Protein Alignment Girdin and ccdc88aa

DIOPT Version :10

• Sequence 1: NP_647780.1
• Gene: Girdin / 38385
• FlyBaseID: FBgn0283724
• Length: 1381
• Species: Drosophila melanogaster
• Sequence 2: XP_021327376.2
• Gene: ccdc88aa / 100329473
• ZFINID: ZDB-GENE-100701-2
• Length: 1554
• Species: Danio rerio
• Alignment Length: 1574
• Identity: 435/1574 - (27%)
• Similarity: 722/1574 - (45%)
• Gaps: 329/1574 - (20%)

  Fly     9 PMEIDEFVNSSIISWLESC----LPRAELLAGYTSLLDGHIIHSVWLQIDPEPQNNPSELNDLN- 68
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Zfish     6 PVILEQFMSSSLVTWVKTLGQLGDKEGNVLSEYTELIDGIFLNKVMNQINPE--GTVQGLNKVNN 68

  Fly    69 --GKSLSIARAKNFECVVRNLKSFFEEELGQTILV-LPDAFTLGHHPESKNGLEQMKTLLTLLLG 130
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Zfish    69 DIGQ-----RAQNLSVLMYHIKSYYQETLHQMIMIPPPNVLLLGKNPVCEEGLEEIRKLLLLLLG 128

  Fly   131 AAVQCPNKELFIARIKELDLETQHAIVGLIKQVT-------DSHSLVLTEDSLERLTPQ------ 182
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Zfish   129 CAVQCERKEEYIEKIQNLDFDTKAEIAAQIQEVTHCQENVFDLHWL-----EMEGLCPEEWENLC 188

  Fly   183 -SMYTHILRLTKERDVMYLKWIDLACVETEMTASDNLVECGQGVSVTRSPSNG--TATSTPSSSS 244
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Zfish   189 RSLSVNLKMLVDQRDRQF----------------EAIVELMQGKEMMKSAVFGSDSSLSEPESSR 237

  Fly   245 NSES-NHLAVECADLRSKNRKLRQELEEKSENLLELREELDDKKARFDKLRQESQEWFTEAKRAS 308
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Zfish   238 LPLSQQHLALELTHAKAKIKRLRQELEEKSEQFLDSRQDLDSVEAELKRLQQENMQLLTDARAAR 302

  Fly   309 AYRDEVDILRERAERADRLEVEVQKYREKLGDSDFYKSRVEELREDNRVLLESKEMLEEQLQRYR 373
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Zfish   303 MYRDELDTMKERAIRADKLESEVTRYRDKLHNMNFYKAKLEELKEDNQVLMESKAMLEEQLQSIK 367

  Fly   374 KRSEHAISLESEIIKYKQKINDMALERDVDRSKLEELLEENSQLQL-------VARNLNSTMDLD 431
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Zfish   368 TRSDKLQPLEKHNLLLEAKLHDMEEERTANRRQIEELMERNVILELSQKRSMEESQRLGWELELA 432

  Fly   432 KSFSENEDDCNSGDNSLSEQLTNNAQTRALKLELENRRLTAALEQLKESSFHESTSKMLELEKEK 496
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Zfish   433 KSPQQNS---ATELKSLSQEVNEKTCSRLLKLEKENQRLLKALEELQGTC--------------- 479

  Fly   497 KKLSLKIEQMQENINRLTQQNVELEGVFKNALE--ENKKLQDAVDNRQKSY--------DRQSLE 551
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Zfish   480 -----------EPLNEFVSQSNHIKGKGRTDIVDCETHKSTPAFANMQNGQMTTPTQRTSNQFLD 533

  Fly   552 READRQKLSDAEQHVETLNKEKQRIQTLNESIQRRADDLERLAESKTKELEQYLEKSRQYELTKQ 616
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Zfish   534 TEHQHASLENANGNLPCLEVELHELEAVNQS------------------QFSYNHNNAQADIQNQ 580

  Fly   617 KLYE----IEARVSTYERENASLLKEVSKLKEGSEQKSVQLDDSINRLDVQSKELQKLGKALEDS 677
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Zfish   581 SITHENGYLEQDKSSLEKENRRLRQQV-KIQEAS------LDSSSLKIAVVEKENRTLVKKISNI 638

  Fly   678 EQVHQKLVELEKQNQELASQRIIDQEMISTLRNDLVTGTLVTKKVRNNLEKLGLADEEPGELNVE 742
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Zfish   639 SEACAKYKELEKDNQELIQQAGVDKRMLITLREELLD------------QRLKLQQK---ECDVE 688

  Fly   743 HVVEKLVR---NPETFKTVREIMLNVTREQLEEEEREGGVKS------DMCVL------------ 786
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Zfish   689 KYIYELERMRLNQETRMGDHEAVDQGQCKQLESELESSLMKSLKIKKERMATLEARLQESAKINQ 753

  Fly   787 CHRQEIFTVEKNIE--LAATPAPAPAQPSSQELRFEHKVRLSPARESAELT----RIKDSNTQLQ 845
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Zfish   754 QLRQDLKTVKQNYEAMLQKDEEEKPGQCSPPE-RMWH-------RESQEATWALLKVKDRVIEVE 810

  Fly   846 TENARLSVDVAALGSQITSLNTQ---------------------HVALQLANSQLAAEKDSLLKE 889
            ..||.|..:..||.:|:.:|.||                     :.|||..|:||..||.::|.:
Zfish   811 RNNATLQAEKQALQTQLQTLQTQSDGLQAQIIVLQQQTASLQENNTALQTHNAQLQVEKSTVLSQ 875

  Fly   890 IDSL------QQEHKHA----------------------LQDQVTLQCLHDQLSAEYESLNKDKE 926
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Zfish   876 NSSLVAHNTQLQRERHSSEAEREGAVREREDLRTVNELLLRDHERLSVLHERQAAELEVLSHRYS 940

  Fly   927 QLKAAVRDLRQELRDTREQQSALEQRIEELTIQNSNMKTCSEDLSILRTEHSKLTDDF---RNLF 988
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Zfish   941 TMESSHRTLEIEHR-------SLEDRYNTLLQQRAQLEGLEK---ALREEQKKMQNEICTNRNVT 995

  Fly   989 ATSDRFKNE-------YKNIQEQYKMVRMEHSSLK-------LQNTELSGELNAKSDQVRCLQME 1039
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Zfish   996 AECQRLRDEKDWLNQTYQKLLVENEGLQLEHKSMKSQLNSIQLEQTQLESELSKLKDLNQQLEIS 1060

  Fly  1040 YSKVQQRCEMLIQNNAELDSERKALMDNVSQLLSQYQELLAISLEDKKHFHEEEKNYTERVHSLK 1104
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Zfish  1061 IIKLTNQCELLSQLKGNVEEENRHLLDQIQSLMLQNRTLLDQTMESKDLFHVEQRQYIDKLNELR 1125

  Fly  1105 RQKEKLEEKIMEHYKKSETTVHKKK-PFASMLVRRVKKASSDLMNKVPSRNRR------SWVDDA 1162
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Zfish  1126 RQKEKLEEKIMDQYKFYDPSPPRRRGNWITLKMRKLMKTKSRDQEHVRSSSPQLGSESCEGLDDL 1190

  Fly  1163 R--TNSQFVIGSESGGNESDNS-NEEPLS------IASDTHLLQRNVP---------LRQSLQRD 1209
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Zfish  1191 RCHDNGSF-MGSQGSEESASNSLNGDTLSPKRSSICALKMFHVKRNKPKDKDKVKSLFRRSLSMN 1254

  Fly  1210 --LLDNSIQRGGAVRSSLQAQKRTDLNNSRRNS----------VHGSL--EAPDVTGSSLTLGTA 1260
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Zfish  1255 DLLLSEGCLDGDSRQQEDQPEEPTNAISKKHHTSAFHHYSSIDIRTSIGNQGKETIPSGLTNGTE 1319

  Fly  1261 GSRRTVYLIDEHQKLPDGSTPGATQSQSV-GGSGSV---NAAPPTPAEP-------------QTP 1308
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Zfish  1320 G--------QDHGRNQSGTNGKSSRAPSASSGEFSVSLENEAWSSDSSPHPDPFSSNRQRFNDSP 1376

  Fly  1309 QKSTENNAPVGPATFLMYNRINTTIGGASNSGDQS-PLLQAS--GSVSGTTMQDDKSARKRTED- 1369
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Zfish  1377 SSSRPNHEELRQGYCSSGSGVGRTSSGRS-AGDRSTPKLDKANIGLYKTQSVQSTESDSKPALDA 1440

  Fly  1370 --KSNSIWYEYGCV 1381
              ||:|:   .||:
Zfish  1441 HGKSSSV---SGCL 1451

Known Domains

Gene	Sequence	Domain	Region	External ID	Identity
Girdin	NP_647780.1	HkD_HkRP	15..165	CDD:411794	56/164 (34%)
		SMC_prok_B	315..1110	CDD:274008	252/908 (28%)
ccdc88aa	XP_021327376.2	None