DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment Mrp4 and Cftr

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_650086.2 Gene:Mrp4 / 41387 FlyBaseID:FBgn0263316 Length:1316 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:XP_006236159.2 Gene:Cftr / 24255 RGDID:2332 Length:1665 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:1499 Identity:435/1499 - (29%)
Similarity:729/1499 - (48%) Gaps:227/1499 - (15%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly     7 DELPENPRERSSPLSSLMFCFALPVLFKGRKKTLEQKDLYRALKEHKSDSLGDRLCAAWDEQVAK 71
            |.:.::|.|::|.:|.|.|.:..|:|.||.:..||..|:|:|.....:|.|.::|...||.:.|.
  Rat   188 DIMQKSPLEKASFISKLFFSWTTPILRKGYRHHLELSDIYQAPSSDSADHLSEKLEREWDREQAS 252

  Fly    72 NETPRLGRALTKVFGFHLFITGVFLLAQEFLTKVTQPICLIGVMA-YFAGNDPDRSKAQLWAAGL 135
            .:.|:|..||.:.|.:.....||.|...| :||..||:.|..::| |...|..:||.|.....||
  Rat   253 KKKPQLIHALRRCFVWRFVFYGVLLYLGE-VTKAVQPVLLGRIIASYDPDNTEERSIAIYLGIGL 316

  Fly   136 IAGSVFSVCIGHPYMLGLLHLGMKMRIALSSLIYRKALRLSRTALGDTTVGQVVNLLSNDVGRFD 200
            ....:....:.||.:.||.|:||:||||:.||||:|.|:||...|...::||:::||||::.:||
  Rat   317 CLLFIVRTLLLHPAIFGLHHIGMQMRIAMFSLIYKKTLKLSSRVLDKISIGQLISLLSNNLNKFD 381

  Fly   201 LVLINVHYLWIAPLELIAVTYLMYLEIGISSMFGVAIMLLFLPFQSYLGKRTSVLRLRTALRTDE 265
            ..|...|::|||||:::.:..|::..:..|:..|:.::::.:.||:.|||.....|.:.|.:.:|
  Rat   382 EGLALAHFIWIAPLQVVLLMGLLWDLLQFSAFCGLGLLIVLVIFQAILGKMMVKYRDKRAAKINE 446

  Fly   266 RVRMMNEIISGIQVIKMYAWEKPFGKVVEMTRFNEMLCIKQVNYIRGILISFAMFLSRIF-TSSS 329
            |:.:.:|:|..|..:|.|.||....|::|..|..|:...::..|:| ...|.|.|.|..| ...|
  Rat   447 RLVITSEVIDNIYSVKAYCWESAMEKIIESLREEELKMTRRSAYMR-FFTSSAFFFSGFFVVFLS 510

  Fly   330 LIAFVLLGNILNAEKAFFVTAYYNILRRSVTMFFPQGISEFAELLVSVRRLEAFMHRPETKVRDK 394
            ::.:.::..|: ..|.|...::..:||.|||..||..:..:.:.|..:|:::.|:...|.||.:.
  Rat   511 VLPYTVINGIV-LRKIFTTISFCIVLRMSVTRQFPTAVQIWYDSLGMIRKIQDFLQTQEYKVLEY 574

  Fly   395 S------KVKNAN-----------QKAESPNGDSPKGNGIPENLIEFSQFQARWESHSL---EPT 439
            :      .::|..           :|.:..|.|....||  ||.:.|        ||..   .|.
  Rat   575 NLMFTGLVMENVTAFWEEGFQELLEKVQLNNDDRKTSNG--ENHLSF--------SHLCLVGNPV 629

  Fly   440 LEDINLQLGRRKLVAVIGPVGAGKSSLIQAILGELPGESGTLRINGSYSYAAQEPWLFTGTVRQN 504
            |::|||.:.:.:::|:.|..||||:||:..|||||....|.::.:|..|:::|..|:..||:::|
  Rat   630 LKNINLNIKKGEMLAITGSTGAGKTSLLMLILGELEASEGIIKHSGRVSFSSQISWIMPGTIKEN 694

  Fly   505 ILFGLDWDKHRYRTVVKKCALERDFELLPFGDKTIVGERGASLSGGQKARISLARAVYRRADIYL 569
            |:||:.:|::||::|||.|.|:.|.......|.|::||.|.:|||||:||||||||||:.||:||
  Rat   695 IIFGVSYDEYRYKSVVKACQLQEDITKFAEQDNTVLGEGGVTLSGGQRARISLARAVYKDADLYL 759

  Fly   570 LDDPLSAVDTHVGRHLFDQCMRGYLRSELVILVTHQLQFLEQADLIVIMDKGRISAMGTYSSMKR 634
            ||.|...:|......:|:.|:...:.|:..||||.:::.|::||.|:|:.:|.....||:|.::.
  Rat   760 LDSPFGYLDVLTEEQIFESCVCKLMASKTRILVTSKMEQLKKADKILILHEGSSYFYGTFSELQS 824

  Fly   635 SGLDFAQLL-------------------------------TAPNK-------------------- 648
            ...||:..|                               |..||                    
  Rat   825 LRPDFSSKLMGYDTFDQFTEERRSSILTETLRRFSVDDASTTWNKAKQSFRQTGEFGEKRKNSIL 889

  Fly   649 ---------------------DAEDLDE------IDGAGGDG----------------------L 664
                                 :::||.|      .|...|:.                      |
  Rat   890 SSFSSVKKISIVQKTPLSIEGESDDLQERRLSLVPDSEHGEAALPRSNMITAGPTFPGRRRQSVL 954

  Fly   665 DLLN-VPSLSRRGSKNSKPSTRNNSFTSLSSMAES------MAQEASLQMQE------------- 709
            ||:. .||......:.::.|.|..|.....|:.|.      ::|:::|.:.|             
  Rat   955 DLMTFTPSSVSSSLQRTRASIRKISLAPRISLKEEDIYSRRLSQDSTLNITEEINEEDLKECFFD 1019

  Fly   710 --TRVEGKIGLGLYKEYLTSGSSWFMIFFMVFLCLATQILCSAADYFLSYWVDKN--VDGQTD-- 768
              .::........|..|.|.....|.:.....|....::   ||..|: .|:.||  |:|..:  
  Rat  1020 DMVKIPTVTTWNTYLRYFTLHRGLFAVLIWCVLVFLVEV---AASLFV-LWLLKNNPVNGGNNGT 1080

  Fly   769 --INTD------PQDMYYFAALNVAV----VVFTIVRTMLFYKMAMRSSTQLHNAMYQGITRAAM 821
              .||.      ....||...:.|.|    :..::.|.:......:.:|..||..|...|..|.|
  Rat  1081 KIANTSYVVVITSSSFYYIFYIYVGVADTLLALSLFRGLPLVHTLITASKILHRKMLHSILHAPM 1145

  Fly   822 YFFNTNPSGRILNRFSKDLGQLDEVLPSVMLDVVQLFLTLLGIIVVICITNPYYLILTLALAIIF 886
            ..||...:|.||||||||:..||:.||..:.|.:||...::|.|:|:....||..:.|:....:|
  Rat  1146 STFNKLKAGGILNRFSKDIAILDDFLPLTIFDFIQLLFIVVGAIIVVSALQPYIFLATVPGLAVF 1210

  Fly   887 YYIREFYLKTSRDVKRLEAVARSPIYSHLSATITGLPTIRALGAQKELIAEFDNLQDLHSSGYYT 951
            ..:|.::|.||:.:|:||:..||||::||..::.||.|:||...|......|....:||::.::.
  Rat  1211 ILLRAYFLHTSQQLKQLESEGRSPIFTHLVTSLKGLWTLRAFRRQTYFETLFHKALNLHTANWFM 1275

  Fly   952 FLATNRAFGYYLDCFCTLYIVIIILNYFINPPQSPGEVGLAITQAMGMTGMVQWAMRQSAELENT 1016
            :|||.|.|...:|....|:.:::.....:...:..|..|:.:|.||.:...:|||:..|.:.::.
  Rat  1276 YLATLRWFQMRIDMIFVLFFIVVTFISILTTGEGEGTTGIILTLAMNIMSTLQWAVNSSIDTDSL 1340

  Fly  1017 MTAVERVVEYDEIEPEGEF-----------DS-------REGKKPSPSWPEKGEIIAEDLCLRYF 1063
            |.:|.||.::.:|:.|...           ||       .|..|...:||..||::.:||.::|.
  Rat  1341 MRSVSRVFKFIDIQTEESICTKIMKELHSEDSPNALVIKNEHVKKCDTWPSGGEMVVKDLTVKYV 1405

  Fly  1064 PDPQAKYVLKALNFRIRPCEKVGIVGRTGAGKSSLINALFRLSYNEGIITIDERDTADMGLFDLR 1128
            .|..|  :|:.::|.|.|.::||::||||:|||:|::|..|:...:|.|.||......|.|.:.|
  Rat  1406 DDGNA--ILENISFSISPGQRVGLLGRTGSGKSTLLSAFLRMLNIKGEIQIDGVSWNSMTLQEWR 1468

  Fly  1129 SKISIIPQEPVLFSGSMRYNLDPFEEYNDAKLWDALEEVKLKPLISELPNGLQSKISEGGSNFSV 1193
            ....:|.|:..:|||:.|.||||..::.|.::|...::|.||.:|.:.|..|...:.:||...|.
  Rat  1469 KAFGVITQKVFIFSGTFRQNLDPNGKWRDEEIWKVADQVGLKSVIEQFPGQLNFTLVDGGYVLSH 1533

  Fly  1194 GQRQLVCLARAILRENRVLVMDEATANVDPQTDALIQATIRSKFRDCTVLTIAHRLNTIMDSDRV 1258
            |.:||:||||::|.:.:::::||.:||:||.|..:|:..:|..|..|||:...||:..::|..|.
  Rat  1534 GHKQLMCLARSVLSKAKIILLDEPSANLDPITYQVIRRVLRQAFAGCTVVLCEHRIEAMLDCQRF 1598

  Fly  1259 LVMDAGHLVEFGSPYELL-----------TSSESKIFHGMVMETGQNTFDSLLKVAEKAHLESMK 1312
            ||::.|::.::.|...||           :|.:.|:|||                   .|....|
  Rat  1599 LVIEQGNVWQYESLQALLSEKSVFQRALSSSEKMKLFHG-------------------RHSSKQK 1644

  Fly  1313 PKSE 1316
            |:::
  Rat  1645 PRTQ 1648

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
Mrp4NP_650086.2 MRP_assoc_pro 13..1292 CDD:188098 431/1467 (29%)
CftrXP_006236159.2 None

Return to query results.
Submit another query.