Protein Alignment Mrp4 and VMR1

DIOPT Version :10

• Sequence 1: NP_650086.2
• Gene: Mrp4 / 41387
• FlyBaseID: FBgn0263316
• Length: 1316
• Species: Drosophila melanogaster
• Sequence 2: NP_011828.1
• Gene: VMR1 / 856350
• SGDID: S000001027
• Length: 1592
• Species: Saccharomyces cerevisiae
• Alignment Length: 1417
• Identity: 419/1417 - (29%)
• Similarity: 711/1417 - (50%)
• Gaps: 196/1417 - (13%)

  Fly     7 DELPENPRER-SSPLSSLMFCFALPVLFKGRKKTLEQKDLYRALKEHKSDSLGDRLCAAWDEQVA 70
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Yeast   261 DDHTSPSREHISSILSCITWSWITNFIWEAQKNTIKLKDIWGLSMEDYSIF------------IL 313

  Fly    71 KNETPR------LGRALTKVFGFHLFITGVFLLAQEFLTKVTQPICLIGVMAYFAGNDPDRSK-- 127
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Yeast   314 KGFTRRNKHINNLTLALFESFKTYLLIGMLWVLVNSIVNLL--PTILMKRFLEIVDN-PNRSSSC 375

  Fly   128 ---AQLWAAGL-IAGSVFSVCIGHPYMLGLLHLGMKMRIALSSLIYRKALR----LSRTALGDT- 183
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Yeast   376 MNLAWLYIIGMFICRLTLAICNSQGQFVS-DKICLRIRAILIGEIYAKGLRRRLFTSPKTSSDSD 439

  Fly   184 ----TVGQVVNLLSNDVGRFDLVLINVHYLWI---APLELIAVTYLMYLEIGISSMFGVAIMLLF 241
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Yeast   440 SISANLGTIINLISIDSFKVSEL---ANYLYVTVQAVIMIIVVVGLLFNFLGVSAFAGISIILVM 501

  Fly   242 LPFQSYLGKRTSVLRLRTALRTDERVRMMNEIISGIQVIKMYAWEKPFGKVVEMTRFNEMLCIKQ 306
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Yeast   502 FPLNFLLANLLGKFQKQTLKCTDQRISKLNECLQNIRIVKYFAWERNIINEIKSIRQKELRSLLK 566

  Fly   307 VNYIRGILISFAMFLSRIFTSSSLIAFVLLGNI----LNAEKAFFVTAYYNILRRSVTMFFPQGI 367
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Yeast   567 KSLVWSV-TSFLWFVTPTLVTG--VTFAICTFVQHEDLNAPLAFTTLSLFTLLKTPLDQ-LSNML 627

  Fly   368 SEFAELLVSVRRLEAFMHRPETKVRDKSKVKNANQKAESPNGDSPKGNGIPENLIEFSQFQARWE 432
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Yeast   628 SFINQSKVSLKRISDFLRMDDT--------EKYNQLTISPD----------KNKIEFKNATLTWN 674

  Fly   433 SHSLEPT---LEDINLQLGRRKLVAVIGPVGAGKSSLIQAILGELPGESGTL------------- 481
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Yeast   675 ENDSDMNAFKLCGLNIKFQIGKLNLILGSTGSGKSALLLGLLGELNLISGSIIVPSLEPKHDLIP 739

  Fly   482 ---RINGSYSYAAQEPWLFTGTVRQNILFGLDWDKHRYRTVVKKCALERDFELLPFGDKTIVGER 543
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Yeast   740 DCEGLTNSFAYCSQSAWLLNDTVKNNIIFDNFYNEDRYNKVIDACGLKRDLEILPAGDLTEIGEK 804

  Fly   544 GASLSGGQKARISLARAVYRRADIYLLDDPLSAVDTHVGRHLFDQCMRG-YLRSELVILVTHQLQ 607
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Yeast   805 GITLSGGQKQRISLARAVYSSAKHVLLDDCLSAVDSHTAVWIYENCITGPLMKNRTCILVTHNVS 869

  Fly   608 F-LEQADLIVIMDKGRISAMGTYSSMKRSGL---DFAQLLTAPNKDAEDLDEIDGAGGDGLDLLN 668
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Yeast   870 LTLRNAHFAIVLENGKVKNQGTITELQSKGLFKEKYVQLSSR-----------DSINEKNANRLK 923

  Fly   669 VPSLSRRGSKNSKPSTRNNSFTSLSSMAESMAQEASLQMQETRVEGKIGLGLYKEYLTSGSSWFM 733
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Yeast   924 AP--RKNDSQKIEPVTENINFDA------NFVNDGQLIEEEEKSNGAISPDVYK--------WYL 972

  Fly   734 IFFMVF--------LCLATQILCSAADYFLSYWV-DKNV--------------DGQTDINTDPQD 775
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Yeast   973 KFFGGFKALTALFALYITAQILFISQSWWIRHWVNDTNVRINAPGFAMDTLPLKGMTDSSKNKHN 1037

  Fly   776 MYYFAALNVAVVVFTIV----RTMLFYKMAMRSSTQLHNAMYQGITRAAMYFFNTNPSGRILNRF 836
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Yeast  1038 AFYYLTVYFLIGIIQAMLGGFKTMMTFLSGMRASRKIFNNLLDLVLHAQIRFFDVTPVGRIMNRF 1102

  Fly   837 SKDLGQLD-EVLPSVMLDVVQLFLTLLGIIVVICITNPYYLILTLALAIIFYYIREFYLKTSRDV 900
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Yeast  1103 SKDIEGVDQELIPYLEVTIFCL-IQCASIIFLITVITPRFLTVAVIVFVLYFFVGKWYLTASREL 1166

  Fly   901 KRLEAVARSPIYSHLSATITGLPTIRALGAQKELIAEFDNLQDLHSSGYYTFLATNRAFGYYLD- 964
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Yeast  1167 KRLDSITKSPIFQHFSETLVGVCTIRAFGDERRFILENMNKIDQNNRAFFYLSVTVKWFSFRVDM 1231

  Fly   965 --CFCTL----YIVIIILNYFINPPQSPGEVGLAITQAMGMTGMVQWAMRQSAELENTMTAVERV 1023
              .|..|    :|::.|.|.      ..|..|:::|.|:..|....|.:|..:..|..|.:|||:
Yeast  1232 IGAFIVLASGSFILLNIANI------DSGLAGISLTYAILFTDGALWLVRLYSTFEMNMNSVERL 1290

  Fly  1024 VEYDEIEPEGEFDSREGK---KPSPSWPEKGEIIAEDLCLRYFPD-PQAKYVLKALNFRIRPCEK 1084
            .||..||.|......||:   ...||||:.|||..|:|.|||.|: |.   |::.::|::.|..|
Yeast  1291 KEYSSIEQENYLGHDEGRILLLNEPSWPKDGEIEIENLSLRYAPNLPP---VIRNVSFKVDPQSK 1352

  Fly  1085 VGIVGRTGAGKSSLINALFR-LSYNEGIITIDERDTADMGLFDLRSKISIIPQEPVLFSGSMRYN 1148
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Yeast  1353 IGIVGRTGAGKSTIITALFRLLEPITGCIKIDGQDISKIDLVTLRRSITIIPQDPILFAGTIKSN 1417

  Fly  1149 LDPFEEYNDAKLWDALEEVKLKPLIS-----ELPN-------------GLQSKISEGGSNFSVGQ 1195
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Yeast  1418 VDPYDEYDEKKIFKALSQVN---LISSHEFEEVLNSEERFNSTHNKFLNLHTEIAEGGLNLSQGE 1479

  Fly  1196 RQLVCLARAILRENRVLVMDEATANVDPQTDALIQATIRSKFRDCTVLTIAHRLNTIMDSDRVLV 1260
            |||:.:||::|||.:::::||||:::|..:|.|||..|||:|...|:|||||||.:::|.||::|
Yeast  1480 RQLLFIARSLLREPKIILLDEATSSIDYDSDHLIQGIIRSEFNKSTILTIAHRLRSVIDYDRIIV 1544

  Fly  1261 MDAGHLVEFGSPYELLTSSESKIFHGMVMETGQNTFDSLLKVAEKAHLESMK 1312
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Yeast  1545 MDAGEVKEYDRPSELL-KDERGIFYSMCRDSGGL---ELLKQIAKQSSKMMK 1592

Known Domains

Gene	Sequence	Domain	Region	External ID	Identity
Mrp4	NP_650086.2	MRP_assoc_pro	13..1292	CDD:188098	411/1389 (30%)
VMR1	NP_011828.1	MRP_assoc_pro	212..1575	CDD:188098	412/1395 (30%)