DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment JYalpha and SERCA

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_001104092.2 Gene:JYalpha / 5740846 FlyBaseID:FBgn0267363 Length:1009 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:NP_726381.1 Gene:SERCA / 49297 FlyBaseID:FBgn0263006 Length:1020 Species:Drosophila melanogaster


Alignment Length:1053 Identity:312/1053 - (29%)
Similarity:503/1053 - (47%) Gaps:143/1053 - (13%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly    31 DNHKIPVDELLERLKTDPNMGLSFVEAKLRLEINGPNILTPQPPTPKWIVFLKTMFGGF--AILL 93
            |.|...|::.|....|||..||:..:.|...:..|||.|..:.....|.:.|: .|...  .|||
  Fly     3 DGHSKTVEQSLNFFGTDPERGLTLDQIKANQKKYGPNELPTEEGKSIWQLVLE-QFDDLLVKILL 66

  Fly    94 WAGSFLCFVGYLIQLQTQHEPPDDNLYLGIALTVLVIVTGLFTYFQVHKSSSIMDSFKNLVPQYA 158
            .|    ..:.:::.|..:||.........:.:.:::|...:...:|...:.|.:::.|...|:..
  Fly    67 LA----AIISFVLALFEEHEETFTAFVEPLVILLILIANAVVGVWQERNAESAIEALKEYEPEMG 127

  Fly   159 TVIREGE--INTVTSDEIVKGDIVEVKFGDRVPADIRILEAHG--LKVDNSSLTGESEPQVRSTE 219
            .|:|:.:  |..|.:.|||.||:|||..||::||||||...:.  |::|.|.|||||...::.|:
  Fly   128 KVVRQDKSGIQKVRAKEIVPGDLVEVSVGDKIPADIRITHIYSTTLRIDQSILTGESVSVIKHTD 192

  Fly   220 FTHENPL---ETKNLAFFSTNVLEGTCRGVVIATGDSTVMGRIANLAAGLDDVQSPISREIQLFI 281
            ...:...   :.||:.|..|||..|..|||||.||.||.:|:|....:..:::::|:.:::..|.
  Fly   193 AIPDPRAVNQDKKNILFSGTNVAAGKARGVVIGTGLSTAIGKIRTEMSETEEIKTPLQQKLDEFG 257

  Fly   282 RFITIFAIILGLSFFAISL------TLGYEFIDAVVF----LIGIIVANVPEGLLVTVTVCLTLT 336
            ..::....::.::.:||::      ..|..:|...::    .:.:.||.:||||...:|.||.|.
  Fly   258 EQLSKVISVICVAVWAINIGHFNDPAHGGSWIKGAIYYFKIAVALAVAAIPEGLPAVITTCLALG 322

  Fly   337 AKRMASKNCLVKNLEAVETLGSTSTICSDKTGTLTQNRMTVAHLW-YDQI------IVESDTTES 394
            .:|||.||.:|::|.:|||||.||.||||||||||.|:|:|:.:: :|::      .:|.:.|.|
  Fly   323 TRRMAKKNAIVRSLPSVETLGCTSVICSDKTGTLTTNQMSVSRMFIFDKVEGNDSSFLEFEMTGS 387

  Fly   395 ---------FRGSHFKIED-KSFNALFMCAALCNSA-----EFKGGQDDIPVFKKDVNGNASEAA 444
                     ..|...|..| .:...|.....:||.:     |||...:.:        |.|:|.|
  Fly   388 TYEPIGEVFLNGQRIKAADYDTLQELSTICIMCNDSAIDYNEFKQAFEKV--------GEATETA 444

  Fly   445 LLKFTETI----------------FAGIGAFRQKHIKLTEIPFNSTEKYQVS------VHEFNSS 487
            |:...|.:                .|..|....|..|...:.|:...|...|      .....:.
  Fly   445 LIVLAEKLNSFSVNKSGLDRRSAAIACRGEIETKWKKEFTLEFSRDRKSMSSYCTPLKASRLGTG 509

  Fly   488 DGYFIVEMKGAPERILDRCSTIIIQGLSVELTPTLKLEFEEAYLEMGGMGE---RVLGFADLLLP 549
            ...|:   |||||.:|:||:...:....|.||..||.:. .|.....|.|.   |.|..|....|
  Fly   510 PKLFV---KGAPEGVLERCTHARVGTTKVPLTSALKAKI-LALTGQYGTGRDTLRCLALAVADSP 570

  Fly   550 MSKYPISYEFSADPPNFPLE-NLRFLGLISLIDPPRAAVPDAVAKCRSAGVRVIMVTGDHPITAK 613
            |.  |...:.......:..| ||.|:|::.::||||..|.|::.:||:||:|||::|||:..||:
  Fly   571 MK--PDEMDLGDSTKFYQYEVNLTFVGVVGMLDPPRKEVFDSIVRCRAAGIRVIVITGDNKATAE 633

  Fly   614 AIARSVGIITTPTAEDIAKQRGVTVLDIDSRQATAIVVHGGELREMKAEELDAVIYYHNEIVFAR 678
            ||.|.:|:.    |||              ...|.....|.|..::...|..|.:  ....:|:|
  Fly   634 AICRRIGVF----AED--------------EDTTGKSYSGREFDDLSPTEQKAAV--ARSRLFSR 678

  Fly   679 TSPQQKLIIVEACQRRGEIVAVTGDGVNDSPALKRADIGVAMGISGSDVSKQAADMILLDDNFAS 743
            ..||.|..|||..|...||.|:|||||||:||||:|:||:||| ||:.|:|.||:|:|.||||:|
  Fly   679 VEPQHKSKIVEFLQSMNEISAMTGDGVNDAPALKKAEIGIAMG-SGTAVAKSAAEMVLADDNFSS 742

  Fly   744 IVVGIEEGRIIFDNLKKSIAYTLTSNLPEIVPFLFFVIFDIPLALGTIAILCIDIGTDMLPAISL 808
            ||..:||||.|::|:|:.|.|.::||:.|:|.........:|.||..:.:|.:::.||.|||.:|
  Fly   743 IVSAVEEGRAIYNNMKQFIRYLISSNIGEVVSIFLTAALGLPEALIPVQLLWVNLVTDGLPATAL 807

  Fly   809 AYEKAESDIMARMPRDPFEDRLVNKKLILMAYLQIG------VIQTVACFFTFFAIMAEHGFPPS 867
            .:...:.|||.:.||.. ::.|::..| ...|:.||      .:...|.:|.|    ::.|...|
  Fly   808 GFNPPDLDIMEKPPRKA-DEGLISGWL-FFRYMAIGFYVGAATVGAAAWWFVF----SDEGPKLS 866

  Fly   868 RLKGIREDWD-SKNVEDLEDGYGQEWTYRERKVLEYTAGTGFFVSIVVT-QVFDLLICKTRRNSI 930
            .       |. :.::..|  |.|.|:...:.|:..........:|::|| ::.:.:...:...|:
  Fly   867 Y-------WQLTHHLSCL--GGGDEFKGVDCKIFSDPHAMTMALSVLVTIEMLNAMNSLSENQSL 922

  Fly   931 LQQG-------MGNHVLNFALVLEFIIACLLCYVPVFEKTLRMYSIKFIWWIYAFPFGLLIFFFD 988
            :...       :|:..|:|  .|.|:|    .||.|.....::..:....||....|.:.:...|
  Fly   923 ITMPPWCNLWLIGSMALSF--TLHFVI----LYVDVLSTVFQVTPLSAEEWITVMKFSIPVVLLD 981

  Fly   989 ESRRFLIRRNPGG 1001
            |:.:|:.|:...|
  Fly   982 ETLKFVARKIADG 994

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
JYalphaNP_001104092.2 P-type_ATPase_Na-K_like 51..1006 CDD:319794 305/1033 (30%)
SERCANP_726381.1 P-type_ATPase_SERCA 5..989 CDD:319778 309/1044 (30%)

Return to query results.
Submit another query.