Protein Alignment Ptr and ptchd3a

DIOPT Version :10

• Sequence 1: NP_610209.2
• Gene: Ptr / 35546
• FlyBaseID: FBgn0262867
• Length: 1169
• Species: Drosophila melanogaster
• Sequence 2: XP_003201375.3
• Gene: ptchd3a / 100334931
• ZFINID: ZDB-GENE-111215-6
• Length: 1003
• Species: Danio rerio
• Alignment Length: 898
• Identity: 305/898 - (33%)
• Similarity: 498/898 - (55%)
• Gaps: 60/898 - (6%)

  Fly     7 CVDKTLNKSFYHLGICIAKHPGYFIIIPVLLTLLCMTGYQQL--KYQIDPEYLFSPIAGEGKTER 69
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Zfish    36 CVEKPISICFQKFGRFVGTYPWWFFISPLLISAVLGTGFCLLEDREANDIEDQFTPVNGPAKQER 100

  Fly    70 AIVEQYFKVNYTHRFNVGRITRPGRFGRVIVITKDGDENMIRREVFQELRQLDNIIQNATTTYDG 134
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Zfish   101 RFVQQNFPQN-DSLFSNQRLYTDGVYASFIAVTK--SSNILTDAAFREIVILDRKVKELNVSTGH 162

  Fly   135 DTYTYKDNCARWENECFENDILNLDALM-DDIEAGQLNLTFPFMFNPVTWDAHLFPVFF-----G 193
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Zfish   163 EVLTFEGLCARRYKKCIPNKILDIHKYYGENLEATELSFPF-FRFG--------FSYIFLGYSVG 218

  Fly   194 GTKLTEDNYVISVPAIQLVYFVTADTK-RQDAKGAEWEETFLRVVGNAENSGQFKHISVSYFASR 257
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Zfish   219 GVNL-NSSIIKSAKSVRLFYFLKEDNRTRTDL----WLNEFLKVF---PSNLSLNSIKVTHSTSL 275

  Fly   258 TLDHELEKNTKTVVPYFSSTFLLMGLFSIITCMMGDAVRSKPFLGLMGNVSAIMATLAAFGLAMY 322
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Zfish   276 SRQVEFEANTKDVIPLFSITYVIAIAFSILSCLRFDCVRNKVWVATFGVFSAGLAVLSSFGMMLH 340

  Fly   323 CGIEFIGINLAAPFLMIGIGIDDTFVMLAGWRRTKAKMPVAERMGLMMSEAAVSITITSVTDFIS 387
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Zfish   341 IGVPFVMTVANSPFLILGIGVDDMFILISCWQQTNVHDRVETRLSNTYKEAAISITITTLTDVLA 405

  Fly   388 FLIGIISPFRSVRIFCTYSVFAVCFTFLWHITFFAACMAISGYRERKNLHSIFGCRVQPMSVAIK 452
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Zfish   406 FYIGLMTPFRSVRSFCLYTSTSILFCYIYSITFFGAFLVLNGRRENSNKHWL-TCKEVPEECAVG 469

  Fly   453 EKRNFLYKAIMAGG-IDANDPDNPIDNKDHMLMAFFKDKMAAVINNKWCKAIIILAFASYLVGAC 516
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Zfish   470 QSK--WYELCCIGGAYDRHTGSEEVQPMNH----FFKKYYGPFLTKSWTKVFVIVFYCIYLIVSI 528

  Fly   517 YGITQIKEGLERRKLSREDSYSVEFFDREDDYYREFPYRMQVIIAGPLNYSDPLVQEQVENLTST 581
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Zfish   529 YGCFQIQEGIDLRNLAADDSYVVKYYDNEKAYFSEYGPNIMVVIRQEFPYWDEKYMSDLETCIED 593

  Fly   582 LEHTSYVTSRRYTESWLRSFLSFLERNNELLNVTVDDEQTFIDAVKEH---WLFPGNPFSLDVRF 643
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Zfish   594 FKNLSFIEKDIFT-SWIKSYKYY--GYHTKLNLSAE------DVFKENLGTFLRFYSDFKQDVNF 649

  Fly   644 NEDETQIIASRFLIQAVNITDTNHEKEMVRDLRQICKDSPLNASIFHPYFVFFDQFELVRPVSLQ 708
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Zfish   650 TNN--SIHASRFFIQTVNISTALDEMNMLNKLRDTAQKCPVPLLVYHPAFIYHDQYAVIVTNTIQ 712

  Fly   709 AMVIGAIIMMIISFVFIPNILCSLWVAFSVISIELGVAGYMALWDVNLDSISMINLIMCIGFSVD 773
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Zfish   713 NIAVTTAVMLLISLLLIPNPLCSLWVTFSIASVIVGVTGFMALWDVNLDTISMIILVVCIGFSVD 777

  Fly   774 FTAHICYTYMSSKKRSPKARVREALHSLGLPIIQGSSSTILGIVALLLAQSYIFLVFFKMVFLVI 838
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Zfish   778 FSAHISYAFVSNKKPSANEKAVEALFNLGYPILQGAVSTILGVVVLSASKNYIFRTFFKIMFLVI 842

  Fly   839 FFGAMHGLFLLPVLLSLFGPGSCLTWTGKDDGSDAEVDDGLDDRQLEKPFSQS 891
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Zfish   843 FFGLFHGLTFIPVFLTFF--DMC-------NGTPAENKSGPEEQAMKKSYTNN 886

Known Domains

Gene	Sequence	Domain	Region	External ID	Identity
Ptr	NP_610209.2	Patched	53..845	CDD:308203	279/802 (35%)
ptchd3a	XP_003201375.3	None