DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment Mrp4 and CG7627

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_650086.2 Gene:Mrp4 / 41387 FlyBaseID:FBgn0263316 Length:1316 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:NP_609215.3 Gene:CG7627 / 34148 FlyBaseID:FBgn0032026 Length:1355 Species:Drosophila melanogaster


Alignment Length:1359 Identity:816/1359 - (60%)
Similarity:1025/1359 - (75%) Gaps:68/1359 - (5%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly     1 MQSMKADELPENPRERSSPLSSLMFCFALPVLFKGRKKTLEQKDLYRALKEHKSDSLGDRLCAAW 65
            |||:|..:|||||||..:.:|:..|.:.:|...||||:||:.||||||||||||::||::|||:|
  Fly     1 MQSLKTADLPENPREHCNFISAACFWYTMPTFIKGRKRTLDTKDLYRALKEHKSETLGNKLCASW 65

  Fly    66 DEQVAKNE-TPRLGRALTKVFGFHLFITGVFLLAQEFLTKVTQPICLIGVMAYFAGNDPDRSKAQ 129
            :.::.|.: .|.|.|||.:|||::..:.|:.|...|...:..|||.|:.::||:.........|.
  Fly    66 ELELEKTKGKPNLLRALLRVFGWYFALLGLVLFLLELGLRTLQPIFLLKLIAYYTHGSESIESAY 130

  Fly   130 LWAAGLIAGSVFSVCIGHPYMLGLLHLGMKMRIALSSLIYRKALRLSRTALGDTTVGQVVNLLSN 194
            .:|||:|..|..:|.|.||||||.:|:|:|||:.:.|:|||||||||::||||||.|.||||:||
  Fly   131 YYAAGVILCSALNVIIMHPYMLGTMHVGLKMRVGMCSMIYRKALRLSKSALGDTTAGHVVNLMSN 195

  Fly   195 DVGRFDLVLINVHYLWIAPLELIAVTYLMYLEIGISSMFGVAIMLLFLPFQSYLGKRTSVLRLRT 259
            ||||.||..|.|||||:.|||.:.:|||||.||||:::||||.||||:|.|:|||||||||||||
  Fly   196 DVGRLDLATIFVHYLWVGPLETLFITYLMYREIGIAAVFGVAFMLLFIPLQAYLGKRTSVLRLRT 260

  Fly   260 ALRTDERVRMMNEIISGIQVIKMYAWEKPFGKVVEMTRFNEMLCIKQVNYIRGILISFAMFLSRI 324
            |||||||||||||||||||||||||||.||..:|...|..|:..|:.|:||||||:||.:||:|:
  Fly   261 ALRTDERVRMMNEIISGIQVIKMYAWELPFEHMVAFARKKEINAIRHVSYIRGILLSFIIFLTRV 325

  Fly   325 FTSSSLIAFVLLGNILNAEKAFFVTAYYNILRRSVTMFFPQGISEFAELLVSVRRLEAFMHRPET 389
            ....||:.:||||..|..|.||.:||||||||.::|:|||||||:.||.|||::|::.:|...||
  Fly   326 SIFLSLVGYVLLGTFLTPEVAFLITAYYNILRTTMTVFFPQGISQMAETLVSIKRVQKYMQSDET 390

  Fly   390 KVRDKS-----KVKNANQKAESPNGDSPKGNG-----------IPENL------IEFSQFQARWE 432
            .|.|.|     ..:.:||:....:||..:...           :.||.      |..|...|:|:
  Fly   391 NVMDMSVDLTEDFQGSNQETVHADGDEERDEAEDKLLGPPIATVNENAKLSEAGISISGLMAKWD 455

  Fly   433 SHSLEPTLEDINLQLGRRKLVAVIGPVGAGKSSLIQAILGELPGESGTLRINGSYSYAAQEPWLF 497
            .:|.:.:|..:||::....::.::|..|:||||||||||||||.|||.:::|||.|||:||||||
  Fly   456 VNSPDYSLNGVNLRVQPGTMLGIVGRTGSGKSSLIQAILGELPAESGEIKVNGSMSYASQEPWLF 520

  Fly   498 TGTVRQNILFGLDWDKHRYRTVVKKCALERDFELLPFGDKTIVGERGASLSGGQKARISLARAVY 562
            :||||||||||...|:.||..||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
  Fly   521 SGTVRQNILFGQPMDRRRYAKVVKKCALERDFELLPFKDKTIVGERGASLSGGQKARISLARAVY 585

  Fly   563 RRADIYLLDDPLSAVDTHVGRHLFDQCMRGYLRSELVILVTHQLQFLEQADLIVIMDKGRISAMG 627
            |...|||||||||||||||.||||:||||||||..:|||.|||||||:.||.||||||||:||:|
  Fly   586 RETSIYLLDDPLSAVDTHVARHLFEQCMRGYLRERIVILATHQLQFLQHADQIVIMDKGRVSAVG 650

  Fly   628 TYSSMKRSGLDFAQLLTAPNKDAEDLDEIDGAGGDGLDLLNVPSLSRRGS-KNSKPSTRNNSFTS 691
            ||.|::.||||||.:|..|.:|.:..:.               |.||.|| .:|....|.||..|
  Fly   651 TYESLRESGLDFASMLADPERDEQSEER---------------SRSRSGSYTHSHSDQRRNSEQS 700

  Fly   692 LSSMAESMAQEASLQM---QETRVEGKIGLGLYKEYLTSGSSWFMIFFMVFLCLATQILCSAADY 753
            |.|||:|...:...:.   ||.:..|:|||.||.:|..:|..:|..|.|:..|:.:|.|.|..||
  Fly   701 LLSMADSCMDDLEAEQANNQERQEAGQIGLRLYSKYFKAGGGFFAFFVMMGFCVLSQGLASLGDY 765

  Fly   754 FLSYWVDK--NVDGQTDIN-------TDPQ-----------------DMYYFAALNVAVVVFTIV 792
            ||||||.|  ||..:.|.|       .:|:                 |.|.|..:.|..::.|:.
  Fly   766 FLSYWVTKKGNVAYRADNNDTTRSEELEPRLSTWLRDIGLSVDAEMLDTYIFTVITVLTILVTVA 830

  Fly   793 RTMLFYKMAMRSSTQLHNAMYQGITRAAMYFFNTNPSGRILNRFSKDLGQLDEVLPSVMLDVVQL 857
            |:.||:.:||::|.:|||:|::|||||||||||||||||||||||||:||:||:||:||:||:|:
  Fly   831 RSFLFFNLAMKASIRLHNSMFRGITRAAMYFFNTNPSGRILNRFSKDMGQVDEILPAVMMDVIQI 895

  Fly   858 FLTLLGIIVVICITNPYYLILTLALAIIFYYIREFYLKTSRDVKRLEAVARSPIYSHLSATITGL 922
            ||.|.||::||.:.||.:||.|:.|.||||.:|.|||||||||||:||:.|||:||||:|::|||
  Fly   896 FLALAGIVIVIAVVNPLFLIPTVVLGIIFYQLRTFYLKTSRDVKRMEAITRSPVYSHLAASLTGL 960

  Fly   923 PTIRALGAQKELIAEFDNLQDLHSSGYYTFLATNRAFGYYLDCFCTLYIVIIILNYFINPPQSPG 987
            .||||.|||:.|.|||||.||:|||.:|.|::|:|||||:|||||.:||.||.|::||.||.:.|
  Fly   961 STIRAFGAQRVLEAEFDNYQDMHSSAFYMFISTSRAFGYWLDCFCVIYIAIITLSFFIFPPANGG 1025

  Fly   988 EVGLAITQAMGMTGMVQWAMRQSAELENTMTAVERVVEYDEIEPEGEFDSREGKKPSPSWPEKGE 1052
            :|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||::|||||..::...|||..||||:|:
  Fly  1026 DVGLAITQAMGMTGMVQWGMRQSAELENTMTAVERVVEYEDIEPEGALEAPADKKPPKSWPEQGK 1090

  Fly  1053 IIAEDLCLRYFPDPQAKYVLKALNFRIRPCEKVGIVGRTGAGKSSLINALFRLSYNEGIITIDER 1117
            |:.::|.|||.|||:::.|||:|:|.|:|.||||||||||||||||||||||||||:|.:.||:|
  Fly  1091 IVFDELSLRYTPDPKSENVLKSLSFVIKPKEKVGIVGRTGAGKSSLINALFRLSYNDGSVLIDKR 1155

  Fly  1118 DTADMGLFDLRSKISIIPQEPVLFSGSMRYNLDPFEEYNDAKLWDALEEVKLKPLISELPNGLQS 1182
            ||::|||.||||||||||||||||||:||||||||:||:|.|||.:|||||||.::::||:||||
  Fly  1156 DTSEMGLHDLRSKISIIPQEPVLFSGTMRYNLDPFDEYSDDKLWRSLEEVKLKEVVADLPSGLQS 1220

  Fly  1183 KISEGGSNFSVGQRQLVCLARAILRENRVLVMDEATANVDPQTDALIQATIRSKFRDCTVLTIAH 1247
            ||:|||:|||||||||||||||||||||:|||||||||||||||.|||.|||:||::||||||||
  Fly  1221 KITEGGTNFSVGQRQLVCLARAILRENRILVMDEATANVDPQTDGLIQTTIRNKFKECTVLTIAH 1285

  Fly  1248 RLNTIMDSDRVLVMDAGHLVEFGSPYELLTSSESKIFHGMVMETGQNTFDSLLKVAEKA 1306
            ||:||||||:|||||||..||||:||||||.::||:|||||.:||..|::||||:|:||
  Fly  1286 RLHTIMDSDKVLVMDAGRAVEFGTPYELLTLADSKVFHGMVKQTGHATYESLLKIAQKA 1344

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
Mrp4NP_650086.2 MRP_assoc_pro 13..1292 CDD:188098 798/1331 (60%)
CG7627NP_609215.3 PLN03130 13..1348 CDD:215595 808/1347 (60%)

Return to query results.
Submit another query.