DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment TER94 and vcp

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_001097249.1 Gene:TER94 / 36040 FlyBaseID:FBgn0286784 Length:826 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:NP_958889.1 Gene:vcp / 327197 ZFINID:ZDB-GENE-030131-5408 Length:806 Species:Danio rerio


Alignment Length:800 Identity:663/800 - (82%)
Similarity:738/800 - (92%) Gaps:6/800 - (0%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly    30 KREDLATAILKRKDRPNRLIVEEAQNDDNSVVSLSQAKMDELQLFRGDTVILKGKRRKETVCIVL 94
            |.:||:|||||:|:|||||||:|:.|:|||||||||||||||||||||||:||||:|:|||||||
Zfish     8 KNDDLSTAILKQKNRPNRLIVDESINEDNSVVSLSQAKMDELQLFRGDTVLLKGKKRRETVCIVL 72

  Fly    95 SDDTCPDEKIRMNRVVRNNLCVHLSDVVSVQSCPDVKYGKRVRILPIDESTEGVTGNLFEIYLKP 159
            |||||.|||:||||||||||.|.|.||:|:|.|||||||||:.:||||::.||:||||||:||||
Zfish    73 SDDTCSDEKVRMNRVVRNNLRVRLGDVISIQPCPDVKYGKRIHVLPIDDTVEGITGNLFEVYLKP 137

  Fly   160 YFLEAYRPIHMGDNFIVRAAMRPIEFKVVLTDPEPYCIVAPETVIFCDGDPIKREEEEESLNAVG 224
            |||||||||..||.|:||..||.:|||||.|||.|||||||:|||.|:|:|||||:||||||.||
Zfish   138 YFLEAYRPIRKGDIFLVRGGMRAVEFKVVETDPSPYCIVAPDTVIHCEGEPIKREDEEESLNEVG 202

  Fly   225 YDDIGGCRKQLAQIKEMVELPLRHPSLFKAIGVKPPRGILMYGPPGTGKTLIARAVANETGAFFF 289
            ||||||.||||||||||||||||||:||||||||||||||:||||||||||||||||||||||||
Zfish   203 YDDIGGVRKQLAQIKEMVELPLRHPALFKAIGVKPPRGILLYGPPGTGKTLIARAVANETGAFFF 267

  Fly   290 LINGPEIMSKLAGESESNLRKAFEEAEKNSPAIIFIDEIDAIAPKRDKTHGEVERRIVSQLLTLM 354
            |||||||||||||||||||||||||||||:||||||||:|||||||:||||||||||||||||||
Zfish   268 LINGPEIMSKLAGESESNLRKAFEEAEKNAPAIIFIDELDAIAPKREKTHGEVERRIVSQLLTLM 332

  Fly   355 DGMKKSSHLIVMAATNRPNSIDPALRRFGRFDREIDIGIPDATGRLEVLRIHTKNMKLHDDVDLE 419
            ||:|:.:|:|||||||||||||||||||||||||:||||||||||||:|:||||||||.||||||
Zfish   333 DGLKQRAHVIVMAATNRPNSIDPALRRFGRFDREVDIGIPDATGRLEILQIHTKNMKLADDVDLE 397

  Fly   420 QIAAESHGHVGADLASLCSEAALQQIREKMDLIDLEDDKIDAEVLASLAVTMENFRYAMTKSSPS 484
            |:|.|:|||||||||:||||||||.||:|||||||||:.|||||:.||||||::||:|:::|:||
Zfish   398 QVANETHGHVGADLAALCSEAALQAIRKKMDLIDLEDETIDAEVMNSLAVTMDDFRWALSQSNPS 462

  Fly   485 ALRETVVEVPNTTWTDIGGLESVKKELQELVQYPVEHPDKFLKFGMQPSRGVLFYGPPGCGKTLL 549
            |||||||||||.||.|||||:.||:|||||||||||||||||||||.||:|||||||||||||||
Zfish   463 ALRETVVEVPNITWEDIGGLDDVKRELQELVQYPVEHPDKFLKFGMTPSKGVLFYGPPGCGKTLL 527

  Fly   550 AKAIANECQANFISVKGPELLTMWFGESEANVRDIFDKARSAAPCVLFFDELDSIAKARGGNVGD 614
            ||||||||||||||:||||||||||||||||||:||||||.||||||||||||||||||||||||
Zfish   528 AKAIANECQANFISIKGPELLTMWFGESEANVREIFDKARQAAPCVLFFDELDSIAKARGGNVGD 592

  Fly   615 AGGAADRVINQILTEMDGMGAKKNVFIIGATNRPDIIDPAILRPGRLDQLIYIPLPDDKSREAIL 679
            .||||||||||||||||||.:||||||||||||||||||||||||||||||||||||:|||.|||
Zfish   593 GGGAADRVINQILTEMDGMSSKKNVFIIGATNRPDIIDPAILRPGRLDQLIYIPLPDEKSRIAIL 657

  Fly   680 KANLRKSPLAKEVDLTYIAKVTQGFSGADLTEICQRACKLAIRQAIEAEIRREKERAENQNSAMD 744
            ||||||||::|:|||.::||:|.||||||||||||||||||||::||.|||||:||..|. |||:
Zfish   658 KANLRKSPISKDVDLDFLAKMTNGFSGADLTEICQRACKLAIRESIENEIRRERERQTNP-SAME 721

  Fly   745 MDEDDPVPEITSAHFEEAMKFARRSVSDNDIRKYEMFAQTLQQSRGFGQNFRFP----GQTGNTS 805
            ::||||||||...||||||:|||||||||||||||||||||||||||| :||||    |.:|.:.
Zfish   722 VEEDDPVPEIRKDHFEEAMRFARRSVSDNDIRKYEMFAQTLQQSRGFG-SFRFPSSNQGGSGPSQ 785

  Fly   806 GSGNNLPVNSPGDNGDDDLY 825
            ||......|...::.|||||
Zfish   786 GSSGGGGGNVFNEDNDDDLY 805

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
TER94NP_001097249.1 CDC48 47..787 CDD:273521 630/739 (85%)
vcpNP_958889.1 CDC48 25..764 CDD:273521 630/739 (85%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 708..727 11/19 (58%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 768..806 15/38 (39%)

Return to query results.
Submit another query.