DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment stmA and stmA

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_001014513.1 Gene:stmA / 35865 FlyBaseID:FBgn0086784 Length:834 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:XP_061517024.1 Gene:stmA / 1280505 VectorBaseID:AGAMI1_009446 Length:839 Species:Anopheles gambiae


Alignment Length:860 Identity:600/860 - (69%)
Similarity:692/860 - (80%) Gaps:47/860 - (5%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly     1 MALIRCCFEPPELPEFFDSFVQKCTDPSCCCGCCSALRPRYKRLVDNIFPVNPEDGLVKSNMEKL 65
            |::|:|||||.|:|||.||||:|||: .||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
Mosquito     1 MSMIKCCFEPLEMPEFLDSFVKKCTE-GCCCGCCSALRPRYKRLVDNIFPANPEDGLVKSNMEKL 64

  Fly    66 TFYSLSSPDKLDRIGEYLYQKATKDINRKRYKLAEIAMEAMDLLLQACHAQTTLNLFVESFLRMV 130
            |||||.||:|||||||||||:|:|||.|||||..|||||||||||.||||| .||||||||||||
Mosquito    65 TFYSLRSPEKLDRIGEYLYQRASKDIYRKRYKFVEIAMEAMDLLLMACHAQ-ILNLFVESFLRMV 128

  Fly   131 QKLLEDSNPNLKIMATNSFVKFANINEDTPSYHRRYDFFISKFSSMCH--SDAASMRDSLRLAGI 193
            ||||||:||.|:||||||||:||||.|||||||||||||||||||||:  :|...:|||:|:|||
Mosquito   129 QKLLEDTNPTLQIMATNSFVRFANIEEDTPSYHRRYDFFISKFSSMCYGNNDDMELRDSIRMAGI 193

  Fly   194 KGLQGVIRKTVSDDLVENIWEAEHMEKIVPSLLFNMQFCVNVMFVKKNLLASGDLTPVE-DATNV 257
            ||||||||||||||||.||||.:||||||||||||||              ||.....: :||..
Mosquito   194 KGLQGVIRKTVSDDLVANIWEKQHMEKIVPSLLFNMQ--------------SGPSKSTDTEATPS 244

  Fly   258 TPPALAEEVLRELVGRASFGHIRSVLKPLLTHLDRHELWVPNTFAIHTFRIVMISIQPQYSYTVV 322
            |||.|||.||||||.|||||||:|||||||||||.|:|||||.|||.||||||||||||||||||
Mosquito   245 TPPLLAEAVLRELVSRASFGHIKSVLKPLLTHLDHHKLWVPNKFAIDTFRIVMISIQPQYSYTVV 309

  Fly   323 ETLMQHLDNNFKSSPKTRTSLAVVLSKIIAIAAGESVGPSALDIINNLLTHLRTSVSTT-SEITP 386
            ||||.|||.|..|||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||:|||||. .|.||
Mosquito   310 ETLMSHLDQNLTSSPKTRTSLAVVLSKIIAIAAGESVGPSALDIINNLLMHLKTSVSTQHDESTP 374

  Fly   387 EESQYQEALINALGEFANHHPDYQKIEIMLFIMNTVPDLSKKSKGDQMLQNILLKSLLKVGTQYS 451
            ||:|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|.|||||.:||||||||||||||||.
Mosquito   375 EETQYQEALINALGEFANHHPDYQKIEIMLFIMNTVPDPSHKSKGDHLLQNILLKSLLKVGTQYR 439

  Fly   452 TVSFEKAFPASFLQPLLKMARAPHNPTRMVVMQILQALLDRHQNEQVLSSVSVKPYPALSQEPPS 516
            |||||||||.||||||||||||...|.|::||||.|.|||||||:.:|:.::|..||.|:.|.||
Mosquito   440 TVSFEKAFPVSFLQPLLKMARAASIPIRIIVMQIFQQLLDRHQNQHLLNVINVSHYPTLTIETPS 504

  Fly   517 RSDIIFTHKYGANIMQALIDSMALSDRVDALTSSFNTAALLIVEMSCNETVQEFLLFILGIQQVA 581
            ||||:||||||:||:||:|:||:..:.::.|.||:||.||:||||:|.||:|||||||||:||||
Mosquito   505 RSDILFTHKYGSNILQAIIESMSQENHLEVLKSSYNTIALVIVEMACGETMQEFLLFILGVQQVA 569

  Fly   582 CTVDTLGNVHKCSLHAISIGLLVLISRVSGINNLLEYAQKIVDARREEASHFLPPLLEPKKLAGK 646
            .|...|...|:|:||:|:|.||:|:.|.:|:..|:||.:|::.||:||||:.||||::..|.|..
Mosquito   570 VTEVELSPKHRCNLHSIAISLLILLGRCTGVGPLVEYVEKLIQARKEEASYLLPPLMDNDKSAPS 634

  Fly   647 TFNLQLPHLAIDKLALGECLQNAGMDAQRLNTGAPYSLNQTDHPGHRHSWVESVSNQLTQRNSSA 711
            |.|..||||.:||||:.||||.||::..|:.||.||:|||||...||||||::.|   ..|||..
Mosquito   635 TLNTNLPHLLVDKLAVAECLQQAGLECNRVQTGTPYALNQTDISAHRHSWVDTHS---AVRNSVV 696

  Fly   712 DLTVYNGDVDSVSSSPGVCKKLLAPEFNFDAMKRALAEPTEAAKREQRERQMQIVRTFREGEFDD 776
            |.: || |::||||||||.|:.||.|:||::|||.|||||||:|||.||:||||.|||||..|:|
Mosquito   697 DAS-YN-DIESVSSSPGVQKRSLASEYNFESMKRVLAEPTEASKREAREKQMQIGRTFRETAFED 759

  Fly   777 LMRRTEPKHDLIQNRLNELFNSLAVERQITQS----------------------DTKSSQLQASN 819
            |:||||||||:|||:|||:||:|:.||||:.|                      :.....|.|..
Mosquito   760 LVRRTEPKHDVIQNKLNEIFNALSAERQISASCGVQAGSLLLAANGGLNGPSMIEPGKHHLAAGG 824

  Fly   820 EKPIYETNFPELFYY 834
            ::||||.||||||:|
Mosquito   825 QRPIYENNFPELFFY 839

Return to query results.
Submit another query.