nucleus:
  • pmid: 31753849
  • subset name: Ileum
  • total genes:
  • clustering:
  • pseudotime:
  • link:

Rows:198
dataset id cluster id cluster name cell type name sample id gene symbol entrez geneid species specific geneid
avg log fc (?)
pct 1 pct 2 p value padj
116 7 stem Ileum RPS9 6203 10442 0.85 1 0.99 0
116 7 stem Ileum RPS18 6222 10401 1.06 1 1 0
116 7 stem Ileum RPL13 6137 10303 0.98 1 1 0
116 7 stem Ileum RPS12 6206 10385 1.08 1 0.99 0
116 7 stem Ileum RPL12 6136 10302 0.97 1 0.99 0
116 7 stem Ileum RPL34 6164 10340 0.89 1 1 0
116 7 stem Ileum RPL13A 23521 10304 0.9 1 1 0
116 7 stem Ileum RPS27 6232 10416 0.7 1 1 0
116 7 stem Ileum RPS3 6188 10420 1.08 1 0.99 0
116 7 stem Ileum OLFM4 10562 17190 1.89 0.99 0.63 0
116 7 stem Ileum RPL31 6160 10334 1.01 1 0.99 0
116 7 stem Ileum RPL35A 6165 10345 0.81 1 0.99 0
116 7 stem Ileum RPS23 6228 10410 0.85 1 0.99 0
116 7 stem Ileum RPL3 6122 10332 0.94 1 0.99 0
116 7 stem Ileum RPS5 6193 10426 0.92 1 0.98 0
116 7 stem Ileum RPL36A 6173 10359 1.11 1 0.96 0
116 7 stem Ileum RPS3A 6189 10421 1.04 1 0.99 0
116 7 stem Ileum RPS24 6229 10411 0.92 1 0.99 0
116 7 stem Ileum RPL11 6135 10301 0.64 1 1 0
116 7 stem Ileum RPS6 6194 10429 1.13 1 0.99 0
116 7 stem Ileum RPL39 6170 10350 1 1 0.99 0
116 7 stem Ileum RPL30 6156 10333 0.82 1 0.99 0
116 7 stem Ileum RPL26 6154 10327 0.88 1 0.99 0
116 7 stem Ileum RPS25 6230 10413 0.74 1 0.99 0
116 7 stem Ileum RACK1 10399 4399 0.82 1 0.98 0
116 7 stem Ileum RPL9 6133 10369 0.76 1 0.99 0
116 7 stem Ileum RPL32 6161 10336 0.89 1 0.99 0
116 7 stem Ileum RPS19 6223 10402 0.86 1 0.99 0
116 7 stem Ileum RPL37 6167 10347 0.82 1 0.99 0
116 7 stem Ileum RPS4X 6191 10424 0.97 1 0.99 0
116 7 stem Ileum RPS27A 6233 10417 0.73 1 0.99 0
116 7 stem Ileum EEF1A1 1915 3189 0.83 1 1 0
116 7 stem Ileum RPL14 9045 10305 0.71 1 0.99 0
116 7 stem Ileum RPS28 6234 10418 0.73 1 0.99 0
116 7 stem Ileum RGMB 285704 26896 1.11 0.89 0.13 0
116 7 stem Ileum ASCL2 430 739 1.21 0.89 0.11 0
116 7 stem Ileum RPL10A 4736 10299 1.02 1 0.96 0
116 7 stem Ileum RPL5 6125 10360 0.97 1 0.94 0
116 7 stem Ileum RPL36 25873 13631 0.74 1 0.99 0
116 7 stem Ileum RPS2 6187 10404 1.21 1 0.98 0
116 7 stem Ileum RPL10 6134 10298 0.71 1 1 0
116 7 stem Ileum RPS14 6208 10387 0.66 1 1 0
116 7 stem Ileum RPS8 6202 10441 1 1 0.99 0
116 7 stem Ileum RPL7A 6130 10364 0.74 1 0.99 0
116 7 stem Ileum RPS15A 6210 10389 0.82 1 0.99 0
116 7 stem Ileum RPL38 6169 10349 0.65 1 0.99 0
116 7 stem Ileum RPL23A 6147 10317 0.73 1 0.99 0
116 7 stem Ileum RPL37A 6168 10348 0.77 1 0.99 0
116 7 stem Ileum SLC12A2 6558 10911 1.23 0.95 0.29 0
116 7 stem Ileum SPINK1 6690 11244 0.87 1 0.95 0
116 7 stem Ileum RPL41 6171 10354 0.56 1 1 0
116 7 stem Ileum RPS17 6218 10397 0.91 1 0.98 0
116 7 stem Ileum RPS21 6227 10409 0.79 1 0.99 0
116 7 stem Ileum RPL27A 6157 10329 0.65 1 1 0
116 7 stem Ileum RPLP0 6175 10371 0.86 1 0.97 0
116 7 stem Ileum MARCKSL1 65108 7142 1.1 0.92 0.26 0
116 7 stem Ileum RPS15 6209 10388 0.54 1 1 0
116 7 stem Ileum SOX4 6659 11200 1.11 0.93 0.3 0
116 7 stem Ileum RPL21 6144 10313 0.65 1 0.99 0
116 7 stem Ileum RPS10 6204 10383 0.77 1 0.98 0
116 7 stem Ileum RPL7 6129 10363 0.88 1 0.99 0
116 7 stem Ileum RPL24 6152 10325 0.68 1 0.98 0
116 7 stem Ileum RPL17 6139 10307 0.81 0.99 0.9 0
116 7 stem Ileum RPLP2 6181 10377 0.66 1 1 0
116 7 stem Ileum CDCA7 83879 14628 0.9 0.9 0.17 0
116 7 stem Ileum RPL15 6138 10306 0.88 1 0.98 0
116 7 stem Ileum RPL18 6141 10310 0.61 1 0.99 0
116 7 stem Ileum RPL23 9349 10316 0.8 0.99 0.91 0
116 7 stem Ileum RPL29 6159 10331 0.53 1 0.99 0
116 7 stem Ileum RPL19 6143 10312 0.59 1 0.99 0
116 7 stem Ileum RPL35 11224 10344 0.67 1 0.99 0
116 7 stem Ileum RPLP1 6176 10372 0.76 1 1 0
116 7 stem Ileum RPS20 6224 10405 0.72 1 0.96 0
116 7 stem Ileum RPS13 6207 10386 0.75 1 0.97 0
116 7 stem Ileum RPS11 6205 10384 0.7 1 0.97 0
116 7 stem Ileum PPP1R1B 84152 9287 0.86 0.95 0.29 0
116 7 stem Ileum HNRNPA1 3178 5031 0.85 0.99 0.89 0
116 7 stem Ileum RPL18A 6142 10311 0.7 1 0.99 0
116 7 stem Ileum RPL8 6132 10368 0.51 1 0.99 0
116 7 stem Ileum RPS7 6201 10440 0.8 0.99 0.93 0
116 7 stem Ileum NBEAL1 65065 20681 0.74 0.98 0.74 0
116 7 stem Ileum GPX2 2877 4554 0.95 0.93 0.36 0
116 7 stem Ileum PABPC1 26986 8554 0.8 0.98 0.79 0
116 7 stem Ileum NPM1 4869 7910 0.88 0.98 0.73 0
116 7 stem Ileum NACA 4666 7629 0.64 1 0.96 0
116 7 stem Ileum ALDH1B1 219 407 0.84 0.79 0.12 0
116 7 stem Ileum EIF3E 3646 3277 0.92 0.95 0.61 0
116 7 stem Ileum RPL22 6146 10315 0.69 1 0.95 0
116 7 stem Ileum RPL4 6124 10353 0.84 0.98 0.74 0
116 7 stem Ileum RPS29 6235 10419 0.61 1 1 0
116 7 stem Ileum RPSA 3921 6502 0.86 0.99 0.88 0
116 7 stem Ileum RPL6 6128 10362 0.77 1 0.93 0
116 7 stem Ileum RAMP1 10267 9843 0.77 0.93 0.38 0
116 7 stem Ileum RPS16 6217 10396 0.61 1 0.98 0
116 7 stem Ileum RPL28 6158 10330 0.48 1 1 0
116 7 stem Ileum ZFAS1 441951 33101 0.77 0.94 0.63 0
116 7 stem Ileum PRDX5 25824 9355 0.56 1 0.94 0
116 7 stem Ileum RPL27 6155 10328 0.58 1 0.96 0
116 7 stem Ileum CDK6 1021 1777 0.74 0.79 0.19 0
116 7 stem Ileum ZFP36L2 678 1108 0.7 0.98 0.68 0
116 7 stem Ileum NOP53 29997 4333 0.53 0.99 0.91 0
116 7 stem Ileum IMPDH2 3615 6053 0.78 0.84 0.29 0
116 7 stem Ileum REG1A 5967 9951 0.86 1 0.94 0
116 7 stem Ileum LGR5 8549 4504 0.72 0.67 0.03 0
116 7 stem Ileum CLU 1191 2095 0.69 0.74 0.13 0
116 7 stem Ileum HMGA1 3159 5010 0.71 0.93 0.56 0
116 7 stem Ileum NAP1L1 4673 7637 0.73 0.79 0.18 0
116 7 stem Ileum KLK1 3816 6357 0.7 0.84 0.28 0
116 7 stem Ileum CD44 960 1681 0.68 0.73 0.14 0
116 7 stem Ileum HSP90AB1 3326 5258 0.65 0.97 0.73 0
116 7 stem Ileum KIAA1324 57535 29618 0.64 0.79 0.21 0
116 7 stem Ileum BTF3 689 1125 0.53 0.98 0.93 0
116 7 stem Ileum SMOC2 64094 20323 1.08 0.62 0.01 0
116 7 stem Ileum AC090498.1 NULL 0.54 0.98 0.84 0
116 7 stem Ileum ETS2 2114 3489 0.65 0.91 0.51 0
116 7 stem Ileum HMGCS2 3158 5008 0.72 0.7 0.14 0
116 7 stem Ileum BEX3 27018 13388 0.55 0.7 0.14 0
116 7 stem Ileum PTMA 5757 9623 0.45 1 0.97 0
116 7 stem Ileum SNHG32 50854 19078 0.57 0.83 0.35 0
116 7 stem Ileum AREG 374 651 0.76 0.73 0.21 0
116 7 stem Ileum EIF3L 51386 18138 0.63 0.9 0.54 0
116 7 stem Ileum DUT 1854 3078 0.55 0.79 0.23 0
116 7 stem Ileum MLXIP 22877 17055 0.62 0.77 0.26 0
116 7 stem Ileum SOX9 6662 11204 0.55 0.69 0.15 0
116 7 stem Ileum EEF1B2 1933 3208 0.42 0.99 0.98 0
116 7 stem Ileum EPHB2 2048 3393 0.49 0.68 0.14 0
116 7 stem Ileum GLUL 2752 4341 0.48 0.66 0.12 0
116 7 stem Ileum PDZK1IP1 10158 16887 0.54 0.84 0.37 0
116 7 stem Ileum COMMD6 170622 24015 0.47 0.95 0.71 0
116 7 stem Ileum EEF1G 1937 3213 0.57 0.84 0.46 0
116 7 stem Ileum SELENOW 6415 10752 0.47 0.92 0.62 0
116 7 stem Ileum EPB41L4A-AS1 114915 30749 0.49 0.77 0.3 0
116 7 stem Ileum EIF3D 8664 3278 0.51 0.87 0.52 0
116 7 stem Ileum FAU 2197 3597 0.29 1 0.99 0
116 7 stem Ileum RSL1D1 26156 24534 0.5 0.85 0.42 0
116 7 stem Ileum APEX1 328 587 0.51 0.79 0.33 0
116 7 stem Ileum RNF43 54894 18505 0.47 0.7 0.19 0
116 7 stem Ileum IDH2 3418 5383 0.5 0.84 0.36 0
116 7 stem Ileum ARID5B 84159 17362 0.51 0.6 0.11 0
116 7 stem Ileum PIK3R1 5295 8979 0.5 0.65 0.16 0
116 7 stem Ileum FBL 2091 3599 0.51 0.8 0.33 0
116 7 stem Ileum SNRPD2 6633 11159 0.44 0.97 0.76 0
116 7 stem Ileum C19orf48 84798 29667 0.48 0.66 0.16 0
116 7 stem Ileum NOB1 28987 29540 0.49 0.66 0.2 0
116 7 stem Ileum MLEC 9761 28973 0.47 0.89 0.49 0
116 7 stem Ileum HES1 3280 5192 0.73 0.88 0.57 0
116 7 stem Ileum CERS6 253782 23826 0.52 0.77 0.33 0
116 7 stem Ileum AC013461.1 NULL 0.44 0.57 0.09 0
116 7 stem Ileum ND4 4538 7459 0.41 1 1 0
116 7 stem Ileum ZBTB38 253461 26636 0.48 0.67 0.22 0
116 7 stem Ileum ZFP36L1 677 1107 0.52 0.84 0.46 0
116 7 stem Ileum EIF3H 8667 3273 0.46 0.9 0.63 0
116 7 stem Ileum TGIF1 7050 11776 0.43 0.65 0.17 0
116 7 stem Ileum RNF186 54546 25978 0.49 0.59 0.13 0
116 7 stem Ileum HMGN3 9324 12312 0.42 0.73 0.26 0
116 7 stem Ileum EEF2 1938 3214 0.34 1 0.97 0
116 7 stem Ileum ZNF703 80139 25883 0.48 0.66 0.22 0
116 7 stem Ileum CNN3 1266 2157 0.48 0.81 0.43 0
116 7 stem Ileum RCN1 5954 9934 0.43 0.57 0.12 0
116 7 stem Ileum MYC 4609 7553 0.51 0.57 0.11 0
116 7 stem Ileum GDF15 9518 30142 0.71 0.58 0.14 0
116 7 stem Ileum TXNIP 10628 16952 0.45 0.78 0.35 0
116 7 stem Ileum ATP5MC2 517 842 0.35 0.99 0.93 0
116 7 stem Ileum ITGA6 3655 6142 0.47 0.7 0.29 0
116 7 stem Ileum QTRT1 81890 23797 0.41 0.95 0.65 0
116 7 stem Ileum RPS4Y1 6192 10425 0.94 0.65 0.32 0
116 7 stem Ileum SNRPE 6635 11161 0.42 0.85 0.45 0
116 7 stem Ileum EIF3F 8665 3275 0.42 0.91 0.68 0
116 7 stem Ileum STARD10 10809 10666 0.41 0.81 0.37 0
116 7 stem Ileum MYADM 91663 7544 0.37 0.53 0.08 0
116 7 stem Ileum NUCKS1 64710 29923 0.4 0.76 0.31 0
116 7 stem Ileum CD9 928 1709 0.42 0.94 0.69 0
116 7 stem Ileum IFITM3 10410 5414 0.4 0.75 0.3 0
116 7 stem Ileum RBMX 27316 9910 0.45 0.81 0.48 0
116 7 stem Ileum IRF2BP2 359948 21729 0.4 0.77 0.35 0
116 7 stem Ileum ST13 6767 11343 0.38 0.94 0.73 0
116 7 stem Ileum SNHG8 100093630 33098 0.47 0.94 0.7 0
116 7 stem Ileum TMEM123 114908 30138 0.38 0.66 0.23 0
116 7 stem Ileum ZKSCAN1 7586 13101 0.39 0.74 0.32 0
116 7 stem Ileum TCEAL9 51186 30084 0.42 0.58 0.15 0
116 7 stem Ileum NDUFA4 4697 7687 0.38 0.96 0.83 0
116 7 stem Ileum EBPL 84650 18061 0.36 0.62 0.18 0
116 7 stem Ileum CCND2 894 1583 0.38 0.69 0.25 0
116 7 stem Ileum CIRBP 1153 1982 0.36 0.95 0.72 0
116 7 stem Ileum RHOBTB3 22836 18757 0.36 0.6 0.18 0
116 7 stem Ileum TMEM63A 9725 29118 0.36 0.54 0.12 0
116 7 stem Ileum RSL24D1 51187 18479 0.41 0.76 0.4 0
116 7 stem Ileum ZNF814 730051 33258 0.39 0.5 0.1 0
116 7 stem Ileum APP 351 620 0.35 0.78 0.4 0
116 7 stem Ileum SLC25A6 293 10992 0.29 1 0.96 0
116 7 stem Ileum SELENBP1 8991 10719 0.4 0.86 0.62 0
116 7 stem Ileum HNRNPA0 10949 5030 0.4 0.82 0.51 0
116 7 stem Ileum PFDN5 5204 8869 0.26 0.99 0.95 0
116 7 stem Ileum NENF 29937 30384 0.36 0.71 0.3 0
116 7 stem Ileum GPR160 26996 23693 0.39 0.91 0.68 0
116 7 stem Ileum FERMT1 55612 15889 0.35 0.54 0.15 0
116 7 stem Ileum HSPD1 3329 5261 0.41 0.82 0.51 0
116 7 stem Ileum BIN1 274 1052 0.31 0.52 0.12 0