Protein Alignment Ptr and ptchd1

DIOPT Version :10

• Sequence 1: NP_610209.2
• Gene: Ptr / 35546
• FlyBaseID: FBgn0262867
• Length: 1169
• Species: Drosophila melanogaster
• Sequence 2: XP_690754.1
• Gene: ptchd1 / 562268
• ZFINID: ZDB-GENE-061220-1
• Length: 887
• Species: Danio rerio
• Alignment Length: 884
• Identity: 238/884 - (26%)
• Similarity: 411/884 - (46%)
• Gaps: 79/884 - (8%)

  Fly    12 LNKSFYHLGICIAKHPGYFIIIPVLLTLLCMTGYQQLKYQIDPEYLFSPIAGEGKTERAIVEQYF 76
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Zfish    10 LRTSFHKLGHFVANHPVFFASAPVLISILLGASFSRYRIEENVEYLLAPKHSLAKIEGNLVDSLF 74

  Fly    77 KVNYTHRFNVGRITRPGRFGRVIVITKDGDENMIRREVFQELRQLDNIIQNATTTYDGDTYTYKD 141
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Zfish    75 PVNRSKHTLYSDLQTPGRYGRVIVTSRRG--SVLDPHHVNSVLKLHNTITQIQVPMLGFNYTFAH 137

  Fly   142 NCARWENE-CFENDILNLDALMDDIEAGQLNLTFPFMFNPVT--------WDAH-LFPVFFGGTK 196
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Zfish   138 LCLLDESKSCIVDDILRVLEEMRSARAS--NHSVPPLRYPITKLKDGREAYIGHQLGGVLASGGR 200

  Fly   197 LTEDNYVISVPAIQLVYFVTADTKRQDAKGAEWEETFLRVVGNAENSGQ-FKHISVSYFASRTLD 260
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Zfish   201 ----DGVRSARALQLTYYLQAVSPLNEVVAASWELLFCR---ELENFGKAHPELSLHPFTSSSLQ 258

  Fly   261 HELEKNTKTVVPYFSSTFLLMGL-----FSIITCMMGDAVRSKPFLGLMGNVSAIMATLAAFGLA 320
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Zfish   259 RDFQRTSRV-----SERPLLFSLAVCLSLAMLCCSMRDCVRTKPWLGLLALVTVSLATLTSAGIL 318

  Fly   321 MYCGIEFIGINLAAPFLMIGIGIDDTFVMLAGWRRTKAKMPVAERMGLMMSEAAVSITITSVTDF 385
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Zfish   319 NLTGGKYNSTYLGIPFVMLGHGLFGTFEMLSSWRRTREDQHVKERVAAVFSDCMLPFTASTALHV 383

  Fly   386 ISFLIGIISPF---RSVRIFCTYSVFAVCFTFLWHITFFAACMAISGYRERKNLHSIFGCRVQPM 447
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Zfish   384 VTFGIG-ASPFTNIEAVRLFCQNACISVLFNYLYILTFYGSNLVFAGYLENNYRHSLF-CRRVPK 446

  Fly   448 SVAIKEK----RNFLY-----KAIMAGGIDANDPDNPIDNKDHMLMAFFKDKMAAVINNKWCKAI 503
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Zfish   447 PELLQQKPAWYRFLMYTHYNEEATEAGPLCAYE--------SHLLVAFMKRYYCDWITNTYVKPF 503

  Fly   504 IILAFASYLVGACYGITQIKEGLERRKLSREDSYSVEFFDREDDYYREFPYRMQVIIAGPLNYSD 568
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Zfish   504 VVLFYLVYVSFALMGYLQVSEGSDLSNVVATETSTIAYTRAQQRYFSSYSPVIGFYIYESIEYWN 568

  Fly   569 PLVQEQVENLTSTLEHTSYVTSRRYTESWLRSFLSFLERNNELLNVTVD-DEQTFIDAVKEHWLF 632
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Zfish   569 TSVQEDLLEYIKGFERI----------SWFESYLNYLHG----LNITTSLSRSNFTERLRSGFL- 618

  Fly   633 PGNP----FSLDVRF---NEDETQIIASRFLIQAVNITDTNHEKEMVRD-LRQICKDSPLNASIF 689
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Zfish   619 -RQPRYVHFTDDIIFAKRSDGEFDVVASRMFLIAKTTENKREEMSILLDTLRKLSLTSRVKFIIF 682

  Fly   690 HPYFVFFDQFELVRPVSLQAMVIGAIIMMIISFVFIPNILCSLWVAFSVISIELGVAGYMALWDV 754
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Zfish   683 NPSFVYMDRYASSVGAPLKNSCIAALFLLFFSTFLAADPLVNAWLTVTVASVEFGLVGFMTLWRV 747

  Fly   755 NLDSISMINLIMCIGFSVDFTAHICYTYMSSKKRSPKARVREALHSLGLPIIQGSSSTILGIVAL 819
            .||.:|::.||..:.::||.:|.:...:...::.:....|:.||...|:|.:|........::.|
Zfish   748 ELDCVSVLCLIYGVNYAVDSSAPLVSAFALGRESTRTRWVKLALEQHGVPALQSYLCYGAALLPL 812

  Fly   820 LLAQSYIFLVFFKMVFLVIFFGAMHGLFLLPVLLSLFGP 858
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Zfish   813 AAVPSNLTRTLFRCLFLTAIITAFHCLAILPVLLTFLPP 851

Known Domains

Gene	Sequence	Domain	Region	External ID	Identity
Ptr	NP_610209.2	Patched	53..845	CDD:308203	217/828 (26%)
ptchd1	XP_690754.1	Patched	92..851	CDD:308203	212/800 (27%)