DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment Atpalpha and atp1a1a.3

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_732572.1 Gene:Atpalpha / 48971 FlyBaseID:FBgn0002921 Length:1041 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:NP_571763.1 Gene:atp1a1a.3 / 64614 ZFINID:ZDB-GENE-001212-3 Length:1024 Species:Danio rerio


Alignment Length:1029 Identity:744/1029 - (72%)
Similarity:878/1029 - (85%) Gaps:12/1029 - (1%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly    13 DSYRVATVIATDDDNRTADGQYKSRRKMPAKVNKKENLDDLKQELDIDFHKISPEELYQRFQTHP 77
            |.|::|   ||.:     ||..|.::   .|.|||: :|:||:|:::|.||::.|||.:::.|..
Zfish     8 DEYKLA---ATSE-----DGVKKPKK---GKKNKKD-MDELKKEVEMDDHKLTLEELSRKYGTDL 60

  Fly    78 ENGLSHAKAKENLERDGPNALTPPKQTPEWVKFCKNLFGGFAMLLWIGAILCFVAYSIQASTSEE 142
            ..|||..:|||.|.||||||||||..||||||||:.|||||..||||||:|||.||||||::.||
Zfish    61 NKGLSITRAKEILARDGPNALTPPVTTPEWVKFCRQLFGGFQTLLWIGALLCFFAYSIQAASEEE 125

  Fly   143 PADDNLYLGIVLSAVVIVTGIFSYYQESKSSKIMESFKNMVPQFATVIREGEKLTLRAEDLVLGD 207
            ||:||||||:||:.||.|.|.||||||:|||:||:||:|:|||.|.|:|||||..:.|||:|:||
Zfish   126 PANDNLYLGLVLAFVVTVNGCFSYYQEAKSSRIMDSFRNLVPQKALVVREGEKSVIDAEDVVVGD 190

  Fly   208 VVEVKFGDRIPADIRIIEARNFKVDNSSLTGESEPQSRGAEFTHENPLETKNLAFFSTNAVEGTA 272
            :||||.||||||||||:.::..||||||||||||||:|..|.:.:|||||:|:||||||.|:|.|
Zfish   191 LVEVKGGDRIPADIRIVSSQGCKVDNSSLTGESEPQTRAPEMSSDNPLETRNIAFFSTNCVDGAA 255

  Fly   273 KGVVISCGDHTVMGRIAGLASGLDTGETPIAKEIHHFIHLITGVAVFLGVTFFVIAFILGYHWLD 337
            :|||::.||.|||||||.|||.|:.|:||||:||.||||:|||||||||:||.|::.||||:||:
Zfish   256 RGVVVNTGDRTVMGRIASLASSLEGGQTPIAREIEHFIHIITGVAVFLGLTFLVLSLILGYNWLE 320

  Fly   338 AVIFLIGIIVANVPEGLLATVTVCLTLTAKRMASKNCLVKNLEAVETLGSTSTICSDKTGTLTQN 402
            .||||||||||||||||.|||||||||||||||.|||||||||||||||||:|||||||||||||
Zfish   321 GVIFLIGIIVANVPEGLPATVTVCLTLTAKRMAKKNCLVKNLEAVETLGSTTTICSDKTGTLTQN 385

  Fly   403 RMTVAHMWFDNQIIEADTTEDQSGVQYDRTSPGFKALSRIATLCNRAEFKGGQDGVPILKKEVSG 467
            |||||||||||.|..|||||:|:|..:||:|..:.||:|:|.|||||.|:..|..:|:||::.:|
Zfish   386 RMTVAHMWFDNHIHIADTTENQTGASFDRSSATWSALARVAGLCNRAVFQSNQSHIPVLKRDTAG 450

  Fly   468 DASEAALLKCMELALGDVMNIRKRNKKIAEVPFNSTNKYQVSIHETEDTNDPRYLLVMKGAPERI 532
            ||||:|||||:||:.|.|..:|:...|:||:|||||||||||||:..::::|::|||||||||||
Zfish   451 DASESALLKCIELSCGSVAEMRENYTKLAEIPFNSTNKYQVSIHKNPNSSEPKHLLVMKGAPERI 515

  Fly   533 LERCSTIFINGKEKVLDEEMKEAFNNAYMELGGLGERVLGFCDFMLPSDKYPNGFKFNTDDINFP 597
            |||||||||.|||:.:|:|||:||.|||:|||||||||||||.|.||.|::|.||.|:|:::|||
Zfish   516 LERCSTIFIQGKEQPMDDEMKDAFQNAYLELGGLGERVLGFCHFCLPDDQFPEGFAFDTEEMNFP 580

  Fly   598 IDNLRFVGLMSMIDPPRAAVPDAVAKCRSAGIKVIMVTGDHPITAKAIAKSVGIISEGNETVEDI 662
            .:||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||:||
Zfish   581 TENLCFVGLMSMIDPPRAAVPDAVAKCRSAGIKVIMVTGDHPITAKAIAKGVGIISEGNETVDDI 645

  Fly   663 AQRLNIPVSEVNPREAKAAVVHGAELRDVSSDQLDEILRYHTEIVFARTSPQQKLIIVEGCQRMG 727
            |.||.|.:.|||||:|||.|:||.||::::.:|||::|::|||||||||||||||||||||||.|
Zfish   646 AARLKIHIDEVNPRDAKACVIHGGELKNMTDEQLDDVLQHHTEIVFARTSPQQKLIIVEGCQRQG 710

  Fly   728 AIVAVTGDGVNDSPALKKADIGVAMGIAGSDVSKQAADMILLDDNFASIVTGVEEGRLIFDNLKK 792
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Zfish   711 AIVAVTGDGVNDSPALKKADIGVAMGIAGSDVSKQAADMILLDDNFASIVTGVEEGRLIFDNLKK 775

  Fly   793 SIAYTLTSNIPEISPFLAFILCDIPLPLGTVTILCIDLGTDMVPAISLAYEHAEADIMKRPPRDP 857
            ||||||||.|||:||||.|:|..||||||||||||||||||||||||||||.||:|||||.||:.
Zfish   776 SIAYTLTSKIPEMSPFLMFVLVGIPLPLGTVTILCIDLGTDMVPAISLAYETAESDIMKRQPRNA 840

  Fly   858 FNDKLVNSRLISMAYGQIGMIQAAAGFFVYFVIMAENGFLPKKLFGIRKMWDSKAVNDLTDSYGQ 922
            ..|:|||.||||::|||||||||..|||.||||:|||||||..|.|||..|:.:.:|||.|||||
Zfish   841 ATDRLVNERLISVSYGQIGMIQAVGGFFTYFVILAENGFLPYDLVGIRVGWEDRFLNDLEDSYGQ 905

  Fly   923 EWTYRDRKTLEYTCHTAFFISIVVVQWADLIICKTRRNSIFQQGMRNWALNFGLVFETVLAAFLS 987
            :|||..||.:|||||||||.|||:|||.||:||||||.|||||||:|..|.|||:.||.||||||
Zfish   906 QWTYESRKIVEYTCHTAFFASIVIVQWTDLLICKTRRLSIFQQGMKNRVLTFGLLEETALAAFLS 970

  Fly   988 YCPGMEKGLRMYPLKLVWWFPAIPFALAIFIYDETRRFYLRRNPGGWLEQETYY 1041
            ||||||..:||||||.:|||.|.|::|.||||||.|::.||||||||:|:||||
Zfish   971 YCPGMEVAVRMYPLKPLWWFCAFPYSLLIFIYDEVRKYILRRNPGGWVERETYY 1024

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
AtpalphaNP_732572.1 ATPase-IIC_X-K 45..1041 CDD:273445 733/995 (74%)
atp1a1a.3NP_571763.1 ATPase-IIC_X-K 32..1024 CDD:273445 730/992 (74%)

Return to query results.
Submit another query.