Protein Alignment Girdin and hook1

DIOPT Version :10

• Sequence 1: NP_647780.1
• Gene: Girdin / 38385
• FlyBaseID: FBgn0283724
• Length: 1381
• Species: Drosophila melanogaster
• Sequence 2: NP_001038663.1
• Gene: hook1 / 570393
• ZFINID: ZDB-GENE-041001-159
• Length: 715
• Species: Danio rerio
• Alignment Length: 808
• Identity: 175/808 - (21%)
• Similarity: 337/808 - (41%)
• Gaps: 174/808 - (21%)

  Fly    19 SIISWLES------CLPRAELLAGYTSLLDGHIIHSVWLQIDPE--PQNNPSELNDLNGKSLSIA 75
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Zfish    11 SLIIWLQTFKTAAPCKTVEDLTSGAAM---SQALH----QIDPSWFSESWLARIKEDVGDNVRL- 67

  Fly    76 RAKNFECVVRNLKSFFEEELGQTI--LVLPDAFTLGHHPESKNGLEQMKTLLTLLLGAAVQCPNK 138
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Zfish    68 KMNNLKKILQMIVDYYNEVLAQQMSDFPLPDLMRV---VEQSDQVE-LGRLLQLILGCAVKCDRK 128

  Fly   139 ELFIARIKELDLETQHAIVGLIKQVTDSHSLVLTEDSLERL-------TPQSMYTHILRLTK--- 193
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Zfish   129 QEYIQIIMTLEESVQHVVMTAIQE-------LMSRESVSQLGAEPAGDTEQQLKKALEDLTEVMA 186

  Fly   194 ERDVMYLKWIDLACVETEMTASDNLVECGQGVSVTRSPSNGTATSTPSSSSNSESNHLAVECADL 258
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Zfish   187 EKEELAQRCQELDMQVTVLQEERNSLLAENDLLTDRS-SQLETFDDPSTPSGRKHSQLQFQLEQL 250

  Fly   259 RSKNRKLRQELEEKSENLLELREELDDKKARFDKLRQESQEWFTEAKRASAYRDEVDILRERAER 323
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Zfish   251 QEENFRLEAAKDDYRIHCEELEKQLVELQHRNDELTSLAEE-------SRSLKDELDILRSCSDR 308

  Fly   324 ADRLEVEVQKYREKLGDSDFYKSRVEELREDNRVLLESKEMLEE----------QLQRYRKR--- 375
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Zfish   309 AVKLEASVETYRKKLEDLSDLRRQMKALEEKNMTYMHNTVSLEEELRKANAARAQLETYKRQVQE 373

  Fly   376 --------SEHAISLESEIIKYKQKINDMALERD---VDRSKLEELLEE-------NSQLQLVAR 422
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Zfish   374 LHKKLSDESRRADNLVFEMKKLQEKYDALVKERERISIERDTLRETNEELRCTQAQQDQLLLAGK 438

  Fly   423 NLNSTMDLDKSFSENEDDCNSGDNSLSEQLTNNAQTRALKLELENRRLTAALEQLKESSFHESTS 487
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Zfish   439 --------------YQTGSPSHDNLAAEMLPIEYREKFIRLQHEN-------------------- 469

  Fly   488 KMLELEKEKKKLSLKIEQMQENINRLTQQNVELEGVFKNALEENKKLQDAVDNRQKSYDRQSLER 552
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Zfish   470 KMLRLQQE--------ESEKQRITELQQQ-----------LEEARRGRSQLDT----------DN 505

  Fly   553 EADRQKLSDAEQHVETLNK--EKQRIQTLNESIQRRAD-DLERLAES-----KTKELEQYLEKSR 609
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Zfish   506 RLNRERISELQQQVEDLQKALQTQGAKPDDSHLKRKLDAHMVQLNEAQDEIMKKKELLEDLQPDA 570

  Fly   610 QYELTKQKLYEIEARVSTYERENASLLKEVSKLKEGSEQKSVQLDDSINRLDVQSKELQKLGKAL 674
            ..  |..|:.|:.|.:...:.:..::........|.:......||..:|   ..|.|:|.|...|
Zfish   571 TQ--TSVKMDELMAALKKKDEDMRAMEDRYKMYLEKARDVIRALDPKLN---PASAEIQSLKVQL 630

  Fly   675 EDSEQVHQKLVELEKQNQELASQRIIDQEMISTLRNDLVTGTLVTKKVRNNLEKLGLADEEPGEL 739
            .|.:   :|::.||::.:: |..|..::::|.|        ....|.:  |.:|:.:.....|..
Zfish   631 SDKD---KKIIALERECEQ-AKLREYEEKLIVT--------AWYNKSL--NFQKMAIESRLSGRA 681

  Fly   740 NVEHVVEKLVRNPETFKTVREIMLNVTR 767
            |      .||...::|...:..:.|..|
Zfish   682 N------SLVPPGQSFLAQQRQVTNARR 703

Known Domains

Gene	Sequence	Domain	Region	External ID	Identity
Girdin	NP_647780.1	HkD_HkRP	15..165	CDD:411794	37/155 (24%)
		SMC_prok_B	315..1110	CDD:274008	109/492 (22%)
hook1	NP_001038663.1	HkD_Hook1	8..157	CDD:411796	37/164 (23%)
		HOOK	180..706	CDD:461694	134/620 (22%)