DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment lig and Ubap2l

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_001260795.1 Gene:lig / 35771 FlyBaseID:FBgn0020279 Length:1417 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:XP_063138197.1 Gene:Ubap2l / 361984 RGDID:1308707 Length:1140 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:1349 Identity:362/1349 - (26%)
Similarity:522/1349 - (38%) Gaps:361/1349 - (26%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly    50 QDASKTDKPEKAQPKATTEQLRIAQITNSTTEDPQINEKVLLLLTMTQRSEEEVCCALNECDYDL 114
            |..::.....|.:|:||.||:|:||:. |...|....|||..|:.:|.::::|...||::|:.|:
  Rat    16 QPQNQNQTQHKQRPQATAEQIRLAQMI-SDHNDADFEEKVKQLIDITGKNQDECVIALHDCNGDV 79

  Fly   115 EAAANFLIEELPQGAFAKYEKKRKNKAANNTADGAAGDGDWADGNGNADRREKSRNRSSNRGGT- 178
            ..|.|.|:|..|.  ...:|...|.|..:...||...:.: .:|..|.||   .|:.|..|||. 
  Rat    80 NRAINVLLEGNPD--THSWEMVGKKKGVSGQKDGGQTESN-EEGKENRDR---DRDYSRRRGGPP 138

  Fly   179 ---RGSSDSRGWRGRETRENERNQRESREPWSGQNAGQDRGDDRANDNYRGQRNG--GGRS-GPG 237
               ||:|     ||||......::...                     .|||.||  |.:| ||.
  Rat   139 RRGRGAS-----RGRECMHGALSKPAV---------------------VRGQENGLDGTKSGGPS 177

  Fly   238 GGGRGGGFVSRSGRGGGR-MGGRTGGPRGDRGSGGPGGA-----------YGSGRGGNANEDHHE 290
            |.|...|   |.|||.|| ..||.||....:|.|....|           |||..|...|...| 
  Rat   178 GRGTDRG---RRGRGRGRGSSGRRGGRFSAQGMGTFNPADYAEPANTDDNYGSSSGNTWNNTGH- 238

  Fly   291 VELWDNTI--------AQNAEKQQQA----HDDAW----GDWNNEEYEGSLKDSKVFTTSNLATQ 339
            .|..|.|.        :....|.:.|    |..||    .:|..|::...|.::|:||.||    
  Rat   239 FEPDDGTRLDFIGVEGSNYPRKFETAPGMIHPGAWRTATEEWGTEDWNEDLSETKIFTASN---- 299

  Fly   340 SAANVVSGTGASVTAVPAAAGTEISAPPGLEHQLVQQGSHLEESSSSGPAAVTPPATLSGSATTP 404
                 ||........|...||..|.    |...|.:..|.:|..||:...:..|      |...|
  Rat   300 -----VSSVPLPAENVTITAGQRID----LAVLLGKTPSSMENDSSNLDPSQAP------SLAQP 349

  Fly   405 LLQYSAAVSNPPPQLQSQGTQS--------GAGTGASAAAGGGAGSTPSSFVSASPDTFSSAASA 461
            |: :|.:..|...|..|..|.|        |.|.|....|.||: :|.|.|:    :.|.:|.: 
  Rat   350 LV-FSNSKQNAISQPASGNTFSHHSMVSMLGKGFGDVGEAKGGS-TTGSQFL----EQFKTAQA- 407

  Fly   462 AATLVHQAQKQQQLQQQTTPI--KPSATLSVEQSQYFNSLAS-----------QGVSPGS----V 509
               |...|.:..|....||..  ..|.|.|....||....|:           |..:|.|    |
  Rat   408 ---LAQLAAQHSQSGSTTTSSWDMGSTTQSPSLVQYDLKSANDSTVHSPFTKRQAFTPSSTMMEV 469

  Fly   510 PVQSAPAGYAQNPVAAYSQTSTSVGVSQYP--NTYANVFASGTAAGAGTAEQSQQQPQIRRARVK 572
            .:|..|      |..|.|..:.....|..|  :|.|...:.|::....::.|..|| ::::.:.|
  Rat   470 FLQEKP------PAVATSTAAPPPPSSPLPSKSTSAPQMSPGSSDNQSSSPQPAQQ-KLKQQKKK 527

  Fly   573 LPPPSKIPASAVEMPGDNALNNIGYLDVQFGALDFGTDDGFEPLPEKVGSGFSIDGQQQQQQPDD 637
            ....|||||.||||||.   .:|..|::|||||.||:    ||:                  ..|
  Rat   528 TSLTSKIPALAVEMPGS---ADISGLNLQFGALQFGS----EPV------------------LSD 567

  Fly   638 YQSKSQQQQQVTLAAGLQSSQISDALNAAGYTSRSTSQQQQGVSSAVNATIDQLTKSDPYGQTGG 702
            |:|        |......|||...:|    |||.::..     ||.|:                 
  Rat   568 YES--------TPTTSASSSQAPSSL----YTSTASES-----SSTVS----------------- 598

  Fly   703 SGNAYQNAYQSSGASKTASGFPTTAPGGYSSSTYANVQSSVANSYQQQGYGSYQPSSYQQQAGSG 767
            |..:.::.|||               |...|:||.:..::....|:|:   |.|...|.....|.
  Rat   599 SNQSQESGYQS---------------GPIQSTTYTSQNNAQGPLYEQR---STQTRRYPSSISSS 645

  Fly   768 AQSGTGAVSGGGGTATQNIPVGGSSSQNSTSVSTSSGVSSNSGSTGNGGVVSGQTGANQAAVSNN 832
            .|...        |..:|    |.||..:|.:.|:..|   .|:||:  .|..::.:..:..|.|
  Rat   646 PQKDL--------TQAKN----GFSSVQATQLQTTQSV---EGATGS--AVKSESPSTSSIPSLN 693

  Fly   833 NSVSGSSSVSNVTAGVASGNVAGVGGGVSQSGVSSGVGVPG------GSASSVGVNVNNNSSSAS 891
            .:|..:|.::  ||...|.         |.||:|....:|.      .||.|...|..::|:|:.
  Rat   694 ETVPAASLLT--TASQHSS---------SLSGLSHSEEIPNTTTTQHSSALSTQQNTLSSSTSSG 747

  Fly   892 SVGAATVAQTATGTTAAVLASLTNKNTSSSNSSGSGGSAATTTGNASGQGAGASTGGVGSSSGAG 956
            ....:|:..|:..:.|.:.:|.:..:|:||..|......:.::...||...|.|.|  .:|:...
  Rat   748 RTSTSTLLHTSVESEANLHSSSSTFSTTSSTVSAPPPVVSVSSSLNSGSSLGLSLG--SNSTVTA 810

  Fly   957 GAGSGGGSGSGLVPTNIQ------MVSQYIQT-GLPY-YQQPVYSYEELQMMQQRVPHVQGYYDL 1013
            ...|...:.||..|.|:.      :.:.||.. ||.: |...||.|::|||:|.|.|  ..||.:
  Rat   811 STRSSVATTSGKAPPNLPPGVPPLLPNPYIMAPGLLHAYPPQVYGYDDLQMLQTRFP--LDYYSI 873

  Fly  1014 NYP-PASLGAGRD-NLGSVTYSAMNDGRFARTDNNSSPVGNVSSTMSQQAGSSA----------P 1066
            .:| |.:...||| :|.|..||. :..:|.|.| .|||....:....||..:..          |
  Rat   874 PFPTPTTPLTGRDGSLASNPYSG-DLTKFGRGD-ASSPAPATTLAQPQQNQTQTHHTTQQTFLNP 936

  Fly  1067 MLNVPYAY----FYGG-NVMPGSFQYGTPAIYPQIPAAN---------TASGQQFPKPSYSAGYG 1117
            .|...|:|    :|.| ..:|.:|||| ||::|..|.::         .||...|.:||   |||
  Rat   937 ALPPGYSYTSLPYYTGVPGLPSTFQYG-PAVFPVAPTSSKQHGVNVSVNASATPFQQPS---GYG 997

  Fly  1118 STSYDTLSQTTQDYSKGGYSSSVNQQSKTQTVSNQSQAGTG-SDLTSSMYGKGHVALNKVNSYEK 1181
            |..|:|           |.|         .|.||     || .|::.|:|.|..      .|:||
  Rat   998 SHGYNT-----------GVS---------VTSSN-----TGVPDISGSVYSKTQ------QSFEK 1031

  Fly  1182 QSFHSGTP-PPFNMPNTQTAGG-----TSAQPYGMYLPMP--------AAGHHNMIHQPIHQD-- 1230
            |.|||||| ..||:|:...:||     |:|    .|.|.|        ...|..::|..:.||  
  Rat  1032 QGFHSGTPAASFNLPSALGSGGPINPATAA----AYPPAPFMHILTPHQQPHSQILHHHLQQDGQ 1092

  Fly  1231 ----------------SNSAGQRQQSTS--QSKSAGKQGYSPSYWAGQN 1261
                            ...:|||.|::|  |.....|..|:...| |.|
  Rat  1093 LPYLQMILCCQRQQEEQTGSGQRSQTSSIPQKPQTNKSAYNSYSW-GAN 1140

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
ligNP_001260795.1 PRK12678 16..>229 CDD:237171 51/182 (28%)
UBA_UBP2_like 85..122 CDD:270463 12/36 (33%)
DUF3697 575..607 CDD:372135 18/31 (58%)
Ubap2lXP_063138197.1 None

Return to query results.
Submit another query.