Protein Alignment Ptr and ptchd4

DIOPT Version :10

• Sequence 1: NP_610209.2
• Gene: Ptr / 35546
• FlyBaseID: FBgn0262867
• Length: 1169
• Species: Drosophila melanogaster
• Sequence 2: XP_031758858.1
• Gene: ptchd4 / 100497488
• XenbaseID: XB-GENE-6044462
• Length: 905
• Species: Xenopus tropicalis
• Alignment Length: 894
• Identity: 230/894 - (25%)
• Similarity: 425/894 - (47%)
• Gaps: 88/894 - (9%)

  Fly     8 VDKTLNKSFYHLGICIAKHPGYFIIIPVLLTLLCMTGYQQL---KYQIDPEYLFSPIAGEGKTER 69
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 Frog    23 IHRGLKSSSYKLGLFVSRHPVFFLTLPAVLTII--FGFSFLSRYKTEKDLEALVAPSHSLAKIER 85

  Fly    70 AIVEQYFKVNYTHRFNVGRITRPGRFGRVIVITKDGDENMIRREVFQELRQLDNIIQNATTTYDG 134
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 Frog    86 SLASSLFPLDQSKKQLYSDLHTPGRYARVIFLSKPGGNILLQAE---RILHIHRAVLDMKVHHRG 147

  Fly   135 DTYTYKDNCA-RWENE-CFENDILNLDALMDDI-EAGQLNLTFPFMFNPVTWDAHLFPVFFGGTK 196
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 Frog   148 YNYSFPHLCVLRSEDKRCVLDEII---SVLEDIRQAALSNKT----------SASKVQVSYPTTK 199

  Fly   197 L--------------------TEDNYVISVPAIQLVYFV-TADTKRQDAKGAEWEETFLRVVGN- 239
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 Frog   200 LKDGRQSFIGHQLGGVAEVPNSKDQRVKSARAIQITYYLQNYGSTTQDHISEQWETEFCTLMHQL 264

  Fly   240 AENSGQFKHISVSYFA-----SRTLDHELEKNTKTVVPYFSSTFLLMGLFSIITCMMGDAVRSKP 299
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 Frog   265 QEERADIQLYSLTSFSLLRDFQKTID---LSRSKIVV-----SLMLVLMAATLSSSMKDCLRSKP 321

  Fly   300 FLGLMGNVSAIMATLAAFGLAMYCGIEFIGINLAAPFLMIGIGIDDTFVMLAGWRRTKAKMPVAE 364
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 Frog   322 FLGLLGVLTICISSVTAAGIFFVTDGRYNSTLLGIPFFAMGHGTKGVFELLSGWRRTRESLPFKD 386

  Fly   365 RMGLMMSEAAVSITITSVTDFISFLIGIISPF---RSVRIFCTYSVFAVCFTFLWHITFFAACMA 426
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 Frog   387 RVADAYSDVMVSYTMTSSLYIITFGMG-ASPFTNIEAVRIFCQNMCITIVLNYFYVFSFYGSCLV 450

  Fly   427 ISGYRERKNLHSIFGCRVQPMSVAIKEKRNFLYKAIMAGGIDANDPDNPIDNKDHMLMAFFKDKM 491
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 Frog   451 FAGQLEQNRYHSIFCCKIP--SEEYLDRKPIWFQTIMSDGHQHSSHHEPDPYENHFIQHFLREHY 513

  Fly   492 AAVINNKWCKAIIILAFASYLVGACYGITQIKEGLERRKLSREDSYSVEFFDREDDYYREFPYRM 556
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 Frog   514 NEWITNTYVKPFVVILYLIYASFSFMGCLQISGGSNIINLLASDSPSVSYAHIQQKYFSNYSPVI 578

  Fly   557 QVIIAGPLNYSDPLVQEQVENLTSTLEHTSYVTSRRYTESWLRSFLSFLERNNELLNVTVDDEQT 621
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 Frog   579 GFYIYEPLEYWNATVQEDLKTISSGFN----------TESWIEQYYQFL----KAANVSASNKTE 629

  Fly   622 FIDAVKEHWLFPG--NPFSLDVRFNE--DETQIIASRFLIQAVNITDTNHE-KEMVRDLRQICKD 681
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 Frog   630 FIGVLQNSFLRRAEFQHFKNDIIISRSGEESNIIASRMFLVARTSENTQREVVELLEKLRPLSLI 694

  Fly   682 SPLNASIFHPYFVFFDQFELVRPVSLQAMVIG--AIIMMIISFVFIPNILCSLWVAFSVISIELG 744
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 Frog   695 QSIKFIVFNPTFVFMDHYGLA--VTMPVLISGFSVLLVLILTFFLVIHPLGNFWLIITVTSIELG 757

  Fly   745 VAGYMALWDVNLDSISMINLIMCIGFSVDFTAHICYTYMSSKKRSPKARVREALHSLGLPIIQGS 809
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 Frog   758 VLGLMTLWNVDMDCVSIMCLIYALNFAIDHCSPLLYTFVLATEHTRTLCIQDSLKEHGTAIIQNV 822

  Fly   810 SSTILGIVALLLAQSYIFLVFFKMVFLVIFFGAMHGLFLLPVLLSLFGP 858
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 Frog   823 VSFLVGLVPLLFVPSNLTSTLFKCLLLTGSCTLLHCFVILPVFLTFFPP 871

Known Domains

Gene	Sequence	Domain	Region	External ID	Identity
Ptr	NP_610209.2	Patched	53..845	CDD:308203	209/831 (25%)
ptchd4	XP_031758858.1	Patched	84..871	CDD:308203	210/829 (25%)