DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment Mrp4 and Abcc3

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_650086.2 Gene:Mrp4 / 41387 FlyBaseID:FBgn0263316 Length:1316 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:NP_542148.2 Gene:Abcc3 / 140668 RGDID:71101 Length:1523 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:1373 Identity:494/1373 - (35%)
Similarity:753/1373 - (54%) Gaps:140/1373 - (10%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly    10 PEN------PRERSSPLSSLMFCFALPVLFKGRKKTLEQKDLYRALKEHKSDSLGDRLCAAWDEQ 68
            |||      |...:...|.|.|.:...:...|.::.||..||:...:|..|..:..||..||.:|
  Rat   199 PENLDTNPCPEASAGFFSRLSFWWFTKLAILGYRRPLEDSDLWSLSEEDCSHKVVQRLLEAWQKQ 263

  Fly    69 VA--------------------------KNETPRLGRALTKVFGFHLFITGVFLLAQEFLTKVTQ 107
            ..                          |.:.|...|||.:.|...|.:...|.|.|:.|:.:..
  Rat   264 QTQASGPQTAALEPKIAGEDEVLLKARPKTKKPSFLRALVRTFTSSLLMGACFKLIQDLLSFINP 328

  Fly   108 PICLIGVMAYFAGNDPDRSKAQLWAAGLIAGSVF-----SVCIGHPYMLGLLHLGMKMRIALSSL 167
            .  |:.::..|. :||   .|..|...|:||.:|     ...|.|.:...:..:.:::|.|:..:
  Rat   329 Q--LLSILIRFI-SDP---TAPTWWGFLLAGLMFVSSTMQTLILHQHYHCIFVMALRIRTAIIGV 387

  Fly   168 IYRKALRLSRTALGDTTVGQVVNLLSNDVGRFDLVLINVHYLWIAPLELIAVTYLMYLEIGISSM 232
            ||||||.::.:...:.|||::|||:|.|..||..|...::.||.|||::|...|.::..:|.|::
  Rat   388 IYRKALTITNSVKREYTVGEMVNLMSVDAQRFMDVSPFINLLWSAPLQVILAIYFLWQILGPSAL 452

  Fly   233 FGVAIMLLFLPFQSYLGKRTSVLRLRTALRTDERVRMMNEIISGIQVIKMYAWEKPFGKVVEMTR 297
            .|||:::|.:|....:..:....:::.....|.|:::|:||::||:|:|:||||..|.:.||..|
  Rat   453 AGVAVIVLLIPLNGAVSMKMKTYQVQQMKFKDSRIKLMSEILNGIKVLKLYAWEPTFLEQVEGIR 517

  Fly   298 FNEMLCIKQVNYIRGILISFAMFLSRIFTSSSLIAFVLLG--------NILNAEKAFFVTAYYNI 354
            .:|:..:::..|::.  ||..:::...|    ::..:.||        |:|:|||||...:.:||
  Rat   518 QSELQLLRKGAYLQA--ISTFIWVCTPF----MVTLITLGVYVCVDKNNVLDAEKAFVSLSLFNI 576

  Fly   355 LRRSVTMFFPQGISEFAELLVSVRRLEAFMHRPETKVRDKSKVKNANQKAESPNGDSPKGNGIPE 419
            |:..:.: .||.||...:..||::|::.|:::.|.   |...|:   :|..||      |..|..
  Rat   577 LKIPLNL-LPQLISGMTQTSVSLKRIQDFLNQDEL---DPQCVE---RKTISP------GRAITI 628

  Fly   420 NLIEFSQFQARWESHSLEPTLEDINLQLGRRKLVAVIGPVGAGKSSLIQAILGELPGESGTLRIN 484
            :...||     | |..|.|||..:|:|:.:..||||:||||.|||||:.|:|||:....|.:.:.
  Rat   629 HNGTFS-----W-SKDLPPTLHSLNIQIPKGALVAVVGPVGCGKSSLVSALLGEMEKLEGAVSVK 687

  Fly   485 GSYSYAAQEPWLFTGTVRQNILFGLDWDKHRYRTVVKKCALERDFELLPFGDKTIVGERGASLSG 549
            ||.:|..|:.|:...|:::|:|||...:..||:..::.|||..|.::||.||:|.:||:|.:|||
  Rat   688 GSVAYVPQQAWIQNCTLQENVLFGQPMNPKRYQQALETCALLADLDVLPGGDQTEIGEKGINLSG 752

  Fly   550 GQKARISLARAVYRRADIYLLDDPLSAVDTHVGRHLFDQCM--RGYLRSELVILVTHQLQFLEQA 612
            ||:.|:|||||||..|:|:||||||||||:||.:|:|||.:  .|.|..:..:||||.:.||.|.
  Rat   753 GQRQRVSLARAVYSDANIFLLDDPLSAVDSHVAKHIFDQVIGPEGVLAGKTRVLVTHGISFLPQT 817

  Fly   613 DLIVIMDKGRISAMGTYSSMKRSGLDFAQLLT--AP--NKDAED------------LDEIDGAGG 661
            |.|:::..|:|:.||.||.:.:....||..|.  ||  |::|.:            |::......
  Rat   818 DFIIVLADGQITEMGHYSELLQHDGSFANFLRNYAPDENQEANEGVLQHANEEVLLLEDTLSTHT 882

  Fly   662 DGLD------------LLNVPSLSRRGSKNSKPSTRNNSFTSLSSMAESMAQEASLQMQETRVE- 713
            |..|            :..:.|||..|...::|..:..:.:....:..:..:|....::|...| 
  Rat   883 DLTDTEPAIYEVRKQFMREMSSLSSEGEGQNRPVLKRYTSSLEKEVPATQTKETGALIKEEIAET 947

  Fly   714 GKIGLGLYKEYLTSGSSWFMIFFMVFLCL---ATQILCSAADYFLSYWV-DKNVDGQTDINTDPQ 774
            |.:.|.:|.:|..|..    :...:|:||   ....:...|:.:||.|. |....||.: ||..:
  Rat   948 GNVKLSVYWDYAKSVG----LCTTLFICLLYAGQNAVAIGANVWLSAWTNDVEEHGQQN-NTSVR 1007

  Fly   775 DMYYFAALNVAVVVFTIVRTMLFYKMAMRSSTQLHNAMYQGITRAAMYFFNTNPSGRILNRFSKD 839
             :..:|.|.:...:..::........|::::..||.|:.....||...||:|.||||||||||||
  Rat  1008 -LGVYATLGILQGLLVMLSAFTMVVGAIQAARLLHTALLHNQIRAPQSFFDTTPSGRILNRFSKD 1071

  Fly   840 LGQLDEVLPSVMLDVVQLFLTLLGIIVVICITNPYYLILTLALAIIFYYIREFYLKTSRDVKRLE 904
            :..:||||...:|.:...|.|.:..||||..:.|.:.::.|.||:.:.:::.||:.|||.:||||
  Rat  1072 IYVIDEVLAPTILMLFNSFYTSISTIVVIVASTPLFCVVVLPLAVFYGFVQRFYVATSRQLKRLE 1136

  Fly   905 AVARSPIYSHLSATITGLPTIRALGAQKELIAEFDNLQDLHSSGYYTFLATNRAFGYYLD----C 965
            :|:||||:||.|.|:||...|||.|..::.....|...|.:....|.::|:||..|.:::    |
  Rat  1137 SVSRSPIFSHFSETVTGTSVIRAYGRVQDFKVLSDAKVDSNQKTTYPYIASNRWLGVHVEFVGNC 1201

  Fly   966 ---FCTLYIVI--IILNYFINPPQSPGEVGLAITQAMGMTGMVQWAMRQSAELENTMTAVERVVE 1025
               |..|:.||  ..||        ||.|||:::.|:.:|..:.|.:|..::||:.:.|||||.|
  Rat  1202 VVLFSALFAVIGRNSLN--------PGLVGLSVSYALQVTLSLNWMIRTLSDLESNIIAVERVKE 1258

  Fly  1026 YDEIEPEGEFDSREGKKPSPSWPEKGEIIAEDLCLRYFPDPQAKYVLKALNFRIRPCEKVGIVGR 1090
            |.:.|.|..:.....:.|. .||..|.:...:..:||  .|..:.|||.|...::..||||||||
  Rat  1259 YSKTETEAPWVLESNRAPE-GWPRSGVVEFRNYSVRY--RPGLELVLKNLTLHVQGGEKVGIVGR 1320

  Fly  1091 TGAGKSSLINALFR-LSYNEGIITIDERDTADMGLFDLRSKISIIPQEPVLFSGSMRYNLDPFEE 1154
            |||||||:...||| |...||.|.||..:.|.:||.||||:::||||:|:||||::|.|||||..
  Rat  1321 TGAGKSSMTLCLFRILEAAEGEIFIDGLNVAHIGLHDLRSQLTIIPQDPILFSGTLRMNLDPFGR 1385

  Fly  1155 YNDAKLWDALEEVKLKPLISELPNGLQSKISEGGSNFSVGQRQLVCLARAILRENRVLVMDEATA 1219
            |:|..:|..||...|...:|..|.||..:.||||.|.|||||||||||||:||::||||:|||||
  Rat  1386 YSDEDIWRTLELSHLSAFVSSQPTGLDFQCSEGGDNLSVGQRQLVCLARALLRKSRVLVLDEATA 1450

  Fly  1220 NVDPQTDALIQATIRSKFRDCTVLTIAHRLNTIMDSDRVLVMDAGHLVEFGSPYELLTSSESKIF 1284
            .:|.:||.|||.|||::|.||||||||||||||||.:||||:|.|.:.||.||..|:.:  ..||
  Rat  1451 AIDLETDDLIQGTIRTQFEDCTVLTIAHRLNTIMDYNRVLVLDKGVVAEFDSPVNLIAA--GGIF 1513

  Fly  1285 HGMVMETG 1292
            :||..:.|
  Rat  1514 YGMAKDAG 1521

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
Mrp4NP_650086.2 MRP_assoc_pro 13..1292 CDD:188098 490/1362 (36%)
Abcc3NP_542148.2 MRP_assoc_pro 7..1522 CDD:188098 494/1373 (36%)

Return to query results.
Submit another query.