DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment inaF-A and inaF-B

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_001096960.1 Gene:inaF-A / 5740676 FlyBaseID:FBgn0085351 Length:89 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:NP_001162726.1 Gene:inaF-B / 8674114 FlyBaseID:FBgn0259918 Length:81 Species:Drosophila melanogaster


Alignment Length:684 Identity:684/684 - (100%)
Similarity:684/684 - (100%) Gaps:0/684 - (0%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly     1 MSDGTCPPINIRRCSCTSDGLSPKKSLTSPIWDRRPSKILDENHLPKQLLVQHHHEDGAFLRNIS 65
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Fly    30 MSDGTCPPINIRRCSCTSDGLSPKKSLTSPIWDRRPSKILDENHLPKQLLVQHHHEDGAFLRNIS 94

  Fly    66 ATELVLEVQETAGTQQIGAPSALPESRVLVLYTGGTIGMKTTDGVYCPVPGYLPEVLRDIPPLND 130
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Fly    95 ATELVLEVQETAGTQQIGAPSALPESRVLVLYTGGTIGMKTTDGVYCPVPGYLPEVLRDIPPLND 159

  Fly   131 RRYIEESYSNVAVRPYSLPPVRNMKKRVVYWIVEYEPLLDSCDMTFDDWIRIATDIKKAYHKYDG 195
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Fly   160 RRYIEESYSNVAVRPYSLPPVRNMKKRVVYWIVEYEPLLDSCDMTFDDWIRIATDIKKAYHKYDG 224

  Fly   196 FVVLHGTDTLAYTASALSFMMENLGKPVIITGSQIPVAEVRSDGMENLIGALITAGNFDIPEVCV 260
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Fly   225 FVVLHGTDTLAYTASALSFMMENLGKPVIITGSQIPVAEVRSDGMENLIGALITAGNFDIPEVCV 289

  Fly   261 YFNNKLMRGNRTVKLDNSALEAFDSPNMHPLAQMAINIKVNYDSIFRSDMVAAFTVHENLCRDVG 325
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Fly   290 YFNNKLMRGNRTVKLDNSALEAFDSPNMHPLAQMAINIKVNYDSIFRSDMVAAFTVHENLCRDVG 354

  Fly   326 MLRIFPSMTIESVRAFLQPPTRGCILQTFGSGNMPTRRQDIIMALKEAIARGVMVVNCSQCLKGQ 390
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Fly   355 MLRIFPSMTIESVRAFLQPPTRGCILQTFGSGNMPTRRQDIIMALKEAIARGVMVVNCSQCLKGQ 419

  Fly   391 VDVNYATGKILYDIGVIPGSDMTSEAAMAKLCYVLGKDEWDLPMKRSMLQSNLRGEMTIASKGAM 455
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Fly   420 VDVNYATGKILYDIGVIPGSDMTSEAAMAKLCYVLGKDEWDLPMKRSMLQSNLRGEMTIASKGAM 484

  Fly   456 RELDIIPHIAKCLRVSSSQEVQLLRDIILPPMFCNAAKTNDVEILKSLKAAGVNFSATDYNLRTA 520
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Fly   485 RELDIIPHIAKCLRVSSSQEVQLLRDIILPPMFCNAAKTNDVEILKSLKAAGVNFSATDYNLRTA 549

  Fly   521 LHVAASNGHLESVNYLLKIGTNVHIKDMFGYNALVCAVKAKAMDCIIAIRDAGGFIDASAQKIGV 585
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Fly   550 LHVAASNGHLESVNYLLKIGTNVHIKDMFGYNALVCAVKAKAMDCIIAIRDAGGFIDASAQKIGV 614

  Fly   586 ELCLAVYQNDMELLKCNEAAGTHMGEKDYDNRTALHVAASLNKPEIVAYLLQCGLNPHEKDDFGI 650
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Fly   615 ELCLAVYQNDMELLKCNEAAGTHMGEKDYDNRTALHVAASLNKPEIVAYLLQCGLNPHEKDDFGI 679

  Fly   651 TPMDEAKRRNLQNLMDMMAEHQALTNNDEVFHLE 684
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Fly   680 TPMDEAKRRNLQNLMDMMAEHQALTNNDEVFHLE 713

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
inaF-ANP_001096960.1 InaF-motif 32..66 CDD:464449 33/33 (100%)
inaF-BNP_001162726.1 InaF-motif 34..68 CDD:464449 33/33 (100%)

Return to query results.
Submit another query.