DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment Calx and Slc8a3

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_001247215.1 Gene:Calx / 42481 FlyBaseID:FBgn0013995 Length:973 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:XP_017449484.2 Gene:Slc8a3 / 140448 RGDID:620197 Length:928 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:935 Identity:442/935 - (47%)
Similarity:607/935 - (64%) Gaps:82/935 - (8%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly    87 VHGEAPDAEELR----------------ECSEGLVLPLWMPQRNISVGDRLVRGFVYFVLLIYLF 135
            ::|...:|.:||                :|.||::||:|.|: |.|:||::.|..||||.|||:|
  Rat    25 LNGLRAEAGDLRDVPSAGQNNESCSGSSDCKEGVILPIWYPE-NPSLGDKIARVIVYFVALIYMF 88

  Fly   136 VGVSIIADRFMAAIEAITSIERAVVVKGPNNTKQVMHVRIWNETVANLTLMALGSSAPEILLSVI 200
            :|||||||||||:||.|||.||.|.:|.||.......:|:|||||:|||||||||||||||||:|
  Rat    89 LGVSIIADRFMASIEVITSQEREVTIKKPNGETSTTTIRVWNETVSNLTLMALGSSAPEILLSLI 153

  Fly   201 EIYAKDFESGDLGPGTIVGSAAYNLFMIIAVCMIWIPAGEVRRIRHLRVFFVTALFSVFAYVWLW 265
            |:....|.:|||||.|||||||:|:|:||.:|:..||.||.|:|:|||||||||.:|||||:||:
  Rat   154 EVCGHGFIAGDLGPSTIVGSAAFNMFIIIGICVYVIPDGETRKIKHLRVFFVTAAWSVFAYIWLY 218

  Fly   266 LILSVFTPGVILVWEAIVTLLFFPLTVLWAYIAERRLLVYKYMDKNYRVNK-RGTVV--AGEHDQ 327
            :||:||:|||:.|||.::||.|||:.||.|::|::|||.||||.|.||.:| ||.::  .|||.:
  Rat   219 MILAVFSPGVVQVWEGLLTLFFFPVCVLLAWVADKRLLFYKYMHKRYRTDKHRGIIIETEGEHPK 283

  Fly   328 -VEMDAEKGPKQPMVTS--ARGN----DAEAFDEARREYITLLTELRQKYPDADLEQLEMMAQEQ 385
             :|||.:      |:.|  ..||    :.:..||:|||.|.:|.:|:||:|:.||:||..||...
  Rat   284 GIEMDGK------MMNSHFLDGNLIPLEGKEVDESRREMIRILKDLKQKHPEKDLDQLVEMANYY 342

  Fly   386 VLARSSKSRAFYRIQATRKMVGSGNLMRK-IQERAHSDLTEVKAQLHAGDDEEADDPIRMYFEPG 449
            .|:...||||||||||||.|.|:||:::| ..|:|..  |...:::|.  ||..|...:::|:|.
  Rat   343 ALSHQQKSRAFYRIQATRMMTGAGNILKKHAAEQAKK--TASMSEVHT--DEPEDFASKVFFDPC 403

  Fly   450 HYTVMENCGEFEVRVVRR-GDISTYASVEYETQDGTASAGTDFVGRKGLLSFPPGVDEQRFRIEV 513
            .|..:||||...:.|||: ||||....|:|:|:||:|:||.|:...:|.:...||..::.|.:.:
  Rat   404 SYQCLENCGAVLLTVVRKGGDISKTMYVDYKTEDGSANAGADYEFTEGTVVLKPGETQKEFSVGI 468

  Fly   514 IDDDVFEEDECFYIRLFN--------------------PSEGVKLAVPMIATVMILDDDHAGIFA 558
            ||||:|||||.|::||.|                    |.....||.|.:|||.||||||||||.
  Rat   469 IDDDIFEEDEHFFVRLSNVRVEEEQLEEGMTPAILNSLPLPRAVLASPCVATVTILDDDHAGIFT 533

  Fly   559 FTDSVFEITESVGRFELKVMRYSGARGTVIVPYWTENDTAT-ESKDYEGARGELVFENNESEKFI 622
            |......::||:|..|:||:|.||||||||||:.|...||. ..:|:|...|||.|:|:|:.|.|
  Rat   534 FECDTIHVSESIGVMEVKVLRTSGARGTVIVPFRTVEGTAKGGGEDFEDTYGELEFKNDETVKTI 598

  Fly   623 DLFILEESSYEKDVSFKVHIGEPRLAPDDTNKESFFNRFFEKHEHSGEPTHDELAAKIKEVEKKP 687
            .:.::::.:|||:.::.:.:..||:......|....         |.|.|           ::|.
  Rat   599 HIKVIDDKAYEKNKNYVIEMMGPRMVDMSVQKALLL---------SPEVT-----------DRKL 643

  Fly   688 VQDLTELDRILLLSKPRNGELTTAYVRIRESQEFKATVDKLVAKANVSAVLGTSSWKEQFKDALT 752
            ..:..|..||..:.||..||.....|.|.||.|||:|||||:.|.|::.|:||.||::||.:|:|
  Rat   644 TMEEEEAKRIAEMGKPVLGEHPKLEVIIEESYEFKSTVDKLIKKTNLALVVGTHSWRDQFMEAIT 708

  Fly   753 VIPADESEFDNDDEEEEVPSCFSYVSHFVCLFWKVLFAFVPPTDICGGYVTFVVSIFVIGVITAI 817
            |..|.:.| :::..||.:||||.||.||:.:|||||||.||||:.|.|:..|||||.:||::|||
  Rat   709 VSAAGDEE-EDESGEERLPSCFDYVMHFLTVFWKVLFACVPPTEYCHGWACFVVSILIIGMLTAI 772

  Fly   818 IGDAASYFGCALNIKDSVTAILFVALGTSIPDTFASMIAAKHDEGADNCIGNVTGSNAVNVFLGI 882
            |||.||:|||.:.:||||||::|||.|||:||||||..||..|..||..||||||||||||||||
  Rat   773 IGDLASHFGCTIGLKDSVTAVVFVAFGTSVPDTFASKAAALQDVYADASIGNVTGSNAVNVFLGI 837

  Fly   883 GLAWTIAAVYHSSHGMTFNVEPGTIGFAVALFCGEALIAIMLIMFRRWHKGIGAELGGPKVSKYI 947
            ||||::||:|.:..|..|:|..||:.|:|.||...|.:.:.::::|| ...:|.|||||:..|..
  Rat   838 GLAWSVAAIYWAMQGQEFHVSAGTLAFSVTLFTIFAFVCLSVLLYRR-RPHLGGELGGPRGCKLA 901

  Fly   948 SAAILVFLWVFYVVICILEAYDVIR 972
            :..:.|.||:.||:...||||..|:
  Rat   902 TTWLFVSLWLLYVLFATLEAYCYIK 926

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
CalxNP_001247215.1 caca 4..973 CDD:273296 442/935 (47%)
Slc8a3XP_017449484.2 caca 1..928 CDD:273296 442/935 (47%)

Return to query results.
Submit another query.