Protein Alignment Atg2 and atg2b

DIOPT Version :10

• Sequence 1: NP_647748.1
• Gene: Atg2 / 38344
• FlyBaseID: FBgn0044452
• Length: 1906
• Species: Drosophila melanogaster
• Sequence 2: XP_012824091.2
• Gene: atg2b / 780082
• XenbaseID: XB-GENE-5763717
• Length: 2068
• Species: Xenopus tropicalis
• Alignment Length: 2246
• Identity: 628/2246 - (27%)
• Similarity: 986/2246 - (43%)
• Gaps: 528/2246 - (23%)

  Fly     6 PW---DGLKTKMCRYLLQRYLGQFFENNLNLEQLKVDLYNGKAVVEDIFLKVNAFNDLFEDQGWA 67
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 Frog     2 PWPFSESIKKRACRYLLQRYLGHFLQEKLSLEQLTLDLYQGTGSLSQVPLDKWSLNEILESADAP 66

  Fly    68 FEVVSGHIGRLTVVVPWNALMTNDSSLEIHNLTITLRPVTRYQSGTTMLESM-WSS-VSSSMQMA 130
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 Frog    67 LEVTEGFIQAISLSIPWGSLLQDNCALEVKGLEMVFRPRPRLRSGS---EPMYWSSFMTSSMQLA 128

  Fly   131 EECMKQVDDD-----VPFLNHNNALIGLEKFAETIDNVLNRIRAKLTNTTLNIEYILPRSDRKLV 190
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 Frog   129 KECLSQKLTDEQEASQPF-------EGLEKFAETIETVLRRVRVTFIDTVFRIENIPENSKTGTA 186

  Fly   191 LSFQASHVEYKNKTGYE-----------------------------------MPMSTSQDTETEE 220
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 Frog   187 LEIRISRIMYSDETADDHSGVNVHQPSAFAHKALELGGVSIFWDEFPASAKCSPVCSTSQVENEP 251

  Fly   221 DPNSSFNALPMIAKHNLVIEGLSLHTSEVLDVMDHQFGPTPYEQLCKIVELKGAQNIQINIKQTE 285
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 Frog   252 KLSPSWNPKPVFEPH-------PQFTRNVPEVA-HS-GPV------QIATLLGKIELGLILKQKE 301

  Fly   286 NIVGPKVSLELSLDDIYFMLTPRQIHLLIEF--------SKGFNCGGQQERPKK----------- 331
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 Frog   302 VLLGTKLDVDGRIGSFHFFLSPRQVHHLLDLVAAIAGPESSGRTPLSNKERRNRPMQQEDEFHIQ 366

  Fly   332 ---GRSLKSAP--------PSEYQMHSLQQP-TRMTGILGQNADWCTGMS-------------EA 371
               .|.::..|        .|.|:..:.:.| :....:....||..|..|             :.
 Frog   367 MELNRYIRKEPVPGGVSSEHSFYESDTAKTPSSHDEEVFFSMADMDTSHSLSTLPPLGDPNTVDL 431

  Fly   372 DPSEYSVYGNPPRSG-------------YARSRKMSE-------------STNSMVTSCTNTLQQ 410
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 Frog   432 DLSLPSTYTNTPAGSPLGPTMLQHAWGDYHEHHKLEEHLMRGTSFRHPIVHPNSL--RRTSLPSR 494

  Fly   411 ELGYTEKSGEILKFKVQISKIYGIALHQDILIQNTANIDSCSTV----------FDHASYLRYSD 465
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 Frog   495 SVSMDESRPELV-FRLAIGSLSVSVLHIDPLPPTETN----STTNPLTPMSHDFFSHIEKL---- 550

  Fly   466 TASGFFLGTLLENHIPLQNQQYLLLR-----AAP---IIVSGSQQRYFQELTSRTTLSATAVD-- 520
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 Frog   551 ------------DPITFPKDDFLCFRNIFADACPYDHLRFIGTDIKISHEQRQRSGLRSFSTDVC 603

  Fly   521 -----LIEVL---DNSK-----EHLLQFD-------RQRNCPDGYHIRPEIVLTQSSSFMFKQNH 565
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 Frog   604 IGYTELLECLFPTDSQSVPPQYTELLRFDCDKTGETRTSPCIHLYYKHSENRGPQGSSGRLNSAP 668

  Fly   566 NRCSNKIECSLDECTAELDISIYDRLGALFGSSP------------------FSGDSASSTPYPD 612
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 Frog   669 RRSELQIKLSPSSC--ELDISIVDRLNSLLQAQKMGTVEMMTSHLYTSYNKHISLHKAFAEVFLD 731

  Fly   613 D---PNQT--EFVVKSENLRLHLRFPVVDGRAANDPLKIPWWKKNVRRD-----FLAVEFRSLV- 666
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 Frog   732 DSGSPANTRVSVMVSAPVLNLAVRFPIPDLR--SDQERGPWFKKSLQKEILHLKFSDVEFKTEIF 794

  Fly   667 ---VSSRSQISIVSDELD-VFYCDADKQS--------------------------------AVH- 694
               ...:.::.:...||. .|..|:||..                                |||
 Frog   795 DGSTPEQMKLELTFKELSGAFQEDSDKPQINFFRVCSTLDGDITSSDNFDWPRIVLKINPVAVHS 859

  Fly   695 ---LLKCQQKMQPNKKIQID----VLQLKDTSDGQKKARKSPFSSKCTFGYTSHVEGLDGSVDKT 752
               .:..::..:.:.:.|.|    ...|||..| .::...|||||:...            .:..
 Frog   860 ILERIAAEEDDEADGRFQEDDEGASHSLKDVCD-LRRPEPSPFSSRRVM------------FENE 911

  Fly   753 DSLLPGETEEINEFCDSCTQSSKLKIFAFIPHVKVVLESKSMYELIYNRLNGDLFMWEPRSP--- 814
            :.::||:..|:.||.:....:|...:...:|.|.:.|.:|:.||.:|||::.||.:|||.:|
 Frog   912 EMVMPGDAIEMTEFQEKAISNSHYILELTLPSVYMTLPNKAFYEKLYNRVSNDLLLWEPTAPSPV 976

  Fly   815 ------HYDI------------SPDNEVPESKDLYAEPQLEEFRRNLLLSTSAMESSIYFSMAEP 861
                  .|.|            |.|........||.:....|  ...:.....|:|:.:....:.
 Frog   977 ETFENLSYGIGLSVASQLITNFSKDGCNQYKSGLYEDDSGSE--EETMQHDYIMDSNYHCRRKKK 1039

  Fly   862 TASAPPAPPVRNEAF-SFELFVEQGTLILFSHLLDPETNQRSKECGKFQVNLKELRLFTVNGLDN 925
            :.|...    ::::| |..:.:..|.:.|||.:..|:...:..:.|:|.:......||:|...:.
 Frog  1040 SESLNK----QSQSFLSVLVNINHGLVSLFSDVKQPDGVVKENQHGEFWLEFHSGSLFSVAKYEG 1100

  Fly   926 DSTRSFFSIQLGEIDALHCGNTLQDLELAWSDLADEKLL----------PTIY------------ 968
            ...:.:..:....:...|.|  |.|..:.    :||..|          ||||
 Frog  1101 FEDKHYVCLHSSSLSLYHQG--LLDGGIP----SDEIRLPSMTRPHWLEPTIYSSEEDGIYSLPA 1159

  Fly   969 -NFASVHQQQDRKRMEVLSLVAEIKK-QPEQRIKRMKMSFGICGAILQHHSCHSEHSWLNQLIDF 1031
             |...|..|      .:|::..:|:. :.|...|...::.|:.||.|||....||.:|..|::.|
 Frog  1160 SNGVGVESQ------SMLTVAVKIQSDKSESNTKEFLVAIGLRGATLQHRVLPSEVTWHEQVLQF 1218

  Fly  1032 MDVADFPIEEYEPFALVSELQLHVWNAGIDYRPKFFPQRAFLDLGYCTLSSNIISSMSGCTLRLL 1096
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 Frog  1219 LNILDEPVLGYNPPASITTFHVHLWSCALDHRPLYLPTRALLTVETFSISCSVALDKSSSSLRII 1283

  Fly  1097 AEDCVLQL----GLVKEESNDSLIPVLNLGLLNISFRLNAEG-SGQPRVDLRSSIHDMHLKTCYD 1156
            .|:..|.|    ..|....|...:.||::|||.::......| ..:||.::..|...:|::||.|
 Frog  1284 MEEAALHLSDKCNAVAVNLNRDYVRVLDMGLLELTILSVKTGEKSKPRFEMHCSSDVIHIRTCSD 1348

  Fly  1157 SAAALAQLIAYVANDRDLCPPEEPILNEDTKPAEPKPNEEHE-----------MSDHTQNHVSKL 1210
            |.|||..||.|:|:..||.||.    ..:|.|...|.|:..:           :::..|..:..|
 Frog  1349 SCAALMNLIQYLASYGDLHPPS----RTETSPGAHKKNKTTDPVTQANIQGPVLAEAEQQILRDL 1409

  Fly  1211 MADAVIDVE-------SSPNLRAMKSPGGREEGIE-----IFYFPDEPKEKRKSTSAKL--QTKS 1261
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 Frog  1410 MSDAMEDTDLNHIVCPSKPHLNGISE--GRCETQEPPCSDLFLFPDESGNVSEESSPMFPPTTPH 1472

  Fly  1262 LMVESPSVIGDILDFESNVILQSYYHQSQVQPQTSLGSQVQQELGSLGNASLEERDFDIIH---- 1322
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 Frog  1473 LLSEA------MLDFPS-----------------------------------ESDDFCILYAPKN 1496

  Fly  1323 -----DEEISRMDKFGVKQIYISEDPLQIVDNHFELPHEKVDLLRPPSNFPVAESTYTLCEMTFT 1382
                 |||.|      ||::.  :|.:.|.:|||.||.:|:|..:.|.:|||....|.:.|::..
 Frog  1497 SVSEKDEEPS------VKKLV--DDNILIKENHFNLPLQKMDTSKAPLHFPVPVVRYVVKEVSLV 1553

  Fly  1383 WHLYGGRDF-----PDEPLKKSSSSATSGFGMSDTYKYGVSQAQEQDKQDKKGSKKGLLKQPKGS 1442
            ||||||:||     |..|.|...|..:|                ..:...::|:  .|::..:|
 Frog  1554 WHLYGGKDFGSALPPLSPAKHYISPHSS----------------PSNTPTRRGN--SLVRGGRG- 1599

  Fly  1443 QRNLEVLVEMQLSKIRFSYETYP-------LTSMYS--SRQVLLVSEIEIRDRLRSSDINKFLYH 1498
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 Frog  1600 -RNQDLLMEIQFSKVKFQHEVYPQGASTVESPSMEQPVSRQVFIVQDLEIRDRLASSQMNKFLHL 1663

  Fly  1499 PTGNNLSHKPDENMVIVKALNVRPNPQKSSAEECSLRVSILPIKLNIDQDTLLFLEDFFSGMFRN 1563
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 Frog  1664 YSSKEMPRKAHSNMLTIKALHVRPETGQ-SPQECCLRVTLMPLRLNIDQDALFFLKDFFTNL--- 1724

  Fly  1564 SASAAGGTKTEGSSSSATDMPVMSVSKMPEELSDKLPDSEV-----KEMVERNLNVLI------- 1616
                            :|::.:: |:..||  ..:.|.|:|     |.:..:..|.:|
 Frog  1725 ----------------STEVEIL-VTPDPE--VKRYPASDVTCSLPKHLYSQERNPVISFIGQSE 1770

  Fly  1617 -EEN-SLDVE-----LEEDPATAPPVFFREVIFSPALPICFDYHGRRIELSRGPVTGLIMGLAQL 1674
             |:| |::.|     ..|:..:..||||||..|:..:||..||||:.:.:.:|.:||:::|||||
 Frog  1771 PEKNGSINSEHIAQSASEEAFSDQPVFFREFRFTSEVPIRLDYHGKHLSMDQGTLTGILIGLAQL 1835

  Fly  1675 QGSGINLREIVNRRGILGWNKLCEFLAKEWLKDIKRNQLPNILSGIGPTNAVLQLFQGIYDLFRL 1739
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 Frog  1836 NNSELKLKRLCYRHGLLGLDKLFSYAVNEWLTDIKKTQLPGILGGVGPMHSLVQLVQGLKDLVWL 1900

  Fly  1740 PIEQYNKDGRIIRGFQLGAQSFTARTALAALEITSRIIHLLQFTAETTFDMLSAGPS-MKKRKGG 1803
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 Frog  1901 PIEQYRKDGRIVRGFQKGAASFGTSTAMAALELTNRIVQTIQAAAETAYDMVSPGPSPVELKRAK 1965

  Fly  1804 RQGKRRRQGRPKDLREGVANAYTIVREGINESANTLIEAAITEHDQKGYSGAVGAVVRQIPQLVV 1868
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 Frog  1966 RFSHHRLVHQPVDLREGVAKAYTVVKEGITDTAQTIYETAAREHENRGVTGAVGGVLRQIPPAVV 2030

  Fly  1869 CPAVLATQATTNILGGAKSSLIPEAKLEARDKWKQE 1904
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 Frog  2031 KPLIVATEATSNVLGGMRNQIRPDVREEESQKWRLE 2066

Known Domains

Gene	Sequence	Domain	Region	External ID	Identity
Atg2	NP_647748.1	Chorein_N	13..117	CDD:463646	38/103 (37%)
		ATG2_CAD	<1116..1185	CDD:433120	25/69 (36%)
		ATG_C	1814..1902	CDD:462761	45/87 (52%)
atg2b	XP_012824091.2	Chorein_N	11..>105	CDD:463646	34/93 (37%)
		MRS6	17..>233	CDD:227376	73/225 (32%)
		MRS6	<1785..2051	CDD:227376	132/265 (50%)
		ATG_C	1975..2064	CDD:462761	45/88 (51%)