Protein Alignment Mdr65 and pgp-5

DIOPT Version :10

• Sequence 1: NP_476831.1
• Gene: Mdr65 / 38726
• FlyBaseID: FBgn0004513
• Length: 1302
• Species: Drosophila melanogaster
• Sequence 2: NP_001257116.1
• Gene: pgp-5 / 181276
• WormBaseID: WBGene00003999
• Length: 1252
• Species: Caenorhabditis elegans
• Alignment Length: 1297
• Identity: 430/1297 - (33%)
• Similarity: 677/1297 - (52%)
• Gaps: 123/1297 - (9%)

  Fly    52 FIMCCIKALT-----LPAVVIIYSEFTSMLVD-RAMQFGTSSNVHALPLFGGGKTLTNASREENN 110
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 Worm    21 FIKVIIKCTTRYEKLLFFLGVVFSILTGMCQPFESYTLGETSQV-----------LVKVTNAINN 74

  Fly   111 EA-----------LYDDSISYGILL-TIASVVMFISGIFSVDVFNMVALRQVTRMRIKLFSSVIR 163
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 Worm    75 KTIDPVDLAHAYKLFESDMNRVVLLFFLVGFAYFTFGFLQFSIMKFVGDNTAYNVRRQYISRLLR 139

  Fly   164 QDIGWHDLASKQNFTQSMVDDVEKIRDGISEKVGHFVYLVVGFIITVAISFSYGWKLTL--AVSS 226
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 Worm   140 KDISYFDGMSTGHLSIVLNDNMERFREVFNEKIALIIALLTDFVIGTILAFYTDWRLACYGTVFS 204

  Fly   227 Y-IPLVILLNYYVAKFQGKL--TAREQESYAGAGNLAEEILSSIRTVVSFGGEKSEVQRYENFLV 288
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 Worm   205 FGIVLSGLLDSW-----GKMKNNEKQNEHISNAGSIAFQALGCYKTVSSLNGQQQEVERYTEELK 264

  Fly   289 PARKASQWKGAFSGLS--------DAVLKSMLYLSCAGAFWYGVNLIIDDRNVENKEYTPAILMI 345
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 Worm   265 NGEKYALNRAFVFSLSRSADYFFTNALNFVILY--------FGANMIYEG-TIE-----PGVVVR 315

  Fly   346 AFFGIIVGADNIARTAPFLESFATARGCATNLFKVIDLTSKIDPLSTD---------GKLLNYGL 401
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 Worm   316 ILYYILFGSYCLGEAILHISRLASA----------IPLTVPIADILLDSDATADEFFSEEIKDTF 370

  Fly   402 RGDVEFQDVFFRYPSRPEVIVHRGLNIRIRAGQTVALVGSSGCGKSTCVQLLQRFYDPVFGSVLL 466
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 Worm   371 QGIISFKNVLFSYPTRPDVPVLKEISFNVQGGECIALVGASGSGKSTVIQLLLHYYNIDSGRISI 435

  Fly   467 DDLDIRKYNIQWLRSNIAVVGQEPVLFLGTIAQNISYGKPGATQKEIEAAATQAGAHEFITNLPE 531
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 Worm   436 DGNDIYNINIKQLRQAMGVVFQEPVLFNTSIEENIRFGKPDATEQEIIDALKNANAFDFVCNFPD 500

  Fly   532 SYRSMIGERGSQLSGGQKQRIAIARALIQNPKILLLDEATSALDYQSEKQVQQALDLASKGRTTI 596
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 Worm   501 GIKTIVGERGAQLSGGQKQRIAIARTLVRNPRILLLDEATSALDNESEFIVQEALQKASIGRTTI 565

  Fly   597 VVSHRLSAIRGADKIVFIHDGKVLEEGSHDDLMALEGAYYNMVRAGDINMPDEVEKEDSIEDTKQ 661
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 Worm   566 VVAHRLSTIRNANKIIVMEKGEIVEVGDHKQLIAMNGVYNNLVQTQLMSTNYEKMNENEERVTRQ 630

  Fly   662 KSLALFEKSFETSPLNFEKGQKNSVQFEEPIIKALIKDTNAQSAEAPPEKPNFFRTFSRILQLAK 726
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 Worm   631 SS----HSDFPSNEISHQK-----IDQEDDYVKKLIAEIKEEGA----KKSN----ICEIIKYCR 678

  Fly   727 QEWCYLILGTISAVAVGFLYPAFAVIFGEFYAALAEKDPEDALRRTAVLSWACLGLAFLTGLVCF 791
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 Worm   679 SEYCILFIAVLGSAIQGIYYPLSSQLMIKSYEAYA-FDKDEMLSKSHFWALSILFLAFTRPIFIF 742

  Fly   792 LQTYLFNYAGIWLTTRMRAMTFNAMVNQEVGWFDDENNSVGALSARLSGEAVDIQGAIGYPLSGM 856
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 Worm   743 FQYYFFGKTAEKLSIKLRSMSFKHLMSLPCAFYDDPCHTATRLSNRLNADSSNVTAAVDDRLGSV 807

  Fly   857 IQALSNFISSVSVAMYYNWKLALLCLANCPIIVGSVILEAKMMSNAVVREKQVIEEACRIATESI 921
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 Worm   808 IMTLVAILLAVIMSFFYSWKMSLQVLMFCPLLYLAGYCNDNFVDQAVEEDSIAFEKSNRAAIEAL 872

  Fly   922 TNIRTVAGLRREADVIREYTEEIQRVEVLIRQKLRWRGVLNSTMQASA----FFAYAVALCYGGV 982
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 Worm   873 ENVRTVRALNMENRVILLVTSHLQK----IRNSYFKRAVIQGTANGFACSCYFFIYAVSFKFGTW 933

  Fly   983 LVSEGQLPFQDIIKVSETLLYGSMMLAQSLAFTPAFSAALIAGHRLFQILDRKPKI---QSPMG- 1043
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 Worm   934 LVLREEILPMDTYLVLMTLSMTASYAGSAVAYLPDHRKAIHAAGLIFHLF-TYPAIMPYDSSQGK 997

  Fly  1044 -TIKNTLAKQLNLFEGVRYRGIQFRYPTRPDAKILNGLDLEVLKGQTVALVGHSGCGKSTCVQLL 1107
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 Worm   998 RNIKN---------GEIELKNVSFEYAQRSDKMILDGVSLKLPAGRTLALVGPSGSGKSTIISLL 1053

  Fly  1108 QRYYDPDEGTIHIDHDDIQHDLTLDGVRTKLGIVSQEPTLFERSIAENIAYGDNRRSVSMVEIIA 1172
            :|:|...:|.:.||.:::. |:.|..:|..:.:|||||.||..||.||..:|.: .:.|.:||..
 Worm  1054 ERFYHAVDGEVKIDEENVV-DVNLHHLRESVSLVSQEPVLFNCSIKENFLFGIS-HNASQLEIDQ 1116

  Fly  1173 AAKSANAHSFIISLPNGYDTRMGARGTQLSGGQKQRIAIARALVRNPKILLLDEATSALDLQSEQ 1237
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 Worm  1117 ALKVANAFSFVSQFPQGLDTLVGERGAQLSGGQKQRIAIARAILRNPKVLLLDEATSALDSDSEK 1181

  Fly  1238 LVQQALDTACSGRTCIVIAHRLSTVQNADVICVIQNGQVVEQGNHMQLISQGGIYAKLHKTQ 1299
            :||.|||||....:.:|:|||||||.|||.|.|::||:|.|||.|.:|:.:..||.:|.:.|
 Worm  1182 VVQNALDTASERLSTVVVAHRLSTVVNADSIAVLKNGKVAEQGTHEELLRKRSIYWRLVQKQ 1243

Known Domains

Gene	Sequence	Domain	Region	External ID	Identity
Mdr65	NP_476831.1	MdlB	118..641	CDD:440747	189/545 (35%)
		MdlB	711..1299	CDD:440747	212/596 (36%)
pgp-5	NP_001257116.1	MdlB	34..614	CDD:440747	200/619 (32%)
		MdlB	678..1243	CDD:440747	209/581 (36%)