Protein Alignment Apoltp and vit-3

DIOPT Version :10

• Sequence 1: NP_995670.2
• Gene: Apoltp / 34283
• FlyBaseID: FBgn0032136
• Length: 4333
• Species: Drosophila melanogaster
• Sequence 2: NP_001367903.1
• Gene: vit-3 / 24104675
• WormBaseID: WBGene00006927
• Length: 1603
• Species: Caenorhabditis elegans
• Alignment Length: 1597
• Identity: 306/1597 - (19%)
• Similarity: 568/1597 - (35%)
• Gaps: 470/1597 - (29%)

  Fly   149 DLTKNLLRFAF----HDGLISEVCPQEQETPWVLNIKKGILSAF-------------QNTMMRFD 196
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 Worm   101 DELKELLELPFRAQIRNGLVSEIQFSSEDAEWSKNAKRSILNLFSLRKSAPVDEMSQDQKDMESD 165

  Fly   197 VDA---NTTETDVSGQCQVQYAL--EDTDSSYVTIRKTKDIN--SCRQRYATHSVL--------- 245
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 Worm   166 KDSLFFNVHEKTMEGDCEVAYTIVQEGEKTIY-----TKSVNFDKCITRPETAYGLRFGSECKEC 225

  Fly   246 ---------QTT-PYTFRDDKTIWPILKSQSHCNLTIDNNVYKEIKCLETHLLVPFSNAS----- 295
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 Worm   226 EKEGQFVKPQTVYTYTFKNEK----LQESEVHSIYTLNVNGQEVVKS-ETRSKVTFVEESKINRE 285

  Fly   296 ----SG---ALTTSTSRLKLDGVES-YSAGEFLEQNP----ELVERRATL--VF-------DHTP 339
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 Worm   286 IKKVSGPKEEIVYSMENEKL--IEQFYQQGDQAEVNPFKAIEMEQKVEQLDEIFRQIQEHEQNTP 348

  Fly   340 AVKPSHDEIKAARELLVEMCRVGFPNIQREFIDVFTNFLQTSKSLDYKTLSVLLQRSASTCEQGR 404
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 Worm   349 --ETVHLIARAVR--MFRMCTI--EELKKVHTTIYTKAEKKVQLVIETTLAV-----AGT-KNTI 401

  Fly   405 NHLLESLPFIGSTASYKVMRDQIINEKLTKQMAHDWMTALSFITRPDEETLETFHSILEYAKNRL 469
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 Worm   402 QHLIHHFE----------------KKSITPLRAAELLKSVQETLYPSEHIADL---LIQLAQSPL 447

  Fly   470 DAEYT-------LGATAVVHSFCKHHEACEENLRVQQIINLLETEFLNLYNLFKGERRTRER--- 524
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 Worm   448 SEKYEPLRQSAWLAAGSVVRGFAS------------------KTQDLPL--IRPASRQTKEKYVR 492

  Fly   525 --------------MVILLKGLGNIGVVSSAFAEQLQWIIREDEAPVDIRLHGILAFRRVDCARH 575
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 Worm   493 VFMQHFRNADSTYEKVLALKTLGNAGIDLSVY--ELVQLIQDPRQPLSIRTEAVDALRLLKDVMP 555

  Fly   576 R---SYFLDNYGNYTLNSELRIYSYLQAMR-CPDYISVGVIKSILEHEEINQVGSFVWSHLTNLA 636
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 Worm   556 RKIQKVLLPVYKNRQNKPELRMAALWRMMHTIPEEPVLAHIVSQMENESNQHVAAFTYNVLRQFS 620

  Fly   637 KSNSP----VRIEAQGLLLNDELSERFKMDIRKFSRNYEHSLFFDEYNFGTTTDANVIFGTDSYL 697
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 Worm   621 KSTNPCYQQLAVRCSKVL----LFTRYQPQEQMLSTYSQLPLFNSEWLSGVQFDFATIFEKNAFL 681

  Fly   698 PRIASVNFTADLFGQSVN--FFEFTARAEGLEELAANAFGPKGPLSGQLLRKKLSFLNRWLGNES 760
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 Worm   682 PKEVQASFET-VFGGNWNKYFAQVGFSQQNFE---------------QVILKTLEKLSLY-GKQS 729

  Fly   761 AEEDDTLENLLSLDNLRLKRKAQEQARASEEEVDEDYDFEESLEGNKRQKRDVSTTRKQEIDRNV 825
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 Worm   730 -------------DELR-SRRVQSGIQMLQEIV---------------KKMNIRPRVQQTDSQNA 765

  Fly   826 DSLGYKLKY---DYNNPRAQFGLRVFGNDLRYFNVESLVEVMALAAKFNPFQQAKNVLSGKEFTY 887
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 Worm   766 HAVFY-LRYKEMDY---------IVLPIDME--TIDNVVEKYVRNGEFDIKSLLTFLTNDSKFEL 818

  Fly   888 TKSRVFLDASYTVPLAVGLPLAIHA--------FGASSIDLRVSGNLDEMDPPTDWHFDVEGQFK 944
            .::..|.:|...:|..:|:||.|..        .|..||:|...|....:|            ..
 Worm   819 HRALFFYEAERRIPTTIGMPLTISGKMPTILSINGKVSIELEKLGARLVLD------------IV 871

  Fly   945 PSVSVDVITTMQTDMFWE---QSGIK--VKSNLYSNSELVAKLKVRGRNL-VSFSFDLPRDKNEI 1003
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 Worm   872 PTVATTHVTEMR---FWYPVIEQGVKSLQSARLHTPLRFESTVELKKNTLEITHKFVVPENKKTT 933

  Fly  1004 FSVRS-----------------------------ELLVQKREEQLPQAGI-ANRSANSTCTWPVL 1038
            .||.:                             ::..::.:.|....|: .|...|....| .|
 Worm   934 VSVHTRPVAFIRVPKNQDSEYVETEEKTISHSQYQMSTEEIDRQYETFGLRINAQGNVLSQW-TL 997

  Fly  1039 DQAIGLQMCSHYSVPDLSNATEIYPSLLLAGPLNFSLILKKSDLSAKKY--VFEYKWD-QQEEDN 1100
            ...:..:....:::.:.:...|....:.:..       |:|:|||..|:  :||.::| :..|..
 Worm   998 PMVLMTEQDFEFTLENKNRPVEFTARVTIGN-------LEKTDLSEIKFDKIFEKEFDLENNESE 1055

  Fly  1101 NFSLVFTTPGSKVPRVLVANVTKVPDAFNASVAFVNGPNRVSAGCSYDGNPDFRRL-DIYLDTNG 1164
            |....|        ..::..:.......|.....:..|.::.      .|.:.|.: |.::
 Worm  1056 NRRQYF--------HKMIREIQSEQGFKNLITLKLEAPQQMY------WNTELRTVCDKWI---- 1102

  Fly  1165 NRSLDLGMELRR----HQDFTAWIYNPRMLLAINGVNITGLAGTVKVNEKNGIKQ------HDVD 1219
             |...:.|:.||    |:: ..|.....:|.|             :....:.::|      .:|.
 Worm  1103 -RMCKVEMDARRSPMEHEN-KEWTLRTELLAA-------------RPQMPSSLRQLREQPHREVQ 1152

  Fly  1220 LSFETKKLQAVIKGNVVQSEITTSTNMTIKYRFQANKIEEINFAGKLVNNGDKSKTEYRG----N 1280
            |:...|      .|:..:||||          |.| ::|:.....|.:.|.::   ||:|    .
 Worm  1153 LALNAK------WGSSKKSEIT----------FNA-QLEQSTEQKKFLRNIER---EYKGIPEYE 1197

  Fly  1281 MKLQTSAYPKLNFASESTWLSLQGHTEGMITYNNAPDYVNP-NYTSLVRLIFARSHSEDSFLDGT 1344
            :.::.:...::|..||   ..|...:|  .|::...|.:.. |:.::..   .|..:||
 Worm  1198 LLIKAARLNQVNVVSE---YKLTPESE--YTFSRIFDLIKAYNFWTVSE---KRVQNED------ 1248

  Fly  1345 QTRASLELKL-PRSKIDYRILVKHKEHIKNGTEHNVIVGLKYTPEKEITGLFSVHLPRRNLFAID 1408
             .|..|:|.: |.|:....:.::                   |||:|:. |.:|.:||
 Worm  1249 -RRVVLQLSVEPLSRQYMNMTIQ-------------------TPEQEVE-LKNVRIPR------- 1285

  Fly  1409 AYMNVTVP------------EFNSCTASLKVNEKATKDYIIFINGSWFTGHSVAVKANYKDRSSR 1461
                |.:|            |....|..:..:|.:|.|.:|: .....|.:|:..    ||.|
 Worm  1286 ----VVLPTIARRAMFQQTWEKTGATCKVGQSEVSTFDNVIY-RAPLTTCYSLVA----KDCS-- 1339

  Fly  1462 VQALHHLKMIVESPSFNITSLNIIYRRKQLLIFY-----DIQAKYDQDPYGLTIQYASNAHNRNT 1521
                       |.|.|.:.:..|....::||:..     :|..|...|.:.:.:.
 Worm  1340 -----------EQPRFAVLAKKINKNSEELLVKVVRREEEIVVKKSDDKFLVKVD---------- 1383

  Fly  1522 NAEVRLKVKERDYWINAKLLSEQPKLLQL---EIHMD 1555
              |.::...|.:.: |.::|.:...:::|   |:..|
 Worm  1384 --EKKVNPTELEQY-NIEILGDNLIVIRLPHGEVRFD 1417

Known Domains

Gene	Sequence	Domain	Region	External ID	Identity
Apoltp	NP_995670.2	LPD_N	49..633	CDD:214755	126/580 (22%)
		Vit_open_b-sht	665..1005	CDD:462702	69/358 (19%)
		DUF1081	1027..>1116	CDD:461916	16/91 (18%)
		VWD	3741..3908	CDD:214566
		C8	3952..4014	CDD:214843
vit-3	NP_001367903.1	Vitellogenin_N	24..617	CDD:460170	126/580 (22%)
		Vit_open_b-sht	651..935	CDD:462702	69/356 (19%)
		VWD	1300..1454	CDD:214566	27/149 (18%)