DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment Mdr50 and ABCB22

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_523740.3 Gene:Mdr50 / 36582 FlyBaseID:FBgn0010241 Length:1313 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:NP_001327523.1 Gene:ABCB22 / 822471 AraportID:AT3G28415 Length:1229 Species:Arabidopsis thaliana


Alignment Length:1259 Identity:470/1259 - (37%)
Similarity:707/1259 - (56%) Gaps:68/1259 - (5%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly    76 LFRYATKKDRALYVIGLLSAVATGLTTPANSLIFGNLANDMIDLGGLLESGKSYRADDAISTLLL 140
            :|.:|...|..|..:||:.||..|..||....|.|.|.||:         |.|...|..    .:
plant    10 IFMHANSVDLVLMGLGLIGAVGDGFITPIIFFITGLLLNDI---------GDSSFGDKT----FM 61

  Fly   141 DKVRQFSLQNTYIGIIMLVCSYLSITCFNYAAHSQILTIRSKFFRSILHQDMKWYDFN--QSGEV 203
            ..:.:.::...|:....||..::...|:......|...:|.|:.|::|.||:.::|.:  .:.:|
plant    62 HAIMKNAVALLYVAGASLVICFVEGYCWTRTGERQASRMREKYLRAVLRQDVGYFDLHVTSTSDV 126

  Fly   204 ASRMNEDLSKMEDGLAEKVVMFVHYLVAFVGSLVLAFVKGWQLSLVCLTSLPLTFI---AMGLVA 265
            .:.::.|...::|.|:||:..|:....|||.|.::.|:..|:|::|......|..|   ..|...
plant   127 ITSVSSDTLVIQDVLSEKLPNFLMSASAFVASYIVGFIMLWRLTIVGFPFFILLLIPGLMCGRAL 191

  Fly   266 VATSRLAKKEVTMYAGAAVVAEGALSGIRTVKAFEGEAKEVAAYKERVVAAKILNIKRNMFSGIG 330
            :..||..::|   |..|..:||.|:|.:|||.||..|.|.::.:...:..:..|.:::.:..||.
plant   192 INISRKIREE---YNEAGSIAEQAISLVRTVYAFGSERKMISKFSAALEGSVKLGLRQGIAKGIA 253

  Fly   331 FGLLWFFIYASYALAFWYGVGLVIKGYHEPAYENYDAGTMITVFFSVMMGSMNIGMAAPYIEAFG 395
            .|... ..||.:....|||..:|:       |.....||:..|...:..|..::|.....::.|.
plant   254 IGSNG-VTYAIWGFMTWYGSRMVM-------YHGAKGGTIFAVIICITYGGTSLGRGLSNLKYFS 310

  Fly   396 IAKGACAKVFHIIEQIPEINPIDGEGKKLNEPLTTIEFKEVEFQYPTRPEVSILNKLNLKIHRGQ 460
            .|..|..::..:|:::|:|:..:..|:.|......::||.|:|.|.:|||..|.:.|.|:|..|:
plant   311 EAVVAGERIIEVIKRVPDIDSDNPRGQVLENIKGEVQFKHVKFMYSSRPETPIFDDLCLRIPSGK 375

  Fly   461 TVALVGPSGCGKSTCIQLVQRFYDPQAGNLLFNGTNLKDLDINWLRSRIGVVGQEPILFATSIYE 525
            :|||||.||.||||.|.|:||||||..|.:|.:|.::|.|.:.||||::|:|.|||.||||||.|
plant   376 SVALVGGSGSGKSTVISLLQRFYDPIVGEILIDGVSIKKLQVKWLRSQMGLVSQEPALFATSIEE 440

  Fly   526 NIRYGREDATREEIEAAAAAANAAIFIKKLPKGYDTLVGERGAQLSGGQKQRIAIARALIRDPEI 590
            ||.:|:|||:.:|:..||.::||..||.:.|.||.|.|||||.|:||||||||:||||:|:.|.:
plant   441 NILFGKEDASFDEVVEAAKSSNAHDFISQFPLGYKTQVGERGVQMSGGQKQRISIARAIIKSPTL 505

  Fly   591 LLLDEATSALDTASEAKVQAALEKVSAGRTTIIVAHRLSTVRRADRIVVINKGEVVESGTHQELM 655
            |||||||||||:.||..||.||:..:.|||||::||||||:|..|.|.|...|::||:|:|:|||
plant   506 LLLDEATSALDSESERVVQEALDNATIGRTTIVIAHRLSTIRNVDVICVFKNGQIVETGSHEELM 570

  Fly   656 ELKD-HYFNLVTTQLGE-----DDGSVLSPTGDIYKNF--DIKDEDEEEIKVLS-----EDEDED 707
            |..| .|.:||..|:.|     |:.||....|. :.||  |:|......|:..|     ...|.:
plant   571 ENVDGQYTSLVRLQIMENEESNDNVSVSMREGQ-FSNFNKDVKYSSRLSIQSRSSLFATSSIDTN 634

  Fly   708 VMVTDEKNKKKKKKKVKDPNEVKPMLEVMKMNKPEWLQIAVGCISSVIMGCAMPIFAVLFGSILQ 772
            :..:..|:||...|:            :|.||||||.....||:|:|:.|...||:|...||::.
plant   635 LAGSIPKDKKPSFKR------------LMAMNKPEWKHALYGCLSAVLYGALHPIYAYASGSMVS 687

  Fly   773 ILSVKDNDQYVRENSNQYSLYFLIAGIVVGIATFLQIYFFGIAGERLTERLRGLMFEAMLRQEVA 837
            :..:..:|: ::|.:..|.|.|:...::..:.:.:|.|.|...||.||:|:|..:...:|..||:
plant   688 VYFLTSHDE-MKEKTRIYVLLFVGLAVLCFLISIIQQYSFAYMGEYLTKRIRENILSKLLTFEVS 751

  Fly   838 WFDDKANGTGSLCARLSGDAAAVQGATGQRIGTIVQSISTLALGIALSMYYEWSLGLVALAFTPF 902
            |||:..|.:||:|:||:.||..|:...|:|:..:||:||.:::...|.:...|.|.:|.:|..|.
plant   752 WFDEDENSSGSICSRLAKDANVVRSLVGERVSLLVQTISAVSVACTLGLAISWKLSIVMIAIQPV 816

  Fly   903 ILIAFYMQRTLMAKENMGSAKTMENCTKLAVEVVSNIRTVASLGREEMFHQNYIGMLIPAVEISK 967
            ::..||.||.::...:..:.|..:..:|||.|.||||||:.:...:|.     |..|:..|:...
plant   817 VVGCFYTQRIVLKSISKKAIKAQDESSKLAAEAVSNIRTITAFSSQER-----ILKLLKMVQEGP 876

  Fly   968 RNTHFR-----GLVYGLARSLMFFAYAACMYYGTWCVIHRGILFGDVFKVSQALIMGTASIANAL 1027
            :..:.|     |:|...:||||....|...:||...:|...|.....|::....:.....||:|.
plant   877 QRENIRQSWLAGIVLATSRSLMTCTSALNYWYGARLIIDGKITSKAFFELFILFVSTGRVIADAG 941

  Fly  1028 AFAPNMQKGVSAAKTIFTFLRRQPSIVDRPGVSRDPWHSEGYVRFDKVKFSYPTRSEIQVLKGLE 1092
            |...::.||..|..::|..|.|..:|.........|.:.:|.::|..|.|:||||.::.:.|...
plant   942 AMTMDLAKGSDAVGSVFAVLDRYTNIEPEKPDGFVPQNIKGQIKFVNVDFAYPTRPDVIIFKNFS 1006

  Fly  1093 LAVSKGQKIALVGPSGCGKSTCIQLIQRFYDVDEGATLIDECDVRNVSMTNLRNQLGIVSQEPIL 1157
            :.:.:|:..|:|||||.||||.|.||:||||..:|...||..|:|:..:.:||..:|:|||||||
plant  1007 IDIDEGKSTAIVGPSGSGKSTIIGLIERFYDPLKGIVKIDGRDIRSYHLRSLRQHIGLVSQEPIL 1071

  Fly  1158 FDRTIRENISYGDNARNVTDQEIISACKKSNIHEFIANLPLGYDTRMGEKGAQLSGGQKQRIAIA 1222
            |..||||||.||..:..:.:.|||.|.|.:|.|:||..|..||||..|::|.|||||||||||||
plant  1072 FAGTIRENIMYGGASDKIDESEIIEAAKAANAHDFIVTLSDGYDTYCGDRGVQLSGGQKQRIAIA 1136

  Fly  1223 RALIRNPKIMLLDEATSALDAESEKVVQDALDAASEGRTTISIAHRLSTVVHSDVIFVFENGLVC 1287
            ||:::||.::||||||||||.:||::|||||.....|||::.|||||||:.:.|.|.|.:.|.|.
plant  1137 RAVLKNPSVLLLDEATSALDNQSERMVQDALGRLMVGRTSVVIAHRLSTIQNCDTITVLDKGKVV 1201

  Fly  1288 EAGDHKQLLAN--RGLYYTLYKLQ 1309
            |.|.|..|||.  .|:|::|..||
plant  1202 ECGTHSSLLAKGPTGVYFSLVSLQ 1225

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
Mdr50NP_523740.3 PTZ00265 69..1308 CDD:240339 468/1256 (37%)
ABCB22NP_001327523.1 MdlB 21..587 CDD:440747 222/589 (38%)
MdlB 640..1225 CDD:440747 231/602 (38%)

Return to query results.
Submit another query.