Protein Alignment SMC2 and SMC1B

DIOPT Version :10

• Sequence 1: NP_610995.1
• Gene: SMC2 / 36653
• FlyBaseID: FBgn0027783
• Length: 1179
• Species: Drosophila melanogaster
• Sequence 2: NP_683515.4
• Gene: SMC1B / 27127
• HGNCID: 11112
• Length: 1235
• Species: Homo sapiens
• Alignment Length: 1320
• Identity: 300/1320 - (22%)
• Similarity: 549/1320 - (41%)
• Gaps: 293/1320 - (22%)

  Fly     2 YVKKLVLDGFKSYGRRTEIEGFDPEFTAITGLNGSGKSNILDSICFVLGISNLQNVRASALQDLV 66
            :::.|:::.|||:..|..|..| ..||.|.|.|||||||::|::.||:| ..:.|:|...:|:|:
Human     3 HLELLLVENFKSWRGRQVIGPF-RRFTCIIGPNGSGKSNVMDALSFVMG-EKIANLRVKNIQELI 65

  Fly    67 Y--KNGQAGITKATVTIVFDNTNPAQCPQGYEKCREISVTRQVVVGGKNKFLINGKLVQNKKVQD 129
            :  ..|:...:.|:|.|::           .|:..|.....:::.||.::|..|..||.......
Human    66 HGAHIGKPISSSASVKIIY-----------VEESGEEKTFARIIRGGCSEFRFNDNLVSRSVYIA 119

  Fly   130 FFCSIQLNVNNPNFLIMQGKIQQVLNMKPKEVLSMVEEAAGT----SQYKTKRDATKTLIEKKET 190
            ....|.:.|...|.|:.||.::.:...||||.....||.:.:    .:|:.|:...:...|..:.
Human   120 ELEKIGIIVKAQNCLVFQGTVESISVKKPKERTQFFEEISTSGELIGEYEEKKRKLQKAEEDAQF 184

  Fly   191 KVRETKVLLDEEVLPKLVKLRQERSAYQEYQKICRDIDF-LIRIHISAKYLKQCETLKTVEANEH 254
            ...:.|.:..|....||.|...||     ||.:..::.. .|::.:...|           .||.
Human   185 NFNKKKNIAAERRQAKLEKEEAER-----YQSLLEELKMNKIQLQLFQLY-----------HNEK 233

  Fly   255 KIEDRIANCKATHAKNLAEV--ESI---ENSVKEMQ----------QQIDAEMGGSIKNLETQLS 304
            ||  .:.|.|..|......|  ||:   ||.||..:          ||.:.|    :|::||.|:
Human   234 KI--HLLNTKLEHVNRDLSVKRESLSHHENIVKARKKEHGMLTRQLQQTEKE----LKSVETLLN 292

  Fly   305 AKRALEATATGSLKAAQGTIQQDEKKIRMASKNIEDDERALAKKEADMAKVQGEFESLK------ 363
            .||      ...:||.:.| ....||:.:|.|:|:|.|:..:|:|.|:..::.|...|.
Human   293 QKR------PQYIKAKENT-SHHLKKLDVAKKSIKDSEKQCSKQEDDIKALETELADLDAAWRSF 350

  Fly   364 ---------------EADARDSKAY----EDAQKKLEAVSQGLSTNENGEASTLQEQLIVAKEQF 409
                           |.:|.....|    |..:||:..::|.|...: .|..|.:|:|...|.:.
Human   351 EKQIEEEILHKKRDIELEASQLDRYKELKEQVRKKVATMTQQLEKLQ-WEQKTDEERLAFEKRRH 414

  Fly   410 SEAQTTIKTSEIELRHTRGVLKQREGETQTNDAAYVKDKKLHDQLVVEIKNLERQLQSLDYEGGH 474
            .|.|..:|..:.::...:..:::.|..|:|......:.|:..:.||.||:..:.::..::
Human   415 GEVQGNLKQIKEQIEDHKKRIEKLEEYTKTCMDCLKEKKQQEETLVDEIEKTKSRMSEVN----- 474

  Fly   475 FEKLKQRRNDL-------HMRKRDLKR-----ELDRCNASRYDLQYQDPEPNFDRRKVRGLVGKL 527
             |:|...|::|       |..||..||     .|.|.        |.|           .:.|:|
Human   475 -EELNLIRSELQNAGIDTHEGKRQQKRAEVLEHLKRL--------YPD-----------SVFGRL 519

  Fly   528 FQV-----KDMQNSMALVQTAGGSLYSYVTDDDVTSKKILQ---RGNLQRRV---TLIPINKIQS 581
            |.:     |..|  :|:.:..|    .::|...|.|:|:.:   |...:.|.   |.:.::.:..
Human   520 FDLCHPIHKKYQ--LAVTKVFG----RFITAIVVASEKVAKDCIRFLKEERAEPETFLALDYLDI 578

  Fly   582 GSLNRNVVEYAQNKVGAENVQWAMSLIDYDRYYEP----VMKFCFGGTLICKDLIVAKQISYDPR 642
            ..:|..:.|....|:          :||..:...|    |::|..|..|:|:.:..|:.|:....
Human   579 KPINERLRELKGCKM----------VIDVIKTQFPQLKKVIQFVCGNGLVCETMEEARHIALSGP 633

  Fly   643 INCRSVTLEGDVVDPHGTVSGGAA------------------PKGANVLEELHAI-KQIEKEYRE 688
            ...::|.|:|.:....|.:|||::                  .:.:..::||..: |.:.||
Human   634 ERQKTVALDGTLFLKSGVISGGSSDLKYKARCWDEKELKNLRDRRSQKIQELKGLMKTLRKE--- 695

  Fly   689 IDSEIAQVEKQIASIENQALAFNKMKENLDLRQHELTMCENRLAQTTFQQNQAEIEEMRERVKTL 753
              :::.|::..|...:.:          |...|:||.|.:.: ....|.|.|::::   ..:..:
Human   696 --TDLKQIQTLIQGTQTR----------LKYSQNELEMIKKK-HLVAFYQEQSQLQ---SELLNI 744

  Fly   754 EQQIIDSREKQKTSQAKIVDIEAKLADAKG-----------------------YRERELNAATNE 795
            |.|.|...|..|..|.:|.:.:.|:...:.                       .|::|::....|
Human   745 ESQCIMLSEGIKERQRRIKEFQEKIDKVEDDIFQHFCEEIGVENIREFENKHVKRQQEIDQKRLE 809

  Fly   796 IKVTKQR----AEKSRANWKKREQEFETLQLEITELQKSIETAKKQHQEMIDNLEKFKA---ELD 853
            .:..|.|    .|.||::.||:..:..||:..|.:..:.|:..||..:..:..:.:..|   :|.
Human   810 FEKQKTRLNVQLEYSRSHLKKKLNKINTLKETIQKGSEDIDHLKKAEENCLQTVNELMAKQQQLK 874

  Fly   854 ALKVNSSSAASEV-TELEQ------AIKEQKDKLRDQNKEMRNQLVKKEKMLKEN-------QEI 904
            .::|..:|:|.:| |::|:      |:..:..||:.:...::..|.:| ::.|.|       |:|
Human   875 DIRVTQNSSAEKVQTQIEEERKKFLAVDREVGKLQKEVVSIQTSLEQK-RLEKHNLLLDCKVQDI 938

  Fly   905 E-----------LEVK---KKENEQKKISSDAKEAKKRMEALEAKYPWIPEEKNCFGMKNTRYDY 955
            |           :||:   :.|:.|..|....||     ||.|..|..:.|:....
Human   939 EIILLSGSLDDIIEVEMGTEAESTQATIDIYEKE-----EAFEIDYSSLKEDLKAL--------- 989

  Fly   956 SKEDPHEAGNKLAKMQ--EKKDKMERTL--NMNAI----MVLDREEEN---FKETERRRNIVAMD 1009
            ..:...||..:|...|  .::|.:.:|.  |:.|:    .|.|:.:|:   |:.:.:...:...:
Human   990 QSDQEIEAHLRLLLQQVASQEDILLKTAAPNLRALENLKTVRDKFQESTDAFEASRKEARLCRQE 1054

  Fly  1010 KEKIKKIIVKMDEEEQDQLNKAATEVNTNFSGIFSSLL--PGAEAKLNPVH-TNGCLTGLEIKVG 1071
            .|::||       ...|...:....|:.:...|:..|.  ..|:|.|:|.: ....|.|:.....
Human  1055 FEQVKK-------RRYDLFTQCFEHVSISIDQIYKKLCRNNSAQAFLSPENPEEPYLEGISYNCV 1112

  Fly  1072 FNGIWKESLGELSGGQKSLVALSLVLAMLKFSPAPLYILDEVDAALDMSHTQNIGSMLKQHFTNS 1136
            ..|.....:..||||:|.:.||:|:.|:..|.|||.::|||||||||.::...:.|.:|:. |..
Human  1113 APGKRFMPMDNLSGGEKCVAALALLFAVHSFRPAPFFVLDEVDAALDNTNIGKVSSYIKEQ-TQD 1176

  Fly  1137 QF--LIVSLKDGLFNHANVL 1154
            ||  :::|||:..::.|:.|
Human  1177 QFQMIVISLKEEFYSRADAL 1196

Known Domains

Gene	Sequence	Domain	Region	External ID	Identity
SMC2	NP_610995.1	SMC_N	2..1162	CDD:481474	300/1320 (23%)
SMC1B	NP_683515.4	SMC_N	3..1206	CDD:481474	300/1320 (23%)