Protein Alignment CG1371 and nomo

DIOPT Version :10

• Sequence 1: NP_610551.1
• Gene: CG1371 / 36053
• FlyBaseID: FBgn0033482
• Length: 1199
• Species: Drosophila melanogaster
• Sequence 2: XP_002662361.1
• Gene: nomo / 446115
• ZFINID: ZDB-GENE-040826-3
• Length: 1208
• Species: Danio rerio
• Alignment Length: 1261
• Identity: 385/1261 - (30%)
• Similarity: 626/1261 - (49%)
• Gaps: 150/1261 - (11%)

  Fly     6 GVFVILLIKL----FQNANAGEVEVVGCGGFIKSHAEIDFSRVEIKLLTKQGSLKDKTDCSPSNG 66
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Zfish     3 GIKELAILTLSFLYFTFVNATDDILVGCGGFVKSDVEINYSVIEIKLYTKQGSLKYQTDCAPING 67

  Fly    67 YYFLPIYDKGDYLLSISPPPGWSFEPEQVELNFDGKTDVCSQGRDVNFVFKGFGITGQVALAAGG 131
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Zfish    68 YFMIPLYDKGDFVLKIEPPSGWSFEPTTVDLHVDGVTDICTKEQDINFVFTGFSVLGTV-LSKGH 131

  Fly   132 --GARGVDVELR--SEQGEVRRTKSDANGVFSFTPIIPGNYVVKASHARWHFSKAEHKVVVVSGN 192
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Zfish   132 LLGPAGVEVSLRKAGEDAVLQSVFTHAGGQYTFLKVLPGSYDITASHSSWTLEQSSTAVVV--SN 194

  Fly   193 TELPANS-LVVSGFDVVGRFDS-SSPLPGNLGVALYKKKGQSLVPKCETS--SPAPPNSVNSAYE 253
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Zfish   195 ENAPAAAPLVVKGYDVSGEVQSDSEPMKG-VSFLLY----SASVTKEDISGCAVAP---VDGALV 251

  Fly   254 SASS----CFSQLDKSGEYIFKNVPSGKYLLQAINLDSKLKLHLSPELLELEVGKDTLQIKDEFK 314
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Zfish   252 GDASLVYLCSSQSREDGTFSFPCLPSGEYTVVPYYRGERITFDVAPSRMDFKVEHSSLTLQPVFR 316

  Fly   315 ITGFTVSGRVLTSAGGEPLKSAVIKVNGKKVAETDAQGSYTLENLKAGTVNIEVESSQLQFSPLQ 379
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Zfish   317 VMGFSVMGRVLNGPDGEGVADAVVTLNNQIKVETKEDGSFRLENMTTGTYTINTHKELMFFEPVT 381

  Fly   380 VKAQINTASLPTIVPSAYEVCGKVVSPKSHNVGLTKIGST-------------------FHSSAS 425
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Zfish   382 VKIAPSTPQLPDIITAGFSVCG--------HISVTRLPETVKQLGRYKVTLSAQRQDQGFFRTVE 438

  Fly   426 TNAETGNWCAFLPVGKYTIEVLTTDADKAAGVQFFPVQQQTEVRDAPVNGITFSQLRAKIRGELQ 490
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Zfish   439 SDSH-GAFCFQVKPGDYSVQVTLPESEVKAGLALQPHSLDISLVDRPVTDLLFTQFIASVSGSVS 502

  Fly   491 CLPDATATCTSAEVTLQALDATGQPTENKWKARAHRGKYVFKDMLPGPYELTIPQGNLCYESTRV 555
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Zfish   503 CL----VACGDLTVSLQPVSRQGERQNFQLSGSSETLTFTFGNVLPGKYKVSITQEEWCWKHKSV 563

  Fly   556 FLNVASAEEDAPPFVHKGYEVSIISSHRALMKYTHVTGPSEPKAPTESL---KIASGVNTFCVKK 617
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Zfish   564 EIDVLDSYVEGVEFRQTGYLLRCSLSHAITLEFF-----QDGSLP-ENVGVYNLSKGVNRFCLSK 622

  Fly   618 YGSYDFKLEGCH-------TYDESLPSKFITPEPDQLQTLIINAVA-HKTGVRVLSTEPTAD--- 671
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Zfish   623 PGVYKVTPRSCHQFEQDYYTYNTSAPS-----------ILTLTAVRHHMTG--LITTDKMLDVTV 674

  Fly   672 SIKLVLESE-------------------------------SLGQEVITPVAES-HKVDGKFAYRY 704
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Zfish   675 TIKSSIESEPALVLGPLRSNEEQRREQQLLEIAARKKERGEAGDEKSPPVEEKPEELREPFHYEF 739

  Fly   705 DTYLKPEQVLRITPVSDVLLFAPQQHE-IVGSSDCVDIAFNFVATRGLILRGKVVPAIKDAKITL 768
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Zfish   740 SYWARAGEKITVTPSSKEFLFYPPEVEATITGENCPGRLVEITGRAGLFLTGQVAPTLEGVEITI 804

  Fly   769 SFPDQPELESLEVLTSVTGEFKFGPIEESLAFDLKAEKESYVFSDYNRQTASFSAHKLCEISVVV 833
            . ..:.....:.|||...|.:..||:.....:|:.|.||.:|.:....:|..|.|..|..::..:
Zfish   805 K-ESKATTPLITVLTDENGAYSVGPLHSDSQYDISASKEGFVLTPVEGKTGDFKAFALAGVTFEI 868

  Fly   834 KDEAGQTLGGVLLSLSGGESYRKNLVTGDNGAINFHSLSPSQYYLRPMMKEYKFEPNSKMIDIKD 898
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Zfish   869 KAEDGVPLSGVLLSLSGA-SFRSNLLTQDTGLLTFNNLSPGQYYFKPMMKEFRFEPSAQMITVEE 932

  Fly   899 GETVSVTLVGKRFAYSIFGTVSSLNGDPFAGVNVQATADNSCPQQPEEATSEANGQYRIRGLQPG 963
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Zfish   933 GQVLHIPITGFKTAYSCYGTVQSIGGDAEQGVAVEAVGQSECGMYSEDTVTDEEGRFRLRGLRPG 997

  Fly   964 CSYSVRVVPD-KEIVERSIPAQHTVKVANEDVRDINLVAISPLKIVDITARVTATLNEHYKTLRI 1027
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Zfish   998 CNYNIQLRGEGNDHIERALPPHKTIEVGNTDIDGINIIAFRQINQFDLSGNV-ITSPEHLPTLWV 1061

  Fly  1028 VMYRKGNSDSPVFSQRVGTPVNPKARLNPGITVFFPRIPLDGKSYVVELQSTLSDKTYTYKLPST 1092
            .:|:..|.|:|..|..:|          ..:...|..:|.||:|||:.|.::||...|.:|||..
Zfish  1062 KLYKSDNLDNPFQSVSLG----------QSLFFHFQPLPRDGESYVLMLDTSLSRSQYDFKLPQV 1116

  Fly  1093 TFVADRGSVFVELEFKPEVRAAEADLNQNSISALVLIALVAIAFFKQDLATSFLSFVWSKLNDV- 1156
            :|.:......|.|.|.|:.:..:.|:.|.|..||.|..|:.:|.:..:.....|..:.|::..|
Zfish  1117 SFTSSGYHKHVTLTFNPKRKIPDQDVAQGSFIALPLTLLLLLAVYNHERVIPLLLQLVSQIQGVR 1181

  Fly  1157 ----------AADLAQRQKSKTQVRK 1172
                      ..|.|:|...:.:.|:
Zfish  1182 GLAQASGDGLPVDEAKRPSKRPKTRR 1207

Known Domains

Gene	Sequence	Domain	Region	External ID	Identity
CG1371	NP_610551.1	ClfA	<44..456	CDD:443959	150/442 (34%)
		ClfA	<828..>969	CDD:443959	62/140 (44%)
		CarboxypepD_reg	914..>970	CDD:433354	22/55 (40%)
nomo	XP_002662361.1	ClfA	<66..>399	CDD:443959	124/343 (36%)
		CarboxypepD_reg	422..480	CDD:433354	9/58 (16%)
		ClfA	<796..>1002	CDD:443959	79/207 (38%)