Protein Alignment SCN8A and Scn8a

DIOPT Version :10

• Sequence 1: NP_055006.1
• Gene: SCN8A / 6334
• HGNCID: 10596
• Length: 1980
• Species: Homo sapiens
• Sequence 2: NP_062139.2
• Gene: Scn8a / 29710
• RGDID: 3638
• Length: 1978
• Species: Rattus norvegicus
• Alignment Length: 1980
• Identity: 1952/1980 - (98%)
• Similarity: 1969/1980 - (99%)
• Gaps: 2/1980 - (0%)

Human     1 MAARLLAPPGPDSFKPFTPESLANIERRIAESKLKKPPKADGSHREDDEDSKPKPNSDLEAGKSL 65
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat     1 MAARLLAPPGPDSFKPFTPESLANIERRIAESKLKKPPKADGSHREDDEDSKPKPNSDLEAGKSL 65

Human    66 PFIYGDIPQGLVAVPLEDFDPYYLTQKTFVVLNRGKTLFRFSATPALYILSPFNLIRRIAIKILI 130
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat    66 PFIYGDIPQGLVAVPLEDFDPYYLTQKTFVVLNRGKTLFRFSATPALYILSPFNLIRRIAIKILI 130

Human   131 HSVFSMIIMCTILTNCVFMTFSNPPDWSKNVEYTFTGIYTFESLVKIIARGFCIDGFTFLRDPWN 195
            |||||||||||||||||||||||||:|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   131 HSVFSMIIMCTILTNCVFMTFSNPPEWSKNVEYTFTGIYTFESLVKIIARGFCIDGFTFLRDPWN 195

Human   196 WLDFSVIMMAYITEFVNLGNVSALRTFRVLRALKTISVIPGLKTIVGALIQSVKKLSDVMILTVF 260
            |||||||||||:||||:||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   196 WLDFSVIMMAYVTEFVDLGNVSALRTFRVLRALKTISVIPGLKTIVGALIQSVKKLSDVMILTVF 260

Human   261 CLSVFALIGLQLFMGNLRNKCVVWPINFNESYLENGTKGFDWEEYINNKTNFYTVPGMLEPLLCG 325
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||:|||||||||||||||.|||||||||||
  Rat   261 CLSVFALIGLQLFMGNLRNKCVVWPINFNESYLENGTRGFDWEEYINNKTNFYMVPGMLEPLLCG 325

Human   326 NSSDAGQCPEGYQCMKAGRNPNYGYTSFDTFSWAFLALFRLMTQDYWENLYQLTLRAAGKTYMIF 390
            |||||||||||:|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   326 NSSDAGQCPEGFQCMKAGRNPNYGYTSFDTFSWAFLALFRLMTQDYWENLYQLTLRAAGKTYMIF 390

Human   391 FVLVIFVGSFYLVNLILAVVAMAYEEQNQATLEEAEQKEAEFKAMLEQLKKQQEEAQAAAMATSA 455
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   391 FVLVIFVGSFYLVNLILAVVAMAYEEQNQATLEEAEQKEAEFKAMLEQLKKQQEEAQAAAMATSA 455

Human   456 GTVSEDAIEEEGEEGGGSPRSSSEISKLSSKSAKERRNRRKKRKQKELSEGEEKGDPEKVFKSES 520
            |||||||||||||:|.||||||||:||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   456 GTVSEDAIEEEGEDGVGSPRSSSELSKLSSKSAKERRNRRKKRKQKELSEGEEKGDPEKVFKSES 520

Human   521 EDGMRRKAFRLPDNRIGRKFSIMNQSLLSIPGSPFLSRHNSKSSIFSFRGPGRFRDPGSENEFAD 585
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   521 EDGMRRKAFRLPDNRIGRKFSIMNQSLLSIPGSPFLSRHNSKSSIFSFRGPGRFRDPGSENEFAD 585

Human   586 DEHSTVEESEGRRDSLFIPIRARERRSSYSGYSGYSQGSRSSRIFPSLRRSVKRNSTVDCNGVVS 650
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
  Rat   586 DEHSTVEESEGRRDSLFIPIRARERRSSYSGYSGYSQCSRSSRIFPSLRRSVKRNSTVDCNGVVS 650

Human   651 LIGGPGSHIGGRLLPEATTEVEIKKKGPGSLLVSMDQLASYGRKDRINSIMSVVTNTLVEELEES 715
            || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   651 LI-GPGSHI-GRLLPEATTEVEIKKKGPGSLLVSMDQLASYGRKDRINSIMSVVTNTLVEELEES 713

Human   716 QRKCPPCWYKFANTFLIWECHPYWIKLKEIVNLIVMDPFVDLAITICIVLNTLFMAMEHHPMTPQ 780
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   714 QRKCPPCWYKFANTFLIWECHPYWIKLKEIVNLIVMDPFVDLAITICIVLNTLFMAMEHHPMTPQ 778

Human   781 FEHVLAVGNLVFTGIFTAEMFLKLIAMDPYYYFQEGWNIFDGFIVSLSLMELSLADVEGLSVLRS 845
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   779 FEHVLAVGNLVFTGIFTAEMFLKLIAMDPYYYFQEGWNIFDGFIVSLSLMELSLADVEGLSVLRS 843

Human   846 FRLLRVFKLAKSWPTLNMLIKIIGNSVGALGNLTLVLAIIVFIFAVVGMQLFGKSYKECVCKINQ 910
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   844 FRLLRVFKLAKSWPTLNMLIKIIGNSVGALGNLTLVLAIIVFIFAVVGMQLFGKSYKECVCKINQ 908

Human   911 DCELPRWHMHDFFHSFLIVFRVLCGEWIETMWDCMEVAGQAMCLIVFMMVMVIGNLVVLNLFLAL 975
            :|:||||||:|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   909 ECKLPRWHMNDFFHSFLIVFRVLCGEWIETMWDCMEVAGQAMCLIVFMMVMVIGNLVVLNLFLAL 973

Human   976 LLSSFSADNLAATDDDGEMNNLQISVIRIKKGVAWTKLKVHAFMQAHFKQREADEVKPLDELYEK 1040
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||:|||||||||||||||||||||||||||
  Rat   974 LLSSFSADNLAATDDDGEMNNLQISVIRIKKGVAWTKVKVHAFMQAHFKQREADEVKPLDELYEK 1038

Human  1041 KANCIANHTGADIHRNGDFQKNGNGTTSGIGSSVEKYIIDEDHMSFINNPNLTVRVPIAVGESDF 1105
            ||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  1039 KANCIANHTGVDIHRNGDFQKNGNGTTSGIGSSVEKYIIDEDHMSFINNPNLTVRVPIAVGESDF 1103

Human  1106 ENLNTEDVSSESDPEGSKDKLDDTSSSEGSTIDIKPEVEEVPVEQPEEYLDPDACFTEGCVQRFK 1170
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  1104 ENLNTEDVSSESDPEGSKDKLDDTSSSEGSTIDIKPEVEEVPVEQPEEYLDPDACFTEGCVQRFK 1168

Human  1171 CCQVNIEEGLGKSWWILRKTCFLIVEHNWFETFIIFMILLSSGALAFEDIYIEQRKTIRTILEYA 1235
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  1169 CCQVNIEEGLGKSWWILRKTCFLIVEHNWFETFIIFMILLSSGALAFEDIYIEQRKTIRTILEYA 1233

Human  1236 DKVFTYIFILEMLLKWTAYGFVKFFTNAWCWLDFLIVAVSLVSLIANALGYSELGAIKSLRTLRA 1300
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  1234 DKVFTYIFILEMLLKWTAYGFVKFFTNAWCWLDFLIVAVSLVSLIANALGYSELGAIKSLRTLRA 1298

Human  1301 LRPLRALSRFEGMRVVVNALVGAIPSIMNVLLVCLIFWLIFSIMGVNLFAGKYHYCFNETSEIRF 1365
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  1299 LRPLRALSRFEGMRVVVNALVGAIPSIMNVLLVCLIFWLIFSIMGVNLFAGKYHYCFNETSEIRF 1363

Human  1366 EIEDVNNKTECEKLMEGNNTEIRWKNVKINFDNVGAGYLALLQVATFKGWMDIMYAAVDSRKPDE 1430
            ||:.|||||:||||||||:||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  1364 EIDIVNNKTDCEKLMEGNSTEIRWKNVKINFDNVGAGYLALLQVATFKGWMDIMYAAVDSRKPDE 1428

Human  1431 QPKYEDNIYMYIYFVIFIIFGSFFTLNLFIGVIIDNFNQQKKKFGGQDIFMTEEQKKYYNAMKKL 1495
            ||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  1429 QPDYEGNIYMYIYFVIFIIFGSFFTLNLFIGVIIDNFNQQKKKFGGQDIFMTEEQKKYYNAMKKL 1493

Human  1496 GSKKPQKPIPRPLNKIQGIVFDFVTQQAFDIVIMMLICLNMVTMMVETDTQSKQMENILYWINLV 1560
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  1494 GSKKPQKPIPRPLNKIQGIVFDFVTQQAFDIVIMMLICLNMVTMMVETDTQSKQMENILYWINLV 1558

Human  1561 FVIFFTCECVLKMFALRHYYFTIGWNIFDFVVVILSIVGMFLADIIEKYFVSPTLFRVIRLARIG 1625
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  1559 FVIFFTCECVLKMFALRHYYFTIGWNIFDFVVVILSIVGMFLADIIEKYFVSPTLFRVIRLARIG 1623

Human  1626 RILRLIKGAKGIRTLLFALMMSLPALFNIGLLLFLVMFIFSIFGMSNFAYVKHEAGIDDMFNFET 1690
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  1624 RILRLIKGAKGIRTLLFALMMSLPALFNIGLLLFLVMFIFSIFGMSNFAYVKHEAGIDDMFNFET 1688

Human  1691 FGNSMICLFQITTSAGWDGLLLPILNRPPDCSLDKEHPGSGFKGDCGNPSVGIFFFVSYIIISFL 1755
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  1689 FGNSMICLFQITTSAGWDGLLLPILNRPPDCSLDKEHPGSGFKGDCGNPSVGIFFFVSYIIISFL 1753

Human  1756 IVVNMYIAIILENFSVATEESADPLSEDDFETFYEIWEKFDPDATQFIEYCKLADFADALEHPLR 1820
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  1754 IVVNMYIAIILENFSVATEESADPLSEDDFETFYEIWEKFDPDATQFIEYCKLADFADALEHPLR 1818

Human  1821 VPKPNTIELIAMDLPMVSGDRIHCLDILFAFTKRVLGDSGELDILRQQMEERFVASNPSKVSYEP 1885
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  1819 VPKPNTIELIAMDLPMVSGDRIHCLDILFAFTKRVLGDSGELDILRQQMEERFVASNPSKVSYEP 1883

Human  1886 ITTTLRRKQEEVSAVVLQRAYRGHLARRGFICKKTTSNKLENGGTHREKKESTPSTASLPSYDSV 1950
            ||||||||||||||||||||||||||||||||:|..|||||||||||:|||||||||||||||||
  Rat  1884 ITTTLRRKQEEVSAVVLQRAYRGHLARRGFICRKMASNKLENGGTHRDKKESTPSTASLPSYDSV 1948

Human  1951 TKPEKEKQQRAEEGRRERAKRQKEVRESKC 1980
            |||:||||||||||||||||||||||||||
  Rat  1949 TKPDKEKQQRAEEGRRERAKRQKEVRESKC 1978

Known Domains

Gene	Sequence	Domain	Region	External ID	Identity
SCN8A	NP_055006.1	Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite	1..20		18/18 (100%)
		Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite	28..62		33/33 (100%)
		I. /evidence=ECO:0000305	114..442		321/327 (98%)
		Ion_trans	131..421	CDD:459842	283/289 (98%)
		Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite	446..530		80/83 (96%)
		Na_trans_cytopl	546..702	CDD:463401	152/155 (98%)
		Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite	568..602		33/33 (100%)
		II. /evidence=ECO:0000305	735..1007		268/271 (99%)
		Ion_trans	752..965	CDD:459842	209/212 (99%)
		Na_trans_assoc	991..1192	CDD:461936	198/200 (99%)
		Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite	1107..1148		40/40 (100%)
		III. /evidence=ECO:0000305	1180..1495		308/314 (98%)
		Ion_trans	1197..1473	CDD:459842	269/275 (98%)
		Na_channel_gate	1465..1517	CDD:240441	51/51 (100%)
		IV. /evidence=ECO:0000305	1504..1801		296/296 (100%)
		Ion_trans	1522..1776	CDD:459842	253/253 (100%)
		IQ	1894..1915	CDD:197470	20/20 (100%)
		Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite	1922..1980		55/57 (96%)
Scn8a	NP_062139.2	Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite	1..20		18/18 (100%)
		Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite	28..62		33/33 (100%)
		I. /evidence=ECO:0000305	114..442		321/327 (98%)
		Ion_trans	131..421	CDD:459842	283/289 (98%)
		Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite	446..530		80/83 (96%)
		Na_trans_cytopl	546..700	CDD:463401	152/155 (98%)
		Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite	576..597		20/20 (100%)
		II. /evidence=ECO:0000305	733..1005		268/271 (99%)
		Ion_trans	750..963	CDD:459842	209/212 (99%)
		Na_trans_assoc	989..1190	CDD:461936	198/200 (99%)
		Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite	1105..1146		40/40 (100%)
		III. /evidence=ECO:0000305	1178..1493		308/314 (98%)
		Ion_trans	1195..1471	CDD:459842	269/275 (98%)
		Na_channel_gate	1463..1515	CDD:240441	51/51 (100%)
		IV. /evidence=ECO:0000305	1502..1799		296/296 (100%)
		Ion_trans	1520..1774	CDD:459842	253/253 (100%)
		IQ	1892..1913	CDD:197470	20/20 (100%)
		Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite	1923..1978		52/54 (96%)