Protein Alignment Mdr65 and pgp-8

DIOPT Version :10

• Sequence 1: NP_476831.1
• Gene: Mdr65 / 38726
• FlyBaseID: FBgn0004513
• Length: 1302
• Species: Drosophila melanogaster
• Sequence 2: NP_509811.2
• Gene: pgp-8 / 181277
• WormBaseID: WBGene00004002
• Length: 1243
• Species: Caenorhabditis elegans
• Alignment Length: 1279
• Identity: 422/1279 - (32%)
• Similarity: 673/1279 - (52%)
• Gaps: 97/1279 - (7%)

  Fly    47 WLFFGFIMCCIKA----LTLPAVVIIYSEFTSMLVDRAMQFGTSSNVHALPLFGGGKTLTNASRE 107
            |..|.|::..:.|    ||.|.:...:.|.:...|........:|             |..:..|
 Worm    35 WEKFLFVIGVVSAICTGLTQPFMSYTFGEVSQAFVRITAAVNNAS-------------LDPSDLE 86

  Fly   108 ENNEALYDDS----ISYGILLTIASVVMFISGIFSVDVFNMVALRQVTRMRIKLFSSVIRQDIGW 168
            :..|..:.|.    |.:|:   :....||. |.....:|..:......|:|.|....::::|..:
 Worm    87 KAYEMFHADMNNVVIHFGL---VGCAFMFF-GFIQFSLFKYIGDNTTYRLRHKFILRLLKKDAKY 147

  Fly   169 HDLASKQNFTQSMVDDVEKIRDGISEKVGHFVYLVVGFIITVAISFSYGWKLTLAVSSYIPLVIL 233
            .|..|....:..:.|::|:.|:..:||:...:.....|.|..|::|...|.|....|.:...:::
 Worm   148 FDTISTGYLSTVLNDNLERFREAFNEKIAFIICFSTDFAIGTALAFYTSWTLASYGSVFAFGIVI 212

  Fly   234 LNYYVAKFQGKLTAREQESYAGAGNLAEEILSSIRTVVSFGGEKSEVQRYENFLVPARKASQWKG 298
            .....:....|...::...|:.||.:|.:.|.|.:||:|..|:..|:::|...|....|....:.
 Worm   213 SGLLNSTSMMKSNEKQSMHYSNAGAIAFQALCSFKTVISLNGQTQELEKYSAELKEGEKFGSRRA 277

  Fly   299 AF----SGLS----DAVLKSMLYLSCAGAFWYGVNLIIDDRNVENKEYTPAILMIAFFGIIVGAD 355
            .|    .|||    :|:..::||:        |.:||.      ||......::..|..::..|.
 Worm   278 FFLATSRGLSHFFCNALNGTILYV--------GADLIY------NKTMNTVAIVTLFHYMLFSAF 328

  Fly   356 NIARTAPFLESFATARGCATNLFKVIDLTSKIDPL-------STDGKLLNYGLRGDVEFQDVFFR 413
            ::......:.....|...||.:|.|  |||..|.:       .||.   |..::|.:.|.:|.|.
 Worm   329 SLGEAFLHISYLLNAINSATPIFDV--LTSDDDMIENNQDNEQTDS---NKTIQGMLSFNNVKFA 388

  Fly   414 YPSRPEVIVHRGLNIRIRAGQTVALVGSSGCGKSTCVQLLQRFYDPVFGSVLLDDLDIRKYNIQW 478
            |||||:|.:.||::..::.|:.:||||:||.||||.||||..||:...|::.:.|..:...|::.
 Worm   389 YPSRPDVDILRGISFDVKQGECIALVGASGSGKSTIVQLLLHFYNIQSGTIKIGDSHLHDINLKQ 453

  Fly   479 LRSNIAVVGQEPVLFLGTIAQNISYGKPGATQKEIEAAATQAGAHEFITNLPESYRSMIGERGSQ 543
            ||:.|.||.||||||..||.:||.:|.|.||..||..|..:|.|::|:.|:.:..::::||||:|
 Worm   454 LRNAIGVVSQEPVLFNTTIEENIRFGNPNATSSEIYEALRKANAYDFVCNIKDGLKTIVGERGAQ 518

  Fly   544 LSGGQKQRIAIARALIQNPKILLLDEATSALDYQSEKQVQQALDLASKGRTTIVVSHRLSAIRGA 608
            |||||||||||||.|::||.||||||||||||..||:.||.||..||:|||||:::||||.||..
 Worm   519 LSGGQKQRIAIARVLVKNPAILLLDEATSALDSASERAVQLALKKASEGRTTIIIAHRLSTIRHC 583

  Fly   609 DKIVFIHDGKVLEEGSHDDLMALEGAYYNMVRAGDINMPDEVEKEDSIEDTKQKSLALFEKSFET 673
            |||:.:.:||:.|.|||::|::::..|.|:|||       :.....|:|:......|  |:..:.
 Worm   584 DKIMVMSNGKIAEVGSHEELISMDREYSNLVRA-------QFFDSQSVEEDINGQGA--EEVIQK 639

  Fly   674 SPLNFEKGQKNSVQFEEPIIKALIKDTNAQSAEAPPEKPNFFRTFSRILQLAKQEWCYLILGTIS 738
            :|.|...|        || ::.|:|:|::..    ..|.|.:    .:|:..:.:...|.:..|.
 Worm   640 TPPNLNDG--------EP-LEELLKETSSDI----EIKSNIW----EVLRECRPDAFLLSMAVIG 687

  Fly   739 AVAVGFLYPAFAVIFGEFYAALAEKDPEDALRRTAVLSWAC--LGLAFLTGLVCFLQTYLFNYAG 801
            :...|..:|..:.|..:.|.|.| .|.|:.|  |....||.  |.|..:..:..:.|.:.|....
 Worm   688 SAIQGCNFPILSQIIVQTYKAYA-MDGENIL--TYGHFWAAMFLVLGVIRPITLYCQFFFFGKVS 749

  Fly   802 IWLTTRMRAMTFNAMVNQEVGWFDDENNSVGALSARLSGEAVDIQGAIGYPLSGMIQALSNFISS 866
            ..|:||:|..:|..:::....::||..:|...|..||:.:..:|:.|:...|..::.::.:|..:
 Worm   750 EKLSTRLRIKSFQHLLSLPCAFYDDPKHSPTRLVNRLNTDPSNIKAAVDARLGSLLMSMVSFSLA 814

  Fly   867 VSVAMYYNWKLALLCLANCPIIVGSVILEAKMMSNAVVREKQVIEEACRIATESITNIRTVAGLR 931
            :.:|.||:|||.|..:...|::..:..|..|..:.::..:....|.:.:||.|.:.|::||..|.
 Worm   815 ILIACYYSWKLTLQVVLFFPVLYYAKFLYKKTTTISIKEDSVAFENSNKIAIEVLDNMKTVKALN 879

  Fly   932 READVIREYTEEIQRVEVLIRQKLRWRGVLNSTMQASAFFAYAVALCYGGVLVSEGQLPFQDIIK 996
            .||.||....|.:..::....::....|:.|......:...||::..:|..|:.:.::...|:..
 Worm   880 MEARVINLVMEYLAVLKTSYPRRSVVMGLANGFSAGCSQIVYAISFKFGTYLILQKEVIPMDMYL 944

  Fly   997 VSETLLYGSMMLAQSLAFTPAFSAALIAGHRLFQILDRKPKIQSPMGTIKNTLAKQLNLFEGVRY 1061
            ...||.|.|.|...::::.|.|..|:.:...:|.:......:.....|...::.|     ..|..
 Worm   945 SLITLSYTSNMAGSAISYMPDFRKAIHSAGLIFNLFTYPATMPFNSDTGSRSITK-----GEVNG 1004

  Fly  1062 RGIQFRYPTRPDAKILNGLDLEVLKGQTVALVGHSGCGKSTCVQLLQRYYDPDEGTIHIDHDDIQ 1126
            ..::|.|..|||..:|:.::|:|..|:|:|:||.||.||||.:.||:.:|..|:|.|.||:|:::
 Worm  1005 ENVKFHYHQRPDYTVLDSVNLKVEAGKTLAIVGPSGSGKSTIISLLEMFYRADQGFIKIDNDNVE 1069

  Fly  1127 HDLTLDGVRTKLGIVSQEPTLFERSIAENIAYGDNRRSVSMVEIIAAAKSANAHSFIISLPNGYD 1191
             ::.||.:|:.||:|||.|.||..||.:||.|| ..|::|..||..|.:.|||.:|:..||.|.|
 Worm  1070 -NINLDHLRSNLGLVSQGPVLFNCSIRDNILYG-LTRNISQTEIENALQIANAFNFVFQLPQGLD 1132

  Fly  1192 TRMGARGTQLSGGQKQRIAIARALVRNPKILLLDEATSALDLQSEQLVQQALDTACSGRTCIVIA 1256
            |.:|.||.||||||||||||.||::||||:|||||||||||.:||::||.|||||....:.||:|
 Worm  1133 TIVGDRGAQLSGGQKQRIAITRAILRNPKLLLLDEATSALDTESEKIVQNALDTASERLSTIVVA 1197

  Fly  1257 HRLSTVQNADVICVIQNGQVVEQGNHMQLISQGGIYAKLHKTQK 1300
            |||||:.|||.|.|::||:|||||.|.||::..|.|.:|.:.||
 Worm  1198 HRLSTIINADSIAVLRNGKVVEQGTHNQLLAVKGDYWRLVQHQK 1241

Known Domains

Gene	Sequence	Domain	Region	External ID	Identity
Mdr65	NP_476831.1	MdlB	118..641	CDD:440747	188/537 (35%)
		MdlB	711..1299	CDD:440747	204/589 (35%)
pgp-8	NP_509811.2	MdlB	37..618	CDD:440747	203/623 (33%)
		MdlB	667..1240	CDD:440747	202/586 (34%)