Protein Alignment shot and alpha-Spec

DIOPT Version :10

• Sequence 1: NP_725339.1
• Gene: shot / 36542
• FlyBaseID: FBgn0013733
• Length: 8805
• Species: Drosophila melanogaster
• Sequence 2: NP_001261286.1
• Gene: alpha-Spec / 38231
• FlyBaseID: FBgn0250789
• Length: 2457
• Species: Drosophila melanogaster
• Alignment Length: 2825
• Identity: 534/2825 - (18%)
• Similarity: 1035/2825 - (36%)
• Gaps: 831/2825 - (29%)

  Fly  5977 DVNSRVAALEKQYLALQKKLDTKKAETEASLRDGR---HFAENCSKTLGWLGGELSNLTDRLLVS 6038
            |:..|    .:|.|:.......:..:....|.|.|   :|..:..:...|:..:|...::.   |
  Fly    17 DIQER----REQVLSRYNDFKIETRQKREKLEDSRRFQYFKRDADELESWIHEKLQAASEE---S 74

  Fly  6039 AHKPT-LQHQIDTHEPIYREVMAREHEVIMLINKGKDLTDRQQ--DRGVKRDLDRIQQQWEKLRR 6100
            ...|| ||.:|..|:....||.|..:.::.|.|.|:::.::|.  ...::..||.:.:.||.|..
  Fly    75 YRDPTNLQAKIQKHQAFEAEVSAHSNAIVSLDNTGQEMINQQHFASESIQVRLDELHKLWELLLS 139

  Fly  6101 EAVDRHTRLQTC------MEHCKK---YSQTSETFLAWLRTAEDKLADLTPGVLSKAKLETRLRD 6156
            ...::..:||..      :..|::   :.:..|||:    ||::...||       ..:|...|.
  Fly   140 RLAEKGLKLQQALVLVQFLRQCEEVMFWIKDKETFV----TADEFGQDL-------EHVEVLQRK 193

  Fly  6157 LQTFRSEVWKHSGEFENTKGLGETFLSSCDIDKEPIKAELQDIRDRWERLNNDLIAR------AH 6215
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  Fly   194 FDEFQKDMASQEYRVTEVNQLADKLVQDGHPERDTITKRKEELNEAWQRLKQLAIVRQEKLFGAH 258

  Fly  6216 EIENCSRRLDDFNDELRNLDHSLGRCEDRLAAHDALGGAAKDPKLLERVKAIREELTNLSKPLQS 6280
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  Fly   259 EIQRFNRDADETVAWIAE--------KDVVLSSDDYG---RD---LASVQALQRKHEGVERDLAA 309

  Fly  6281 LKALAKDISAEA-RAAGGDADHLTSEVDGLADRMSELQGRLDDRCGELQSAATAVSQFNEQMKS- 6343
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  Fly   310 LEDKVSTLGAEAQRLCSIHADH----SDQIRDKQAEI-------ANYWQSLTTKARERKQKLDES 363

  Fly  6344 -----LGIDLNDLETEIEKLSPPGREIKIVQVQIDDVGKIQTKLDRLVGRLEDAERAADVLVDAG 6403
                 ...|..||.:.|..:       |.: :..|::.|.....:.|:.|.::.:
  Fly   364 YYLHRFLADFRDLVSWINGM-------KAI-ISADELAKDVAGAEALLERHQEHK---------- 410

  Fly  6404 FAADTTQTREQISTLRKTLGRLDNRVRDHEDNLHSTLKALREFYDHQSQTLDDIQDVSDEFKRMK 6468
                               |.:|.|    ||:...|.::.::..:.:.....:||
  Fly   411 -------------------GEIDAR----EDSFKLTTESGQKLLEREHYAAAEIQ---------- 442

  Fly  6469 PVGSELDQIRRQQEDFRNFRERKVEPLAINVDKVNVAGRDLVRSAGSGVSTTAIEKDLEKLNDRW 6533
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  Fly   443 ------------------------EKLA------------------------ALENDKSSLLSLW 459

  Fly  6534 NDLKERMNERDRRLDVALLQSGKFQEALAGLSKWLSDTEEMVANQKPPSSDYKVVKAQLQEQKFL 6598
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  Fly   460 ED---RRILYEQCMDLQL-----FYRDTEQADTWMAKQEAFLANEDLGDS-LDSVEALIKKHEDF 515

  Fly  6599 KKMLLDRQNSMGSLANLGKEV--ANHCEPGERASIEKQLNDLMKRFDALTDGAEQRELDLEEAME 6661
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  Fly   516 EKSLAAQEEKIKALDIFATKLIDGQHYAADDVAQ-RRQM--LLARRAALQEKSSKRRQLLEDSNR 577

  Fly  6662 VAKRFHDKISPLELWLDNTERSVKAMELIPTDEEKIQQRIREHDRLHDEILGKKPDFSDLADVTA 6726
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  Fly   578 Y-QQFERDCDETKGWI--SEKLKFATDDSYLDPTNLNGKMQKHQNFEHELNANKSRIEDITNVGT 639

  Fly  6727 QLM---HLVSDEEAVNLGEKVRGVTERYTGLVDASDNIGALLAESRQGLRHLVLSYQDLVAWMES 6788
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  Fly   640 ELIEKQHYAADQ----INTRMQEIVVLWETLVQASDKKGTKLNEACQ-QQQFNRTIEDIELWLSE 699

  Fly  6789 MEAEL------KRFKSVPVYAEKLLEQMDHLLELNENIAGHASNVEST-------VESGAELMKH 6840
            :|.:|      |...||....:|      |.| |..::..|...:||.       :|||     |
  Fly   700 IEGQLLSEDHGKDLTSVQNLQKK------HAL-LEADVMAHQDRIESIKVAANKFIESG-----H 752

  Fly  6841 ISNDEAIQLKDKLDSLQRRYGDLTNRGGDLLKSAQNALPLVQQFHEAHNRLVEWMQSAEAALAPS 6905
            ...|   .:::|..:|..||.                                      |..||.
  Fly   753 FDAD---NIRNKEGNLSARYA--------------------------------------ALAAPM 776

  Fly  6906 EPRQADVLRLEGELADMRPILDSINQVGPQLCQLSPGEGAATIESIVTRDNRRFDSIVEQIQRKA 6970
            ..|:             :.:|||:.                                |:|:.|
  Fly   777 GERK-------------QHLLDSLQ--------------------------------VQQLFR-- 794

  Fly  6971 ERLHLSNQRAKEVTGDIDELLEWFREMD----TTLREADLPAMEPKLVRAQLQEHRSINDDISSQ 7031
                           |:::...|.||.:    :|.|..||..     |:..:::|:::..:|::.
  Fly   795 ---------------DLEDEAAWIREKEPIAASTNRGRDLIG-----VQNLIKKHQAVLAEINNH 839

  Fly  7032 KGRVRDVTAASKKVLRESPQSENTATLREKLDDLKEIVDTVAQLCSERLGILEQALPLSEHFADS 7096
            :.|:.:|.::.:.:|::.|.:.:  .:|::|:.|:|..:|:.:..|:|...|:.:|...::|||:
  Fly   840 EARLLNVISSGENMLKDQPFASD--DIRQRLEALQEQWNTLKEKSSQRKQDLDDSLQAHQYFADA 902

  Fly  7097 HQGLTAWLDDMEQQISRLSMPALRPDQITLQQDKNERLLQSIAEHKPLLDKLNKTGEALGAL--- 7158
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  Fly   903 NEA-ESWMREKE--------PIATGSDYGKDEDSSEALLK---KHEALVSDLEAFGNTIQALQEQ 955

  Fly  7159 ----------VADDDGAK----------------------INEILDTDNARYAALRLELRERQQA 7191
                      |.|..|.:                      :..:|:::|..:  .::|:.:||..
  Fly   956 AKNCRQQETPVVDITGKECVVALYDYTEKSPREVSMKKGDVLTLLNSNNKDW--WKVEVNDRQGF 1018

  Fly  7192 LESALQESSQFSDKLE-GMLRALANTVD---------QVN-QLDPLSALPQ----KIREQI---- 7237
            :.:|      :..|:: |:..:..|.||         |:| |.|.|.||.:    |:.|.:
  Fly  1019 VPAA------YIKKIDAGLSASQQNLVDNHSIAKRQNQINSQYDNLLALARERQNKLNETVKAYV 1077

  Fly  7238 --------------EDNDALMDD-----------LDKRQDAFSAVQRAANDVIAKAGNKADPAVR 7277
                          ::|.|.:.|           |.|:.|.|:. ...||:|  :..|..:.||:
  Fly  1078 LVREAADLAQWIRDKENHAQIADVVGEDLEEVEVLQKKFDDFND-DLKANEV--RLANMNEIAVQ 1139

  Fly  7278 -----------DIKAKLEKLNNLWNDVQNATKKRGSSLDDILSVAEPFWKQLNSVMKTLKDLEET 7331
                       .|:.:::.||..||::|..|.::.|.|.           ..:.|.:..:|::||
  Fly  1140 LTSLGQTEAALKIQTQMQDLNEKWNNLQTLTAEKASQLG-----------SAHEVQRFHRDIDET 1193

  Fly  7332 LS--CQEPPAAQPQDIKKQQVALQEI--RHE-----IDQTKPEVEQVRRHGSNLMNMCGEPDKPE 7387
            ..  .::..|....|:.|...::|.:  :||     :...:.::.|:....:.||.  ..||..|
  Fly  1194 KDWIAEKANALNNDDLGKDLRSVQTLQRKHEGVERDLAALRDKIRQLDETANRLMQ--SHPDTAE 1256

  Fly  7388 ---VKKHIEDLDNAWDNITALYAKREENLIDAMEKAMEFHETLQNLLKFLTKAEDKFAHLGA--- 7446
               .|:  ::::..||.|......|:|.|:|:.:           |.:||:...|..|.:.:
  Fly  1257 QTYAKQ--KEINEMWDQIITKSTARKEKLLDSYD-----------LQRFLSDYRDLLAWINSMMS 1308

  Fly  7447 ------VGSDIDAVKRQIEQLKSFKDEV-------------------------DPHMVEVEA--- 7477
                  :.:|:...:..||:.::.:.|:                         :.|..|::|
  Fly  1309 LVTSDELANDVTGAEALIERHQARRAEIGFTLGISSAPGAAASTSSIASPSGDEEHRTEIDARAG 1373

  Fly  7478 -------LNRQAVELTERTSPEQAASIREPLSVVNRRWEALLRGMVERQKQLEHAL-LHLGQFQH 7534
                   ...:.::.....|||    |:|.:..:.:..|.|.:...||:.|||..| |.|.....
  Fly  1374 TFGAFEQFGNELLQANHYASPE----IKEKIEDLAKAREDLEKAWTERRLQLEQNLDLQLYMRDC 1434

  Fly  7535 ALNELLVWINKTDSTL--DQLKPIPGDPQLLEVELAKLKVLANDIQAHQNSVDTLNDAGRQLIET 7597
            .|.|  .|::..::.|  |......|:   :|..:.|.:.....|..|:..:..|.....|||
  Fly  1435 ELAE--SWMSAREAFLNADDDANAGGN---VEALIKKHEDFDKAINGHEQKIAALQTVADQLI-- 1492

  Fly  7598 EKGSVEASTTQEKLRKLNNEWKQLLQKASDRQHEL--EEALREAHGYIAEVQDILGWLGDVDAVI 7660
            .:....::...||.:::...|:.|.:...:::..|  |:.|::   :..:..:|..|:.:
  Fly  1493 AQNHYASNLVDEKRKQVLERWRHLKEGLIEKRSRLGDEQTLQQ---FSRDADEIENWIAE----- 1549

  Fly  7661 GASKPVGGLPETATEQLERFMEVYN-------------ELDENRPKVETIQAQGQEYIKRQNQMK 7712
                    ..:.|||  |.:.:..|             ||..|..:::::.|.|...|.:: |..
  Fly  1550 --------KLQLATE--ESYKDPANIQSKHQKHQAFEAELAANADRIQSVLAMGGNLIDKK-QCS 1603

  Fly  7713 VSSSNLQHTLRTLKQRWDAVVSRASDKKIKLEIALKEATEFHDTLQAFVEWLTQAEKLLSNAEPV 7777
            .|...:|..|..:..:|:.:..:.::|.:||:.|.|:.| :...::....||.:.|.||: .|..
  Fly  1604 GSEDAVQKRLTQIADQWEYLTHKTTEKSLKLKEANKQRT-YIAAVKDLDFWLGEVESLLT-TEDS 1666

  Fly  7778 SRVLETIQAQMEEHKVLQKDVSTHREAMLLLDKKGTHLKYFSQKQDVILIKNLLVSVQHRWERVV 7842
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  Fly  1667 GKDLASVQNLMKKHQLVEADIVAHEDRIKDMNNQADSL-VESGQFDTAGIQEKRQSINERYERIC 1730

  Fly  7843 SKAAERTRALDHGYKEAREFND-----AWSGMMQYLQETEQVL--DQIIEEATASKEPQKIKKYI 7900
            :.||.|...|:......:.|.|     :|      ::|.:.::  |....:.|.   .|.:||
  Fly  1731 NLAAHRQARLNEALTLHQFFRDIADEESW------IKEKKLLVGSDDYGRDLTG---VQNLKK-- 1784

  Fly  7901 GKLKETHRQLGAKQSVYDGTMRTGKNLLERAPKGDRPVLDKMLIELKEQWTRVWSKSIDRQRKLE 7965
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  Fly  1785 -KHKRLEAELGSHEPAIQAVQEAGEKLMDVSNLG-VPEIEQRLKALNQAWAELKNLAATRGQKLD 1847

  Fly  7966 EALLLSGQFSDALGELLDWLKKAKSRLNENGPVHGD-LETVQGLCEHHKHIEQDLQKRAAQMQGV 8029
            |:|... ||...:.|...|:.:.:..|:...  :|| :..||||.:.|...|.|......:...:
  Fly  1848 ESLTYQ-QFLAQVEEEEAWITEKQQLLSVED--YGDSMAAVQGLLKKHDAFETDFTAHKDRCSLI 1909

  Fly  8030 LKTGRDLERSGNNPEVGRQLDEMQSIWEEVKSAVAKRGERLQVALVDAEKLNARVQ-ALFD---- 8089
            ...|.:|..:.|:.                ..::|:|.::|::.|.:...|.||.: ||.|
  Fly  1910 CDQGSELVEAKNHH----------------GESIAQRCQQLRLKLDNLSALAARRKGALLDNSAY 1958

  Fly  8090 ------------WLDHAEHKLRYAKNAPDDEKVSREMMDIHMDFMKDLRVRER--EKTETFE--- 8137
                        |:|..|:.:|      .||            |.:||...:.  .|.|||:
  Fly  1959 LQFMWKADVVESWIDDKENYVR------SDE------------FGRDLSTVQTLLTKQETFDAGL 2005

  Fly  8138 -------------YAEDIINKAYPDAIPIIKNWLSIIQQRWEEVRQWAINRESKL----EQHLQ- 8184
                         ..:.:||.::..:..|:|....:| .||:::|..:..|:.:|    ||..|
  Fly  2006 NAFEQEGIHNITALKDQLINASHAQSPAILKRHGDVI-ARWQKLRDASNTRKDRLLAMQEQFRQI 2069

  Fly  8185 --------------------SLKDLDD-----TIEELLA-------------------------- 8198
                                :.:||.|     :|||:.|
  Fly  2070 EELYLTFAKKASAFNSWFENAEEDLTDPVRCNSIEEIRALRDAHAQFQASLSSAEADFKALAALD 2134

  Fly  8199 --------------W--LSGLEGTLLNLKHEQLPDEIPPVEKLIEDHKEFMENTARRQNEVDRAC 8247
                          |  :..||.|..||            :|:||:....:...|:||.|.|:..
  Fly  2135 QKIKSFNVGPNPYTWFTMEALEETWRNL------------QKIIEERDGELAKEAKRQEENDKLR 2187

  Fly  8248 K---------------PRQLPPGARKPSRSGKTPV-FKGSRDQGLNAR--KGSRITPTRDTPDRD 8294
            |               .|....|.   :|.|.:.: ..||.:|.|.|.  |.:.:...|  .|..
  Fly  2188 KEFAKHANLFHQWLTETRYYMLGY---NRQGTSMMEGSGSLEQQLEALRVKATEVRARR--VDLK 2247

  Fly  8295 RLPHYGP----------RFSP-STSGPELEFRSPRAKLLWTKWRDVWMLSWERQRLLNDHLLYLK 8348
            ::...|.          |::. ||.|            |..:|..:..||...|..|...:
  Fly  2248 KIEELGALLEEHLILDNRYTEHSTVG------------LAQQWDQLDQLSMRMQHNLEQQI---- 2296

  Fly  8349 DVERARNFSW--DDWRKRFLKYMNHKKSRLTDLFRKMDKDNNGMIPRDVFIDGILNTKFDTSGL- 8410
               :|||.|.  :|..|.|           :.:|:..|||.:|.:....|...:....:|...:
  Fly  2297 ---QARNHSGVSEDSLKEF-----------SMMFKHFDKDKSGKLNHQEFKSCLRALGYDLPMVE 2347

  Fly  8411 ------EMKAVADLFDRNGEGLIDWQEFIA 8434
                  |.:|:.|:.|.|.:|.:..||:||
  Fly  2348 EGQPDPEFEAILDVVDPNRDGYVSLQEYIA 2377

Known Domains

Gene	Sequence	Domain	Region	External ID	Identity
shot	NP_725339.1	SAC6	204..>420	CDD:227401
		CH_PLEC-like_rpt2	223..327	CDD:409038
		SPEC	471..689	CDD:238103
		SPEC	690..866	CDD:238103
		SH3_10	864..929	CDD:407754
		SPEC	1047..1250	CDD:238103
		SPEC	1153..1390	CDD:238103
		PLEC	<1498..1526	CDD:197605
		Plectin	1949..1980	CDD:459901
		DUF5585	2860..>3198	CDD:465521
		SMC_prok_B	<4936..>5564	CDD:274008
		SPEC	5304..5513	CDD:238103
		SPEC	<5658..5787	CDD:413338
		SPEC	5793..6007	CDD:238103	4/29 (14%)
		SPEC	6011..6220	CDD:238103	47/229 (21%)
		SPEC	6118..6330	CDD:238103	43/221 (19%)
		PRK09039	<6279..6441	CDD:181619	29/168 (17%)
		SPEC	6443..6660	CDD:238103	35/218 (16%)
		SPEC	6663..6878	CDD:238103	45/230 (20%)
		SPEC	6880..7087	CDD:238103	33/210 (16%)
		SPEC	6986..7196	CDD:238103	48/248 (19%)
		SPEC	7196..7417	CDD:238103	60/287 (21%)
		SPEC	7314..7526	CDD:238103	48/267 (18%)
		SPEC	7528..7747	CDD:238103	43/235 (18%)
		SPEC	7749..7968	CDD:238103	49/225 (22%)
		SPEC	7973..8181	CDD:238103	50/247 (20%)
		FRQ1	<8375..8444	CDD:444056	17/67 (25%)
		GAS2	8450..8522	CDD:128539
		PHA03307	8550..>8795	CDD:223039
alpha-Spec	NP_001261286.1	SPEC	48..258	CDD:238103	42/223 (19%)
		SPEC	154..364	CDD:238103	46/245 (19%)
		SPEC	261..470	CDD:238103	51/335 (15%)
		SPEC	471..680	CDD:238103	43/224 (19%)
		SPEC	682..893	CDD:238103	57/333 (17%)
		Spectrin	893..>961	CDD:395348	17/79 (22%)
		SH3_Alpha_Spectrin	974..1026	CDD:212742	6/59 (10%)
		SPEC	1074..1287	CDD:238103	46/230 (20%)
		SPEC	1182..1425	CDD:238103	48/261 (18%)
		SPEC	1426..1638	CDD:238103	44/237 (19%)
		SPEC	1533..1744	CDD:238103	49/232 (21%)
		SPEC	1646..1850	CDD:238103	48/218 (22%)
		SPEC	1852..2062	CDD:238103	50/247 (20%)
		SPEC	1958..2176	CDD:238103	42/248 (17%)
		SPEC	2072..2296	CDD:238103	45/252 (18%)
		EFh	2311..2379	CDD:238008	18/78 (23%)
		EFhand_Ca_insen	2386..2456	CDD:430177