DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment Mrp4 and CG31793

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_650086.2 Gene:Mrp4 / 41387 FlyBaseID:FBgn0263316 Length:1316 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:NP_609930.4 Gene:CG31793 / 326161 FlyBaseID:FBgn0051793 Length:1307 Species:Drosophila melanogaster


Alignment Length:1322 Identity:822/1322 - (62%)
Similarity:1028/1322 - (77%) Gaps:43/1322 - (3%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly     4 MKADELPENPRERSSPLSSLMFCFALPVLFKGRKKTLEQKDLYRALKEHKSDSLGDRLCAAWDEQ 68
            |:|.:||.||||.:..|||||||||||:||||||:||:..|||:.|.||::.||||.....|:::
  Fly     1 MQASKLPPNPRESAGILSSLMFCFALPILFKGRKQTLQPTDLYKTLNEHEAASLGDEFFQGWEDE 65

  Fly    69 VAK-------NETPRLGRALTKVFGFHLFITGVFLLAQEFLTKVTQPICLIGVMAYFAGNDPDRS 126
            ||:       ...|.:.|.:.:|||:.|.::|:.:.|.|..|:.|.|:.|.|:::.|:.:....|
  Fly    66 VARCRRKGDSGRKPSVLRVIGRVFGWRLIMSGITIAALELGTRATVPLLLAGLISEFSEHGNGHS 130

  Fly   127 -KAQLWAAGLIAGSVFSVCIGHPYMLGLLHLGMKMRIALSSLIYRKALRLSRTALGDTTVGQVVN 190
             .||::|..|||..:.||.:.||||:|::||.||||:|:||.|||||||||||:||.||.|||||
  Fly   131 YNAQIYAVLLIACILASVLLTHPYMMGMMHLAMKMRVAVSSAIYRKALRLSRTSLGGTTTGQVVN 195

  Fly   191 LLSNDVGRFDLVLINVHYLWIAPLELIAVTYLMYLEIGISSMFGVAIMLLFLPFQSYLGKRTSVL 255
            |||||:.|||..||:.|:||:.||||:..:|.:|.:||::|.:|::|::|:||.|:||.:.||.|
  Fly   196 LLSNDLNRFDRCLIHFHFLWLGPLELLIASYFLYEQIGMASFYGISILVLYLPLQTYLSRVTSKL 260

  Fly   256 RLRTALRTDERVRMMNEIISGIQVIKMYAWEKPFGKVVEMTRFNEMLCIKQVNYIRGILISFAMF 320
            ||:||||||:||||||||||||||||||.||:||||::...|.:||..|:|:|.:||||:||.:.
  Fly   261 RLQTALRTDQRVRMMNEIISGIQVIKMYTWERPFGKLIGQMRRSEMSSIRQMNLLRGILLSFEIT 325

  Fly   321 LSRIFTSSSLIAFVLLGNILNAEKAFFVTAYYNILRRSVTMFFPQGISEFAELLVSVRRLEAFMH 385
            |.||....||:.|||.|..|.||:||.|||:||||||:|:.|||.|:|:|||||||:||:..||.
  Fly   326 LGRIAIFVSLLGFVLGGGELTAERAFCVTAFYNILRRTVSKFFPSGMSQFAELLVSMRRITNFMM 390

  Fly   386 RPETKVRDKSKVKNANQKAES--------PNGDSPKGNG-IPENLIEFSQFQARW--ESHSLEPT 439
            |.|..|.|.|  :..::|||.        .....|.|.| .|:.|:|....:|||  |.|.|  .
  Fly   391 REEANVIDMS--ERRDEKAEEEQHLLKEVEKRSYPVGIGKEPDTLVEIKALRARWGQEQHDL--V 451

  Fly   440 LEDINLQLGRRKLVAVIGPVGAGKSSLIQAILGELPGESGTLRINGSYSYAAQEPWLFTGTVRQN 504
            |.::|:.|.|.:|||||||||:||||||||||||||.|||:::::|.||||:||||||..:||.|
  Fly   452 LNNVNMSLRRGQLVAVIGPVGSGKSSLIQAILGELPPESGSVQVSGKYSYASQEPWLFNASVRDN 516

  Fly   505 ILFGLDWDKHRYRTVVKKCALERDFELLPFGDKTIVGERGASLSGGQKARISLARAVYRRADIYL 569
            |||||..||.|||||:|:||||||.||| .||.||||||||||||||:|||.||||||||||:||
  Fly   517 ILFGLPMDKQRYRTVLKRCALERDLELL-HGDGTIVGERGASLSGGQRARICLARAVYRRADVYL 580

  Fly   570 LDDPLSAVDTHVGRHLFDQCMRGYLRSELVILVTHQLQFLEQADLIVIMDKGRISAMGTYSSMKR 634
            ||||||||||||||||||:||||:|..:|||||||||||||.||||||||||.:||.|||..|.:
  Fly   581 LDDPLSAVDTHVGRHLFDECMRGFLGKQLVILVTHQLQFLEDADLIVIMDKGHVSACGTYEEMLK 645

  Fly   635 SGLDFAQLLTAPNKDAEDLDEIDGAGGDGLDLLNVPSLSRRGSKNSKPSTRNNSFTSLSSMAE-S 698
            ||.||||||....:::        .|||  :::..|:|||:.|..|..|: |.|.:||.||.| .
  Fly   646 SGQDFAQLLVESTQNS--------GGGD--EIITSPNLSRQSSALSTKSS-NGSSSSLESMVEKE 699

  Fly   699 MAQEASLQMQETRVEGKIGLGLYKEYLTSGSSWFMIFFMVFLCLATQILCSAADYFLSYWVDKNV 763
            ..:.:::..||:|..|:|||.:||:|..:|....:...::.||:.||||.|..||||||||....
  Fly   700 KPKPSAVSSQESRSGGQIGLSMYKKYFGAGCGVLVFVVLIMLCIGTQILASGGDYFLSYWVKNTA 764

  Fly   764 DGQTDINTDPQDMYYFAALNVAVVVFTIVRTMLFYKMAMRSSTQLHNAMYQGITRAAMYFFNTNP 828
            ...|      .|:|||.|:||.:|:..::||:||:.:.|.|||:|||.|:||::|.|:|||:|||
  Fly   765 SSST------LDIYYFTAINVGLVICALLRTLLFFNITMHSSTELHNTMFQGLSRTALYFFHTNP 823

  Fly   829 SGRILNRFSKDLGQLDEVLPSVMLDVVQLFLTLLGIIVVICITNPYYLILTLALAIIFYYIREFY 893
            ||||||||:.||||:|||:|:||||.:|:||||.|||.|:|:|||:|||.|.|:.:.|||.|:||
  Fly   824 SGRILNRFANDLGQVDEVMPAVMLDCIQIFLTLTGIICVLCVTNPWYLINTFAMMLAFYYWRDFY 888

  Fly   894 LKTSRDVKRLEAVARSPIYSHLSATITGLPTIRALGAQKELIAEFDNLQDLHSSGYYTFLATNRA 958
            |||||||||||||||||:|||.|||:.|||||||:|||:.||.::||.|||||||||||::|:||
  Fly   889 LKTSRDVKRLEAVARSPMYSHFSATLVGLPTIRAMGAQQTLIGQYDNYQDLHSSGYYTFVSTSRA 953

  Fly   959 FGYYLDCFCTLYIVIIILNYFINPP-QSPGEVGLAITQAMGMTGMVQWAMRQSAELENTMTAVER 1022
            ||||||.||..|::.:||:.|.||| .:.|::|||||||:||||||||.|||||||||.||:|||
  Fly   954 FGYYLDLFCVAYVISVILHNFFNPPLHNAGQIGLAITQALGMTGMVQWGMRQSAELENAMTSVER 1018

  Fly  1023 VVEYDEIEPEGEFDSREGKKPSPSWPEKGEIIAEDLCLRYFPDPQAKYVLKALNFRIRPCEKVGI 1087
            |:||.:::|||:|:|...|:|..|||::|:::.:||.|||.||..:..|||.|:|.|:|.|||||
  Fly  1019 VLEYKDLDPEGDFNSPAEKQPPKSWPKEGKLVTKDLSLRYEPDTNSPCVLKGLSFTIQPMEKVGI 1083

  Fly  1088 VGRTGAGKSSLINALFRLSYNEGIITIDERDTADMGLFDLRSKISIIPQEPVLFSGSMRYNLDPF 1152
            |||||||||||||||||||||:|.|.||..||.|:||.||||||||||||||||||:||||||||
  Fly  1084 VGRTGAGKSSLINALFRLSYNDGAILIDSLDTNDIGLHDLRSKISIIPQEPVLFSGTMRYNLDPF 1148

  Fly  1153 EEYNDAKLWDALEEVKLKPLISELPNGLQSKISEGGSNFSVGQRQLVCLARAILRENRVLVMDEA 1217
            |:|.|.|||.|||:|.||..|||||:||||.|||||:|||||||||||||||||||||:||||||
  Fly  1149 EQYPDDKLWKALEDVHLKEEISELPSGLQSIISEGGTNFSVGQRQLVCLARAILRENRILVMDEA 1213

  Fly  1218 TANVDPQTDALIQATIRSKFRDCTVLTIAHRLNTIMDSDRVLVMDAGHLVEFGSPYELLTSSESK 1282
            |||||||||||||||||:||:||||||||||||||||||:||||||||:|||||||||||:|::|
  Fly  1214 TANVDPQTDALIQATIRNKFKDCTVLTIAHRLNTIMDSDKVLVMDAGHVVEFGSPYELLTASKAK 1278

  Fly  1283 IFHGMVMETGQNTFDSLLKVAE 1304
            :||||||:||:.:||.||||||
  Fly  1279 VFHGMVMQTGKASFDHLLKVAE 1300

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
Mrp4NP_650086.2 MRP_assoc_pro 13..1292 CDD:188098 807/1299 (62%)
CG31793NP_609930.4 PLN03130 10..1305 CDD:215595 817/1313 (62%)

Return to query results.
Submit another query.