Protein Alignment SMC2 and smc3

DIOPT Version :10

• Sequence 1: NP_610995.1
• Gene: SMC2 / 36653
• FlyBaseID: FBgn0027783
• Length: 1179
• Species: Drosophila melanogaster
• Sequence 2: XP_031761083.1
• Gene: smc3 / 100145671
• XenbaseID: XB-GENE-957583
• Length: 1217
• Species: Xenopus tropicalis
• Alignment Length: 1315
• Identity: 327/1315 - (24%)
• Similarity: 582/1315 - (44%)
• Gaps: 250/1315 - (19%)

  Fly     1 MYVKKLVLDGFKSYGRRTEIEGFDPEFTAITGLNGSGKSNILDSICFVLGISNLQNVRASALQDL 65
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 Frog     1 MYIKQVIIQGFRSYRDQTIVDPFSSKHNVIVGRNGSGKSNFFYAIQFVLS-DEFSHLRPEQRLAL 64

  Fly    66 VYKNGQAGITKATVTIVFDNTNPAQCPQGYEKCREISVTRQVVVGGKNKFLINGKLVQNKKVQDF 130
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 Frog    65 LHEGTGPRVISAFVEIIFDNSD-NRLPIDKE---EVSL-RRVIGAKKDQYFLDKKMVTKNDVMNL 124

  Fly   131 FCSIQLNVNNPNFLIMQGKIQQVLNMKPKEVLSMVEEAAGTSQYKTKRDATKTLIEKKETKVRET 195
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 Frog   125 LESAGFSRSNPYYIVKQGKINQMATAPDSQRLKLLREVAGTRVYDERKEESISLMKETEGKREKI 189

  Fly   196 KVLLD--EEVLPKLVKLRQERSAYQEYQKICRDIDFLIRIHISAKYLKQCETLKTVEANEHKIE- 257
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 Frog   190 NELLKYIEERLHTLEEEKEELAQYQKWDKMRRALEY---------------TIYNQELNETRAKL 239

  Fly   258 DRIANCKATHAKNLAE-----------VESIENSVKEMQQQIDAEMGGSIKNLETQLSAKR---- 307
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 Frog   240 DELSSKRETSGEKSRQLRDAQQDARDKMEDIERQVREFKSKISA-----MKEEKEQLSSERQEQI 299

  Fly   308 ----ALEATATGSLKAAQGTIQQDEKKIRMASKNIEDDERALAKKEADMAKVQGEFESLKEAD-- 366
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 Frog   300 KQRTKLELKAKDLQDELAGNSEQRKRLLKERQKLLEKIE----EKQKELAETEPKFSSVKQKEES 360

  Fly   367 --ARDSKAYE---DAQKKLEAVSQGLSTNENG-----EASTLQEQLIVAKEQFSEAQTTIKTSEI 421
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 Frog   361 GIARLAQATQERTDLYAKQGRGSQFTSKEERDKWIKKELKSLDQAINDKKRQIAAINKDLEDTEA 425

  Fly   422 ELRHTRGVLKQREGETQT---NDAAYVK------DKKLHDQLVVEIKNLERQLQS-LDY----EG 472
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 Frog   426 N--------KEKNLEQYTKLDQDLSEVKARVEELDKKYY-----EVKNKKDELQSERNYLWREEN 477

  Fly   473 GHFEKLKQRRNDLHMRKRDLKRELDRCNASRYDLQYQDPEPNFDRRKV--------RGLVGKLFQ 529
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 Frog   478 AEQQALAAKREDLEKKQQLLRAATGKAILNGIDSINKVLE-HFRRKGINQHVINGYHGIVMNNFD 541

  Fly   530 VKDMQNSMALVQTAGGSLYSYVTDDDVTSKKIL---QRGNLQRRVTLIPINKIQSGSLNRNVVEY 591
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 Frog   542 CEPAFYTCVEV-TAGNRLFYHIVDSDEVSTKILMEFNRMNLPGEVTFLPLNK-----LDVRDTAY 600

  Fly   592 AQNKVGAENVQWAMSLIDYDRYYEPVMKFCFGGTLICKDLIVAKQISYDPRINCRSVTLEGDVVD 656
            .:.......:    |.:.|:..::...|..||.||||:.:.|:.|::....::|  :|||||.|.
 Frog   601 PETNDAIPMI----SKLRYNHRFDKAFKHVFGKTLICRSMEVSTQLARAFTMDC--ITLEGDQVS 659

  Fly   657 PHGTVSGGAAPKGANVLE----------ELHAI-----KQIEKEYREIDSEIAQVEKQIASIENQ 706
            ..|.::||......:.||          ||||:     :.:.:....|::||.|:..|:..||.|
 Frog   660 HRGALTGGYYDTRKSRLELQKDVRKVEDELHALEAKLNENLRRNIERINNEIDQLMNQMQQIETQ 724

  Fly   707 ALAFNKMKENLDLRQHELTMCENRLAQT--TFQQNQAEIEEMRERVKTLEQQIIDSREKQKTSQA 769
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 Frog   725 Q---RKFKASRDSILSEMKMLKEKRQQSEKTFMPKQRSLQSLEASLHAME----STRESLKAELG 782

  Fly   770 KIVDIEAKLADAKGYRERELNAATNEIKVTKQRAEKSRANWKKREQEFETLQLEIT--------- 825
            ..:..:..|.|     ::.::|..:||:..:|         :.|:...|.::||.|
 Frog   783 TDLLSQLSLDD-----QKRVDALNDEIRQLQQ---------ENRQLLNERIKLEGTITRVETYLN 833

  Fly   826 -ELQKSIETAKKQHQEMIDN-----LEKFKAELDAL--KVNSSSAASEVTELEQAIKEQKDKLRD 882
             .|:|.::..:::..|:.:.     |....:||:|:  :|..:.|.||  .|:..|.:.:.:::|
 Frog   834 ENLRKRLDQVEQELNELRETEGGTVLTATTSELEAINKRVKDTLARSE--GLDGTIDKTEVEIKD 896

  Fly   883 QNKEM-RNQLVKKEKMLKENQEI-ELE---------VKKKENEQKKI---SSDAKEAKKRMEALE 933
            ..|.| |.:.::||.|...|.:. |||         :||||...|||   .|..:||.::.:.|.
 Frog   897 LVKSMDRWKNMEKEHMEAINHDTKELEKMTNRQGMLLKKKEECMKKIRELGSLPQEAFEKYQTLS 961

  Fly   934 AKYPWIPEEKNCFGMKNTRYDYSKEDPHEAGNKLAKMQEKKDKMERTLNMNAIMVLDREEE---N 995
            .|..:...|: |    ||..........:|.::.....|:|:|:           :.|:||   .
 Frog   962 LKQLFRKLEQ-C----NTELKKYSHVNKKALDQFVNFSEQKEKL-----------IKRQEELDRG 1010

  Fly   996 FKETERRRNIVAMDKEKIKKIIVKMDEEEQDQLNKAATEVNTNFSGIFSSLLPGAEAKL------ 1054
            :|......|::.:.|.:..::..|              :|:.|||.:|..|:||.:|.|
 Frog  1011 YKSIMELMNVLELRKYEAIQLTFK--------------QVSKNFSEVFQKLVPGGKATLVMKKGD 1061

  Fly  1055 -----------------------NPVHTNGCLTGLEIKVGFNGIWKE--SLGELSGGQKSLVALS 1094
                                   :.|.:....||:.|:|.|.|...|  .:.:|||||||||||:
 Frog  1062 VEGSQSQDEGEGSAEGERGSGAHSSVPSVDQFTGVGIRVSFTGKQAEMREMQQLSGGQKSLVALA 1126

  Fly  1095 LVLAMLKFSPAPLYILDEVDAALDMSHTQNIGSMLKQHFTNSQFLIVSLKDGLFNHANVLFRTLF 1159
            |:.|:.|..|||.|:.||:|.|||..|.:.:..|:.:..:::||:..:.:..|...|:..:...|
 Frog  1127 LIFAIQKCDPAPFYLFDEIDQALDAQHRKAVSDMIMELASHAQFITTTFRPELLESADKFYGVKF 1191

  Fly  1160 EEGVSTITRQVSRQA 1174
            ...||.|....:.||
 Frog  1192 RNKVSHIDVITAEQA 1206

Known Domains

Gene	Sequence	Domain	Region	External ID	Identity
SMC2	NP_610995.1	SMC_N	2..1162	CDD:481474	321/1300 (25%)
smc3	XP_031761083.1	SMC_N	2..1197	CDD:426784	322/1303 (25%)