DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment Hsp70Aa and Haus8l2

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_731651.1 Gene:Hsp70Aa / 48581 FlyBaseID:FBgn0013275 Length:642 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:XP_038944691.1 Gene:Haus8l2 / 680121 RGDID:1595502 Length:646 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:643 Identity:479/643 - (74%)
Similarity:550/643 - (85%) Gaps:3/643 - (0%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly     2 PAIGIDLGTTYSCVGVYQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDSERLIGDPAKNQVAMNPRNTVFD 66
            ||:|||||||||||||:||||||||||||||.||||||||||:||||||.|||||||||.|||||
  Rat     5 PAVGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNCTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVAMNPTNTVFD 69

  Fly    67 AKRLIGRKYDDPKIAEDMKHWPFKVVSDGGKPKIGVEYKGESKRFAPEEISSMVLTKMKETAEAY 131
            |||||||::||..:..|||||||.||:|.|:||:.||||||:|.|.|||:||||||||||.||||
  Rat    70 AKRLIGRRFDDAVVQSDMKHWPFMVVNDAGRPKVQVEYKGETKSFYPEEVSSMVLTKMKEIAEAY 134

  Fly   132 LGESITDAVITVPAYFNDSQRQATKDAGHIAGLNVLRIINEPTAAALAYGLDKNLKGERNVLIFD 196
            ||:::|:||:||||||||||||||||||.|||||||||||||||||:||.|||.:..||||||||
  Rat   135 LGKTVTNAVVTVPAYFNDSQRQATKDAGTIAGLNVLRIINEPTAAAIAYVLDKKVGAERNVLIFD 199

  Fly   197 LGGGTFDVSILTIDEGSLFEVRSTAGDTHLGGEDFDNRLVTHLADEFKRKYKKDLRSNPRALRRL 261
            |||||||||||||::| :|||:||||||||||||||||:|.|...|||||:|||:..|.||:|||
  Rat   200 LGGGTFDVSILTIEDG-IFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRMVNHFIAEFKRKHKKDISENKRAVRRL 263

  Fly   262 RTAAERAKRTLSSSTEATIEIDALFEGQDFYTKVSRARFEELCADLFRNTLQPVEKALNDAKMDK 326
            |||.|||||||||||:|:||||:|:||.||||.::|||||||.|||||.||.||||||.|||:||
  Rat   264 RTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGIDFYTSITRARFEELNADLFRGTLDPVEKALRDAKLDK 328

  Fly   327 GQIHDIVLVGGSTRIPKVQSLLQDFFHGKNLNLSINPDEAVAYGAAVQAAILSGDQSGKIQDVLL 391
            .||||||||||||||||:|.||||||:||.||.||||||||||||||||||||||:|..:||:||
  Rat   329 SQIHDIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGKELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILSGDKSENVQDLLL 393

  Fly   392 VDVAPLSLGIETAGGVMTKLIERNCRIPCKQTKTFSTYADNQPGVSIQVYEGERAMTKDNNALGT 456
            :||.||||||||||||||.||:||..||.|||:||:||:||||||.|||||||||||||||.||.
  Rat   394 LDVTPLSLGIETAGGVMTVLIKRNTTIPTKQTQTFTTYSDNQPGVLIQVYEGERAMTKDNNLLGK 458

  Fly   457 FDLSGIPPAPRGVPQIEVTFDLDANGILNVSAKEMSTGKAKNITIKNDKGRLSQAEIDRMVNEAE 521
            |:|:|||||||||||||||||:||||||||||.:.||||...|||.|||||||:.:|:|||.|||
  Rat   459 FELTGIPPAPRGVPQIEVTFDIDANGILNVSAVDKSTGKENKITITNDKGRLSKEDIERMVQEAE 523

  Fly   522 KYADEDEKHRQRITSRNALESYVFNVKQAVE-QAPAGKLDEADKNSVLDKCNDTIRWLDSNTTAE 585
            ||..||||.|.:::|:|:||||.||:|..|| :...||:::.||..:|||||:.|.|||.|.|||
  Rat   524 KYKAEDEKQRDKVSSKNSLESYAFNMKATVEDEKLQGKINDEDKQKILDKCNEIISWLDKNQTAE 588

  Fly   586 KEEFDHKLEELTRHCSPIMTKMHQQGAGAGAGGPGANCGQQAGGFGG-YSGPTVEEVD 642
            ||||:|:.:||.:.|:||:||::|...|...|.||...|..|...|| .||||:||||
  Rat   589 KEEFEHQQKELEKVCNPIITKLYQSAGGMPGGMPGGFPGGGAPPSGGASSGPTIEEVD 646

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
Hsp70AaNP_731651.1 PTZ00009 2..642 CDD:240227 477/641 (74%)
Haus8l2XP_038944691.1 PTZ00009 1..613 CDD:240227 462/608 (76%)

Return to query results.
Submit another query.