Protein Alignment Girdin and Hook1

DIOPT Version :10

• Sequence 1: NP_647780.1
• Gene: Girdin / 38385
• FlyBaseID: FBgn0283724
• Length: 1381
• Species: Drosophila melanogaster
• Sequence 2: XP_038965825.1
• Gene: Hook1 / 313370
• RGDID: 1309987
• Length: 733
• Species: Rattus norvegicus
• Alignment Length: 737
• Identity: 180/737 - (24%)
• Similarity: 334/737 - (45%)
• Gaps: 117/737 - (15%)

  Fly    27 CLPRAELLAGYTSLLDGHIIHSV--------WLQIDPEPQNNPSELNDLNGKSLSIARAKNFECV 83
            |....:|..|.|.   ..::|.:        ||          |.:.|..|.:..| :|.|.:.|
  Rat    36 CQDVKQLTNGVTM---AQVLHQIDVAWFSESWL----------SRIKDDVGDNWRI-KASNLKKV 86

  Fly    84 VRNLKSFFEEELGQTIL--VLPDAFTLGHHPESKNGLEQMKTLLTLLLGAAVQCPNKELFIARIK 146
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  Rat    87 LHGITSYYHEFLGQQISEELIPD---LNQITESSDPVE-LGRLLQLILGCAVNCEKKQEHIKNIM 147

  Fly   147 ELDLETQHAIVGLIKQVTDSHSLVLT--EDSLERLTPQSMYTHILRLTKERDVMYLKWIDL--AC 207
            .|:...||.::..|:::. |..:|.:  .|::..|..|     :.|..:|......:..:|  .|
  Rat   148 TLEESVQHVVMTAIQELM-SKEIVSSPASDAVGELEQQ-----LKRALEELQEALAEKEELKQRC 206

  Fly   208 VETEMTAS------DNLVECGQGVSVTRSPSNGTATSTPSSSSNSESNHLAVECADLRSKNRKLR 266
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  Rat   207 QELDMQVTALQDEKNSLVSENEMMNEKLDQLDG-SFDDPNTMVAKKYFHVQLQLEQLQEENYRLE 270

  Fly   267 QELEEKSENLLELREELDDKKARFDKLRQESQEWFTEAKRASAYRDEVDILRERAERADRLEVEV 331
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  Rat   271 AAKDDYRVHCEELEKQLIEFQHRNDELTSLAEE-------TRALKDEIDVLRATSDKANKLESTV 328

  Fly   332 QKYREKLGDSDFYKSRVEELREDNRVLLESKEMLEEQLQRYRKRSEHAISLESEIIKYKQKIND- 395
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  Rat   329 EVYRQKLQDLNDLRKQVKSLQETNMMYMHNTVSLEEELKK-------ANAARAQLETYKRQVQDL 386

  Fly   396 -------------MALERDVDRSKLEELLEENSQLQLVARNLNSTMDLDKSFSENEDDCNSGDNS 447
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  Rat   387 HTKLSSESKRADTLAFEMKRLEEKHETLLKEKERLIEQRDTLKETNEELRCSKAQQDHLNQADSS 451

  Fly   448 LSEQLTNNAQTRALKLELENRRLTAALEQLKESSFHESTSKMLELEKEKKKLSLKIEQMQENINR 512
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  Rat   452 ATKSYENLA---AEIMPVEYREVFIRLQ-------HE--NKMLRLQQEGTE-NERIEQLQEQLEQ 503

  Fly   513 LTQQNVELEGVFKNALEENKKLQDAVDNRQKSYDRQSLEREAD-----RQKLSDAEQHVETLNKE 572
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  Rat   504 KHRKMNELETEQRLSKERIGELQQQIEDLQKSLQEQGSKSEGESSSKLKQKL---EAHMEKLTEV 565

  Fly   573 KQRIQTLNESIQRRADDLERLAESKTKELEQYLEKSRQYELTKQKLYEIEARVSTYERENASLLK 637
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  Rat   566 HEELQKKQELIEDLQPDISQNAQ-KISELEAALQKK------DEDMKAMEERYKMYLEKARNVIK 623

  Fly   638 EVS-KLKEGSEQKSV---QLDDSINRLDVQSKELQKLGKALEDSEQVHQKLVELEKQNQELASQR 698
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  Rat   624 TLDPKLNPASAEIMLLRKQLAEKDRRIEILESEC-KVAK-FRDYE---EKLIVSAWYNKSLAFQK 683

  Fly   699 IIDQEMISTLRNDLVTGTLVTK 720
            :       .:.:.||:|....|
  Rat   684 L-------GMESRLVSGASACK 698

Known Domains

Gene	Sequence	Domain	Region	External ID	Identity
Girdin	NP_647780.1	HkD_HkRP	15..165	CDD:411794	41/147 (28%)
		SMC_prok_B	315..1110	CDD:274008	110/429 (26%)
Hook1	XP_038965825.1	HkD_Hook1	27..168	CDD:411796	42/150 (28%)
		HOOK	191..724	CDD:461694	133/558 (24%)