Protein Alignment Gem3 and deaD

DIOPT Version :10

• Sequence 1: NP_524019.1
• Gene: Gem3 / 39195
• FlyBaseID: FBgn0011802
• Length: 1028
• Species: Drosophila melanogaster
• Sequence 2: NP_417631.2
• Gene: deaD / 947674
• ECOCYCID: EG10215
• Length: 629
• Species: Escherichia coli
• Alignment Length: 553
• Identity: 136/553 - (24%)
• Similarity: 247/553 - (44%)
• Gaps: 53/553 - (9%)

  Fly    26 TFEELRLYRNLLNGLKRNNFVTPTKIQAAAIPMALAKMDLIIQSKSGTGKTLIYVIAVVQSFNPN 90
            ||.:|.|...:|..|....:..|:.|||..||..|...|::..:::|:|||..:.:.::|:.:|.
E. coli     7 TFADLGLKAPILEALNDLGYEKPSPIQAECIPHLLNGRDVLGMAQTGSGKTAAFSLPLLQNLDPE 71

  Fly    91 INQPHAMIVVPTRELAIQVQDTFFHLCKSFRDFKCSAFIGGTDVAKDRKRMNES-RVIIGTPGRL 154
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E. coli    72 LKAPQILVLAPTRELAVQVAEAMTDFSKHMRGVNVVALYGGQRYDVQLRALRQGPQIVVGTPGRL 136

  Fly   155 LHLYENRVFDVSKLRLLVLDEADQLYQTKSLQHTVSKLIEAMPKNRQIIACSATYDQNLDERLAK 219
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E. coli   137 LDHLKRGTLDLSKLSGLVLDEADEMLRMGFIE-DVETIMAQIPEGHQTALFSATMPEAIRRITRR 200

  Fly   220 VMDKPMLISNSERATVLLGIRQFVYELPQQNNSVEEMRLKLQILGQIFNQLPYEQAIIFASSQMR 284
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E. coli   201 FMKEPQEVRIQSSVTTRPDISQSYW-------TVWGMR-KNEALVRFLEAEDFDAAIIFVRTKNA 257

  Fly   285 ADSYKNYLTASGIDCHLISGAMEQSERLHVFEGYRNFTMRILVATDLMARGVDSPHANLVINIDP 349
            .......|..:|.:...::|.|.|:.|....|..::..:.||:|||:.|||:|....:||:|.|.
E. coli   258 TLEVAEALERNGYNSAALNGDMNQALREQTLERLKDGRLDILIATDVAARGLDVERISLVVNYDI 322

  Fly   350 PQDHVTYLHRIGRAGRFGSKGIAITFIASKKESQRFREMSKKIATAWSVLEFPKEPMPNEFNFWD 414
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E. coli   323 PMDSESYVHRIGRTGRAGRAGRALLFV-ENRERRLLRNIERTMK-----LTIPEVELPNA----- 376

  Fly   415 FEKYNFDYYIKEENPLQEMPMPIKENRSKENVDASSVDLENLQKDQDGKRRDPDKLPVALENVET 479
                    .:..:..|::....:::.....::|.....|..:|...:|:..|.:.|..||..: .
E. coli   377 --------ELLGKRRLEKFAAKVQQQLESSDLDQYRALLSKIQPTAEGEELDLETLAAALLKM-A 432

  Fly   480 QKELELENLPESSHNNKNLRVKEKEIVRQGKLKETNSKAGGSKTNKTERRKKSNTPSKLQKQITE 544
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E. coli   433 QGERTLIVPPDAPMRPKR------------EFRDRDDRGPRDRNDRGPRGDREDRPRRERRDVGD 485

  Fly   545 VQQTPEITVNKYYMQEDIQRTADGKEYHPVNGA 577
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E. coli   486 M-QLYRIEVGR----------DDGVEVRHIVGA 507

Known Domains

Gene	Sequence	Domain	Region	External ID	Identity
Gem3	NP_524019.1	SrmB	26..409	CDD:440279	111/383 (29%)
deaD	NP_417631.2	PRK11634	1..629	CDD:236941	136/553 (25%)