Protein Alignment Apoltp and vtg4

DIOPT Version :10

• Sequence 1: NP_995670.2
• Gene: Apoltp / 34283
• FlyBaseID: FBgn0032136
• Length: 4333
• Species: Drosophila melanogaster
• Sequence 2: NP_001038759.2
• Gene: vtg4 / 678536
• ZFINID: ZDB-GENE-001201-3
• Length: 1358
• Species: Danio rerio
• Alignment Length: 1652
• Identity: 303/1652 - (18%)
• Similarity: 575/1652 - (34%)
• Gaps: 462/1652 - (27%)

  Fly    49 EQLYKYQYTVAVRTEFAGSGDNSSDLLLKSDLEIFFPKPCEGY----LRINDAKLYDTLDELNDN 109
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Zfish    27 DKTYKYKY----------------EALLLGGL------PQEGLARAGIKVSSKVLLSAV------ 63

  Fly   110 ESDSSEKTKEYDYYDNLANEESESQNYDNMHPKSSDFNVDLTKNL-------LRFAFHDGLISEV 167
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Zfish    64 ----TENTYLMKLMDPLLYEYAGTWPKDSFVPATK-----LTSALAAQLQIPIKFEYANGVVGKV 119

  Fly   168 CPQEQETPWVLNIKKGILSAFQNTMMRFDVDANTTETDVSGQCQVQYAL-EDTDSSYVTIRKTKD 231
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Zfish   120 FAPAGVSPTVMNLHRGILNILQLNLKKTQNIYELQEAGAQGVCRTHYVINEDPKTNHIIVTKSKD 184

  Fly   232 INSCRQRYATHSVLQTTPYTFRDDKTIWPILKSQSHCNLTIDNNVYKEIKCLETHLLVPFSNASS 296
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Zfish   185 LSHCQERIMKDVGLAYTERCAECTKRVKSLIETATY-----------------NYIMKP---ADN 229

  Fly   297 GALTTSTSRLKLDGVES-YSAGEFLE-QNPELVERRATLVF---DHTPAVKPSHD-------EIK 349
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Zfish   230 GALIAEAT------VEEVYQFSPFNEIHGAAMMEAKQTLAFVEIEKTPVVPFKADYMHRGSLQYE 288

  Fly   350 AARELL---VEMCRVGFPNIQREFIDVFTNFLQTSKS-------LDYKTLSVLLQRSASTCEQ-- 402
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Zfish   289 FATEILQTPIQLMKIS--DAPAQIVEVLKHLVANNKDMVHDDAPLKFVQLVQLLR--VATLEKIE 349

  Fly   403 -----------GRNHLLESLPFIGSTASYKVMRDQII-NEKLTKQMAHDWMTALSFITRPDEETL 455
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Zfish   350 AIWSQFKDKPVYRRWLLDALPAVGTPVIIKFIKEKFLAGEFTTPEFIQTLVIALQRVS-ADLETI 413

  Fly   456 ETFHSILEYAK----NRLDAEYTLGATAVVHSFCKHHEACEENLRVQQIINLLETEFLNLYNLFK 516
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Zfish   414 QMTASLAMHEKFSTVPALREVAMLGYGSLIARHCIAVPTCPAEL--LRPIHEIATEAVSKNDI-- 474

  Fly   517 GERRTRERMVILLKGLGNIGVVSSAFAEQLQWIIR--------EDEAPVDIRLHGILAFRRVDCA 573
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Zfish   475 ------PEITLALKVMGNAGHPSS-----LKPIMKLLPGLRTAANALPVRVQVDAILALRNIAKK 528

  Fly   574 RHR-------SYFLDNYGNYTLNSELRIYSYLQAMRCPDYISVGVIKSI---LEHEEINQVGSFV 628
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Zfish   529 EPKLVQPIALQLVLDR----ALHPEVRMVACIVLFEAEP--SVALISSLAGALRTEPNMHVASFA 587

  Fly   629 WSHLTNLAKSNSPVRIEAQGL------LLNDELSERFKMDIRKFSRNYEHSLFFDEYNFGTTTDA 687
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Zfish   588 YSHIKSLTRITAPDMAYVAGAANVAIKLMNCKLD---RLNYR-YSRAFKMDYYYTPLMIGAAGSA 648

  Fly   688 NVIFGTDSYLPRIASVNFTADLFGQSVNFFEFTARAEGLEELAANAFGPKGPLSGQLLRKKLSFL 752
            .:|....:.|||.......|.|.|.:.:..||..|..|:.|...     |.|
Zfish   649 YMINDAATILPRAVVAKARAYLAGAAADVVEFGVRTGGIHEALL-----KSP------------- 695

  Fly   753 NRWLGNESAEEDDTLENLLSLDNLRLKRKAQEQARASEEEVDEDYDFEESLEGNKRQKRDVSTTR 817
                                               |::|.||.       :...||..|.::..:
Zfish   696 -----------------------------------AADESVDR-------ITKIKRTLRALTNWK 718

  Fly   818 KQEIDRNVDSLGYKLKYDYNNPRAQFGLRVFGNDLRYFNVESLVEVMALAAKFNPFQQA------ 876
            ....|:               |.|...::|||.::.|.|.:..:...|:.....|..:|
Zfish   719 ALPTDK---------------PLASAYVKVFGQEVAYVNFDKTIIEEAIPMVTGPKPRALLKEAL 768

  Fly   877 KNVLSGKEFTYTKSRVFLDASYTVPLAVGLPLAIH----AFGASSIDLRVS------GNLDEMD- 930
            |.:..|..|.|.|..:..:....:|.|||:|:...    |..|:|::::.:      ..|:.|.
Zfish   769 KALQEGIAFQYAKPLLAAEVRRILPTAVGVPMEFSWYTAAVAAASVNVQATVTPALPEKLESMTY 833

  Fly   931 ---PPTDWHFDVEGQFKPSVSVDVITTMQTDMFWEQSGIKVKSNLYSNSELVAKLKVRGR----- 987
               ..||..|..|.  :|||::.....|..:..:.|:.:..:..:    ..:|..||..|
Zfish   834 EQLKKTDVQFQAEA--RPSVALQTFAVMGVNTAFIQAAVMARGKI----RTIAPGKVAARADILK 892

  Fly   988 ---NLVSFSFDLPRDKNEIFSVRSELLVQKREEQLPQAGIANRSANSTCTWPVLDQAIGLQMCSH 1049
               .:.:...|||   ..|.|...|.|...|       .|.:.||..:.  |.:.: :.||....
Zfish   893 GNYKVEALPVDLP---EHIASASFETLAVVR-------NIEDHSAERSV--PFVPE-LSLQNSQA 944

  Fly  1050 YSVPDLSNATEIYPSLLLAGPLNFSLILKKSDLSAKKYVFEYKWDQQEEDNNFSLVFTTPGSKVP 1114
            ....|||  :|:.|...:..|..|...|    ..|..|: |.|...:...:|.:.:
Zfish   945 SYAGDLS--SEVSPDASVRAPAPFDRTL----CYAVPYI-EIKGCVEVHSHNAAFI--------- 993

  Fly  1115 RVLVANVTKVPDAFNASVAFVNGPNRVSAGCSYDGNPDFRRLDIYLDTNGNRSLDLGMELRRHQD 1179
                         .|:::.::.|.:...|..|....|...||:..:.. |.|:.:
Zfish   994 -------------RNSTLFYIIGHHTARAAVSRAEGPAVERLEFEVQV-GPRAAE---------- 1034

  Fly  1180 FTAWIYNPRMLLAINGVN---ITGLAGTVKVNEKNGIKQHDVDLSFETKKLQAVIKGNVVQSEIT 1241
                    |:|..||.::   ..|.|..:|:.|                .|....|...|.||.:
Zfish  1035 --------RLLKQINIIDDDTPEGQAFLLKLRE----------------ILDTEAKNAPVSSESS 1075

  Fly  1242 TSTNMTIKYRFQANKIEEINFAGKLVNNGDKSKTEYRGNMKLQTSAYPKLNFASESTWLSLQGHT 1306
            :|::...:                                          :.:|.||..|..|.:
Zfish  1076 SSSSRNSR------------------------------------------STSSSSTSTSSSGSS 1098

  Fly  1307 EGMITYNNAPDYVNPNYTSLVRLIFARSHSEDSFLDGTQTRASLELKLPRSKIDYRILVKHKEHI 1371
            ....:.:::......:.|:.:...|.:.| :|.:|  ....|:.:.....:...:..:.|....:
Zfish  1099 SSSSSSSSSMSSSRMSKTATIMEPFRKFH-KDRYL--APHSATKDTSSGSAAASFEQMQKKNRFL 1160

  Fly  1372 KNGTEH-NVIVGLKYTPEKEITGLFSVHLPRRNLFAIDAYMNVTVPEFNSCTASLKVNEKATKDY 1435
            .|.... ..|:......::::.|           :.:.||.:..........:|:..|:...
Zfish  1161 GNDIPPVFAIIARAVRADQKLLG-----------YQLAAYFDKPTARVQLIASSIAENDNMK--- 1211

  Fly  1436 IIFINGSWFTGHSVAVKANY--KDRSSRVQALHHLKMIVESPSF-------NITSLNIIYRRKQL 1491
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Zfish  1212 -ICADGALLSKHKVTAKFSWGAECKQYAVFAKAEAGVLGEYPAARLEVEWERLPKIASTYAKK-- 1273

  Fly  1492 LIFYDIQAKYDQDPYGLTIQYASNAHNRNTNAEVRLKVKERDYWINAKLLSEQPKLLQL-----E 1551
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Zfish  1274 VSKYILNAAYDT---GFRFERATNS--------------EKEIELTAALPSQ--KSLNVIARIPE 1319

  Fly  1552 IHMDKIRDVHIQV-------GLLNVDK 1571
            |.|.: ||:::.|       |...:||
Zfish  1320 ITMSR-RDIYLPVTVPINPDGTFTIDK 1345

Known Domains

Gene	Sequence	Domain	Region	External ID	Identity
Apoltp	NP_995670.2	LPD_N	49..633	CDD:214755	130/653 (20%)
		Vit_open_b-sht	665..1005	CDD:462702	68/367 (19%)
		DUF1081	1027..>1116	CDD:461916	18/88 (20%)
		VWD	3741..3908	CDD:214566
		C8	3952..4014	CDD:214843
vtg4	NP_001038759.2	Vitellogenin_N	24..592	CDD:460170	130/653 (20%)
		Vit_open_b-sht	626..910	CDD:462702	69/368 (19%)
		Vit_b-sht_shell	1166..1330	CDD:462705	35/200 (18%)