DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment Mrp4 and mrp-3

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_650086.2 Gene:Mrp4 / 41387 FlyBaseID:FBgn0263316 Length:1316 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:NP_001359552.1 Gene:mrp-3 / 181677 WormBaseID:WBGene00003409 Length:1505 Species:Caenorhabditis elegans


Alignment Length:1358 Identity:436/1358 - (32%)
Similarity:724/1358 - (53%) Gaps:121/1358 - (8%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly     2 QSMKADELPENPRERSSPLSSLMFCFALPVLFKGRKKTLEQKDLYRALKEHKSDSLGDRLCAAW- 65
            |::|.      |.|.::.:|..:..:...::..|.::||...|::....:...:.|..|....| 
 Worm   189 QNLKC------PEENANFISRQLLLWFTQIISLGYERTLVADDVFEMDSQMDQEYLKARWKTEWL 247

  Fly    66 -------DEQVA---KNETPRLGRALTKVFG-FHLF----------------------------- 90
                   ::||.   |.|..|.|.....:.| |:.:                             
 Worm   248 KQTEKAREKQVKLDDKRERARTGSEKAPLLGTFNNYGAVNLDDKDRVIVQPSVIVTLWQIMKWEI 312

  Fly    91 ITGVFLLAQEFLTKVTQPICLIGVMAYF-AGNDPDRSKAQLWAAGL-IAGSVFSVCIGHPYMLGL 153
            :.|.|:.....|.:...|..|..::.:. ..|.|..:...| |.|| :||.:.|:.: :.|.:.:
 Worm   313 LGGSFIKFLSDLLQFANPTFLNYLILFIETPNAPLINGIGL-AVGLFLAGQIKSLFM-NTYFIAM 375

  Fly   154 LHLGMKMRIALSSLIYRKALRLSRTALGDTTVGQVVNLLSNDVGRFDLVLINVHYLWIAPLELIA 218
            ..:|.|::..||..:|.|:|.||.||..:.|||::||:||.||.||.::...:...|.:|.::|.
 Worm   376 TRVGAKIQTMLSCAVYEKSLLLSNTARRERTVGEMVNILSIDVDRFRMITPQIQQYWSSPFQIII 440

  Fly   219 VTYLMYLEIGISSMFGVAIMLLFLPFQSYLGKRTSVLRLRTALRTDERVRMMNEIISGIQVIKMY 283
            ...|:...||::...|:.:|:..:|....:...|...:||.....|||:|::||:::||:|:|:.
 Worm   441 CMVLLSQTIGVAVWAGIVVMISIVPINICVSMITKRWQLRLMKYKDERIRLINEVLNGIKVVKLS 505

  Fly   284 AWEKPFGKVVEMTRFNEMLCIKQVNYIRGILISFAMFL---SRIFTS-SSLIAFVLLG--NILNA 342
            |||....:.:|..|..|:..|||    ..:|.:||..|   :.:|.: ||...|||:.  |:|..
 Worm   506 AWETAMEETIERVRDKELKMIKQ----SALLKTFADCLNVGAPVFVALSSFTVFVLIDPKNVLTP 566

  Fly   343 EKAFFVTAYYNILRRSVTMFFPQGISEFAELLVSVRRLEAFMHRPETKVRDKSKVKNANQKAESP 407
            ..||...:.:|:||..: |...:.:::..:|:||.:|:..|:...|.   |.:.:          
 Worm   567 NIAFVSLSLFNLLRGPL-MMAAELVAQTVQLVVSNKRVRTFLCEKEV---DTAAI---------- 617

  Fly   408 NGDSPKGNGIPENLIEFSQFQARWESHSLEPTLEDINLQLGRRKLVAVIGPVGAGKSSLIQAILG 472
              |......:..|.:|.......|:|.... .|.||....|.::||.|:|.||:|||||:.|.||
 Worm   618 --DKEIRGELYTNTVEIHSGSFAWDSAEAR-ILSDIEFLAGSKELVTVVGSVGSGKSSLLLAALG 679

  Fly   473 ELPGESGTLRINGSYSYAAQEPWLFTGTVRQNILFGLDWDKHRYRTVVKKCALERDFELLPFGDK 537
            |:....|.:.:.||.:|.:|:||:...::::|:|...|.:...|:.|::.|||:.|.:.||.||.
 Worm   680 EMEKVCGYVGVRGSVAYLSQQPWILNQSLKKNVLMQADLNDVLYKKVIESCALKEDLKQLPDGDD 744

  Fly   538 TIVGERGASLSGGQKARISLARAVYRRADIYLLDDPLSAVDTHVGRHLFDQCM--RGYLRSELVI 600
            |.:||:|.:|||||||||:||||||:..|:|.|||||||||.|||:|:||..:  .|.|.....|
 Worm   745 TEIGEKGINLSGGQKARIALARAVYQSKDVYFLDDPLSAVDAHVGKHIFDNVIGPNGMLSHTTRI 809

  Fly   601 LVTHQLQFLEQADLIVIMDKGRISAMGTYSSM-----KRSGL-----DFAQLLTAPNKDA---ED 652
            |||:...||:::..|::|..|||...|||:.:     .|..|     ::||...:..:::   |:
 Worm   810 LVTNCTSFLQESGKIIVMKDGRIKHCGTYNELLTDVEAREYLQEVDNEYAQAQESSGEESGGEEN 874

  Fly   653 LDEIDGAGGDGLDLLNVPSLSRRGSKNSKPSTRNNSFTSLSSMAESMAQEASLQMQETRVEGKIG 717
            .|.:.|:...|..:..:..||:...|.||           ||:.|....:|.:..:|..: |::.
 Worm   875 SDILPGSIASGSRMSRLSRLSKISRKKSK-----------SSIVEKKKPDALITKEEAAI-GRVN 927

  Fly   718 LGLYKEYLTSGSSWFMIFFMVFLCLATQILCSAA---DYFLSYWVDKNVD-GQTDINTDPQDMYY 778
            .|:|..|.   .:..::.:::...:|..:..|.|   ..:|:.|.|.|:| ...|..:....:..
 Worm   928 PGVYLLYF---KAMGIVTYVLPYAIAVVLNVSFALGRSLWLTAWSDANIDINHPDTMSVGARLGV 989

  Fly   779 FAALNVAVVVFTIVRTMLFYKMAMRSSTQLHNAMYQGITRAAMYFFNTNPSGRILNRFSKDLGQL 843
            :|...:..|:|.....:|.....:.:|..||..:...:.|..:.:|:..|.|||:||.:||:..:
 Worm   990 YAGFGITEVIFLFFSLVLLLIGGVAASKNLHKPLLHNVLRNPLSYFDITPIGRIINRLAKDMEVV 1054

  Fly   844 DEVLPSVMLDVVQLFLTLLGIIVVICITNPYYLILTLALAIIFYYIREFYLKTSRDVKRLEAVAR 908
            |..|.|....:|...:.::..::::..|.|.::.:.:.:.||::::.::.:|::|.::|:.::.|
 Worm  1055 DLRLSSSFRFLVMALINMVQTVLIVSYTTPLFIAIIIPVFIIYFFVLKYSIKSTRQLQRIASLTR 1119

  Fly   909 SPIYSHLSATITGLPTIRALGAQKELIAEFDNLQDLH-SSGYYTFLATNRAFGYYLDCFCTLYIV 972
            |||:|:.|.|:.|:.|:||.....|.:...|...:.| ...||:.:| ||.....|:....:.|.
 Worm  1120 SPIFSNFSETLQGISTVRAFQWSDEFVRRNDEHLNTHVKCSYYSQMA-NRWLSIRLELLGNIVIF 1183

  Fly   973 IIILNYFINPPQ--SPGEVGLAITQAMGMTGMVQWAMRQSAELENTMTAVERVVEYDEIEPEGEF 1035
            ...:...|....  :.|.:||:::.::.:|.|:...:||..|:|..:.:|||:.||.:.:.|.|:
 Worm  1184 SAAILAIIGKESGITAGMLGLSVSYSLNITFMLNMFVRQINEVETNVVSVERIDEYSKTKSEAEW 1248

  Fly  1036 DSREGKKPSPSWPEKGEIIAEDLCLRYFPDPQAKYVLKALNFRIRPCEKVGIVGRTGAGKSSLIN 1100
            .......|| :||..|.:..||...||  ..:...|||.::..|.|.:|||:.||||||||||..
 Worm  1249 RLDNNNLPS-NWPTGGAVNIEDYSCRY--RDELDLVLKQISLNILPGQKVGVCGRTGAGKSSLAL 1310

  Fly  1101 ALFRL-SYNEGIITIDERDTADMGLFDLRSKISIIPQEPVLFSGSMRYNLDPFEEYNDAKLWDAL 1164
            ||||: ...:|.|:||:..|:.:||.|||.|::|||||.|||:.::|:|:||..::.|.:||.||
 Worm  1311 ALFRIVEAADGNISIDQTITSHIGLHDLREKLTIIPQENVLFANTLRFNIDPKGQFTDQQLWLAL 1375

  Fly  1165 EEVKLKPLISELPNGLQSKISEGGSNFSVGQRQLVCLARAILRENRVLVMDEATANVDPQTDALI 1229
            |...||..:..||:.|:|.::|||.|||||||||:||.||:||:::|||:|||||.:|.:||.::
 Worm  1376 ENSNLKAHVELLPHKLESPVAEGGENFSVGQRQLLCLTRALLRKSKVLVLDEATAGIDNRTDTMV 1440

  Fly  1230 QATIRSKFRDCTVLTIAHRLNTIMDSDRVLVMDAGHLVEFGSPYELLTSSESKIFHGM 1287
            |||||.||.|.|::||||||:||:|.||::|||||.:||.|.|.|||.:..|: |:|:
 Worm  1441 QATIREKFADSTIITIAHRLHTIIDYDRIIVMDAGRIVEDGIPGELLKNRNSQ-FYGL 1497

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
Mrp4NP_650086.2 MRP_assoc_pro 13..1292 CDD:188098 434/1347 (32%)
mrp-3NP_001359552.1 MRP_assoc_pro 25..1501 CDD:188098 436/1358 (32%)

Return to query results.
Submit another query.