Protein Alignment Cul1 and cul-5

DIOPT Version :10

• Sequence 1: NP_523655.1
• Gene: Cul1 / 35742
• FlyBaseID: FBgn0015509
• Length: 774
• Species: Drosophila melanogaster
• Sequence 2: NP_505616.2
• Gene: cul-5 / 179413
• WormBaseID: WBGene00000840
• Length: 765
• Species: Caenorhabditis elegans
• Alignment Length: 812
• Identity: 228/812 - (28%)
• Similarity: 394/812 - (48%)
• Gaps: 98/812 - (12%)

  Fly    14 VNLDDIWSELVEGIMQVFEHEKSLTRSQYMRFYTHVYDYCTSVSAAPSGRSSGKTGGAQLVGKKL 78
            :..|:.||: .:.|:....|:||:|.:.:...:.|||...:.|...|               .|:
 Worm     1 MQFDEEWSK-ADPIVHALLHQKSVTPAAWQDLFYHVYKITSWVDDGP---------------LKI 49

  Fly    79 YDRLEQFLKSYLSELLTKFKAISGEEVLLSRYTKQWKSYQFSSTVLDGICNYLNRNWVKRECEEG 143
            .|.|.:.:..|:.|...:.:::..:..||..|.|:|..:...:.:|......::.:..:|...|.
 Worm    50 RDILTRCINDYVHEANKRIRSLQTDGSLLIGYIKEWNRFYQQANILPLPFKKIDESSRRRSVPET 114

  Fly   144 QKGIYKIYRLALVAWKGHLFQVLNEPVTKAVLKSIEEERQGKLINRSLVRDVIECYVELSFNEED 208
            .:  ..|..:.|..|...:|..::|.:....|:.::|||.|.:|:...|..:.|.:|.|  |:.
 Worm   115 PE--ESIRTVMLEKWNEIIFMNISEQLLVEALRLVKEERDGNIIDAQNVIGIRESFVAL--NDR- 174

  Fly   209 TDAEQQKLSVYKQNFENKFIADTSAFYEKESDAFLSTNTVTEYLKHVENRLEEETQRVR------ 267
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 Worm   175 --AGEDPLLVYRQSFERQFIEQTTEYYKKICGNLLNELGVLEYMVYADKKLEEEQQRAKRYLEMN 237

  Fly   268 ----GFNSKNGLSYLHETTADVLKSTCEEVLIEKHLKIFHTEFQNLLNADRNDDLKRMYSLVALS 328
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 Worm   238 SPTSGKHMEKAVIALVESFEDTILAECSKLIASKDV----------------ERLQRLYRLIRRT 286

  Fly   329 SKNLTDLKSILENHILHQGTEAIAKCCTTDAAN---DPKTYVQTILDVHKKYNALVLTAFNNDNG 390
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 Worm   287 RSGIDTVLKCIDTHIRTEGLNDM----RNNAENLSTDPERYVQQLLLMFDKFSSLVREGFCDDAR 347

  Fly   391 FVAALDKACGKFINSNVV----------TIANSASKSPELLAKYCDLLLKKS--SKNPEDKELED 443
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 Worm   348 LLTARDKAFRAVVNDSSIFKTEMMNKKGRTLSVESKCAELLANYCDLLLRKTQLSKKLTSEEIDE 412

  Fly   444 NLNQVMVVFKYIEDKDVFQKYYSKMLAKRLVNHTSASDDAEAMMISKLKQTCGY--EYTVKLQRM 506
            .||||::|.||:|:||||.:::...|::||:...||..:.|.||::||:: ||.  :...||.||
 Worm   413 KLNQVLLVLKYVENKDVFMRFHRAHLSRRLILEMSADQEKEEMMVTKLRE-CGMPSDAVNKLSRM 476

  Fly   507 FQDIGVSKDLNSYFKQYLAEKNLTMEI--DFGIEVLSSGSWPFQLSN--NFLLPSELERSVRQFN 567
            .|||.::||:||.||:.|...|....|  ...::||:.|:|....|.  .|.||.|||..|.:..
 Worm   477 LQDIELNKDMNSSFKKALTGTNNNKSIADSINMKVLNGGAWGRGGSERIRFSLPRELEDFVPEME 541

  Fly   568 EFYAARHSGRKLNWLYQMCKGELIMNVNRNNSSTYTLQASTFQMSVLLQFNDQL--SFTVQQLQD 630
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 Worm   542 AFYKKQHNGRKLCWMHHWSSGTMVFGT--ANGGRFDLECTTFQMAVLFCFNDRAHDKISLETLRL 604

  Fly   631 NTQTQQENLIQVL-----------QILLKAKVLTSSDNENSLTPESTVELFLDY------KNKKR 678
            .|:.....|.:.|           |||| ..|.:::......|..:...:..|:      |:::|
 Worm   605 ATELPDAELNRTLLSLVAYPKMRYQILL-CDVPSTTVTARDFTDSTKFLINHDFNVVKNGKSQQR 668

  Fly   679 -RININQPLKTELKVEQETVHKHIEEDRKLLIQAAIVRIMKMRKRLNHTNLISEVLNQLSTRFKP 742
             ::|:...|:..|:...|..|:.|...|:|.:|..||:|:|.||......|..|::..|...|.|
 Worm   669 GKVNLIGRLQLSLEANAEKEHESIVALRELRVQEGIVKILKTRKTYTLAQLTMELVEILKPLFIP 733

  Fly   743 KVPVIKKCIDILIEKEYLERMEGHKDTYSYLA 774
            ...:||:.||.|||.:|:||.....:|:.|::
 Worm   734 NRKIIKEQIDWLIENKYMERRADDINTFVYIS 765

Known Domains

Gene	Sequence	Domain	Region	External ID	Identity
Cul1	NP_523655.1	Cullin	20..673	CDD:459983	192/696 (28%)
		Cullin_Nedd8	704..765	CDD:463146	24/60 (40%)
cul-5	NP_505616.2	Cullin	7..657	CDD:459983	192/696 (28%)
		Cullin_Nedd8	692..759	CDD:214883	25/66 (38%)