Protein Alignment Ptr and ptchd3b

DIOPT Version :10

• Sequence 1: NP_610209.2
• Gene: Ptr / 35546
• FlyBaseID: FBgn0262867
• Length: 1169
• Species: Drosophila melanogaster
• Sequence 2: XP_002667290.6
• Gene: ptchd3b / 100331480
• ZFINID: ZDB-GENE-160517-1
• Length: 835
• Species: Danio rerio
• Alignment Length: 866
• Identity: 285/866 - (32%)
• Similarity: 464/866 - (53%)
• Gaps: 51/866 - (5%)

  Fly     2 TCGISCVDKTLNKSFYHLGICIAKHPGYFIIIPVLLTLLCMTGY---QQLKYQIDPEYLFSPIAG 63
            :|...|::|.:.:.|..||..:..||.:|:::|::::.....|:   .:||.. |....|:|..|
Zfish     3 SCTTDCIEKPIRRCFESLGKFVGLHPWWFVVLPLVMSAGLGGGFFFLNELKSD-DIVEQFTPKKG 66

  Fly    64 EGKTERAIVEQYFKVNYTHRFNVGRITRPGRFGRVIVITKDGDENMIRREVFQELRQLDNIIQNA 128
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Zfish    67 RAKMERRFFQETFPQS-DSQFSVIRINTDGVFASLIF---SSQSNILSVTALDEIIRIDVKIKRF 127

  Fly   129 TTTYDGDTYTYKDNCARWENECFENDILNLDALMDDIEAGQLNLTFP----FMFNPVTWDAHLFP 189
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Zfish   128 SVSLDTNTFAFSDICADVNGTCNSNVILDVFG-YNASNVSFVNMTYPKYCRSEFNCV----HLGN 187

  Fly   190 VFFGGTKLTEDNYVISVPAIQLVYFVTADTKRQDAKGAEWEETFLRVVGNAENSGQFKHISVSYF 254
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Zfish   188 V-ISEVEVDQDGFVQSAKAVRLFYYL---QENNDTLTDAWLQKLMDVLSNVTTS----QTEVSYF 244

  Fly   255 ASRTLDHELEKNTKTVVPYFSSTFLLMGLFSIITCMMGDAVRSKPFLGLMGNVSAIMATLAAFGL 319
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Zfish   245 TSMSRQQEFEKSTRSVTQLFAVTYFLAISFSIMSCLRFDNVRNKAWLASLGVFSTAQAVLSSFGL 309

  Fly   320 AMYCGIEFIGINLAAPFLMIGIGIDDTFVMLAGWRRTKAKMPVAERMGLMMSEAAVSITITSVTD 384
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Zfish   310 LLLLNVPFVITAASSPFLILGIGIDDMFIMISSWQRTNIQDSVPKRMSDTYREAAISITITTLTD 374

  Fly   385 FISFLIGIISPFRSVRIFCTYSVFAVCFTFLWHITFFAACMAISGYRERKNLHSIFGCRVQPMSV 449
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Zfish   375 VLAFYLSFSNPFGSVQSFCLYAGTAVLLCYFYNITFFGACLALNGRREGANKHWL-TCMKVPEEM 438

  Fly   450 AIKEKRNFLYKAIMAGGIDANDPDNPIDNKDHMLMAFFKDKMAAVINNKWCKAIIILAFASYLVG 514
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Zfish   439 PPGESK--AYTLCCVGG---SYNRNTGTEEEHPMALFFRKCYGPFLTTSWCKAFVVLIYFTYIGV 498

  Fly   515 ACYGITQIKEGLERRKLSREDSYSVEFFDREDDYYREFPYRMQVIIAGPLNYSDPLVQEQVENLT 579
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Zfish   499 SVYGCLQLKEGIDLKNLALDDSYIIQYYDAESAYFHYYGPNVMLAINGTFPYWEESERNQLETCI 563

  Fly   580 STLEHTSYVTSRRYTESWLRSFLSFLERNNELLNVTVDDE-QTFIDAVKEHWLFPGNPFSLDVRF 643
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Zfish   564 KRFLELDFVNS---STSWLHAF----ERYGVGRNISSEASFKTHLHEFLEH-----NPM-LKQDV 615

  Fly   644 NEDETQIIASRFLIQAV--NITDTNHEKEMVRDLRQICKDSPLNASIFHPYFVFFDQFELVRPVS 706
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Zfish   616 NITDNNITASRLFLQTIVQNAT----EKTVVNSLRKTAEICPYQLLVYHPAFIYHDQYTVIGQVT 676

  Fly   707 LQAMVIGAIIMMIISFVFIPNILCSLWVAFSVISIELGVAGYMALWDVNLDSISMINLIMCIGFS 771
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Zfish   677 LQTIAVSTAVMLFIALMLIPHPLCALWVAFAIASVILGVTGFMALLNIRLDSISMINLVISIGFS 741

  Fly   772 VDFTAHICYTYMSSKKRSPKARVREALHSLGLPIIQGSSSTILGIVALLLAQSYIFLVFFKMVFL 836
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Zfish   742 VDFSAHISYTFVSSTKSDVNGRIVEALAHLGYPILQGALSTVVGVVVLSASSSYIFRTLFTIVLL 806

  Fly   837 VIFFGAMHGLFLLPVLLSLFG 857
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Zfish   807 VITLGLLHGIAFIPVFLTFCG 827

Known Domains

Gene	Sequence	Domain	Region	External ID	Identity
Ptr	NP_610209.2	Patched	53..845	CDD:308203	266/798 (33%)
ptchd3b	XP_002667290.6	None