Protein Alignment superdeath and pepN

DIOPT Version :10

• Sequence 1: NP_651674.3
• Gene: superdeath / 43444
• FlyBaseID: FBgn0039640
• Length: 999
• Species: Drosophila melanogaster
• Sequence 2: NP_415452.1
• Gene: pepN / 947253
• ECOCYCID: EG10696
• Length: 870
• Species: Escherichia coli
• Alignment Length: 891
• Identity: 186/891 - (20%)
• Similarity: 310/891 - (34%)
• Gaps: 237/891 - (26%)

  Fly   107 KYDRDVRLPHSIRPLKYNIT---IEPQLSGNFTFAGSVQIRIRVLEDCYNITMHAEELNISRSDA 168
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E. coli     8 KYRHDYRAP------DYQITDIDLTFDLDAQKTVVTAVSQAVRHGASDAPLRLNGEDLKL----V 62

  Fly   169 SVHRVQNNGEP-----EGDGLRIHKQYLVGAKQFFVIELYDKLLKDVEYVVHLRFDGIIEDYLQG 228
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E. coli    63 SVH---INDEPWTAWKEEEGALV----ISNLPERFTL----KIINEISPAANTA--------LEG 108

  Fly   229 FYRSSYEVHNETRWVASTQFQATDARRAFPCFDEPALKANFTLHIARPRNMTTISNMPIVSSNDH 293
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E. coli   109 LYQSGDAL--------CTQCEAEGFRHITYYLDRPDVLARFTTKIIADK-----IKYPFLLSNGN 160

  Fly   294 ATMPSYV-----WDHFAESLPMSTYLVAYAISDF------------------THISSGNF--AVW 333
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E. coli   161 RVAQGELENGRHWVQWQDPFPKPCYLFALVAGDFDVLRDTFTTRSGREVALELYVDRGNLDRAPW 225

  Fly   334 ARADAIKSAEYALSVGPRILTFLQDFFNVTFPLPKIDMIALPEFQAGAMENWGLITFRETAMLYD 398
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E. coli   226 AMTSLKNSMKWD-----------EERFGLEYDLDIYMIVAVDFFNMGAMENKGLNIFNSKYVLAR 279

  Fly   399 PGVATANNKQRVASVVGHELAHQWFGNLVTPSWWSDIWLNEGFASYMEY-LTADAVAPEWKQLDQ 462
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E. coli   280 TDTATDKDYLDIERVIGHEYFHNWTGNRVTCRDWFQLSLKEGLTVFRDQEFSSD--------LGS 336

  Fly   463 FVVNELQAV-------FQLDALSTSHKISHEVFNPQEISEIFDRISYAKGSTIIRMMAHFLTNPI 520
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E. coli   337 RAVNRINNVRTMRGLQFAEDASPMAHPIRPDMV--IEMNNFYTLTVYEKGAEVIRMIHTLLGEEN 399

  Fly   521 FRRGLSKYLQEMAYNSATQDDLWHFLTVEAKSSGLLDDSRSVK-EIMDTWTLQTGYPVVKVSRHP 584
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E. coli   400 FQKGMQLYFERHDGSAATCDDF-----VQA-----MEDASNVDLSHFRRWYSQSGTPIVTVKDDY 454

  Fly   585 NSDVIRLEQVRFVYTNTTREDESLLWYIPITFTTDSELNFANTRPTTWMPRTKLYELENRELSLA 649
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E. coli   455 NPET---EQ----YTLT------------ISQRTPATPDQAEKQPLHIPFAIELYDNEGKVIPL- 499

  Fly   650 KWFIFNVQQTGYYRVNYDLENWMAITEHLMDVDNFEDI--------APAN-----RAQLIDDVMN 701
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E. coli   500 --------QKGGHPVNSVLNVTQAEQTFVFDNVYFQPVPALLCEFSAPVKLEYKWSDQQLTFLMR 556

  Fly   702 LARGSYLSYETAMN-LTRYL-----GHELG-------HVPWKAAISNFIFIDSMFVNSGDYDLLK 753
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E. coli   557 HARNDFSRWDAAQSLLATYIKLNVARHQQGQPLSLPVHV---ADAFRAVLLDEKIDPALAAEILT 618

  Fly   754 NYLLKQLKKVYDQVGFKDSQDESEDILVKLKRADILSMACHLGHQECIAEASRHFQNWMQTPNPD 818
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E. coli   619 LPSVNEMAELFDII--------DPIAIAEVREALTRTLATELA-DELLAIYNANYQS-------- 666

  Fly   819 SNNPIVPNLRGVVYCSAIQYGTEYEWDFAFERFLKTNVPGEKDLLLNALGCSKEPWLLYRFLRRG 883
                              :|..|:| |.|            |..|.||  |       .|||..|
E. coli   667 ------------------EYRVEHE-DIA------------KRTLRNA--C-------LRFLAFG 691

  Fly   884 --------ISGQHIRKQDLFRVFAAVSTTVVGQNIAFDFLRNNWQE 921
                    :|.|.....::....||:|..|..|....|.|...:.:
E. coli   692 ETHLADVLVSKQFHEANNMTDALAALSAAVAAQLPCRDALMQEYDD 737

Known Domains

Gene	Sequence	Domain	Region	External ID	Identity
superdeath	NP_651674.3	M1_APN-Q_like	121..571	CDD:341064	108/491 (22%)
		ERAP1_C	651..976	CDD:463368	54/305 (18%)
pepN	NP_415452.1	pepN	1..870	CDD:237585	186/891 (21%)