Protein Alignment Dys and shot

DIOPT Version :10

• Sequence 1: NP_001036722.1
• Gene: Dys / 42327
• FlyBaseID: FBgn0260003
• Length: 3598
• Species: Drosophila melanogaster
• Sequence 2: NP_725339.1
• Gene: shot / 36542
• FlyBaseID: FBgn0013733
• Length: 8805
• Species: Drosophila melanogaster
• Alignment Length: 4132
• Identity: 759/4132 - (18%)
• Similarity: 1447/4132 - (35%)
• Gaps: 1197/4132 - (28%)

  Fly    27 IDTQCTPVKDLFLDLRDGHRLLALLSTLTQTNLKPEKGRMRVHHINNLNKVITEIQQHGVKLVNI 91
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  Fly  5226 VQDQMNEAKALHNELLSSGRLVDNAQQALDNLLRSLGGQLSPMEINQLELPIADLKNNYQQLL-- 5288

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               ....:.:..|..|.:|      ||::....:...||....::...             |.||
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  Fly  5524 ---------------AYEGLKDQVLSWLASTEARVNGLPPVAIDLDRIKQQHDE-----LKPICK 5568

  Fly   359 EHQEYV------------------------------------------GEA-------------L 368
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  Fly  5569 DYRDYAPTIDKINDIGAQYDALIRPESPARKRSTYSPIKRTSPLRRMSGDARSPSPTKGGILSPL 5633

  Fly   369 EEGSNLINESQKAGAGLSQEDQNEVRQQMVLLNERWETLRLRALDVQAKILMRLAEFQKQ--KLE 431
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  Fly  5634 STGSSGFGSRRSSQDGFQLSELSPVQQQLSEINNRYGLIGVRLNDRQHELDNLNEELRKQYENLK 5698

  Fly   432 QLRQFLTSVEDRISHMSDIGPTLEEAEKQLLEAQKLKADLSEQQELVDSLSSMVVIV----NDTS 492
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  Fly   493 GNFNDLEDRLSALGERWSHV-------VKWSDLRKEKLQQYKCISRWLDAREQDLKLME--SRDV 548
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  Fly   610 LKQIVEVQTVRIETKGFNFGRDRASYDDSRVVRPEGWVDYQMIIRFGEDDSQEDDDEHDLASKKR 674
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  Fly  5863 LAGTPDAQAVEIKLKDI-LGK----WDDL-----VGKLDDRANSLGGAADSSKEFD-----AAVN 5912

  Fly   675 KLRNA-----DNFNALENHIMEHFGYVQEVEQKLQQLQRQSLRQQCELLKELQAENSRRCGTLPE 734
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  Fly  5913 RLREALQNISDNLDTLPTD-----GDHQENLRKIENLERQ-LEGQRPLLADVEQSAATLCNILGD 5971

  Fly   735 LKKLYEVCELEDPSRNLLLEETHIKQLEQRYANLSQKLSSQQSESHTLLAKEKYY---------- 789
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  Fly  5972 PASRADV-------------NSRVAALEKQYLALQKKLDTKKAETEASLRDGRHFAENCSKTLGW 6023

  Fly   790 -----NSLTGFKLVLADSRDWYKQHAGSASGNELEQRLS-----HMESLASE------ISEAKTA 838
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  Fly  6024 LGGELSNLTDRLLV-------------SAHKPTLQHQIDTHEPIYREVMAREHEVIMLINKGKDL 6075

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  Fly  6076 TDRQQDRGV--KRDLDRIQQQWEKLRREAVDRHTRLQTCMEHCKKYSQTSETFLAWLRTAEDKLA 6138

  Fly   892 KVSNQKVRVSNLEV-MQEQQHFLNQL---LDEMESLR------LTYDNIPKHLIGEELQTAWNRL 946
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  Fly  6139 DLTPGVLSKAKLETRLRDLQTFRSEVWKHSGEFENTKGLGETFLSSCDIDKEPIKAELQDIRDRW 6203

  Fly   947 PEQLNERVIKQTTAIENLNHFAAEYNAIIAMLRSA---ADSKLNGSD--GASSQDLRKLEIDVIS 1006
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  Fly  6204 -ERLNNDLIARAHEIENCSRRLDDFNDELRNLDHSLGRCEDRLAAHDALGGAAKDPKLLE----R 6263

  Fly  1007 ARNFSEILIKEAEPAQKESLQSQIRALNTLYDQVEQVHREKKEQQTVLQSHIDLIQLRLKETDQW 1071
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  Fly  1072 LTDLESNTPKSGISDIVNSNELFQSKSRFQTLKETCERETTQFRDLNERGGELLLQMDELQDQDR 1136
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  Fly  6320 LDD-RCGELQSAATAVSQFNE--QMKSLGIDLNDL----ETEIEKLSPPGREIKIVQVQIDD--- 6374

  Fly  1137 ESRYGSLAKQFTRINARWTEVTE----LVYA-----KTALLEHISTQLGEFKKFMVSETGYLDKL 1192
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  Fly  6375 ---VGKIQTKLDRLVGRLEDAERAADVLVDAGFAADTTQTREQIST---------LRKT--LGRL 6425

  Fly  1193 ENKIRNTPENAADAEEIMEE--------LDDLENV----------------LRSHSEEW------ 1227
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  Fly  6426 DNRVRDHEDNLHSTLKALREFYDHQSQTLDDIQDVSDEFKRMKPVGSELDQIRRQQEDFRNFRER 6490

  Fly  1228 --------LDKIQEIGNELI---DNEFMADSIRRDIDETVQRWTQLQQQAKKRTELLEQKVSEAE 1281
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  Fly  6491 KVEPLAINVDKVNVAGRDLVRSAGSGVSTTAIEKDLEKLNDRWNDLKERMNERDRRLDVALLQSG 6555

  Fly  1282 QSEKCIVQFEKWLTRVDDILSDHL--DNDVTIVDQPEEFQRLAHEFVANEKN-FKEISELIDEHT 1343
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  Fly  6556 KFQEALAGLSKWLSDTEEMVANQKPPSSDYKVVKAQLQEQKFLKKMLLDRQNSMGSLANLGKEVA 6620

  Fly  1344 RNGKVGAANRLQEQLNLMEVRF-------KYCQAKLSKCTAIQHSYESRLNRAYTDLRNVERSTE 1401
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  Fly  6621 NHCEPGERASIEKQLNDLMKRFDALTDGAEQRELDLEEAMEVAKRFHDKISPLELWLDNTERSVK 6685

  Fly  1402 VVDVASAGPNTVQTQYQKCLQIYRTLSEIKSEIESTIKTGRRVCEDRYTKSP--KQLSQRIDALK 1464
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  Fly  6686 AMEL-------IPTDEEK--------------IQQRIREHDRLHDEILGKKPDFSDLADVTAQLM 6729

  Fly  1465 HLYN-----TLGENVTQSKATLERLLTLARQLEECFDSADNLIRRFESPQEVHDRNSILLEFEDV 1524
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  Fly  1525 LRRCEDHYNEYNKSCDQSCMVETRQRIDGLKATYHKLTSADIIKRLTEMKTTLQNLDNISL---E 1586
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  Fly  6762 ----------------GALLAESRQGLRHLVLSYQ-----DLVAWMESMEAELKRFKSVPVYAEK 6805

  Fly  1587 TLRAMEHDLKEIN-------------VPSNPEIEKLQQQVIAI----VVDVLKTRFNEATTLAAR 1634
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  Fly  6806 LLEQMDH-LLELNENIAGHASNVESTVESGAELMKHISNDEAIQLKDKLDSLQRRYGDLTNRGGD 6869

  Fly  1635 NTSSPDNDDTEIVVVSDTVRQRRARTPQSGESPSSAHTSSSESPTKGVENSPGAVGDQVMPDLLP 1699
            ...|..| ...:|........|.....||.|:
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                                               ..|||.|.|...:|:
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  Fly  1765 EPQQGEIVDTVNILESVEPFVPEYVETVQIVDLSEDSDSSV----------RVDSQGKEMRRSKS 1819
               :||:.|...||:|:....|      |:..||....::.          |.||..::::|...
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  Fly  1874 V----ANERDILRDSEEEE------PKTPD----TPRAAQVSKPKRWRQLQPEMDALEPESPGRD 1924
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  Fly  7035 VRDVTAASKKVLRESPQSENTATLREKLDDLKEIVDTVAQLCSER--------LGILEQALPLSE 7091

  Fly  1925 SFYSPDKESGFDAEPLVFSDDEDIPRFSLEMTSTIDSDSDTSRIMTPSTKNPNPFLSKVLESLSS 1989
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  Fly  2303 VLKGDVKRQQLQEKELKQFSLAPHCSADLDYMRCCLKVTRLREHWDETSQCVLQRAAQLKNMLSD 2367
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  Fly  2368 SQRFEAKRLELEKWLARMEQRAERMGTIATTADILEAQQKEQKSFHAELHQNKQHFDIFNELTQK 2432
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  Fly  7485 LTERTSPEQAASIREPLSVVNRRWEALLRGMVERQKQLEHALLH-LGQFQHALNELLVWINKTDS 7548

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  Fly  7549 TLDQLK-PIPGDPQLLEVELAKLKVLANDIQAHQNSVDTLNDAGRQLIETEKGSVEASTTQEKLR 7612

  Fly  2555 EMNQRWNNLKSKSIAIRNRLESNSEHWNALLLSLRELTEWVIRKDTELSTLGLG-PVRGDAVSLQ 2618
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  Fly  2747 VGEA-NEQMQQLQRLRDKMTT---ASALLDDCNEQQSFFTANQVLVPTPCLSKLEDLNTRMKLLQ 2807
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  Fly  7832 VSVQHRWERVVSKAAERTRALDHGYKEAREFNDAWSGMMQYLQETEQVLDQIIEEATAS------ 7890

  Fly  2868 IDHERETTHWDHPEMIELMKGLADLNEIRFSAYRTAMKLRSVQKRLALDRI----SMSTACESFD 2928
                      ..|:.|:...|                ||:...::|...:.    :|.|.....:
  Fly  7891 ----------KEPQKIKKYIG----------------KLKETHRQLGAKQSVYDGTMRTGKNLLE 7929

  Fly  2929 R--HGLRAQNDK-LIDIPDMTTVLHSLYVTID---KIDLTLMLD--------LAINWI------L 2973
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            ..|                  :.:..:..|...|..|.:    |:..|.|.||           |
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            :....:.  ||:.::| |..|.     ...|.:.||::..     |.:..|:..|.
  Fly  8214 QLPDEIP--PVEKLIE-DHKEF-----MENTARRQNEVDR-----ACKPRQLPPGARKPSRSGKT 8265

  Fly  3242 --------------TGSNSTP--DSDDEHQLIAQYCQALPGTSNGS----APKSPV--------- 3277
                          .||..||  |:.|..:|.....:..|.||...    :|::.:
  Fly  8266 PVFKGSRDQGLNARKGSRITPTRDTPDRDRLPHYGPRFSPSTSGPELEFRSPRAKLLWTKWRDVW 8330

  Fly  3278 ------------QVMAAMDAEQREEL------EAIIRDLEEENANLQAEYQQLCSKEQSGM-PED 3323
                        .::...|.|:....      :..::.:..:.:.|...:::: .|:.:|| |.|
  Fly  8331 MLSWERQRLLNDHLLYLKDVERARNFSWDDWRKRFLKYMNHKKSRLTDLFRKM-DKDNNGMIPRD 8394

  Fly  3324 --SNGMQHSSSSMTGL-----------SGQG-EQGQDMMA--------------------EAKLL 3354
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  Fly  8395 VFIDGILNTKFDTSGLEMKAVADLFDRNGEGLIDWQEFIAALRPDWQERKPANDSDKIHDEVKRL 8459

  Fly  3355 ------RQHKGRLEARMQILEDHNRQLEAQLQRLRQLLDEP----NGGGSSATSSGLPSAPGSAL 3409
                  || |.|:   .|:.|...|..::|..||.::|...    .|||..|....|........
  Fly  8460 VMLCTCRQ-KFRV---FQVGEGKYRFGDSQKLRLVRILRSTVMVRVGGGWVALDEFLQKNDPCRA 8520

  Fly  3410 NSKPN------------TLQTRSVTASQLNTDSPAKMNQQNGHYEHNSKGIMLPGMNSEIQQQHA 3462
            ..:.|            ..|:.:....:.:|.:.|.....:.|..:.....:.|.|:.:
  Fly  8521 KGRTNIELREQFILADGVSQSMAAFTPRRSTPNAAATASSSPHAHNGGSSNLPPYMSGQ------ 8579

  Fly  3463 QLASLAAKHHQHQLSGALNALHQQQQQQLQQQPPQQQRSMMTGNGGMDISGGMQTSGGYLGDDGR 3527
                           |.:..:.::..:.:....|  .||.::.:....:|   ...|.:.|..||
  Fly  8580 ---------------GPIIKVRERSVRSIPMSRP--SRSSLSASTPDSLS---DNEGSHGGPSGR 8624

  Fly  3528 PPP---------------------PPHSSLMQQQHQQHLNENSSGLVTVITEQELESINDDLEDS 3571
            ..|                     .|:|..:.:|..:..:.:.|.|....|:....|.....:.|
  Fly  8625 YTPRKVTYTSTRTGLTPGGSRAGSKPNSRPLSRQGSKPPSRHGSTLSLDSTDDHTPSRIPQRKPS 8689

  Fly  3572 SSSNTTNTT--------TTTTT-------TAT-TEKT 3592
            :.|..:.||        |||||       |:| |.||
  Fly  8690 TGSTASGTTPRPARLSVTTTTTPGSRLNGTSTITRKT 8726

Known Domains

Gene	Sequence	Domain	Region	External ID	Identity
Dys	NP_001036722.1	CH_DMD-like_rpt1	12..118	CDD:409035	18/90 (20%)
		CH_SF	129..229	CDD:469584	20/131 (15%)
		SPEC	312..525	CDD:238103	54/282 (19%)
		PRK03918	<716..1238	CDD:235175	117/621 (19%)
		SMC_prok_B	<995..1279	CDD:274008	64/333 (19%)
		SPEC	1174..1365	CDD:238103	37/234 (16%)
		SPEC	1289..1485	CDD:413338	38/212 (18%)
		SPEC	2369..2576	CDD:238103	51/214 (24%)
		SPEC	2477..2714	CDD:238103	52/246 (21%)
		WW	2852..2882	CDD:238122	4/29 (14%)
		EFh_DMD_like	2919..3085	CDD:320000	46/200 (23%)
		EF-hand-like motif	2919..2958	CDD:320000	13/44 (30%)
		EF-hand-like motif	2961..2995	CDD:320000	9/51 (18%)
		EF-hand-like motif	3001..3037	CDD:320000	8/43 (19%)
		EF-hand-like motif	3050..3085	CDD:320000	7/35 (20%)
		ZZ_dystrophin	3110..3158	CDD:239074	9/58 (16%)
shot	NP_725339.1	SAC6	204..>420	CDD:227401
		CH_PLEC-like_rpt2	223..327	CDD:409038
		SPEC	471..689	CDD:238103
		SPEC	690..866	CDD:238103
		SH3_10	864..929	CDD:407754
		SPEC	1047..1250	CDD:238103
		SPEC	1153..1390	CDD:238103
		PLEC	<1498..1526	CDD:197605
		Plectin	1949..1980	CDD:459901
		DUF5585	2860..>3198	CDD:465521
		SMC_prok_B	<4936..>5564	CDD:274008	67/384 (17%)
		SPEC	5304..5513	CDD:238103	34/214 (16%)
		SPEC	<5658..5787	CDD:413338	33/131 (25%)
		SPEC	5793..6007	CDD:238103	57/275 (21%)
		SPEC	6011..6220	CDD:238103	42/224 (19%)
		SPEC	6118..6330	CDD:238103	46/226 (20%)
		PRK09039	<6279..6441	CDD:181619	40/194 (21%)
		SPEC	6443..6660	CDD:238103	34/216 (16%)
		SPEC	6663..6878	CDD:238103	52/291 (18%)
		SPEC	6880..7087	CDD:238103	53/308 (17%)
		SPEC	6986..7196	CDD:238103	59/281 (21%)
		SPEC	7196..7417	CDD:238103	50/285 (18%)
		SPEC	7314..7526	CDD:238103	45/222 (20%)
		SPEC	7528..7747	CDD:238103	53/248 (21%)
		SPEC	7749..7968	CDD:238103	52/265 (20%)
		SPEC	7973..8181	CDD:238103	45/246 (18%)
		FRQ1	<8375..8444	CDD:444056	13/69 (19%)
		GAS2	8450..8522	CDD:128539	19/75 (25%)
		PHA03307	8550..>8795	CDD:223039	36/203 (18%)