Protein Alignment Girdin and Ccdc88a

DIOPT Version :10

• Sequence 1: NP_647780.1
• Gene: Girdin / 38385
• FlyBaseID: FBgn0283724
• Length: 1381
• Species: Drosophila melanogaster
• Sequence 2: NP_001414725.1
• Gene: Ccdc88a / 305605
• RGDID: 1306694
• Length: 2016
• Species: Rattus norvegicus
• Alignment Length: 1693
• Identity: 445/1693 - (26%)
• Similarity: 776/1693 - (45%)
• Gaps: 407/1693 - (24%)

  Fly     8 TPMEIDEFVNSSIISWLESCLPRAELLAG-------YTSLLDGHIIHSVWLQIDPEPQNNPSELN 65
            ||: :::|:.|.:::|:::..|   |.||       |.:|:||..::.|.|||:|:.::......
  Rat     7 TPL-LEQFMTSPLVTWVKTFGP---LAAGNGTNLDEYVALVDGVFLNQVMLQINPKTESQRVNKK 67

  Fly    66 DLNGKSLSIARAKNFECVVRNLKSFFEEELGQTILV-LPDAFTLGHHPESKNGLEQMKTLLTLLL 129
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  Rat    68 VNNDASL---RIHNLSILVKQIKFYYQDTLQQLIMMSLPNILVIGKNPFSEQGTEEVKKLLLLLL 129

  Fly   130 GAAVQCPNKELFIARIKELDLETQHAIVGLIKQVT-------DSHSLVLTEDSLERLTP--QSMY 185
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  Rat   130 GCAVQCQKKEEFIEKIQGLDFDTKAAVAAHIQEVTHNQENVFDLQWMEVTDMSQEDTEPLLKSMA 194

  Fly   186 THILRLTKERDVMYLKWIDLACVETEMTASDNLVECGQ---GV-------SVTRSPSNGTATSTP 240
            :|:.||..|||                ..|:.::|..:   ||       |..:||     ..:|
  Rat   195 SHLRRLIDERD----------------EHSETIIELSEERDGVHFLPHASSSAQSP-----CGSP 238

  Fly   241 SSSSNSESNHLAVECADLRSKNRKLRQELEEKSENLLELREELDDKKARFDKLRQESQEWFTEAK 305
            .........||:||.||.::|.|:||||||||:|.||:.::||:..:....:|:||:....::|:
  Rat   239 GMKRTESRQHLSVELADAKAKIRRLRQELEEKTEQLLDCKQELEQMEVELKRLQQENMNLLSDAR 303

  Fly   306 RASAYRDEVDILRERAERADRLEVEVQKYREKLGDSDFYKSRVEELREDNRVLLESKEMLEEQLQ 370
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  Rat   304 SARMYRDELDALREKAVRVDKLESELCRYKERLHDIEFYKARVEELKEDNQVLLETKTMLEDQLE 368

  Fly   371 RYRKRSEHAISLESEIIKYKQKINDMALERDVDRSKLEELLEENSQLQLVAR-NLNSTMDLD--- 431
            ..|.||:....||.|.::.|.|::||.:|||:||.|:|||:|||..|::..: :::.::.|.
  Rat   369 GTRARSDKLHELEKENLQLKAKLHDMEMERDMDRKKIEELMEENMTLEMAQKQSMDESLHLGWEL 433

  Fly   432 KSFSENEDDCNSGDNSLSEQLTNNAQTRALKLELENRRLTAALEQLKES--SFHESTSKMLELEK 494
            :..|...:...:...||..::.....::.||||:||:.||..:|:|:.:  |...||||:|::||
  Rat   434 EQISRTSELAEAPQKSLGHEVNELTSSKLLKLEMENQSLTKTVEELRSTMDSAEGSTSKILKVEK 498

  Fly   495 EKKKLSLKIEQMQENINRLTQQNVELEGVFKNALEENKKLQDAVDNRQKSYDRQ--SLEREAD-- 555
            |.::||.|:|.::..|.:..|.....:.:.|:.::|..:|:..::..:::.:||  .||:|.:
  Rat   499 ENQRLSKKVEILENEIIQEKQSLQNCQNLSKDLMKEKAQLEKTIETLRENSERQIKILEQENEHL 563

  Fly   556 ---------RQKLSDAEQHVETLNKEKQRIQTLNESIQRRADDLERLAESK---TKELEQYLEKS 608
                     |.::| ||..|:.:.||.   :.|:|||:..:..|.::...|   .||||.|.||.
  Rat   564 NQTVSSLRQRSQIS-AEARVKDIEKEN---KILHESIKETSGKLSKIEFEKRQMKKELELYKEKG 624

  Fly   609 RQYE------------------------LTKQKLYEIEARVSTYERENASLLKEVSKLK------ 643
            .:.|                        :|.:||..:|...|..||||....|.:...|
  Rat   625 ERAEELENELNRLGKENELLQKKITNLKITCEKLETLEQENSELERENRKFKKTLDSFKNLTFQL 689

  Fly   644 EGSEQKSVQLDD-----------------SINRLDVQSKEL------------------------ 667
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  Rat   690 ESLEKENSQLDEENLELRRSVESLKCASMKMAQLQLENKELESEKEQLKKGLELMKASFKKTERL 754

  Fly   668 -----------QKLGKALEDS-----------------------------------EQVHQ---- 682
                       |:|.||||:|                                   ||:.:
  Rat   755 EVSYQGLDTENQRLQKALENSNKKIQQLESELQDLEMENQTLQKNLEELKISSKRLEQLEKENKS 819

  Fly   683 --------------------------------------------------------------KLV 685
                                                                          :|.
  Rat   820 LEQETSQLEKDKKQLEKENKRLRQQAEIKDTTLEENNVKIGNLEKENKTLFKEISVYKESCVRLK 884

  Fly   686 ELEKQNQELASQRIIDQEMISTLRNDLVTGTLVTKKVRNNLEKLGLADEEPGELNVEHVV-EKLV 749
            ||||:|:||..:..||.:.:.|||.|||:..|.|:::.|:||||....|:.| ||.|.:: ::..
  Rat   885 ELEKENKELVKRATIDIKTLVTLREDLVSEKLKTQQMNNDLEKLTHELEKIG-LNKERLLQDEQS 948

  Fly   750 RNPETFKTVREIMLNVTREQLE-EEEREGGVKSDMCVLCH-----RQEIFTVEKNIELAATPAPA 808
            .:...:|.:...:.:..::.|| :||:...:::.:....:     |.|:.||:||.|       |
  Rat   949 TDDSRYKLLESKLESTLKKSLEIKEEKIAALEARLEESTNYNQQLRHELKTVKKNYE-------A 1006

  Fly   809 PAQPSSQELRFEHKVRLSP-----ARESAELTR-------------------------------- 836
            ..|...:|...:..:.:|.     .|||.|.||
  Rat  1007 LKQRQDEERMVQSSLPISGEDDKWGRESQEATRELLKVKDRLIEVERNNATLQAEKQALKTQLKQ 1071

  Fly   837 ---------------------IKDSNTQLQTENARLSVDVAALGSQITSLNTQHVALQLANSQLA 880
                                 :::.||.|||:||:|.|:.:.|.||.|||..|:..|.:..|.|.
  Rat  1072 LETQNNNLQAQILALQRQTVSLQEQNTTLQTQNAKLQVENSTLNSQSTSLMNQNAQLLIQQSSLE 1136

  Fly   881 AEKDSLLKEIDSLQQEHKHALQDQVTLQCLHDQLSAEYESLNKDKEQLKAAVRDLRQELRDTREQ 945
            .|.:|::||.:.|:..:...::|...|:.||::.::|||||......||:|.::|..|.:|..::
  Rat  1137 NENESIMKEREDLKSLYDALIKDHEKLELLHERQASEYESLISKHGTLKSAHKNLEVEHKDLEDR 1201

  Fly   946 QSALEQRIEELTIQNSNMKTCSEDLSILRTEHSKLTDDFRNLFATSDRFKNEYKNIQEQYKMVRM 1010
            .:.|.::..:|......:|...|.:.:....|..:..:::.|...:||..:.|..:.::.::::.
  Rat  1202 YNQLLKQKGQLEDLEKMIKVEQEKMLLESKNHEMVAAEYKKLCGDNDRLNHTYSQLLKETEILQT 1266

  Fly  1011 EHSSL-------KLQNTELSGELNAKSDQVRCLQMEYSKVQQRCEMLIQNNAELDSERKALMDNV 1068
            :|.:|       ||:.|.|..|.:...:|.:.|.:..:|:..:||:|.|....|:.|.:.|:|.:
  Rat  1267 DHKNLKSVLNNSKLEQTRLEAEFSKLKEQYQQLDITSTKLNNQCELLSQLKGNLEEENRHLLDQI 1331

  Fly  1069 SQLLSQYQELLAISLEDKKHFHEEEKNYTERVHSLKRQKEKLEEKIMEHYKKSETTVHKKK-PFA 1132
            ..|:.|.:.||..::|.|..||.|::.|.::::.|:|||||||||||:.||..:.:..::: .:.
  Rat  1332 QTLMLQNRTLLEQNMESKDLFHVEQRQYIDKLNELRRQKEKLEEKIMDQYKFYDPSPPRRRGNWI 1396

  Fly  1133 SMLVRRVKKASSDLMNKVPSRNRRSWVDDARTNSQFVIG--------SESGGNESDNSNEEPLSI 1189
            ::.:|::.|:..|:     :|.|:..:....|.|....|        |:...:...||.|:..::
  Rat  1397 TLKMRKLIKSKKDI-----NRERQKSLTLTPTRSDSSEGFLQLPHQDSQDSSSVGSNSLEDGQTL 1456

  Fly  1190 ASDTHLL--------QRNVP---------LRQSL-QRDLLDNSIQRGGAVRSSLQ-AQKRTDLNN 1235
            .:....:        .||.|         .|:|: ..||:.:.:..||....|.: .:...|::.
  Rat  1457 GTKKSSMVALKRLPFLRNRPKDKDKMKACYRRSMSMNDLVQSMVLAGGQWTGSTENLEVPDDIST 1521

  Fly  1236 SRRNSVHGSLEAPDVTGSSLTLGTAGSRRTVYLID--EHQKLPDGSTPGATQSQSVGGSGSVNAA 1298
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  Rat  1522 GKRRKELGAMAFSTTAINFSTVNSSAAFRSKQLVNNKDTTSFEDVSPQGISDDSSTG--SRVHAS 1584

  Fly  1299 PPTPAEP-QTPQKSTENNAPVGPATFLMYNRINTTIGGASN---------SGDQSPL-----LQA 1348
            .|...:. :|...::.|||           .::....||:|         |||.|.|     ..:
  Rat  1585 RPASLDSGRTSTSNSNNNA-----------SLHEVKAGAANIQSRPQSHSSGDFSLLHDHETWSS 1638

  Fly  1349 SGS 1351
            |||
  Rat  1639 SGS 1641

Known Domains

Gene	Sequence	Domain	Region	External ID	Identity
Girdin	NP_647780.1	HkD_HkRP	15..165	CDD:411794	56/164 (34%)
		SMC_prok_B	315..1110	CDD:274008	276/1071 (26%)
Ccdc88a	NP_001414725.1	None