DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment c11.1 and Mroh1

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_652606.1 Gene:c11.1 / 53436 FlyBaseID:FBgn0040236 Length:1742 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:NP_001419052.1 Gene:Mroh1 / 100125385 RGDID:1642414 Length:1640 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:1812 Identity:418/1812 - (23%)
Similarity:759/1812 - (41%) Gaps:323/1812 - (17%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly    58 IFDGLMDKEEQVRIAMQQAIVKILETHPERAAEILSEHRSQQPKMTDQTVAMLLDCIRRVVGAET 122
            :.|.:.||:..|:..:..|:..:.|..|:.......|:..|..|:.......:|..:..::.:..
  Rat    13 LLDSITDKDPMVQEQVCSALCSLGEAQPDETLRACEEYLRQHDKLAHPYRTKILRAMETILSSHI 77

  Fly   123 -PLPPAANQKLIDLALQELTKNPEHLPLIQNPAQRILVAIG-RSSPESCEQVMEALQEKGTSTEG 185
             .|.......:|.||..|:|:..|.....|..|..:|||:| |.:.:..|:|:...|      .|
  Rat    78 HDLDKDTASAVILLASSEMTRTKELDCDWQQAASSVLVAVGKRFTNQVMEEVLNRFQ------PG 136

  Fly   186 -VAHFMLMQCLGLLATENPAGVVPHIKAILSRSQPHLVGIRQDHIKQAHAYAIGRFSEALLEESG 249
             :.|..::..|..|:..|...:||.:.:|||...|.|...:||.:|.....|:..|||::||...
  Rat   137 MLPHSSVLHTLANLSMSNAFDMVPFLPSILSTMLPMLGMAKQDALKVVFCCALQHFSESILEYLA 201

  Fly   250 KKEE--------ENCSTEISVAYDVLFNQWLHSREPKVCVEILQALSSMYPLLPKDRIQDQAARL 306
            ..::        :....:|..|||.||:.||.||:.|:.:.::.||..|..|||.:|:::|..:|
  Rat   202 NLDQAPDPTVRKDTFGADIFGAYDFLFHHWLQSRDAKLRLAVVAALGPMSHLLPSERLEEQLPKL 266

  Fly   307 VPQILALYRRSVDRNAVTQFLCSVLKTNLALNATVLDGIIDVLVTHLFDLVCVYPDYEKPQTVKG 371
            :|.:|.||::..:...:::.|..:|:..:.:::..|:..::.|:..|...:||..:...|..:..
  Rat   267 LPAVLGLYKKHAETFQISKSLGQILEAAVNVSSRTLEVQLEALLVALHSQICVPVESSSPLVMNS 331

  Fly   372 HYEVLRCFHLLAGHQPYSTRIMDTLLIHLRNNSERERMKSLLILTHLLNSCAGNIENRIPATIEC 436
            ..||||||.:||...|  .|::..||..|..|:||.|:.:|.||.|::||.|..:|.:.|..:..
  Rat   332 QKEVLRCFTVLACCSP--DRLLAFLLPRLDTNNERLRVGTLQILRHIVNSAAAQMEIKKPFILSS 394

  Fly   437 LKQLILSERGIKMKLTLLKTIVALAQKSHIRD---KEFVWFVVRHSCRFSKPSQEHGSQEEH--A 496
            :: |.|.:...|:|..:::.|.|:|...::..   :..|.::|:.....::..|:.|...|.  |
  Rat   395 MR-LPLLDTNDKVKRAVVQVISAMAHHGYLEQPGGEVMVEYIVQQCALPAEEPQKPGPDGEDLAA 458

  Fly   497 NLVLSCE-NTLYMLASTVGTLDELLKRELLNYLILLDYTDICGNLAKCLASLFAKSPHIEYDIAG 560
            :.|.:.. .|||::::||..::.:|...||.:|..:.:|.....|.:.|..|..|...       
  Rat   459 DSVRAVSIRTLYLVSTTVDRMNSVLWPYLLEFLTPVRFTGALTPLCRSLVHLALKRQE------- 516

  Fly   561 DDAATEQATPESMGAAGEDRSVIK-RGKVMVPGAETIYARCLALLGNQQC-IKRCSNILSFLRYY 623
                           ||.|..:|: .....:|....:..|.|.:..|... ..|.:..|..|:..
  Rat   517 ---------------AGADDFLIQYNANANLPSPFALTTRLLVVSSNPYLGDGRGAASLRLLKVM 566

  Fly   624 HPQVNPALEELWERKIPDLLLQINRESAYRQLLHDFVLETNEFLGGLDENFAQRLASKLADQMYL 688
            |..::|.|.:.||..:|.||          :.|.:...||...     :.:.::|...|.|.:  
  Rat   567 HQNIHPLLGQRWETTMPVLL----------EYLDEHTEETLSL-----KEWEEKLLVFLRDTL-- 614

  Fly   689 YPMQLPHSEW----------HLPDLSA---ERGMLLQAVALTLLQVTDVACIHTKIDLIVTTAR- 739
              :.:..:.|          .||..|.   |:..|.:.:..||...:....:...:..::.||| 
  Rat   615 --IMVSDNVWICQLSQEMCKQLPSYSGTPQEKNFLYKCIGTTLGAASSKEVVRKHLRELLETARY 677

  Fly   740 QERLDKHVKHADYEKRIEPCARALGYISRQHLGHLIKKLTELAQVGGRKHSTGFFSNLHFIKD-T 803
            ||..:|           |..|...|..:..||...:.:|.:..:....:.||..||   ..|| :
  Rat   678 QEETEK-----------EGLACCFGICAITHLEDTLAQLEDFVRSDVFRKSTSIFS---IFKDRS 728

  Fly   804 HKELENYKSNLLVVKAFGRIMDEADPLQSIQHLDEDDTL-----------LGFLIQQLAVHKDQT 857
            ..|:|..||:|::  .:|.:..:| |.:.:....|.|.|           ||..::.    ||..
  Rat   729 EHEVEKLKSSLIL--CYGHVAAQA-PRELMLAKVESDILRSIFQCFNTKVLGIKVET----KDPA 786

  Fly   858 IMSAILQTLL----SICN-------------QLIA---------TKEQLPAPLRHRKQIMETVFN 896
            :...::|:|.    ::|:             :|:|         .::.|..|:| :|.::...:.
  Rat   787 LKLCLVQSLCMVSQAMCSGAQASSFHFSRKAELVAQMMEFIRAEPQDYLRTPIR-KKAMLACTYL 850

  Fly   897 IPIE-------------APFHDLPLLPTILKLGTDFIRIGGPDTEECVDGGVIFEIACRNFFGCA 948
            :.:|             :..|.:..||.            ||:.|:.|               |.
  Rat   851 VTLEPALEEQTQADVIHSCLHSVMALPP------------GPEGEDGV---------------CQ 888

  Fly   949 QQLKMKFDSQEEDERNSFLAKHLNESLPQLNALVRAIVELDASPATLDLIIGILEGWTRDRNSEV 1013
            :.|.:                   :::..|..|:.:::..:.:|..|.:::..|..|.:......
  Rat   889 ESLYL-------------------DTVCALEDLLTSLLRQNMTPQGLQIMVEHLSPWIKSPRGHE 934

  Fly  1014 RICASHVFNNTLDVYIKSMKIGCEAPSKFNQTGQMLGKIVPRCIDSNGTVRQVSVEILQKTLEIA 1078
            |..|..:....|..:::.:::....|  |:..|.::|...|||.|:..|.||.:|         .
  Rat   935 RARALGLGACLLQFFLEHLQVSTLVP--FHNLGLLVGLFAPRCADTWTTTRQEAV---------G 988

  Fly  1079 CIYETLTIA------SIDSTADWLKEIETIKEHIITDEPKQIYNLAGDIAKIIALRISSFQYLQF 1137
            |:|..|.:.      |.|...|..:.:.|:|:.::..:|..:::....||::||.|:.|.|.:..
  Rat   989 CVYSLLYLQLGYEGFSRDHRDDVAERLLTLKDGLVHADPTILFHTCHSIAQVIAKRLPSDQLISL 1053

  Fly  1138 CKTLLHSLRDPEQSSTIGASVVLKFFIQQKGSELFHAIPDLVRDSLLALRVCEVPRAKSGVLKAL 1202
            ..|:..||.||:::.:..|:|::...::::|:.|...:|::|......||..:..........::
  Rat  1054 LLTMFESLGDPDKNCSRAATVMINCLLKERGNVLLEKVPEIVSVLRAKLRDTQEEHVLPAAQHSV 1118

  Fly  1203 VALTKHHPKLVCAEMLSQPLPYDPNLVEYWHLVCNDPELTGLTLDNFLQLLSGASLQEGGQDASL 1267
            ..|...|.:.|.:.:|..|||:|.:....|..:..:|.||...|:..|:.:|        :|...
  Rat  1119 YLLASQHCEAVVSSLLGSPLPFDSHTCALWRALAVEPSLTAQVLELLLEKMS--------KDVPF 1175

  Fly  1268 SERQ---------KLASGQPFAIFCALHEMLPCKDIKGQLETRFADMFCMLLTSLSSYTNLAAPN 1323
            .|.:         ::|:..|.|..|||:|:|........:...:..:|..||..:|....:..|.
  Rat  1176 KESRAFLLGSTADRVATLLPLAATCALNEVLSAPSSGTVVLELYPQLFVALLLRVSCTVGVQLPR 1240

  Fly  1324 PINNASLSPNQTQSGKTKFGFVPNKELIKLNPCQIALETFQAFLTNLEMEQIASVLTVNTQLASS 1388
                 :|...:.:|....      |....|:||..|::..||.|.....:.:...:.:      .
  Rat  1241 -----NLQAKERKSTSLA------KAARNLDPCSSAVDALQALLLRSGSQDVLRCVEL------E 1288

  Fly  1389 ADWHNYIELLTPMAIGLGQQLQLGSPQMRQLVNSLSKYVA---------------SPYDGQRVAA 1438
            ..|    |||...|   |.:     ..:.||.:|::||..               |.|:.|||.:
  Rat  1289 GGW----ELLRTSA---GHE-----DGVAQLASSMAKYAGPRLPLVMKALGCTQNSVYEIQRVTS 1341

  Fly  1439 VGIFSRLVPLKPTGE--LAASILLHLGAALSDPNAVVRGLSIQGMGYVGQLGEKEAKRYSETAIG 1501
            ....:.|:......:  |...:|.:|.|.|.|.:|.||.|.::|:..:......:.:.:....:.
  Rat  1342 TAFLAELLSSNVVNDLMLLEPLLDNLTARLKDSSASVRRLVLRGLANMASGSPDKVQAHGPQLMT 1406

  Fly  1502 ALLKGVDDPVGD---CLINIPLESMRGLSGILRALPSERVEPFHVSL-----AIRIRPFLGNYAL 1558
            |::.|:||  ||   .|  :.||:|.|||.:|     :.|||:.:.|     .||||||..:..:
  Rat  1407 AMVSGLDD--GDEPHSL--VALEAMVGLSRLL-----DLVEPWDLRLVLLHTTIRIRPFFDSEKV 1462

  Fly  1559 EMREAAIQLFGDI---CEGKHDDGSSSPTSSMEALREQLIANLFPLLLHLSESEVAIASACRGTL 1620
            |.|.|:|:|||.:   |.|:.:|          ...||::..|.||||||.:.:|.:||||:..|
  Rat  1463 EFRTASIRLFGHLNKACPGECED----------VFLEQVVGGLVPLLLHLRDPQVPVASACKFAL 1517

  Fly  1621 QRVCRLLTAPRVVEMAE---QQLGEERGHQLNYSSFVLEFVKTIALELTDHIQDFIDSCLPQLRS 1682
               |..:......|:|.   :.|.|  |..:::..|:....|.:.....|.:...:.:.|...:|
  Rat  1518 ---CMCVPHLECAELAAAFYKYLQE--GRSVHFGEFLNSTCKHLMHHFPDLLGRLVSTNLFYFKS 1577

  Fly  1683 QWPEVRGSAAIVIG--ILHNFLSER-NVQTETVASKIAVLLKDEQALVRMRAATALG 1736
            .|.:||.:|.:..|  :||....:| .|..|.:...:.:||||....||.:||..||
  Rat  1578 SWDDVRAAAPMFTGFLVLHAEPEQRTQVDLEQLIVALQLLLKDPVPGVREKAAETLG 1634

Return to query results.
Submit another query.