Protein Alignment Gem3 and CG32344

DIOPT Version :10

• Sequence 1: NP_524019.1
• Gene: Gem3 / 39195
• FlyBaseID: FBgn0011802
• Length: 1028
• Species: Drosophila melanogaster
• Sequence 2: NP_612028.4
• Gene: CG32344 / 326208
• FlyBaseID: FBgn0052344
• Length: 827
• Species: Drosophila melanogaster
• Alignment Length: 912
• Identity: 191/912 - (20%)
• Similarity: 357/912 - (39%)
• Gaps: 180/912 - (19%)

  Fly    10 AGGEERSSDVAPGQVKT-----FEELRLYRNLLNGLKRNNFVTPTKIQAAAIPMALAKMDLIIQS 69
            ||..:|.:|:...:.|.     |:.:.|...|:.|:.:..:..||.||...||:.|...|::..:
  Fly    19 AGTSDRGADILKSKSKKNKSGGFQSMGLGFELIKGITKRGYKVPTPIQRKTIPLILEGRDVVAMA 83

  Fly    70 KSGTGKTLIYVIAVVQSFNPNINQP----HAMIVVPTRELAIQVQDTFFHLCKSFRDFKCSAFIG 130
            |:|:|||..::|.:.:....  .:|    .|:|:.||||||:|.. .|......|.:.|....:|
  Fly    84 KTGSGKTACFLIPLFEKLQR--REPTKGARALILSPTRELAVQTY-KFIKELGRFMELKSILVLG 145

  Fly   131 GTDVAKDRKRMNE-SRVIIGTPGRLLHLYENRVFDVSKLRLLVLDEADQLYQT---KSLQHTVSK 191
            |..:......::. ..||:.||||.|||.......::.:..:|.||||:|::.   :.|..|:.:
  Fly   146 GDSMDSQFSAIHTCPDVIVATPGRFLHLCVEMDLKLNSIEYVVFDEADRLFEMGFGEQLNETLHR 210

  Fly   192 LIEAMPKNRQIIACSATYDQNLDERLAKVMDKPMLI-----SNSERATVLLGIRQFVYELPQQNN 251
            |    |.:||.:..|||..:.|.|.....::.|:||     |....|..|    :|:|..|....
  Fly   211 L----PSSRQTVMFSATLPKLLVEFARAGLNDPVLIRLDVESKLPDALAL----KFLYCRPDDRY 267

  Fly   252 SVEEMRLKLQILGQIFNQLPYEQAIIFASSQMRADSYKNYLTASGIDCHLISGAMEQSERLHVFE 316
            :...:.||..|..|       .|.::||.:|...:.....||.:||....:..:::.:.|.....
  Fly   268 TALVVLLKYVIPVQ-------SQTVVFAGTQHHVELISYILTEAGISNASVYSSLDPAARKINTA 325

  Fly   317 GYRNFTMRILVATDLMARGVDSPHANLVINIDPPQDHVTYLHRIGRAGRFGSKGIAITFIASKKE 381
            .:.|..:.:|:.||:.|||:|.|..:.|:|:..|.....::||:||..|.|..|.|.:.:::...
  Fly   326 KFVNKKVSVLIVTDVAARGIDIPSLDFVVNLHFPGKPKLFVHRVGRCARAGRTGTAYSIVSTDDT 390

  Fly   382 SQRFREMSKKIATAWSVLEFPKEPMPNEFNFWDFEKY-NFDYYIKEENPLQEMPMPIKENRSKEN 445
            :                            :..|...: |..:.|.:.:.|..:|..:.|   :|:
  Fly   391 A----------------------------HLLDLHLFLNRPFNIHDSSALGTIPQDLLE---EEH 424

  Fly   446 VDASSVDLEN-----LQKDQDGKRRDPDKLPVALENVETQ---------KELE--------LENL 488
            :..:.:...:     |:..::..::.....|||..:...:         |.||        |...
  Fly   425 LTVTDIKKSHHIAGVLRTSENAYKKYLSSRPVASTDANARVKKIKFFALKPLEDFFTAAPVLAQA 489

  Fly   489 PESSHNNKNLRVKEKEIVRQGKLKE---------TNSKAGGS--KTNKTERRKKSNTPSKLQKQI 542
            .|:|..:...:.|.....|  ||:|         .:.:.||:  :.|.|::..:.....:.:.|.
  Fly   490 AEASGQSTESQAKVSAAER--KLQEEKHDILVKMRSFRPGGTVFELNTTQKSTQFIVMKEKRMQH 552

  Fly   543 TEVQQTPEITVNKYYMQ---EDIQRTADGKEYHPVNGAGNHQVPSKSNQKPV---EFISPELTPT 601
            .||       :||:..|   |||..  :.|....:|       || |.:.|.   |.||......
  Fly   553 AEV-------INKFRQQRAEEDIDE--EKKTIEALN-------PS-SGRMPTADEEAISSTFNKV 600

  Fly   602 LTPLELTQEPSPTTVTPPAPPANSINNKTYCLAAPTQTSSMTIQNMVISNTVDDASSISSDSMVV 666
            :.|..| |.........|......||:|......|.|::....::.:..|..:..:..:..|:
  Fly   601 VAPKRL-QNMDALYKDKPKKKKRKINSKDEDHYVPYQSADKHTEDGLAINNFERQAQNAEFSV-- 662

  Fly   667 CGYHSDRSYDTYYATSDEEEIWNRLMSK-------QRRQLKSKRG------HGKRRVILYKKVFP 718
                |||............:.|:|:..|       :..:::::.|      ....|...:|:
  Fly   663 ----SDRDLSQEVKHKPGLKKWDRIKKKMVSVQDPRANKIRTESGAWIPASFKTGRYAEWKE--- 720

  Fly   719 KLKANVKRKLKKRMSSSC--RSKKAHHLRK----RHVYKNISLLPHMNLCHLLQKFTNQERFLKR 777
              |:.::.:|::..:.|.  .:|...|.::    ||...|:.|       .|.::.|..::.::|
  Fly   721 --KSKIEDQLQRENAGSDDENAKPLSHAQRYPVSRHARHNLKL-------ELKKRLTGNDKEMRR 776

  Fly   778 LHKYAKNQFIDNARVGFLLDKLYKSILEMYYNSAKERKKHFKEAMKESLKSIDNYESQESSESEE 842
            ..:..|:                :..||......:|..:...|..|.|::.....::|.:..|:.
  Fly   777 PEQIVKS----------------RMRLEFIKKRNEENAERKSENRKRSMRKTQRPKAQSTGGSKR 825

  Fly   843 EE 844
            .:
  Fly   826 RK 827

Known Domains

Gene	Sequence	Domain	Region	External ID	Identity
Gem3	NP_524019.1	SrmB	26..409	CDD:440279	101/400 (25%)
CG32344	NP_612028.4	DEADc_DDX54	39..243	CDD:350717	61/210 (29%)
		SrmB	41..449	CDD:440279	109/456 (24%)
		DBP10CT	<679..721	CDD:462373	6/46 (13%)