DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment JYalpha and Atp4a

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_001104092.2 Gene:JYalpha / 5740846 FlyBaseID:FBgn0267363 Length:1009 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:NP_036641.1 Gene:Atp4a / 24216 RGDID:2177 Length:1034 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:1016 Identity:545/1016 - (53%)
Similarity:716/1016 - (70%) Gaps:10/1016 - (0%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly     1 MPPKKKNKEHKINGKEKKKDIQSFKKDVETDNHKIPVDELLERLKTDPNMGLSFVEAKLRLEI-- 63
            |..|...|:....|.:||:.:::.||::|.::|::.|.||.::.:|....||   :|.|..|:  
  Rat    22 MAAKMSKKKAGGGGGKKKEKLENMKKEMEMNDHQLSVSELEQKYQTSATKGL---KASLAAELLL 83

  Fly    64 -NGPNILTPQPPTPKWIVFLKTMFGGFAILLWAGSFLCFVGYLIQLQTQHEPPDDNLYLGIALTV 127
             :|||.|.|...||:::.|.:.:.||...|:|..:.:|.:.:.||........||||||.:||..
  Rat    84 RDGPNALRPPRGTPEYVKFARQLAGGLQCLMWVAAAICLIAFAIQASEGDLTTDDNLYLALALIA 148

  Fly   128 LVIVTGLFTYFQVHKSSSIMDSFKNLVPQYATVIREGEINTVTSDEIVKGDIVEVKFGDRVPADI 192
            :|:|||.|.|:|..||::|:.||||||||.|||||:|:...:.:|::|.||:||:|.||||||||
  Rat   149 VVVVTGCFGYYQEFKSTNIIASFKNLVPQQATVIRDGDKFQINADQLVVGDLVEMKGGDRVPADI 213

  Fly   193 RILEAHGLKVDNSSLTGESEPQVRSTEFTHENPLETKNLAFFSTNVLEGTCRGVVIATGDSTVMG 257
            |||.|.|.||||||||||||||.||.|.|||:||||:|:|||||..||||.:|:|::|||.|::|
  Rat   214 RILSAQGCKVDNSSLTGESEPQTRSPECTHESPLETRNIAFFSTMCLEGTAQGLVVSTGDRTIIG 278

  Fly   258 RIANLAAGLDDVQSPISREIQLFIRFITIFAIILGLSFFAISLTLGYEFIDAVVFLIGIIVANVP 322
            |||:||:|:::.::||:.||:.|:..|...||:.|.:||.:::.:||.|:.|:||.:.|:||.||
  Rat   279 RIASLASGVENEKTPIAIEIEHFVDIIAGLAILFGATFFVVAMCIGYTFLRAMVFFMAIVVAYVP 343

  Fly   323 EGLLVTVTVCLTLTAKRMASKNCLVKNLEAVETLGSTSTICSDKTGTLTQNRMTVAHLWYDQIIV 387
            ||||.||||||:|||||:|||||:||||||||||||||.||||||||||||||||:|||:|..|.
  Rat   344 EGLLATVTVCLSLTAKRLASKNCVVKNLEAVETLGSTSVICSDKTGTLTQNRMTVSHLWFDNHIH 408

  Fly   388 ESDTTESFRGSHFKIEDKSFNALFMCAALCNSAEFKGGQDDIPVFKKDVNGNASEAALLKFTETI 452
            .:||||...|..|....:::.||.....|||.|.||.|||.:||.|:.|.|:|||.|||||:|..
  Rat   409 TADTTEDQSGQTFDQSSETWRALCRVLTLCNRAAFKSGQDAVPVPKRIVIGDASETALLKFSELT 473

  Fly   453 FAGIGAFRQKHIKLTEIPFNSTEKYQVSVHEF-NSSDGYFIVEMKGAPERILDRCSTIIIQGLSV 516
            ......:|.:..|:.|||||||.|:|:|:|.. :..|...::.|||||||:|:|||:|:|:|..:
  Rat   474 LGNAMGYRDRFPKVCEIPFNSTNKFQLSIHTLEDPRDPRHLLVMKGAPERVLERCSSILIKGQEL 538

  Fly   517 ELTPTLKLEFEEAYLEMGGMGERVLGFADLLLPMSKYPISYEFSADPPNFPLENLRFLGLISLID 581
            .|....:..|:.|||.:||:|||||||..|.|....||..|.|..:..|||...|.|.||:|:||
  Rat   539 PLDEQWREAFQTAYLSLGGLGERVLGFCQLYLNEKDYPPGYTFDVEAMNFPSSGLCFAGLVSMID 603

  Fly   582 PPRAAVPDAVAKCRSAGVRVIMVTGDHPITAKAIARSVGIIT--TPTAEDIAKQRGVTVLDIDSR 644
            ||||.|||||.|||:||:|||||||||||||||||.|||||:  :.|.||||.:..:.|..::.:
  Rat   604 PPRATVPDAVLKCRTAGIRVIMVTGDHPITAKAIAASVGIISEGSETVEDIAARLRMPVDQVNKK 668

  Fly   645 QATAIVVHGGELREMKAEELDAVIYYHNEIVFARTSPQQKLIIVEACQRRGEIVAVTGDGVNDSP 709
            .|.|.|::|.:|::|...||...:..|.|:|||||||||||:|||:|||.|.|||||||||||||
  Rat   669 DARACVINGMQLKDMDPSELVEALRTHPEMVFARTSPQQKLVIVESCQRLGAIVAVTGDGVNDSP 733

  Fly   710 ALKRADIGVAMGISGSDVSKQAADMILLDDNFASIVVGIEEGRIIFDNLKKSIAYTLTSNLPEIV 774
            |||:|||||||||:|||.:|.|||||||||||||||.|:|:||:||||||||||||||.|:||:.
  Rat   734 ALKKADIGVAMGIAGSDAAKNAADMILLDDNFASIVTGVEQGRLIFDNLKKSIAYTLTKNIPELT 798

  Fly   775 PFLFFVIFDIPLALGTIAILCIDIGTDMLPAISLAYEKAESDIMARMPRDPFEDRLVNKKLILMA 839
            |:|.::...:||.||.|.||.|::.||:.|::||||||||||||...||:|..|||||:.|...:
  Rat   799 PYLIYITVSVPLPLGCITILFIELCTDIFPSVSLAYEKAESDIMHLRPRNPRRDRLVNEPLAAYS 863

  Fly   840 YLQIGVIQTVACFFTFFAIMAEHGFPPSRLKGIREDWDSKNVEDLEDGYGQEWTYRERKVLEYTA 904
            |.|||.||:.|.|..:|..||:.|:.|....|:|..|:..:::||:|.||||||:.:|...:||.
  Rat   864 YFQIGAIQSFAGFADYFTAMAQEGWFPLLCVGLRPQWEDHHLQDLQDSYGQEWTFGQRLYQQYTC 928

  Fly   905 GTGFFVSIVVTQVFDLLICKTRRNSILQQG-MGNHVLNFALVLEFIIACLLCYVPVFEKTLRMYS 968
            .|.||:||.:.|:.|:||.||||.|..||| ..|.:|..|:|.:..|.|.|||.|..........
  Rat   929 YTVFFISIEMCQIADVLIRKTRRLSAFQQGFFRNRILVIAIVFQVCIGCFLCYCPGMPNIFNFMP 993

  Fly   969 IKFIWWIYAFPFGLLIFFFDESRRFLIRRNPGGWVEQETYY 1009
            |:|.||:...|||||||.:||.|:..:|..||.|.:||.||
  Rat   994 IRFQWWLVPMPFGLLIFVYDEIRKLGVRCCPGSWWDQELYY 1034

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
JYalphaNP_001104092.2 P-type_ATPase_Na-K_like 51..1006 CDD:319794 527/961 (55%)
Atp4aNP_036641.1 H-K_ATPase_N 2..>27 CDD:312544 2/4 (50%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 15..40 5/17 (29%)
ATPase-IIC_X-K 42..1034 CDD:273445 537/994 (54%)

Return to query results.
Submit another query.