DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment Slik and Slk

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_726441.1 Gene:Slik / 37893 FlyBaseID:FBgn0035001 Length:1703 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:XP_006231620.1 Gene:Slk / 54308 RGDID:3780 Length:1234 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:1398 Identity:475/1398 - (33%)
Similarity:708/1398 - (50%) Gaps:269/1398 - (19%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly     1 MSFITNLKKVFHLGGGEAKKKRLYNNIKMDTDPAEFWEMVGELGDGAFGKVYKAQHKEQKRFAAA 65
            |||. |.:|:|.|  |..|||:.|.::|.|.:|.||||::|||||||||||||||:||....|||
  Rat     1 MSFF-NFRKIFKL--GSEKKKKQYEHVKRDLNPEEFWEIIGELGDGAFGKVYKAQNKETNVLAAA 62

  Fly    66 KMCQLEDEENLSDHMVEIDILSEIKHPNIVELYEAFSIDDKLWMLIEYCDGGALDSIMVELEKPL 130
            |:...:.||.|.|:|||||||:...|||||:|.:||..::.||:|||:|.|||:|::|:|||:||
  Rat    63 KVIDTKSEEELEDYMVEIDILASCDHPNIVKLLDAFYYENNLWILIEFCAGGAVDAVMLELERPL 127

  Fly   131 TEPQIAYVCKHMTEGLTFLHRNKVIHRDLKAGNVLLTMEGGVKLADFGVSAKNKHTMQKHDTFIG 195
            ||.||..|||...|.|.:||.||:|||||||||:|.|::|.:|||||||||||..|:|:.|:|||
  Rat   128 TESQIQVVCKQTLEALNYLHDNKIIHRDLKAGNILFTLDGDIKLADFGVSAKNTRTIQRRDSFIG 192

  Fly   196 TPYWMAPELVLCETFRDNPYDHKVDIWSLGITLIELAQMEPPNSEMSPMRVLLKIQKSEPPKLEQ 260
            ||||||||:|:|||.:|.|||:|.|:|||||||||:|::|||:.|::||||||||.|||||.|.|
  Rat   193 TPYWMAPEVVMCETSKDRPYDYKADVWSLGITLIEMAEIEPPHHELNPMRVLLKIAKSEPPTLAQ 257

  Fly   261 PSRWSKEFNDFLKKSLVKDPQVRPTTDVLMQHAFINRNLDA-KPIKDLLLEYKAEVVEEVVDDET 324
            |||||..|.|||||.|.|:...|.||..|:||.|:  .:|: ||:::|:.|.||||.|||.|.:.
  Rat   258 PSRWSSNFKDFLKKCLEKNVDARWTTSQLLQHPFV--TVDSNKPVRELIAEAKAEVTEEVEDGKE 320

  Fly   325 EEPRNSALQLDLDDDSASLQSQDIDKLPGTPTSILRDAKEQSQPSSSLPIAAAATAAAAATTTTK 389
            |:          |||                           :..|:|||  .|...|::..:..
  Rat   321 ED----------DDD---------------------------ETESALPI--PANKRASSDLSIA 346

  Fly   390 ATTPDRPNHTKDDNA---EAAAQQPPHTKVPAPAPPSSQQTPPPQVQQPPTPPAQPTAAVLQKKP 451
            ::..|:    ...||   |:.:::..|.       .|..:.....:.:.|||.....|..:....
  Rat   347 SSEEDK----LSQNACILESVSERTEHN-------TSGDKFSNKVLSEKPTPEGPEKAVDVDGPA 400

  Fly   452 EDV--AAVAETSEKTESDKKHFVKKGKAPPPPSPLGLANAKPAASDSQTSPKKLATPEPTSPVTT 514
            .||  ..|||.:::...    |.:.|:....|.    ..::|...|.||                
  Rat   401 NDVNLETVAEPNDQAVG----FHENGREKKRPK----LESQPDTEDQQT---------------- 441

  Fly   515 AIEVAIGQEAMEPKPQPPSPTASSIVSVQSVASSSSSGSVSNAVLSSSTSLITINSDPPTPHHHQ 579
                                     |.|..|...:.|..|   :|.::|..:....|....:.. 
  Rat   442 -------------------------VDVNLVGEGNDSNIV---ILETNTDCLKPEEDRNEENQE- 477

  Fly   580 PLPPQPQHLILPNSL---ESVSQITVVTSTHPPVIIDNSVMPPQNEVIIVSNDMNKSTHLHESST 641
                     |:.|.|   |.:..|.:.|                  :.:||.:..:.        
  Rat   478 ---------IIENKLTQSEEIKDIHIQT------------------MDLVSQETGEK-------- 507

  Fly   642 DDDFPSLDDSLG-------------DATTPPHKQSSMILAVNEPAGVVPAP--------PSQ--- 682
            :.||.::|:.:|             |.|     |..:|..::...|...||        .||   
  Rat   508 EADFQAIDNEVGFTKEETQEKLGKDDKT-----QKVVISDISSEVGTDEAPGDTQKAAEQSQDAE 567

  Fly   683 -------PQTSSTVHARKLDESEVLIVSPSYADDDSAYNTASGSHSHDHSDHLMDTSHV---SVV 737
                   |:.:.|:..:..:..|                 |.|:.....|...::...:   |.|
  Rat   568 GGAGEEAPEPAQTLTEKATEGPE-----------------AHGAEEEPRSGERVEDKQLEQQSAV 615

  Fly   738 TVGDEGVKVKDSSNELVKRQPNGVGIVPEDVNIIVNRFKQEKRSPDSSLSENGSVR-----GRRG 797
            ..|:..|.....|......:|.     .::|:               .:||:.|:.     |..|
  Rat   616 CEGEGQVTSTSESTRATTEEPE-----TDEVD---------------QVSESNSIEELERLGVTG 660

  Fly   798 IEVLVGGSGGSDVDSIGTNTSQESRHETDHNNKQQYPAAALMPPPPPSL---TNNHNHETIDEEE 859
            .|....||.|.....:... .:|:..|.....:.|.|||:....|||.|   .|.|:..|.::.|
  Rat   661 AEEQALGSKGEAATEVDLE-REENAQELPIKAEPQAPAASQPSEPPPVLIPSINIHSENTENKGE 724

  Fly   860 -------EVVIRPK----------ARVPAVVKSANAQ---------GLTKE--EIELRNLR--KK 894
                   |.::.|:          :...:.|:::::.         ..||:  .:.|:..|  ||
  Rat   725 MGALPKPETILPPEPENGKGNDTDSGTGSTVENSSSDLNLSISSFLSKTKDSGSVSLQETRRQKK 789

  Fly   895 TRKRTRKFEIDGVQMTTTTSRVIYGDDENGRIYDDHDFRKQELRELKLLQKQEKKQQTELHLKEQ 959
            |.|:||||.:|||:::.|||:::  .|.:.:..:....|:||||||:||||:|:|.|.:|:.|.|
  Rat   790 TLKKTRKFIVDGVEVSVTTSKIV--TDSDSKTEELRFLRRQELRELRLLQKEEQKAQQQLNGKLQ 852

  Fly   960 QAKEQQDRRFEQERSSLEKTYEADMDMLARQHKQLVEKTEQTQENELRSSSKRIRSEQEQELKIF 1024
            |.:||..||||||..|.::.|:.:::.|.:|.||.:|:.||...|.||..:|||:.|||:||..|
  Rat   853 QQREQIFRRFEQEMLSKKRQYDQEIENLEKQQKQTIERLEQEHTNRLRDEAKRIKGEQEKELSKF 917

  Fly  1025 RENLKQEIRLLKQEVDLFPKDKRKDEFKQRRSAMELDHEEKERAFLDSLKERHELLLRRLSEKHR 1089
            :..|:...:.:..||:..||:.||:..|:|:..:......:|:.|:...::..:..|:::.::.:
  Rat   918 QNMLRNRKKEVINEVEKAPKELRKELMKRRKEELAQSQHAQEQEFVQKQQQELDGALKKIIQQQK 982

  Fly  1090 DHLATINRNFLQQKQNAMRTREALLWELEEKQLHERHQLSKRHVKELCFMQRHQMIIRHEKELDQ 1154
            ..||.|.|..|..||..:|.|||.:|||||:.|.|:|||.|:.:|:..|:||||::.|||||.:|
  Rat   983 AELANIERECLNNKQQLLRAREAAIWELEERHLQEKHQLLKQQLKDQYFIQRHQLLKRHEKETEQ 1047

  Fly  1155 VKRMLQRKEEDMVKKQTMEKRALPKRIRAERKARDLMFRESLRISTNLDPEIERDRLKKFQEQEK 1219
            ::|..||..|::..:||.|:..|||..|:|.|.|..||::||||::...|:.:|:::|:|..||:
  Rat  1048 MQRYNQRLIEELKNRQTQERARLPKIQRSEAKTRMAMFKKSLRINSTATPDQDREKIKQFAAQEE 1112

  Fly  1220 KRYMQEERRFEVKHQKQLEELRATRESAIKELEQLQNEKRRALVEHEHSKLSEIDERLKGELREW 1284
            ||...|......||:.|:.:|:...|:.::||.||||||...|||||..||.|:||....||:||
  Rat  1113 KRQKNERMAQHQKHESQMRDLQLQCEANVRELHQLQNEKCHLLVEHETQKLKELDEEHSQELKEW 1177

  Fly  1285 REQLVPRKQELNRQIKLAIDQHEKRFGLVTNRE 1317
            ||:|.|||:.|..:....:.:.|..|.:....|
  Rat  1178 REKLRPRKKTLEEEFARKLQEQEVFFKMTGESE 1210

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
SlikNP_726441.1 STKc_SLK_like 31..310 CDD:132942 174/279 (62%)
PKK 958..1095 CDD:463600 45/136 (33%)
PKK 1126..1266 CDD:463600 61/139 (44%)
SlkXP_006231620.1 STKc_SLK 28..309 CDD:270811 175/282 (62%)
PKK 851..989 CDD:463600 45/137 (33%)
PKK 1019..1159 CDD:463600 61/139 (44%)

Return to query results.
Submit another query.