Protein Alignment Ekar and Ir7f

DIOPT Version :10

• Sequence 1: NP_001036250.1
• Gene: Ekar / 43806
• FlyBaseID: FBgn0039916
• Length: 899
• Species: Drosophila melanogaster
• Sequence 2: NP_001138177.1
• Gene: Ir7f / 7354418
• FlyBaseID: FBgn0259188
• Length: 621
• Species: Drosophila melanogaster
• Alignment Length: 799
• Identity: 127/799 - (15%)
• Similarity: 268/799 - (33%)
• Gaps: 231/799 - (28%)

  Fly    44 YAIHRLNMDKSLLPETTVDYYVEYVNRFDSFETVQKVCKLIRVGVQAVFSPTDSVLATHINSICD 108
            |:|:     ||.|..:.:|...|..|.:        |.:.:|:.::.|.:...:.|...|::
  Fly    19 YSIY-----KSYLENSRIDMQGEDANLY--------VARALRLVIENVLAQLSTTLVVTIST--- 67

  Fly   109 ALDIPNIGRSAHDFSINVYPSKQLVNYAFNDVIQYLNWTRFGILHEKENGIINLHQLSRSFHGEV 173
                .::| :||.|           .|..|.::.........:|..:.:.::|      ...|..
  Fly    68 ----RHLG-TAHWF-----------EYMMNILMDSWRMVAVQLLRIRPDLVVN------PVPGRK 110

  Fly   174 HMRQVSRDSYVSALNEFKGKEIHNIIIDTNSNGISILLKNILQQQMNEYKYHYLFTSFDLETYDL 238
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  Fly   111 RVSLLMVDSYQG-------------LLDTN-----ITASN---ANFDDPDYYFIF----LQARD- 149

  Fly   239 EDFKYNFVNITSFRLVDTADVGVKQILKDIGLYSHHIFKKPYLNLHIKKSTILESEPALMFDSVY 303
                                   ..|.|::.|...|.....:|:.::...|   ::..::..:.|
  Fly   150 -----------------------HLIPKELQLILDHCLAHFWLHCNVMIQT---AQVEVLVYTYY 188

  Fly   304 VFAIGLQTLEQSHSLTLLNISCEEENSWDGGLSLINYLNAVEWKGLTGPIQFKDGQRVQFKLDLI 368
            .:.  ....::::.:.:        |::||.          :||...   .|.|
  Fly   189 PYT--ADACQKAYPIPV--------NTFDGR----------KWKASQ---MFPD----------- 219

  Fly   369 KLKQHSIVKVGEWTPHGHLNITEPSMFFDAGSMNVTLVVITILETPYVMMHYGKNFTGNERFYGF 433
            ||.|          .||                 ..|.|:|..:.|:|.:.:.... ...|..||
  Fly   220 KLSQ----------MHG-----------------CPLTVLTWHQPPFVELVWDPKH-NRSRGSGF 256

  Fly   434 CVDILETISREVGFDYILDLVPDRKYGAKDPETGEWNGMVAQLMKYKADLAVGSMTITYARESVI 498
            .:.::|.::|.:.|...|..:...:..|.....|...|.:.:|::...::::|....|..|..::
  Fly   257 EIQLVEHLARRMNFSLELVNIALLRPNAYRLAEGSSEGPIEKLLQRNVNISMGYFRKTARRNQLL 321

  Fly   499 DFTKPFMNLGISILFKVPTSEPTRLFSFMNPLAIEIWIYVLIAYFLVSLCIYIVGKLSPIEWKCI 563
            .....:.:..:..:.::.......|...:.|..:.:|:.:|:| .|:.|.|::.......|
  Fly   322 TTPMSYYSANLVAVLQLERYRIGSLALLVFPFELSVWMLLLLA-LLIHLGIHLPSARRGNE---- 381

  Fly   564 NACDLENISIGNQFSLTDSFWFTIGTFMQQSPDIYPRAMSTRIISSTWGFFSLIIVASYTANLAA 628
                 |:...|.|         .:...:..:....||:...|.|::.|.:.|:.:..||.:.|..
  Fly   382 -----EDGGGGLQ---------VVALLLGAALARLPRSWRHRFIAAHWLWASIPLRISYQSLLFH 432

  Fly   629 FLTTERMINPIENAEDLASQTEISYGTLDSGSTMTFF---------RDSVIETYKKIWRSMD--- 681
            .:..:....|..:.:.|.::   .:..:.:.:|....         .||:        :|:|
  Fly   433 LIRLQLYNTPSFSLDQLLAE---GFQGICTANTQRLLLEMPQLARDPDSI--------QSVDTPF 486

  Fly   682 ----------NKKPSAFTTTYEDGIKRVNQGNYAFLMESTMLD--YIVQRDCNLTQIGGLLDTKG 734
                      |:....|....:|       ...:||..|...:  ::|::..|:...
  Fly   487 DWDVLNVLTRNRNRKIFAVANQD-------VTLSFLHSSAHPNAFHVVKQPVNVEYA-------- 536

  Fly   735 YGIATPKGSPWRDKISLAILELQERGDIQMLYDKWWKNTDETCTRKNTSKQSKANSLGLESIGGV 799
             |:..||.|...:|:...|..|...|.|.    .|.:.:..:..||.....:....:....:.|:
  Fly   537 -GMYMPKHSFLYEKMDDDIRRLDASGFIH----AWRRASFASVHRKEQVHMTSRRYINHAKLSGI 596

  Fly   800 FVV-----LIAGIIVAAVV 813
            ::|     |:||::.|..|
  Fly   597 YMVMAGLYLLAGLLFAGEV 615

Known Domains

Gene	Sequence	Domain	Region	External ID	Identity
Ekar	NP_001036250.1	PBP1_iGluR_Kainate	24..390	CDD:380605	53/345 (15%)
		PBP2_iGluR_Kainate	402..771	CDD:270432	65/392 (17%)
		Lig_chan	532..806	CDD:459656	49/302 (16%)
Ir7f	NP_001138177.1	Periplasmic_Binding_Protein_Type_2	231..>358	CDD:473866	20/127 (16%)