Protein Alignment DNAlig1 and lig3

DIOPT Version :10

• Sequence 1: NP_611843.2
• Gene: DNAlig1 / 37791
• FlyBaseID: FBgn0262619
• Length: 747
• Species: Drosophila melanogaster
• Sequence 2: NP_001025345.2
• Gene: lig3 / 563276
• ZFINID: ZDB-GENE-030131-8453
• Length: 1011
• Species: Danio rerio
• Alignment Length: 800
• Identity: 200/800 - (25%)
• Similarity: 333/800 - (41%)
• Gaps: 150/800 - (18%)

  Fly     5 ITSFFKKKSDATDSPSPPKKVPKIDAKTELPDE------PHIKSESASPETKPKVE---PMSVDS 60
            :...|:|...|..:....:.:.:::...||.||      .|:...:|...:.||.:   .::...
Zfish   139 VKCIFEKLERARATTKKIEDITELEGWEELQDEDKDLINKHVSELAAKVNSTPKKKVQAKLNTSG 203

  Fly    61 EEKTSPVKNVKKEPKEVDDKTTDKKVTTIGLNSTAATKEDVENYDPSADSYHPLKNAYWKDKKVT 125
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Zfish   204 QLSSPPADPTVNAPRKFSGFT--------------ATKAGSSSSSPGPSPAKPAQGSVLSAQMCD 254

  Fly   126 PYLA--LARTFQ----VIEETKGRLKMIDTLSNFFCSVMLVSPEDLVPSVYLSINQLAPAYEGLE 184
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Zfish   255 PTHKDNLLREFRKLCALVAEKSGYNAKTEIVRDFLTKGS--GGDKFRGDLYLTVKLLLP------ 311

  Fly   185 LGVAETTLM---KAICKATGRNLAHIKSQTQLTGDLGIVAEQSRVSQ--RMMFQPAP-------- 236
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Zfish   312 -GVVKNVYNLNDKQIVKLFSRILN--CNQDDMVQDL----EQGDVSETVRMFFEESKSFPPSAKS 369

  Fly   237 -LNVRDVFRKLREIAKLSGQSKMDL-VYNMFVACRSSEARFFIRSLIGKLRIGIAEQSLLTALAI 299
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Zfish   370 LLTIQEVDASLSRLSQLTKEDDQQAELQSIAKKCTGNDLKCYIRLVKHDLKINSGAKHILDA--- 431

  Fly   300 GLVKKNHIDDCKASKVPDVYKDEIVDTTLLLK--TAYCQCPNYDIIIPAILKYDIKELQERCPMH 362
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Zfish   432 --VDPNAYDAFKASR----NLGDVIDRVLRNQQDASNGTGPRKILSIEASLM------------- 477

  Fly   363 PGMPLRPMLAQPTKGVHEVFERF-GGMQITCEWKYDGERAQIHRNEKGEISIFSRNSE----NNT 422
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Zfish   478 --TPVQPMLAEACKSIEYAMKKCPNGMY--SEIKYDGERVQVHKN-GNHFSYFSRSLKPVLPHKV 537

  Fly   423 AKYPDLIARSTALLKGDVKSYIIDSEIVAWDVERKQILPFQVLSTRKRKNVDIEEIKVQVCVYIF 487
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Zfish   538 AHFKDFIPQAFA----GGHSMILDAEVLLIDTKTSKPLPFGTLGVHKKAAFQ----DAQVGLFVF 594

  Fly   488 DLLYINGTALVTKNLSERRKLLLEHFQEVEGEWKFATALDTNDIDEVQQFLEESIKGNCEGLMVK 552
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Zfish   595 DCIYFNGVSLMDKPLCERRKFLHDNMVEVPNRILFSEMKHVTRAPDLAEMITRVIREGLEGLVLK 659

  Fly   553 TLDEEATYEIAKRSRNWLKLKKDYLSN--VGDSLDLVVIGGYKGKGRRTGTYGGFLLACYDTENE 615
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Zfish   660 --DIKGLYEPGK--RHWLKVKKDYLNEGAMADTADLVVLGAFYGKGSNGGIMSSFLMGCYDPESR 720

  Fly   616 EYQSICKIGTGFTD---EDLQTHSEF--LGKHVT------SAAKSYYR----YDPSLEPDHWFEP 665
            ::.::.|...||.|   :.||...:.  :||..:      ...|:||.    .||...|
Zfish   721 KWCTVTKCSGGFDDAMLDRLQKDLDVIKIGKDPSKIPGWLKIVKNYYPDFIIRDPQKAP------ 779

  Fly   666 VQVWEVKCADLSLSPIHRAAIGIVDGERGISLRFPRFIRIRDDKNSENATDANQVAHMYQ----- 725
              |||:..|:.|.|.:|.|        .|||:||||..|:||||:.:.||:..|:..:|:
Zfish   780 --VWEITGAEFSKSEMHTA--------DGISIRFPRCTRMRDDKDWKTATNLQQLKELYRISKEN 834

  Fly   726 -------SQDQVKNNQKSST 738
                   ...:...|.|||:
Zfish   835 CDFEVTAGPSKANQNDKSSS 854

Known Domains

Gene	Sequence	Domain	Region	External ID	Identity
DNAlig1	NP_611843.2	PLN03113	1..745	CDD:215584	200/799 (25%)
lig3	NP_001025345.2	zf-PARP	95..180	CDD:459887	7/40 (18%)
		dnl1	317..829	CDD:273147	163/572 (28%)
		LIG3_BRCT	935..1005	CDD:465260