DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment JYalpha and Atp12a

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_001104092.2 Gene:JYalpha / 5740846 FlyBaseID:FBgn0267363 Length:1009 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:NP_619593.2 Gene:Atp12a / 192113 MGIID:1926943 Length:1035 Species:Mus musculus


Alignment Length:1015 Identity:549/1015 - (54%)
Similarity:732/1015 - (72%) Gaps:11/1015 - (1%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly     4 KKKNKEHKINGKEK-----KKDIQSFKKDVETDNHKIPVDELLERLKTDPNMGLSFVEAKLRLEI 63
            :|.:|:.| .||.|     |...:..||:::.|:|::...:|.::..|:...|||.:.|...|..
Mouse    23 QKDDKKFK-GGKNKDSEPNKSQEEELKKELDLDDHRLSNTDLEQKYGTNIIQGLSSIRAAELLAR 86

  Fly    64 NGPNILTPQPPTPKWIVFLKTMFGGFAILLWAGSFLCFVGYLIQLQTQHEPPDDNLYLGIALTVL 128
            :|||.|||...||:.|.|||.|.|||:||||.|:.||::.|:|| ........||:|||..|.::
Mouse    87 DGPNALTPPKQTPEIIKFLKQMVGGFSILLWIGAALCWIAYVIQ-YVSSTASLDNVYLGAILVLV 150

  Fly   129 VIVTGLFTYFQVHKSSSIMDSFKNLVPQYATVIREGEINTVTSDEIVKGDIVEVKFGDRVPADIR 193
            ||:||:|.|:|..||::||.||..::||.|.|||:.|...:.::::|.||:||:|.||::|||||
Mouse   151 VILTGIFAYYQEAKSTNIMASFSKMIPQQALVIRDAEKKIIPAEQLVVGDVVEIKGGDQIPADIR 215

  Fly   194 ILEAHGLKVDNSSLTGESEPQVRSTEFTHENPLETKNLAFFSTNVLEGTCRGVVIATGDSTVMGR 258
            ::.:.|.||||||||||||||.|||||||||||||||:.|:||..||||..|:||.|||.|::||
Mouse   216 LVFSQGCKVDNSSLTGESEPQARSTEFTHENPLETKNIGFYSTTCLEGTATGIVINTGDRTIIGR 280

  Fly   259 IANLAAGLDDVQSPISREIQLFIRFITIFAIILGLSFFAISLTLGYEFIDAVVFLIGIIVANVPE 323
            ||:||:|:...::||:.||:.|:..:...|:.:|:.||..::.:.|..:||::|||.||||||||
Mouse   281 IASLASGVGSEKTPIAIEIEHFVHIVAAVAVSVGVIFFITAVCMKYYVLDAIIFLISIIVANVPE 345

  Fly   324 GLLVTVTVCLTLTAKRMASKNCLVKNLEAVETLGSTSTICSDKTGTLTQNRMTVAHLWYDQIIVE 388
            |||.||||.|:|||||||.||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||:|..|..
Mouse   346 GLLATVTVTLSLTAKRMAKKNCLVKNLEAVETLGSTSIICSDKTGTLTQNRMTVAHLWFDNQIFV 410

  Fly   389 SDTTESFRGSHFKIEDKSFNALFMCAALCNSAEFKGGQDDIPVFKKDVNGNASEAALLKFTETIF 453
            :||:|:.....|.....::.:|.....|||.|||:.||:.:|:.|:.|.|:|||.|||||:|.|.
Mouse   411 ADTSENQTKQAFDQSSGTWASLSKIITLCNRAEFRPGQESVPIMKRVVVGDASETALLKFSEVIL 475

  Fly   454 AGIGAFRQKHIKLTEIPFNSTEKYQVSVHEF-NSSDGYFIVEMKGAPERILDRCSTIIIQGLSVE 517
            ..:...|:::.|:.|||||||.|:|:|:||. :.:|..|::.|||||||||::||||:|.|....
Mouse   476 GDVMDIRKRNHKVAEIPFNSTNKFQLSIHETEDPNDKRFLMVMKGAPERILEKCSTIMINGQEQP 540

  Fly   518 LTPTLKLEFEEAYLEMGGMGERVLGFADLLLPMSKYPISYEFSADPPNFPLENLRFLGLISLIDP 582
            |..:....|..||:|:||:|||||||..|.||..|:|.||.|..|..|||..||.|:||:|:|||
Mouse   541 LDKSSADAFHTAYMELGGLGERVLGFCHLYLPADKFPQSYTFDVDSINFPTSNLCFVGLLSMIDP 605

  Fly   583 PRAAVPDAVAKCRSAGVRVIMVTGDHPITAKAIARSVGIIT--TPTAEDIAKQRGVTVLDIDSRQ 645
            ||:.|||||:||||||::||||||||||||||||:|||||:  ..|.|||||:|.:.|..::.|:
Mouse   606 PRSTVPDAVSKCRSAGIKVIMVTGDHPITAKAIAKSVGIISANNETVEDIAKRRNIAVEQVNKRE 670

  Fly   646 ATAIVVHGGELREMKAEELDAVIYYHNEIVFARTSPQQKLIIVEACQRRGEIVAVTGDGVNDSPA 710
            |.|.||.|.||::|..|:||.::..:.|||||||||||||||||.|||:..:|||||||||||||
Mouse   671 AKAAVVTGMELKDMTPEQLDELLINYQEIVFARTSPQQKLIIVEGCQRQDAVVAVTGDGVNDSPA 735

  Fly   711 LKRADIGVAMGISGSDVSKQAADMILLDDNFASIVVGIEEGRIIFDNLKKSIAYTLTSNLPEIVP 775
            ||:||||:||||:|||.:|.||||:||||||||||.|:||||:|||||||:||||||.|:.|:.|
Mouse   736 LKKADIGIAMGIAGSDAAKNAADMVLLDDNFASIVTGVEEGRLIFDNLKKTIAYTLTKNIAELCP 800

  Fly   776 FLFFVIFDIPLALGTIAILCIDIGTDMLPAISLAYEKAESDIMARMPRDPFEDRLVNKKLILMAY 840
            ||.:::..:||.:|||.||.||:|||::|:|:|||||||||||.|.||...:||||||:|.:.:|
Mouse   801 FLIYIVAGLPLPIGTITILFIDLGTDIIPSIALAYEKAESDIMNRKPRHKKKDRLVNKQLAIYSY 865

  Fly   841 LQIGVIQTVACFFTFFAIMAEHGFPPSRLKGIREDWDSKNVEDLEDGYGQEWTYRERKVLEYTAG 905
            |.||::|.:..|..:|.:.|:.||.|:.|..:|..|::.::.||||.||||||..:||.||:|..
Mouse   866 LHIGLMQALGGFLVYFTVYAQQGFWPTSLINLRVSWETDDINDLEDSYGQEWTRYQRKYLEWTGS 930

  Fly   906 TGFFVSIVVTQVFDLLICKTRRNSILQQGM-GNHVLNFALVLEFIIACLLCYVPVFEKTLRMYSI 969
            |.|||:|:|.|:.||:|.|||||||.|||: .|.|:...::.:.|:|.:|.|.......|....:
Mouse   931 TAFFVAIMVQQIADLIIRKTRRNSIFQQGLFRNKVIWVGIISQIIVALVLSYGLGSVTALSFTML 995

  Fly   970 KFIWWIYAFPFGLLIFFFDESRRFLIRRNPGGWVEQETYY 1009
            :..:|..|.|..:||:.:||.|:..||..||.|.::..||
Mouse   996 RAQYWFVAVPHAILIWVYDEMRKLFIRLYPGSWWDKNMYY 1035

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
JYalphaNP_001104092.2 P-type_ATPase_Na-K_like 51..1006 CDD:319794 534/958 (56%)
Atp12aNP_619593.2 Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 22..49 7/26 (27%)
ATPase-IIC_X-K 40..1035 CDD:273445 541/995 (54%)

Return to query results.
Submit another query.