DRSC - DRSC Integrative Ortholog Prediction Tool

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Protein Alignment SCN8A and Scn8a

DIOPT Version :9

Sequence 1:	NP_001317189.1	Gene:	SCN8A / 6334	HGNCID:	10596	Length:	1980	Species:	Homo sapiens
Sequence 2:	NP_062139.2	Gene:	Scn8a / 29710	RGDID:	3638	Length:	1978	Species:	Rattus norvegicus

Alignment Length:	1980	Identity:	1954/1980 - (98%)
Similarity:	1969/1980 - (99%)	Gaps:	2/1980 - (0%)

- Green bases have known domain annotations that are detailed below.

Human     1 MAARLLAPPGPDSFKPFTPESLANIERRIAESKLKKPPKADGSHREDDEDSKPKPNSDLEAGKSL 65
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat     1 MAARLLAPPGPDSFKPFTPESLANIERRIAESKLKKPPKADGSHREDDEDSKPKPNSDLEAGKSL 65

Human    66 PFIYGDIPQGLVAVPLEDFDPYYLTQKTFVVLNRGKTLFRFSATPALYILSPFNLIRRIAIKILI 130
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat    66 PFIYGDIPQGLVAVPLEDFDPYYLTQKTFVVLNRGKTLFRFSATPALYILSPFNLIRRIAIKILI 130

Human   131 HSVFSMIIMCTILTNCVFMTFSNPPDWSKNVEYTFTGIYTFESLVKIIARGFCIDGFTFLRDPWN 195
            |||||||||||||||||||||||||:|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   131 HSVFSMIIMCTILTNCVFMTFSNPPEWSKNVEYTFTGIYTFESLVKIIARGFCIDGFTFLRDPWN 195

Human   196 WLDFSVIMMAYVTEFVDLGNVSALRTFRVLRALKTISVIPGLKTIVGALIQSVKKLSDVMILTVF 260
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   196 WLDFSVIMMAYVTEFVDLGNVSALRTFRVLRALKTISVIPGLKTIVGALIQSVKKLSDVMILTVF 260

Human   261 CLSVFALIGLQLFMGNLRNKCVVWPINFNESYLENGTKGFDWEEYINNKTNFYTVPGMLEPLLCG 325
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||:|||||||||||||||.|||||||||||
  Rat   261 CLSVFALIGLQLFMGNLRNKCVVWPINFNESYLENGTRGFDWEEYINNKTNFYMVPGMLEPLLCG 325

Human   326 NSSDAGQCPEGYQCMKAGRNPNYGYTSFDTFSWAFLALFRLMTQDYWENLYQLTLRAAGKTYMIF 390
            |||||||||||:|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   326 NSSDAGQCPEGFQCMKAGRNPNYGYTSFDTFSWAFLALFRLMTQDYWENLYQLTLRAAGKTYMIF 390

Human   391 FVLVIFVGSFYLVNLILAVVAMAYEEQNQATLEEAEQKEAEFKAMLEQLKKQQEEAQAAAMATSA 455
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   391 FVLVIFVGSFYLVNLILAVVAMAYEEQNQATLEEAEQKEAEFKAMLEQLKKQQEEAQAAAMATSA 455

Human   456 GTVSEDAIEEEGEEGGGSPRSSSEISKLSSKSAKERRNRRKKRKQKELSEGEEKGDPEKVFKSES 520
            |||||||||||||:|.||||||||:||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   456 GTVSEDAIEEEGEDGVGSPRSSSELSKLSSKSAKERRNRRKKRKQKELSEGEEKGDPEKVFKSES 520

Human   521 EDGMRRKAFRLPDNRIGRKFSIMNQSLLSIPGSPFLSRHNSKSSIFSFRGPGRFRDPGSENEFAD 585
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   521 EDGMRRKAFRLPDNRIGRKFSIMNQSLLSIPGSPFLSRHNSKSSIFSFRGPGRFRDPGSENEFAD 585

Human   586 DEHSTVEESEGRRDSLFIPIRARERRSSYSGYSGYSQGSRSSRIFPSLRRSVKRNSTVDCNGVVS 650
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
  Rat   586 DEHSTVEESEGRRDSLFIPIRARERRSSYSGYSGYSQCSRSSRIFPSLRRSVKRNSTVDCNGVVS 650

Human   651 LIGGPGSHIGGRLLPEATTEVEIKKKGPGSLLVSMDQLASYGRKDRINSIMSVVTNTLVEELEES 715
            || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   651 LI-GPGSHI-GRLLPEATTEVEIKKKGPGSLLVSMDQLASYGRKDRINSIMSVVTNTLVEELEES 713

Human   716 QRKCPPCWYKFANTFLIWECHPYWIKLKEIVNLIVMDPFVDLAITICIVLNTLFMAMEHHPMTPQ 780
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   714 QRKCPPCWYKFANTFLIWECHPYWIKLKEIVNLIVMDPFVDLAITICIVLNTLFMAMEHHPMTPQ 778

Human   781 FEHVLAVGNLVFTGIFTAEMFLKLIAMDPYYYFQEGWNIFDGFIVSLSLMELSLADVEGLSVLRS 845
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   779 FEHVLAVGNLVFTGIFTAEMFLKLIAMDPYYYFQEGWNIFDGFIVSLSLMELSLADVEGLSVLRS 843

Human   846 FRLLRVFKLAKSWPTLNMLIKIIGNSVGALGNLTLVLAIIVFIFAVVGMQLFGKSYKECVCKINQ 910
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   844 FRLLRVFKLAKSWPTLNMLIKIIGNSVGALGNLTLVLAIIVFIFAVVGMQLFGKSYKECVCKINQ 908

Human   911 DCELPRWHMHDFFHSFLIVFRVLCGEWIETMWDCMEVAGQAMCLIVFMMVMVIGNLVVLNLFLAL 975
            :|:||||||:|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   909 ECKLPRWHMNDFFHSFLIVFRVLCGEWIETMWDCMEVAGQAMCLIVFMMVMVIGNLVVLNLFLAL 973

Human   976 LLSSFSADNLAATDDDGEMNNLQISVIRIKKGVAWTKLKVHAFMQAHFKQREADEVKPLDELYEK 1040
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||:|||||||||||||||||||||||||||
  Rat   974 LLSSFSADNLAATDDDGEMNNLQISVIRIKKGVAWTKVKVHAFMQAHFKQREADEVKPLDELYEK 1038

Human  1041 KANCIANHTGADIHRNGDFQKNGNGTTSGIGSSVEKYIIDEDHMSFINNPNLTVRVPIAVGESDF 1105
            ||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  1039 KANCIANHTGVDIHRNGDFQKNGNGTTSGIGSSVEKYIIDEDHMSFINNPNLTVRVPIAVGESDF 1103

Human  1106 ENLNTEDVSSESDPEGSKDKLDDTSSSEGSTIDIKPEVEEVPVEQPEEYLDPDACFTEGCVQRFK 1170
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  1104 ENLNTEDVSSESDPEGSKDKLDDTSSSEGSTIDIKPEVEEVPVEQPEEYLDPDACFTEGCVQRFK 1168

Human  1171 CCQVNIEEGLGKSWWILRKTCFLIVEHNWFETFIIFMILLSSGALAFEDIYIEQRKTIRTILEYA 1235
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  1169 CCQVNIEEGLGKSWWILRKTCFLIVEHNWFETFIIFMILLSSGALAFEDIYIEQRKTIRTILEYA 1233

Human  1236 DKVFTYIFILEMLLKWTAYGFVKFFTNAWCWLDFLIVAVSLVSLIANALGYSELGAIKSLRTLRA 1300
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  1234 DKVFTYIFILEMLLKWTAYGFVKFFTNAWCWLDFLIVAVSLVSLIANALGYSELGAIKSLRTLRA 1298

Human  1301 LRPLRALSRFEGMRVVVNALVGAIPSIMNVLLVCLIFWLIFSIMGVNLFAGKYHYCFNETSEIRF 1365
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  1299 LRPLRALSRFEGMRVVVNALVGAIPSIMNVLLVCLIFWLIFSIMGVNLFAGKYHYCFNETSEIRF 1363

Human  1366 EIEDVNNKTECEKLMEGNNTEIRWKNVKINFDNVGAGYLALLQVATFKGWMDIMYAAVDSRKPDE 1430
            ||:.|||||:||||||||:||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  1364 EIDIVNNKTDCEKLMEGNSTEIRWKNVKINFDNVGAGYLALLQVATFKGWMDIMYAAVDSRKPDE 1428

Human  1431 QPKYEDNIYMYIYFVIFIIFGSFFTLNLFIGVIIDNFNQQKKKFGGQDIFMTEEQKKYYNAMKKL 1495
            ||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  1429 QPDYEGNIYMYIYFVIFIIFGSFFTLNLFIGVIIDNFNQQKKKFGGQDIFMTEEQKKYYNAMKKL 1493

Human  1496 GSKKPQKPIPRPLNKIQGIVFDFVTQQAFDIVIMMLICLNMVTMMVETDTQSKQMENILYWINLV 1560
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  1494 GSKKPQKPIPRPLNKIQGIVFDFVTQQAFDIVIMMLICLNMVTMMVETDTQSKQMENILYWINLV 1558

Human  1561 FVIFFTCECVLKMFALRHYYFTIGWNIFDFVVVILSIVGMFLADIIEKYFVSPTLFRVIRLARIG 1625
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  1559 FVIFFTCECVLKMFALRHYYFTIGWNIFDFVVVILSIVGMFLADIIEKYFVSPTLFRVIRLARIG 1623

Human  1626 RILRLIKGAKGIRTLLFALMMSLPALFNIGLLLFLVMFIFSIFGMSNFAYVKHEAGIDDMFNFET 1690
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  1624 RILRLIKGAKGIRTLLFALMMSLPALFNIGLLLFLVMFIFSIFGMSNFAYVKHEAGIDDMFNFET 1688

Human  1691 FGNSMICLFQITTSAGWDGLLLPILNRPPDCSLDKEHPGSGFKGDCGNPSVGIFFFVSYIIISFL 1755
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  1689 FGNSMICLFQITTSAGWDGLLLPILNRPPDCSLDKEHPGSGFKGDCGNPSVGIFFFVSYIIISFL 1753

Human  1756 IVVNMYIAIILENFSVATEESADPLSEDDFETFYEIWEKFDPDATQFIEYCKLADFADALEHPLR 1820
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  1754 IVVNMYIAIILENFSVATEESADPLSEDDFETFYEIWEKFDPDATQFIEYCKLADFADALEHPLR 1818

Human  1821 VPKPNTIELIAMDLPMVSGDRIHCLDILFAFTKRVLGDSGELDILRQQMEERFVASNPSKVSYEP 1885
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  1819 VPKPNTIELIAMDLPMVSGDRIHCLDILFAFTKRVLGDSGELDILRQQMEERFVASNPSKVSYEP 1883

Human  1886 ITTTLRRKQEEVSAVVLQRAYRGHLARRGFICKKTTSNKLENGGTHREKKESTPSTASLPSYDSV 1950
            ||||||||||||||||||||||||||||||||:|..|||||||||||:|||||||||||||||||
  Rat  1884 ITTTLRRKQEEVSAVVLQRAYRGHLARRGFICRKMASNKLENGGTHRDKKESTPSTASLPSYDSV 1948

Human  1951 TKPEKEKQQRAEEGRRERAKRQKEVRESKC 1980
            |||:||||||||||||||||||||||||||
  Rat  1949 TKPDKEKQQRAEEGRRERAKRQKEVRESKC 1978

Known Domains:

Indicated by green bases in alignment.

Gene	Sequence	Domain	Region	External ID	Identity
SCN8A	NP_001317189.1	Disordered. /evidence=ECO:0000256\|SAM:MobiDB-lite	1..20		18/18 (100%)
		Disordered. /evidence=ECO:0000256\|SAM:MobiDB-lite	28..62		33/33 (100%)
		I. /evidence=ECO:0000305	114..442		323/327 (99%)
		Ion_trans	131..421	CDD:395416	285/289 (99%)
		Disordered. /evidence=ECO:0000256\|SAM:MobiDB-lite	446..530		80/83 (96%)
		Na_trans_cytopl	504..702	CDD:403218	194/197 (98%)
		Disordered. /evidence=ECO:0000256\|SAM:MobiDB-lite	568..602		33/33 (100%)
		II. /evidence=ECO:0000305	735..1007		268/271 (99%)
		Ion_trans	752..965	CDD:395416	209/212 (99%)
		Na_trans_assoc	991..1192	CDD:399489	198/200 (99%)
		Disordered. /evidence=ECO:0000256\|SAM:MobiDB-lite	1107..1148		40/40 (100%)
		III. /evidence=ECO:0000305	1180..1495		308/314 (98%)
		Ion_trans	1197..1473	CDD:395416	269/275 (98%)
		Na_channel_gate	1465..1517	CDD:240441	51/51 (100%)
		IV. /evidence=ECO:0000305	1504..1801		296/296 (100%)
		Ion_trans	1522..1776	CDD:395416	253/253 (100%)
		GPHH	1788..1835	CDD:407139	46/46 (100%)
		IQ	1894..1915	CDD:197470	20/20 (100%)
		Disordered. /evidence=ECO:0000256\|SAM:MobiDB-lite	1922..1980		55/57 (96%)
Scn8a	NP_062139.2	Disordered. /evidence=ECO:0000256\|SAM:MobiDB-lite	1..20		18/18 (100%)
		Disordered. /evidence=ECO:0000256\|SAM:MobiDB-lite	28..62		33/33 (100%)
		I. /evidence=ECO:0000305	114..442		323/327 (99%)
		Ion_trans	131..421	CDD:395416	285/289 (99%)
		Disordered. /evidence=ECO:0000256\|SAM:MobiDB-lite	446..530		80/83 (96%)
		Na_trans_cytopl	504..700	CDD:403218	194/197 (98%)
		Disordered. /evidence=ECO:0000256\|SAM:MobiDB-lite	576..597		20/20 (100%)
		II. /evidence=ECO:0000305	733..1005		268/271 (99%)
		Ion_trans	750..963	CDD:395416	209/212 (99%)
		Na_trans_assoc	989..1190	CDD:399489	198/200 (99%)
		Disordered. /evidence=ECO:0000256\|SAM:MobiDB-lite	1105..1146		40/40 (100%)
		III. /evidence=ECO:0000305	1178..1493		308/314 (98%)
		Ion_trans	1195..1471	CDD:395416	269/275 (98%)
		Na_channel_gate	1463..1515	CDD:240441	51/51 (100%)
		IV. /evidence=ECO:0000305	1502..1799		296/296 (100%)
		Ion_trans	1520..1774	CDD:395416	253/253 (100%)
		GPHH	1786..1833	CDD:407139	46/46 (100%)
		IQ	1892..1913	CDD:197470	20/20 (100%)
		Disordered. /evidence=ECO:0000256\|SAM:MobiDB-lite	1923..1978		52/54 (96%)

Information from Original Tools:

Tool	Simple Score	Weighted Score	Original Tool Information
Tool	Simple Score	Weighted Score	BLAST Result	Score	Score Type	Cluster ID
Compara	1	0.930	-	-		C83681967
Domainoid	1	1.000	590	1.000	Domainoid score	I5022
eggNOG	1	0.900	-	-		E1_KOG2301
HGNC	1	1.500	-	-
Hieranoid	1	1.000	-	-
Homologene	1	1.000	-	-		H7927
Inparanoid	1	1.050	3909	1.000	Inparanoid score	I240
NCBI	1	1.000	-	-
OMA	1	1.010	-	-		QHG52281
OrthoDB	1	1.010	-	-		D13170at7742
OrthoFinder	1	1.000	-	-		FOG0000268
OrthoInspector	1	1.000	-	-		oto132316
orthoMCL	1	0.900	-	-		OOG6_100419
Panther	1	1.100	-	-	LDO	PTHR10037
Phylome	1	0.910	-	-
SonicParanoid	1	1.000	-	-		X214
SwiftOrtho	1	1.000	-	-
TreeFam	0	0.000	Not matched by this tool.
	17	17.310