Protein Alignment RhoGEF2 and arhgef2a

DIOPT Version :10

• Sequence 1: NP_477317.1
• Gene: RhoGEF2 / 36915
• FlyBaseID: FBgn0023172
• Length: 2559
• Species: Drosophila melanogaster
• Sequence 2: NP_001410313.1
• Gene: arhgef2a / 368266
• ZFINID: ZDB-GENE-030722-5
• Length: 1149
• Species: Danio rerio
• Alignment Length: 1245
• Identity: 259/1245 - (20%)
• Similarity: 452/1245 - (36%)
• Gaps: 292/1245 - (23%)

  Fly  1233 NEKRSRQDEELDVELTPDRGQASIVRQ---PSDRRPDANISIRSNGNTSCNTSGLNTTDLQSSFH 1294
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Zfish    77 NDTRSVSLEDLD----PD--EMSLVLNGALRSKRAREVRRSVTQASLTSLTEEEVGTE--HQDHH 133

  Fly  1295 GSCANDSINPGGGAG------CNMDLSTSVASTTPST-----------SGSVAAGLSAFAELNAL 1342
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Zfish   134 RSALEEQSNQMHGCSASAPSLCMMQQMPRSSAPRPRSYCHESNLHHQIGGSSNSIDSEYAAL-GL 197

  Fly  1343 DTVDKEARRERYSQHPKHKSAPVSVNRSESYKERLSNKRNRNSRRKTSDPSLSSRPNDEQLDLG- 1406
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Zfish   198 DTDRRQVKAKR--QENKEDLSGNRLERTLSFLRKMTANRKNKEKERMREREREAREREARYSNGH 260

  Fly  1407 ------LSNATYVGSSNSSLSSAGGSESPSTSME-----HFAAPGAAGGVQ-VPPMGLNQN---- 1455
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Zfish   261 LFNCLTVSGTTLCSACNKSITAKEALSCPTCNVTIHNRCRDTLPNCVKMKQKQQKMALMRNNSAY 325

  Fly  1456 QHPHLLIQQHAQQ-----YCQQDSFQAGLAGA--------AGSSAASN--SSFWNAGHPLPVARW 1505
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Zfish   326 QNVTLRNKAHLKERPSSAIYPSDSLRQSLLGSRRGRSSLLLSKSVSTNNIAGTLNDDSPLGLRRI 390

  Fly  1506 TLESEDE-------------------------DDVN------EAD-WSSMVAAEVLAALTDAEKK 1538
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Zfish   391 LSQSTDSLNFRSRTMSMESLNDEGECYVSSLLEDLDCEGPEFEADSWSMAVDSSYLQTHRKDVIK 455

  Fly  1539 RQEIINEIYQTERNHVRTLKLLDRLFFLPLYESGLLSQDHLLLLFPPALLSLREIHGAFEQSLKQ 1603
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Zfish   456 RQDVIYELIQTELHHVRTLRIMDCVFRRGMLEEVQLEPGVVHALF-PCLERLLSIHTHFLTQLLA 519

  Fly  1604 RRIE-------HNHVVNTIGDLLADMFDGQSGVVLCEFAAQFCARQQIALEALKEKRNKDEMLQK 1661
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Zfish   520 RRAHSLQPGSTNNFTITQISDVLIKQFSGQFADDMLKAYSEFCSRHMKAVKLYKELLARDKRLQL 584

  Fly  1662 LLKKSESHKACRRLELKDLLPTVLQRLTKYPLLFENLYKVTVRLLPENTTEAEAIQRAVESSKRI 1726
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Zfish   585 FIRRVSRGPLLRRHGFQECILLVTQRITKYPVLLQRIHDNT----KDNLEEAAGLSQALACLREL 645

  Fly  1727 LVEVNQAVKTAEDAHKLQNIQRKLDRSSYDKEE----FKKLDLTQHHLIHDGNLTIKKNPSVQLH 1787
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Zfish   646 LCSVDQQVLELERTHRLQEIRSRVDPRAEAKLRSGALFRPAELLRRQLIHEGTL-LWKTPSSRLK 709

  Fly  1788 G---LLFENMIVLLTKQDDKYYLKNLHTPLSITNKPVSPIMSIDADTLIRQEAADKNSFFLIKMK 1849
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Zfish   710 DVQVLLMTDILVFLQEKDQRFIFASLDK---------SAVVSLQS-LLVRDIANQERGLFLISSE 764

  Fly  1850 TS--QMLELRAPSSSECKTWFKHFSDVAARQSKNRSKNASSNHDTSISDPALAAIPHSNTKESLE 1912
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Zfish   765 SSPPEMYELYAASKDDRNTWLRLIQQTIGSCPSREEFPLIETEDKALLRRLKADIQQKDS-EVLE 828

  Fly  1913 LSTDTVQPLAATATLTTTPLAPMLPIATVTPAPATNNSNVSSLTGVQLRNPQRDATASESDADY- 1976
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Zfish   829 LLQERV-------TLFSDLAEVMGGYEVMLPACSRNLFRAES---PQAPRGEQLLTQAITEVDRL 883

  Fly  1977 --------VNTPKPRSSQNEVNRTMSIRSTGEPIQKYSANGTEANDVTLRHSQSTRESVRPGSTG 2033
                    :..|.|.:|....|...|:...|   |:...||::.|           ::.:.|:
Zfish   884 TELLLGSGLEVPLPCNSNGHHNPPGSLVING---QEVLVNGSQEN-----------QAAQDGN-- 932

  Fly  2034 EERNSTYGMVGGNSKRDSASIVCSNNSNNTRTLLMQSPLVDPTAIQVSISPAHTAEPVLTPGEKL 2098
                       ||...|.                                         ||.|::
Zfish   933 -----------GNQMEDK-----------------------------------------TPSEEV 945

  Fly  2099 RRLDASIRNDLLEKQKIICDIFRLPVEHYDQIVDIAM----MPEAPKDSADIALAAYDQIQTLTK 2159
            .:...::...|...|.::.        ..|.|:::.:    :.:.|..:..:...:.|....:..
Zfish   946 SQRLVNLSAQLHALQGVVI--------RQDTILELCLRESPVSQTPSGARTVRSLSRDGASDMGS 1002

  Fly  2160 M----LNEYMHVTPEQEVSAVSTAVCGHCHEKEKLRKKVAPSSSFSSSPPPLPPPNRQHAQAQAQ 2220
            :    |.:..|...::|:..:..| .|...:.|::|
Zfish  1003 VGELALLQRQHSLLQEELVRLRGA-DGKLRDSERVR----------------------------- 1037

  Fly  2221 IPPSRLMPKLQTLDLDEVAIHEDDDGYCEIDELRLPAIPSKPHERPTTPLAPFNTE-PKTSQSVI 2284
               :.|..:|:.:..:..|:  .|.|.....:     .||...|..|.|    ||: |..||..:
Zfish  1038 ---AHLEKQLRDMKTNSAAL--GDRGGTAGSQ-----APSNRRESDTDP----NTDTPLASQESM 1088

  Fly  2285 DASKRQSTDAVPEGLLEQEPLEGDKTETKGEDNEVKTVPSDKLSESCNEERQCVEADITKEVADP 2349
            |.|         :||.|...:|.|......:|:||.:..|.: |||..:.:     ||.:| ::.
Zfish  1089 DQS---------DGLQECSDVEVDVISDDDDDDEVDSRVSPR-SESPRDLQ-----DIPEE-SET 1137

  Fly  2350 TTSKNEAAAS 2359
            .|...|..||
Zfish  1138 ATDPRERDAS 1147

Known Domains

Gene	Sequence	Domain	Region	External ID	Identity
RhoGEF2	NP_477317.1	PDZ_ARHGEF11-12-like	258..333	CDD:467282
		RGS_GEF_like	934..1055	CDD:188710
		C1_ARHGEF-like	1150..1202	CDD:410382
		RhoGEF	1539..1731	CDD:238091	59/198 (30%)
		PH_16	1756..1876	CDD:436083	34/128 (27%)
arhgef2a	NP_001410313.1	C1_ARHGEF2	256..315	CDD:410427	8/58 (14%)
		RhoGEF	456..650	CDD:238091	59/198 (30%)
		PH_ARHGEF2	690..807	CDD:275428	31/127 (24%)