Protein Alignment PolZ1 and nexmifb

DIOPT Version :10

• Sequence 1: NP_524881.2
• Gene: PolZ1 / 47186
• FlyBaseID: FBgn0002891
• Length: 2130
• Species: Drosophila melanogaster
• Sequence 2: XP_073778650.1
• Gene: nexmifb / 796115
• ZFINID: ZDB-GENE-140106-18
• Length: 1265
• Species: Danio rerio
• Alignment Length: 1228
• Identity: 234/1228 - (19%)
• Similarity: 411/1228 - (33%)
• Gaps: 393/1228 - (32%)

  Fly   317 LMTLEQSTLSEQTLSDQTILPQATMQTTMPGTKAQ------KRRFNL----QKLLANAVYPEECS 371
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Zfish    63 MSTSETGSYGDQLLSDQLL--------SFPVTKTQLLEKKDTEKIDLDDPASKNLYESLLLDKCT 119

  Fly   372 QDQQQLLVN--------ASFIQNHV-----TCGYSSSVSLSTSKDESDDLDETVVDEELILSLTQ 423
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Zfish   120 -GEDGLLTNPNQDWGYFESFISESKMELLDLC---SKNELSVNLFSEEDVDNYMFDDD------- 173

  Fly   424 PHGAIPHDATLREEDLELLDALQLLEEQNESESHVDLDSSLAPLSQHKKFELTPELL----DKET 484
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Zfish   174 ------DDSTLSSDVCSLKIRYESFQDNIREKTNV--------LQEETQFNFFPSVLVNCTKKES 224

  Fly   485 AATAALFDEDVDSDEDADQETRHDFSTVLDDVDELLLKLTQSQPAESKELKASSKLPQIDGADDR 549
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Zfish   225 GVVKRVVDEAPPKSEELGFQNDNK-----GDVNEC---SAEQMPSYSP--KMNYFIDSSNSADDS 279

  Fly   550 LQRTPIKSISSKSKSSPSKTPTTPIGQKSLPKSPRTPKTSAAKKYAPLALT-------------- 600
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Zfish   280 ------GEYSDESSSTICSFDTF---QDNRPKNLFTRKNASCSNHLNYGLRAKRKFRFSDDYLYY 335

  Fly   601 IGSSSSKKSNDEFAGRPSNPRLSLQLDQGTGTGTLRPEISLRKKLAMSEMRRKSFEDSFVLLK-- 663
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Zfish   336 VESTDGERNVEKREKPPIGPKQEEDLD-----------------WCPKKRRKYSRKDPPVIIKYI 383

  Fly   664 -------NDCTPVRSTRRSTSNLDKTHIICSLTPRDRNPGLSDMFETEDGKQLPPKKVVRKTRWS 721
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Zfish   384 IVNRFKGDKCMAVKLGR-----IDSSDTTVSL-----NEDTINKYE-----KLSP----LKDFWQ 429

  Fly   722 TRNQDIESLPK--AGCEIERPHRSEGSALDELKPRRSARHKVNSANPDECSSEIQ---TTGPRVT 781
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Zfish   430 EKQREREEQLKLAAGDKHNSHHHAFRSSPPKRKYKLANRLRIQRIQTVEQSPNMQGPFASDPRQE 494

  Fly   782 TTSLDRPQKKARLSQSPKENTKTSMNGTVALEKA-TKDSSS-------NSESPHQQENSVSEQI- 837
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Zfish   495 VSSTD-------------ETASMGMPLTIATSCASTLDSNDIIHTAARKSRSQEREERRIGNKIF 546

  Fly   838 -----------------EYLESKPKKSDETARSCDEKLQRELIPQEPAGISP---------GDSA 876
                             :.:|:....:|.|.....:|....:...|...:||         ..:|
Zfish   547 RIHKFRSEARLRSKKIRDLVENNESMTDLTEVCSLQKNMDTVGGAEDKNVSPAAHISHLCESQTA 611

  Fly   877 NSTEEITF----SPCHDEAIESDTESD-------YIVTKLRKTPNL---------KRLRWSIRSE 921
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Zfish   612 NATEKFAFVSNTCSCNKESSSENVAASVSVIPGGYLQTLLDASDSSGSTGIPFFPQQTQHSLELS 676

  Fly   922 LLNKQFT----PSSGIRPPETETTPQLSPKSNESNTPELMRSFYEHSLIVNSPSVFSDFLDSPEI 982
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Zfish   677 LEKQQFTSIQLAQSCVLSPPSESELQQSPQ----NCPTLTQ-MWQAQLHSNQKFTTADVAES--- 733

  Fly   983 HMDSPRSAPPSPDSNSFVIAPLELPPSYDEVVSGSRKMDI------------------PEYEFQ- 1028
                      :...||| ...:.||.|....|||..::.:                  |:.|||
Zfish   734 ----------AIQPNSF-NGEMALPMSESLTVSGFSQLSLESNRMLYEKNYMPEQPLPPDAEFQA 787

  Fly  1029 ---KPYYSNPSDVSKVTEVGFLVLHIPGNKLNDCDPFQSILGNDRGLASWRRRQLIAIGGLAMLQ 1090
               :|.:...:            ||....:|...|...|:.......:|           |::..
Zfish   788 CQGQPQFQRAT------------LHTDNGRLISFDSVGSLSAASSNYSS-----------LSLKS 829

  Fly  1091 RHR-GEQKVREYFST--------QQRI-AIEP-----------------------AQLAP----- 1117
            ..: ||..|.|.|..        ||.| ||.|                       ::|:|
Zfish   830 CEKDGEDDVNEDFLAHYSPKLVIQQSIDAITPLRESTDLLDISNFTPDKFRHASLSELSPPETPN 894

  Fly  1118 -----TWQEAKIWLKAKELLRQREEPKKS-SDDIDSPIK-IKRQKI--------TMMLQAEEGDG 1167
                 ..:|.||..||.:|   ::..|.| ::::|...| ||:|.:        |..|....|:.
Zfish   895 LSPQVMGREIKIVGKATDL---QDGVKMSCTENMDWKCKMIKQQDLARYSVEGHTYQLNVFNGEN 956

  Fly  1168 GSGDEDA------GEELDC---------SLSLTPLSQAKDKCKATPTSSKARETGKSRLKR---- 1213
            ..|.:..      |:.::.         :.:..|..|...|.||    .||.:|.|.::.|
Zfish   957 NLGTKQENLSSIDGDMVNAIKGTKAKRRNSNKPPAGQGTKKTKA----PKAPKTDKGKIPRQNSR 1017

  Fly  1214 -GTRLSFIGSQDEEPPSSQ-----------SSEQ----SVSSSAAQAELDRSSFLRQLEGSSQDR 1262
             ..:|..:  .||:..:||           |||.    ..|.|.:|...|:    |:.|..|...
Zfish  1018 TSKKLKTL--LDEKGSNSQTEGIAYLLKDSSSEDWTGIGCSESTSQVHDDQ----REFEEPSNIL 1076

  Fly  1263 QHDLSFGLSH------ATLDNTFGFKVNLENLQQAKADIDCNHLTIITLEVFVSTRGD 1314
            .:.:| |::.      |:::..:|...|:....:|      |.|.:.||::...|..|
Zfish  1077 SNIVS-GMAEVQRFMMASVEPIWGPAANVSLPSEA------NSLKLKTLKILAGTSSD 1127

Known Domains

Gene	Sequence	Domain	Region	External ID	Identity
PolZ1	NP_524881.2	PTZ00166	20..>196	CDD:240301
		DNA_polB_zeta_exo	1297..1518	CDD:99821	6/18 (33%)
		POLBc_zeta	1550..2000	CDD:99917
		zf-C4pol	2041..2107	CDD:464119
nexmifb	XP_073778650.1	None