DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment ATPsynbeta and atpD

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_001259081.1 Gene:ATPsynbeta / 43829 FlyBaseID:FBgn0010217 Length:511 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:NP_418188.1 Gene:atpD / 948244 ECOCYCID:EG10101 Length:460 Species:Escherichia coli


Alignment Length:466 Identity:328/466 - (70%)
Similarity:379/466 - (81%) Gaps:8/466 - (1%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly    42 ANGKIVAVIGAVVDVQF-DDNLPPILNALEVDNRSPRLVLEVAQHLGENTVRTIAMDGTEGLVRG 105
            |.||||.||||||||:| .|.:|.:.:||||.|.:.||||||.|.||...||||||..::||.||
E. coli     2 ATGKIVQVIGAVVDVEFPQDAVPRVYDALEVQNGNERLVLEVQQQLGGGIVRTIAMGSSDGLRRG 66

  Fly   106 QKVLDTGYPIRIPVGAETLGRIINVIGEPIDERGPIDTDKTAAIHAEAPEFVQMSVEQEILVTGI 170
            ..|.|..:||.:|||..|||||:||:|||:|.:|.|..::..|||..||.:.::|..||:|.|||
E. coli    67 LDVKDLEHPIEVPVGKATLGRIMNVLGEPVDMKGEIGEEERWAIHRAAPSYEELSNSQELLETGI 131

  Fly   171 KVVDLLAPYAKGGKIGLFGGAGVGKTVLIMELINNVAKAHGGYSVFAGVGERTREGNDLYNEMIE 235
            ||:||:.|:|||||:||||||||||||.:||||.|:|..|.|||||||||||||||||.|:||.:
E. coli   132 KVIDLMCPFAKGGKVGLFGGAGVGKTVNMMELIRNIAIEHSGYSVFAGVGERTREGNDFYHEMTD 196

  Fly   236 GGVISLKDKTSKVALVYGQMNEPPGARARVALTGLTVAEYFRDQEGQDVLLFIDNIFRFTQAGSE 300
            ..||      .||:|||||||||||.|.||||||||:||.||| ||:|||||:|||:|:|.||:|
E. coli   197 SNVI------DKVSLVYGQMNEPPGNRLRVALTGLTMAEKFRD-EGRDVLLFVDNIYRYTLAGTE 254

  Fly   301 VSALLGRIPSAVGYQPTLATDMGSMQERITTTKKGSITSVQAIYVPADDLTDPAPATTFAHLDAT 365
            |||||||:|||||||||||.:||.:|||||:||.||||||||:||||||||||:|||||||||||
E. coli   255 VSALLGRMPSAVGYQPTLAEEMGVLQERITSTKTGSITSVQAVYVPADDLTDPSPATTFAHLDAT 319

  Fly   366 TVLSRAIAELGIYPAVDPLDSTSRIMDPNIIGQEHYNVARGVQKILQDYKSLQDIIAILGMDELS 430
            .||||.||.|||||||||||||||.:||.::|||||:.|||||.|||.|:.|:||||||||||||
E. coli   320 VVLSRQIASLGIYPAVDPLDSTSRQLDPLVVGQEHYDTARGVQSILQRYQELKDIIAILGMDELS 384

  Fly   431 EEDKLTVARARKIQRFLSQPFQVAEVFTGHAGKLVPLEQTIKGFSAILAGDYDHLPEVAFYMVGP 495
            |||||.|||||||||||||||.|||||||..||.|.|:.||:||..|:.|:||||||.||||||.
E. coli   385 EEDKLVVARARKIQRFLSQPFFVAEVFTGSPGKYVSLKDTIRGFKGIMEGEYDHLPEQAFYMVGS 449

  Fly   496 IEEVVEKADRL 506
            |||.||||.:|
E. coli   450 IEEAVEKAKKL 460

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
ATPsynbetaNP_001259081.1 AtpD 44..510 CDD:439825 327/464 (70%)
atpDNP_418188.1 AtpD 1..460 CDD:439825 327/464 (70%)

Return to query results.
Submit another query.