DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment JYalpha and atp4a

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_001104092.2 Gene:JYalpha / 5740846 FlyBaseID:FBgn0267363 Length:1009 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:XP_031762229.1 Gene:atp4a / 100488221 XenbaseID:XB-GENE-486104 Length:1031 Species:Xenopus tropicalis


Alignment Length:1010 Identity:540/1010 - (53%)
Similarity:724/1010 - (71%) Gaps:9/1010 - (0%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly     4 KKKNKEHKINGKEKKKDIQSFKKDVETDNHKIPVDELLERLKTDPNMGLSFVEAKLRLEINGPNI 68
            |||:|     |.:|::.::|.||:::.::|:|.::||.::..|:...|:....|...|..:|||.
 Frog    27 KKKSK-----GSKKQEKLESMKKEMDINDHEITIEELEQKYNTNVTKGMKATFAAEILIRDGPNE 86

  Fly    69 LTPQPPTPKWIVFLKTMFGGFAILLWAGSFLCFVGYLIQLQTQHEPPDDNLYLGIALTVLVIVTG 133
            |.|...||:::.|.:.:.||...|:|..:.:|.:.:.|:.........|||||.|.|..:|:|||
 Frog    87 LKPPKGTPEYVKFARQLAGGLQCLMWVAAVICLIAFGIECAQGDLTSADNLYLAITLIAVVVVTG 151

  Fly   134 LFTYFQVHKSSSIMDSFKNLVPQYATVIREGEINTVTSDEIVKGDIVEVKFGDRVPADIRILEAH 198
            .|.|:|..||::|:.||||||||.|||:|:||...:.::::|.||:||:|.||||||||||:.:.
 Frog   152 CFGYYQEFKSTNIIASFKNLVPQQATVLRDGEKFQINANQLVVGDLVEIKGGDRVPADIRIITSQ 216

  Fly   199 GLKVDNSSLTGESEPQVRSTEFTHENPLETKNLAFFSTNVLEGTCRGVVIATGDSTVMGRIANLA 263
            |.||||||||||||||.||.|:|||:||||:|:|||||..||||..||:|.|||.|::||||:||
 Frog   217 GCKVDNSSLTGESEPQTRSPEYTHESPLETRNIAFFSTMCLEGTATGVIINTGDRTIIGRIASLA 281

  Fly   264 AGLDDVQSPISREIQLFIRFITIFAIILGLSFFAISLTLGYEFIDAVVFLIGIIVANVPEGLLVT 328
            :|:.:.::||:.||:.|:..|...||..|.:||.:::.:||.|:.|:||.:.|:||.||||||.|
 Frog   282 SGVGNEKTPIAIEIEHFVDIIAGLAIFFGATFFVVAMVIGYPFLRAMVFFMAIVVAYVPEGLLAT 346

  Fly   329 VTVCLTLTAKRMASKNCLVKNLEAVETLGSTSTICSDKTGTLTQNRMTVAHLWYDQIIVESDTTE 393
            |||||:|||||:|.|||:||||||||||||||.||||||||||||||||:|||:|..|..:||||
 Frog   347 VTVCLSLTAKRLARKNCVVKNLEAVETLGSTSVICSDKTGTLTQNRMTVSHLWFDNQIHSADTTE 411

  Fly   394 SFRGSHFKIEDKSFNALFMCAALCNSAEFKGGQDDIPVFKKDVNGNASEAALLKFTETIFAGIGA 458
            ...|..|.....::.||....:|||.|.||.|||.:|:.|:.|.|:|||.|||||:|.....:..
 Frog   412 DQSGQSFDQTSDTWRALSKVTSLCNRACFKSGQDGVPIPKRIVIGDASETALLKFSELTVGNVME 476

  Fly   459 FRQKHIKLTEIPFNSTEKYQVSVHEFNSS-DGYFIVEMKGAPERILDRCSTIIIQGLSVELTPTL 522
            :|.:..|.||:|||||.|:|:|:||.... |..:::.|||||||||:|||||:|:|..:.|....
 Frog   477 YRDRFKKATELPFNSTNKFQLSIHELQDPLDLRYLLVMKGAPERILERCSTIMIKGQELPLDEQW 541

  Fly   523 KLEFEEAYLEMGGMGERVLGFADLLLPMSKYPISYEFSADPPNFPLENLRFLGLISLIDPPRAAV 587
            |..|:.||:::||:|||||||..|.|...:||..:.|..:..|||...|.|.||||:||||||.|
 Frog   542 KEAFQTAYMDLGGLGERVLGFCHLYLNEKEYPRGFSFDTEEMNFPTSGLCFAGLISMIDPPRATV 606

  Fly   588 PDAVAKCRSAGVRVIMVTGDHPITAKAIARSVGIIT--TPTAEDIAKQRGVTVLDIDSRQATAIV 650
            ||||.|||:||:|||||||||||||||||.|||||:  :.|.||||.:..:.|..::.|.|.|.|
 Frog   607 PDAVMKCRTAGIRVIMVTGDHPITAKAIAASVGIISEGSETVEDIAARLRIPVEQVNKRDARACV 671

  Fly   651 VHGGELREMKAEELDAVIYYHNEIVFARTSPQQKLIIVEACQRRGEIVAVTGDGVNDSPALKRAD 715
            ::||:|::|.:|||...:..|.|:|||||||||||||||:||:.|.||||||||||||||||:||
 Frog   672 INGGQLKDMTSEELVEALKLHPEMVFARTSPQQKLIIVESCQKLGAIVAVTGDGVNDSPALKKAD 736

  Fly   716 IGVAMGISGSDVSKQAADMILLDDNFASIVVGIEEGRIIFDNLKKSIAYTLTSNLPEIVPFLFFV 780
            |||||||:|||.:|.|||||||||||||||.|:|:||:||||||||||||||.|:||:.|:|.::
 Frog   737 IGVAMGIAGSDAAKNAADMILLDDNFASIVTGVEQGRLIFDNLKKSIAYTLTKNIPELAPYLIYI 801

  Fly   781 IFDIPLALGTIAILCIDIGTDMLPAISLAYEKAESDIMARMPRDPFEDRLVNKKLILMAYLQIGV 845
            ...:||.||.|.||.|::.||:.|::|||||:||||||...||:|..|||||:.|.:.:|.|:|:
 Frog   802 TASVPLPLGCITILFIELCTDIFPSVSLAYERAESDIMHLKPRNPRRDRLVNEALAVYSYFQVGI 866

  Fly   846 IQTVACFFTFFAIMAEHGFPPSRLKGIREDWDSKNVEDLEDGYGQEWTYRERKVLEYTAGTGFFV 910
            ||:.|.|..:|.:||:.|:.|:.:.|:|..|::::::||||.|||:||:.:|...:|...|.||:
 Frog   867 IQSFAGFVDYFTVMAQEGWFPAYVLGLRSHWENQHLQDLEDSYGQQWTFSQRLYQQYNCYTVFFI 931

  Fly   911 SIVVTQVFDLLICKTRRNSILQQG-MGNHVLNFALVLEFIIACLLCYVPVFEKTLRMYSIKFIWW 974
            ||.|.|:.|:||.||||.|:.||| ..|.||..|:|.:..:...|||.|..........|:|.||
 Frog   932 SIEVCQIADVLIRKTRRLSVFQQGFFRNKVLVIAIVFQLCLGNFLCYCPGMPNVFNFMPIRFQWW 996

  Fly   975 IYAFPFGLLIFFFDESRRFLIRRNPGGWVEQETYY 1009
            :...|||:|||.:||.|:..:|||||.|.::|.||
 Frog   997 LVPVPFGILIFVYDEIRKLGVRRNPGSWYDKELYY 1031

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
JYalphaNP_001104092.2 P-type_ATPase_Na-K_like 51..1006 CDD:319794 523/958 (55%)
atp4aXP_031762229.1 ATPase-IIC_X-K 39..1031 CDD:273445 532/991 (54%)

Return to query results.
Submit another query.